Protein–RNA interactions for Protein: Q04844

CHRNE, Acetylcholine receptor subunit epsilon, humanhuman

Predictions only

Length 493 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHRNEQ04844 RNU1-94P-201ENST00000362627 173 ntBASIC4.79□□□□□ -1.64
CHRNEQ04844 RNU6-238P-201ENST00000363313 106 ntBASIC4.79□□□□□ -1.64
CHRNEQ04844 Y_RNA.135-201ENST00000363439 95 ntBASIC4.79□□□□□ -1.64
CHRNEQ04844 C1orf100-202ENST00000366537 483 ntTSL 1 (best) BASIC4.79□□□□□ -1.64
CHRNEQ04844 TEX35-202ENST00000367639 785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.79□□□□□ -1.64
CHRNEQ04844 DEFB119-203ENST00000376321 457 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.79□□□□□ -1.64
CHRNEQ04844 SNORA75B-201ENST00000384053 137 ntBASIC4.79□□□□□ -1.64
CHRNEQ04844 Y_RNA.463-201ENST00000384271 102 ntBASIC4.79□□□□□ -1.64
CHRNEQ04844 Y_RNA.476-201ENST00000384347 108 ntBASIC4.79□□□□□ -1.64
CHRNEQ04844 RNA5SP219-201ENST00000390940 113 ntBASIC4.79□□□□□ -1.64
CHRNEQ04844 AL049697.2-201ENST00000403708 294 ntBASIC4.79□□□□□ -1.64
CHRNEQ04844 AL035079.1-201ENST00000405210 287 ntBASIC4.79□□□□□ -1.64
CHRNEQ04844 EI24P4-201ENST00000423683 1078 ntBASIC4.79□□□□□ -1.64
CHRNEQ04844 AC093655.2-201ENST00000425735 631 ntBASIC4.79□□□□□ -1.64
CHRNEQ04844 AC004875.1-201ENST00000432702 378 ntTSL 3 BASIC4.79□□□□□ -1.64
CHRNEQ04844 AL138921.2-201ENST00000443919 578 ntTSL 5 BASIC4.79□□□□□ -1.64
CHRNEQ04844 AL356421.2-201ENST00000446733 197 ntTSL 3 BASIC4.79□□□□□ -1.64
CHRNEQ04844 SNORD121B-201ENST00000458838 81 ntBASIC4.79□□□□□ -1.64
CHRNEQ04844 RPL7AP28-201ENST00000464513 571 ntBASIC4.79□□□□□ -1.64
CHRNEQ04844 AC016651.1-201ENST00000502680 822 ntTSL 3 BASIC4.79□□□□□ -1.64
CHRNEQ04844 HMGB3P16-201ENST00000508037 287 ntBASIC4.79□□□□□ -1.64
CHRNEQ04844 AC008526.1-201ENST00000509149 338 ntBASIC4.79□□□□□ -1.64
CHRNEQ04844 AC010468.2-201ENST00000511981 438 ntTSL 2 BASIC4.79□□□□□ -1.64
CHRNEQ04844 RNU6-635P-201ENST00000516651 102 ntBASIC4.79□□□□□ -1.64
CHRNEQ04844 AC044810.3-201ENST00000527565 589 ntTSL 3 BASIC4.79□□□□□ -1.64
CHRNEQ04844 ST3GAL3-233ENST00000531816 344 ntTSL 1 (best) BASIC4.79□□□□□ -1.64
CHRNEQ04844 AC103798.1-201ENST00000532562 376 ntTSL 2 BASIC4.79□□□□□ -1.64
CHRNEQ04844 AP002989.1-201ENST00000533459 562 ntTSL 4 BASIC4.79□□□□□ -1.64
CHRNEQ04844 AC002563.1-201ENST00000535109 451 ntTSL 3 BASIC4.79□□□□□ -1.64
CHRNEQ04844 LINC02408-202ENST00000538573 559 ntTSL 4 BASIC4.79□□□□□ -1.64
CHRNEQ04844 AC092470.1-201ENST00000546187 132 ntBASIC4.79□□□□□ -1.64
CHRNEQ04844 LINC00644-201ENST00000555156 295 ntTSL 2 BASIC4.79□□□□□ -1.64
CHRNEQ04844 MTCO3P23-201ENST00000561363 289 ntBASIC4.79□□□□□ -1.64
CHRNEQ04844 LINC02168-201ENST00000565327 352 ntTSL 2 BASIC4.79□□□□□ -1.64
CHRNEQ04844 AC007599.2-201ENST00000573040 493 ntTSL 5 BASIC4.79□□□□□ -1.64
CHRNEQ04844 AC090457.1-201ENST00000579775 211 ntTSL 3 BASIC4.79□□□□□ -1.64
CHRNEQ04844 MIR1269B-201ENST00000580405 75 ntBASIC4.79□□□□□ -1.64
CHRNEQ04844 AC073254.1-207ENST00000600482 714 ntTSL 5 BASIC4.79□□□□□ -1.64
CHRNEQ04844 AL354984.3-201ENST00000604803 325 ntBASIC4.79□□□□□ -1.64
CHRNEQ04844 ATP1B3P1-201ENST00000605365 821 ntBASIC4.79□□□□□ -1.64
CHRNEQ04844 ESRRAP2-204ENST00000606337 280 ntTSL 5 BASIC4.79□□□□□ -1.64
CHRNEQ04844 AC098657.3-201ENST00000620434 263 ntBASIC4.79□□□□□ -1.64
CHRNEQ04844 AP001005.3-201ENST00000622049 129 ntBASIC4.79□□□□□ -1.64
CHRNEQ04844 PCBP1-AS1-278ENST00000625518 864 ntTSL 5 BASIC4.79□□□□□ -1.64
CHRNEQ04844 PDE4D-229ENST00000638939 375 ntTSL 5 BASIC4.79□□□□□ -1.64
CHRNEQ04844 TLK1P1-201ENST00000456760 2440 ntBASIC4.79□□□□□ -1.64
CHRNEQ04844 FGF13-202ENST00000315930 19519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.79□□□□□ -1.64
CHRNEQ04844 CFAP47-203ENST00000378653 9943 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC4.79□□□□□ -1.64
CHRNEQ04844 HEATR5A-203ENST00000543095 7840 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.79□□□□□ -1.64
CHRNEQ04844 BBX-206ENST00000415149 8930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.79□□□□□ -1.64
CHRNEQ04844 ADGRL2-204ENST00000370715 5585 ntTSL 1 (best) BASIC4.79□□□□□ -1.64
CHRNEQ04844 BANK1-203ENST00000444316 3141 ntTSL 2 BASIC4.79□□□□□ -1.64
CHRNEQ04844 AC106895.2-201ENST00000511291 1824 ntTSL 3 BASIC4.79□□□□□ -1.64
CHRNEQ04844 MNS1-201ENST00000260453 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.79□□□□□ -1.64
CHRNEQ04844 NUP107-202ENST00000378905 2859 ntTSL 5 BASIC4.79□□□□□ -1.64
CHRNEQ04844 EXO1-208ENST00000518483 2899 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.79□□□□□ -1.64
CHRNEQ04844 GPBP1-205ENST00000511209 2243 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC4.78□□□□□ -1.64
CHRNEQ04844 SPINK5-202ENST00000359874 3656 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.78□□□□□ -1.64
CHRNEQ04844 FAM216B-201ENST00000313851 3243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.78□□□□□ -1.64
CHRNEQ04844 NXPH1-205ENST00000602349 1953 ntBASIC4.78□□□□□ -1.64
CHRNEQ04844 OR2T7-202ENST00000641557 3409 ntAPPRIS P1 BASIC4.78□□□□□ -1.64
CHRNEQ04844 MAPK10-235ENST00000638225 8941 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC4.78□□□□□ -1.64
CHRNEQ04844 PTPRD-203ENST00000381196 9911 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.78□□□□□ -1.64
CHRNEQ04844 PLCB1-210ENST00000612075 6576 ntTSL 5 BASIC4.78□□□□□ -1.64
CHRNEQ04844 WDR72-202ENST00000396328 7507 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC4.78□□□□□ -1.64
CHRNEQ04844 TMEM71-202ENST00000377901 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.78□□□□□ -1.64
CHRNEQ04844 SPAM1-203ENST00000402183 1860 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC4.78□□□□□ -1.64
CHRNEQ04844 DLD-204ENST00000437604 1859 ntTSL 2 BASIC4.78□□□□□ -1.64
CHRNEQ04844 RNU6-82P-201ENST00000363970 107 ntBASIC4.78□□□□□ -1.64
CHRNEQ04844 RNU5E-6P-201ENST00000365574 115 ntBASIC4.78□□□□□ -1.64
CHRNEQ04844 SNORA67-201ENST00000384423 137 ntBASIC4.78□□□□□ -1.64
CHRNEQ04844 RNY1P14-201ENST00000384426 108 ntBASIC4.78□□□□□ -1.64
CHRNEQ04844 TRAV16-201ENST00000390444 329 ntAPPRIS P1 BASIC4.78□□□□□ -1.64
CHRNEQ04844 RN7SKP125-201ENST00000410481 302 ntBASIC4.78□□□□□ -1.64
CHRNEQ04844 AL031674.1-202ENST00000413070 465 ntTSL 3 BASIC4.78□□□□□ -1.64
CHRNEQ04844 AC083867.1-201ENST00000413567 457 ntTSL 3 BASIC4.78□□□□□ -1.64
CHRNEQ04844 PDSS1P1-201ENST00000422953 1114 ntBASIC4.78□□□□□ -1.64
CHRNEQ04844 AL080248.1-201ENST00000428954 388 ntTSL 3 BASIC4.78□□□□□ -1.64
CHRNEQ04844 RPL7P28-201ENST00000437739 740 ntBASIC4.78□□□□□ -1.64
CHRNEQ04844 TBX18-AS1-202ENST00000441863 382 ntTSL 2 BASIC4.78□□□□□ -1.64
CHRNEQ04844 GAS5-223ENST00000452197 483 ntTSL 3 BASIC4.78□□□□□ -1.64
CHRNEQ04844 AL354710.1-201ENST00000453641 246 ntBASIC4.78□□□□□ -1.64
CHRNEQ04844 Z92846.1-201ENST00000456203 268 ntBASIC4.78□□□□□ -1.64
CHRNEQ04844 AC046136.1-201ENST00000459855 533 ntTSL 3 BASIC4.78□□□□□ -1.64
CHRNEQ04844 UBA52P7-201ENST00000486088 380 ntBASIC4.78□□□□□ -1.64
CHRNEQ04844 LINC02377-201ENST00000500169 450 ntTSL 3 BASIC4.78□□□□□ -1.64
CHRNEQ04844 AC026780.2-201ENST00000503489 730 ntTSL 5 BASIC4.78□□□□□ -1.64
CHRNEQ04844 AC097473.1-201ENST00000508142 408 ntBASIC4.78□□□□□ -1.64
CHRNEQ04844 RPL37-204ENST00000508493 553 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC4.78□□□□□ -1.64
CHRNEQ04844 RNU6-189P-201ENST00000516120 101 ntBASIC4.78□□□□□ -1.64
CHRNEQ04844 RNU4ATAC7P-201ENST00000516280 125 ntBASIC4.78□□□□□ -1.64
CHRNEQ04844 HTN3-202ENST00000526767 578 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC4.78□□□□□ -1.64
CHRNEQ04844 AL355102.1-201ENST00000555383 460 ntTSL 5 BASIC4.78□□□□□ -1.64
CHRNEQ04844 AC023510.1-201ENST00000555862 490 ntTSL 2 BASIC4.78□□□□□ -1.64
CHRNEQ04844 PWRN1-203ENST00000564898 389 ntTSL 5 BASIC4.78□□□□□ -1.64
CHRNEQ04844 AC090621.1-201ENST00000592121 419 ntTSL 3 BASIC4.78□□□□□ -1.64
CHRNEQ04844 SUMO2P15-201ENST00000604285 278 ntBASIC4.78□□□□□ -1.64
CHRNEQ04844 LINC00310-205ENST00000609062 863 ntTSL 5 BASIC4.78□□□□□ -1.64
CHRNEQ04844 AP001486.3-201ENST00000615334 372 ntBASIC4.78□□□□□ -1.64
CHRNEQ04844 MIR6128-201ENST00000615528 109 ntBASIC4.78□□□□□ -1.64
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 105 ms