Protein–RNA interactions for Protein: P98173

FAM3A, Protein FAM3A, humanhuman

Predictions only

Length 230 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FAM3AP98173 AC026427.2-201ENST00000506228 536 ntBASIC2.36□□□□□ -2.03
FAM3AP98173 CDC42P4-201ENST00000510507 563 ntBASIC2.36□□□□□ -2.03
FAM3AP98173 MEF2C-AS1-208ENST00000512585 741 ntTSL 5 BASIC2.36□□□□□ -2.03
FAM3AP98173 AC021491.3-201ENST00000513378 156 ntTSL 3 BASIC2.36□□□□□ -2.03
FAM3AP98173 RNU6-1095P-201ENST00000516148 108 ntBASIC2.36□□□□□ -2.03
FAM3AP98173 RNU6-751P-201ENST00000516382 101 ntBASIC2.36□□□□□ -2.03
FAM3AP98173 CDKL3-207ENST00000521755 586 ntTSL 5 BASIC2.36□□□□□ -2.03
FAM3AP98173 C8orf22-204ENST00000522267 739 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC2.36□□□□□ -2.03
FAM3AP98173 CLEC2D-214ENST00000543300 399 ntTSL 1 (best) BASIC2.36□□□□□ -2.03
FAM3AP98173 CLEC2D-216ENST00000545918 288 ntTSL 1 (best) BASIC2.36□□□□□ -2.03
FAM3AP98173 OR7K1P-201ENST00000546439 926 ntBASIC2.36□□□□□ -2.03
FAM3AP98173 AC008083.3-201ENST00000547777 329 ntTSL 3 BASIC2.36□□□□□ -2.03
FAM3AP98173 NIFKP8-201ENST00000560500 874 ntBASIC2.36□□□□□ -2.03
FAM3AP98173 AC104229.1-201ENST00000561364 255 ntBASIC2.36□□□□□ -2.03
FAM3AP98173 CYCSP39-201ENST00000565821 309 ntBASIC2.36□□□□□ -2.03
FAM3AP98173 MIR4446-201ENST00000578505 67 ntBASIC2.36□□□□□ -2.03
FAM3AP98173 AC006116.8-203ENST00000587448 465 ntTSL 3 BASIC2.36□□□□□ -2.03
FAM3AP98173 AC130469.1-201ENST00000597256 388 ntTSL 5 BASIC2.36□□□□□ -2.03
FAM3AP98173 LINC01440-205ENST00000608080 737 ntTSL 3 BASIC2.36□□□□□ -2.03
FAM3AP98173 AC245100.7-201ENST00000609678 442 ntBASIC2.36□□□□□ -2.03
FAM3AP98173 CC2D2B-209ENST00000618242 980 ntTSL 5 BASIC2.36□□□□□ -2.03
FAM3AP98173 CR381653.2-201ENST00000624041 768 ntBASIC2.36□□□□□ -2.03
FAM3AP98173 AC092442.1-201ENST00000636216 138 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.36□□□□□ -2.03
FAM3AP98173 FO624990.1-201ENST00000636373 85 ntBASIC2.36□□□□□ -2.03
FAM3AP98173 MFSD8-245ENST00000641743 948 ntBASIC2.36□□□□□ -2.03
FAM3AP98173 ANKRD36BP1-201ENST00000358576 1779 ntBASIC2.36□□□□□ -2.03
FAM3AP98173 RAPGEF6-210ENST00000512052 3535 ntTSL 2 BASIC2.35□□□□□ -2.03
FAM3AP98173 RNU6-115P-201ENST00000364310 107 ntBASIC2.35□□□□□ -2.03
FAM3AP98173 MRRF-203ENST00000373723 1176 ntTSL 3 BASIC2.35□□□□□ -2.03
FAM3AP98173 MIR16-1-201ENST00000385271 89 ntBASIC2.35□□□□□ -2.03
FAM3AP98173 AL024474.1-201ENST00000404655 591 ntBASIC2.35□□□□□ -2.03
FAM3AP98173 AC008173.1-201ENST00000418901 264 ntBASIC2.35□□□□□ -2.03
FAM3AP98173 LINC00407-201ENST00000426509 295 ntTSL 5 BASIC2.35□□□□□ -2.03
FAM3AP98173 SUMO1P4-201ENST00000429430 302 ntBASIC2.35□□□□□ -2.03
FAM3AP98173 AC112220.1-201ENST00000434628 355 ntBASIC2.35□□□□□ -2.03
FAM3AP98173 AC002542.1-201ENST00000440683 193 ntBASIC2.35□□□□□ -2.03
FAM3AP98173 AL135938.1-201ENST00000443141 297 ntBASIC2.35□□□□□ -2.03
FAM3AP98173 RPS3AP12-201ENST00000443616 753 ntBASIC2.35□□□□□ -2.03
FAM3AP98173 IGKV1OR-3-201ENST00000446944 348 ntBASIC2.35□□□□□ -2.03
FAM3AP98173 AL136164.1-201ENST00000456795 352 ntTSL 3 BASIC2.35□□□□□ -2.03
FAM3AP98173 SIDT1-AS1-201ENST00000462180 465 ntTSL 3 BASIC2.35□□□□□ -2.03
FAM3AP98173 AC025181.1-201ENST00000477507 416 ntBASIC2.35□□□□□ -2.03
FAM3AP98173 AC112695.1-201ENST00000504213 592 ntTSL 2 BASIC2.35□□□□□ -2.03
FAM3AP98173 AC006445.2-201ENST00000510061 472 ntBASIC2.35□□□□□ -2.03
FAM3AP98173 AC008716.1-201ENST00000511084 513 ntBASIC2.35□□□□□ -2.03
FAM3AP98173 AC139720.2-201ENST00000514766 440 ntTSL 2 BASIC2.35□□□□□ -2.03
FAM3AP98173 SNORA31.15-201ENST00000516771 132 ntBASIC2.35□□□□□ -2.03
FAM3AP98173 AC104233.2-201ENST00000518922 414 ntTSL 3 BASIC2.35□□□□□ -2.03
FAM3AP98173 AP003102.1-201ENST00000525638 661 ntBASIC2.35□□□□□ -2.03
FAM3AP98173 RGS4-209ENST00000531057 544 ntTSL 4 BASIC2.35□□□□□ -2.03
FAM3AP98173 MGST1-215ENST00000540056 546 ntTSL 3 BASIC2.35□□□□□ -2.03
FAM3AP98173 LINC02328-203ENST00000557195 682 ntTSL 3 BASIC2.35□□□□□ -2.03
FAM3AP98173 AC090607.4-201ENST00000558192 369 ntTSL 3 BASIC2.35□□□□□ -2.03
FAM3AP98173 LINC02126-202ENST00000563754 750 ntTSL 1 (best) BASIC2.35□□□□□ -2.03
FAM3AP98173 AC090506.1-201ENST00000583089 572 ntTSL 4 BASIC2.35□□□□□ -2.03
FAM3AP98173 AC024563.1-202ENST00000597533 419 ntTSL 3 BASIC2.35□□□□□ -2.03
FAM3AP98173 AC098617.1-216ENST00000602099 708 ntTSL 5 BASIC2.35□□□□□ -2.03
FAM3AP98173 AP002826.1-201ENST00000608835 315 ntBASIC2.35□□□□□ -2.03
FAM3AP98173 AC105265.4-201ENST00000618391 306 ntTSL 5 BASIC2.35□□□□□ -2.03
FAM3AP98173 AC010297.1-201ENST00000623948 149 ntBASIC2.35□□□□□ -2.03
FAM3AP98173 AC068880.5-201ENST00000624331 290 ntBASIC2.35□□□□□ -2.03
FAM3AP98173 AC079228.1-201ENST00000624774 1049 ntBASIC2.35□□□□□ -2.03
FAM3AP98173 AL121594.5-201ENST00000631724 573 ntBASIC2.35□□□□□ -2.03
FAM3AP98173 AC073130.1-201ENST00000457033 1958 ntTSL 2 BASIC2.35□□□□□ -2.03
FAM3AP98173 PIK3C2G-202ENST00000433979 4840 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.35□□□□□ -2.03
FAM3AP98173 AP000526.1-201ENST00000603308 1388 ntBASIC2.35□□□□□ -2.03
FAM3AP98173 SLC30A6-202ENST00000357055 4758 ntTSL 2 BASIC2.34□□□□□ -2.03
FAM3AP98173 CACNB4-228ENST00000636598 7808 ntTSL 5 BASIC2.34□□□□□ -2.03
FAM3AP98173 CENPE-201ENST00000265148 8612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.34□□□□□ -2.03
FAM3AP98173 NETO1-202ENST00000397929 1849 ntTSL 1 (best) BASIC2.34□□□□□ -2.03
FAM3AP98173 ASB17-201ENST00000284142 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.34□□□□□ -2.03
FAM3AP98173 RNA5SP387-201ENST00000364226 106 ntBASIC2.34□□□□□ -2.03
FAM3AP98173 DEFB119-202ENST00000376315 324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.34□□□□□ -2.03
FAM3AP98173 TMSB4XP8-201ENST00000402089 135 ntBASIC2.34□□□□□ -2.03
FAM3AP98173 AL138827.1-201ENST00000402666 306 ntBASIC2.34□□□□□ -2.03
FAM3AP98173 AL136372.1-201ENST00000403060 228 ntBASIC2.34□□□□□ -2.03
FAM3AP98173 BCL2L11-207ENST00000405953 425 ntTSL 1 (best) BASIC2.34□□□□□ -2.03
FAM3AP98173 RPS27L-202ENST00000411926 528 ntTSL 3 BASIC2.34□□□□□ -2.03
FAM3AP98173 AL592148.1-201ENST00000413568 445 ntBASIC2.34□□□□□ -2.03
FAM3AP98173 TMSB4XP6-201ENST00000415187 135 ntBASIC2.34□□□□□ -2.03
FAM3AP98173 AL356320.2-201ENST00000417263 507 ntBASIC2.34□□□□□ -2.03
FAM3AP98173 AL354733.1-203ENST00000417672 495 ntTSL 5 BASIC2.34□□□□□ -2.03
FAM3AP98173 AL513175.2-201ENST00000422071 443 ntBASIC2.34□□□□□ -2.03
FAM3AP98173 TMSB4XP1-201ENST00000424567 135 ntBASIC2.34□□□□□ -2.03
FAM3AP98173 AC006946.1-201ENST00000429106 328 ntBASIC2.34□□□□□ -2.03
FAM3AP98173 ZMYM4-AS1-201ENST00000432683 459 ntTSL 2 BASIC2.34□□□□□ -2.03
FAM3AP98173 AC087499.2-201ENST00000432861 149 ntBASIC2.34□□□□□ -2.03
FAM3AP98173 MRPL50P4-201ENST00000446432 475 ntBASIC2.34□□□□□ -2.03
FAM3AP98173 AC010226.1-203ENST00000515570 765 ntTSL 2 BASIC2.34□□□□□ -2.03
FAM3AP98173 SNORA70.16-201ENST00000516390 95 ntBASIC2.34□□□□□ -2.03
FAM3AP98173 HMGB1P41-201ENST00000520234 440 ntBASIC2.34□□□□□ -2.03
FAM3AP98173 AC087272.1-201ENST00000523624 533 ntBASIC2.34□□□□□ -2.03
FAM3AP98173 AC025300.1-201ENST00000526616 384 ntTSL 3 BASIC2.34□□□□□ -2.03
FAM3AP98173 AL133279.1-201ENST00000553487 473 ntTSL 3 BASIC2.34□□□□□ -2.03
FAM3AP98173 AL359238.1-201ENST00000557770 744 ntTSL 3 BASIC2.34□□□□□ -2.03
FAM3AP98173 GTF2IP8-201ENST00000560687 584 ntBASIC2.34□□□□□ -2.03
FAM3AP98173 AC009163.5-201ENST00000575421 637 ntBASIC2.34□□□□□ -2.03
FAM3AP98173 AC015908.2-202ENST00000585243 756 ntTSL 3 BASIC2.34□□□□□ -2.03
FAM3AP98173 AC060766.3-201ENST00000591442 263 ntBASIC2.34□□□□□ -2.03
FAM3AP98173 AC012443.1-201ENST00000605605 231 ntBASIC2.34□□□□□ -2.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 96.8 ms