Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y6Q1

CAPN6, Calpain-6, humanhuman

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Length 641 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CAPN6Q9Y6Q1 AC091979.2-201ENST00000607514 214 ntBASIC5.08□□□□□ -1.6
CAPN6Q9Y6Q1 AL359962.2-201ENST00000610044 303 ntTSL 5 BASIC5.08□□□□□ -1.6
CAPN6Q9Y6Q1 MIR6778-201ENST00000617912 73 ntBASIC5.08□□□□□ -1.6
CAPN6Q9Y6Q1 AC140113.4-201ENST00000622087 222 ntBASIC5.08□□□□□ -1.6
CAPN6Q9Y6Q1 AC011155.2-201ENST00000623202 216 ntBASIC5.08□□□□□ -1.6
CAPN6Q9Y6Q1 AL138828.1-201ENST00000626414 291 ntTSL 5 BASIC5.08□□□□□ -1.6
CAPN6Q9Y6Q1 OR8S1-202ENST00000641651 939 ntAPPRIS P1 BASIC5.08□□□□□ -1.6
CAPN6Q9Y6Q1 CLEC1B-204ENST00000428126 3054 ntTSL 1 (best) BASIC5.08□□□□□ -1.6
CAPN6Q9Y6Q1 LINC02516-201ENST00000563724 1771 ntTSL 2 BASIC5.08□□□□□ -1.6
CAPN6Q9Y6Q1 FAM197Y3-202ENST00000427622 2325 ntTSL 5 BASIC5.08□□□□□ -1.6
CAPN6Q9Y6Q1 FAM197Y7-202ENST00000433321 2325 ntTSL 2 BASIC5.08□□□□□ -1.6
CAPN6Q9Y6Q1 OR6B1-202ENST00000641698 5153 ntAPPRIS P1 BASIC5.08□□□□□ -1.6
CAPN6Q9Y6Q1 DNAH6-202ENST00000389394 12795 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.08□□□□□ -1.6
CAPN6Q9Y6Q1 DCN-201ENST00000052754 7156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.08□□□□□ -1.6
CAPN6Q9Y6Q1 RBMS1-202ENST00000392753 3781 ntTSL 5 BASIC5.08□□□□□ -1.6
CAPN6Q9Y6Q1 EIF2AK3-203ENST00000419748 4222 ntTSL 1 (best) BASIC5.08□□□□□ -1.6
CAPN6Q9Y6Q1 AL049641.1-201ENST00000441055 1948 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
CAPN6Q9Y6Q1 SGMS2-201ENST00000359079 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.07□□□□□ -1.6
CAPN6Q9Y6Q1 PDE4D-205ENST00000360047 3122 ntTSL 1 (best) BASIC5.07□□□□□ -1.6
CAPN6Q9Y6Q1 LINC01630-206ENST00000635103 4292 ntTSL 5 BASIC5.07□□□□□ -1.6
CAPN6Q9Y6Q1 RNA5SP391-201ENST00000363456 119 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
CAPN6Q9Y6Q1 RNA5SP428-201ENST00000365129 132 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
CAPN6Q9Y6Q1 RNA5SP455-201ENST00000365190 119 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
CAPN6Q9Y6Q1 Y_RNA.482-201ENST00000384377 111 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
CAPN6Q9Y6Q1 MIR195-201ENST00000385194 87 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
CAPN6Q9Y6Q1 MT-TG-201ENST00000387429 68 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
CAPN6Q9Y6Q1 UBE2V1P2-201ENST00000397758 440 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
CAPN6Q9Y6Q1 AL139397.2-201ENST00000404529 772 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
CAPN6Q9Y6Q1 VDAC1P9-201ENST00000412766 841 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
CAPN6Q9Y6Q1 AL591848.1-201ENST00000413092 322 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
CAPN6Q9Y6Q1 AL358176.3-201ENST00000420757 454 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
CAPN6Q9Y6Q1 AL645608.4-201ENST00000423619 154 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
CAPN6Q9Y6Q1 CBX3P6-201ENST00000430257 527 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
CAPN6Q9Y6Q1 FTLP19-201ENST00000433300 394 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
CAPN6Q9Y6Q1 AC092813.2-201ENST00000434540 399 ntTSL 3 BASIC5.07□□□□□ -1.6
CAPN6Q9Y6Q1 AC093414.1-201ENST00000434712 514 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
CAPN6Q9Y6Q1 AL451139.1-201ENST00000434718 346 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
CAPN6Q9Y6Q1 LINC01754-201ENST00000437920 750 ntTSL 3 BASIC5.07□□□□□ -1.6
CAPN6Q9Y6Q1 AL591501.1-201ENST00000439992 495 ntTSL 5 BASIC5.07□□□□□ -1.6
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CAPN6Q9Y6Q1 RNU7-59P-201ENST00000459101 61 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
CAPN6Q9Y6Q1 MIR2053-201ENST00000459295 91 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
CAPN6Q9Y6Q1 AC022795.1-201ENST00000473808 480 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
CAPN6Q9Y6Q1 BX284632.1-201ENST00000478218 541 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
CAPN6Q9Y6Q1 RPL7P43-201ENST00000478876 753 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
CAPN6Q9Y6Q1 AL136038.1-201ENST00000497246 351 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
CAPN6Q9Y6Q1 AC104304.1-201ENST00000505797 291 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.07□□□□□ -1.6
CAPN6Q9Y6Q1 LINC02200-202ENST00000508879 615 ntTSL 3 BASIC5.07□□□□□ -1.6
CAPN6Q9Y6Q1 RPS27AP18-201ENST00000515536 459 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
CAPN6Q9Y6Q1 RANP9-201ENST00000519957 271 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
CAPN6Q9Y6Q1 AP005357.1-201ENST00000520749 476 ntTSL 3 BASIC5.07□□□□□ -1.6
CAPN6Q9Y6Q1 AC021698.1-201ENST00000524858 716 ntTSL 3 BASIC5.07□□□□□ -1.6
CAPN6Q9Y6Q1 OR5M1-201ENST00000526538 948 ntAPPRIS P1 BASIC5.07□□□□□ -1.6
CAPN6Q9Y6Q1 AL137161.1-201ENST00000532231 390 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
CAPN6Q9Y6Q1 AL358913.1-201ENST00000554342 121 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
CAPN6Q9Y6Q1 AC012100.2-201ENST00000558317 304 ntTSL 5 BASIC5.07□□□□□ -1.6
CAPN6Q9Y6Q1 EAF1-AS1-207ENST00000599742 772 ntTSL 5 BASIC5.07□□□□□ -1.6
CAPN6Q9Y6Q1 AC003973.1-201ENST00000600071 546 ntTSL 4 BASIC5.07□□□□□ -1.6
CAPN6Q9Y6Q1 AC104662.1-201ENST00000604448 511 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
CAPN6Q9Y6Q1 AP001486.3-201ENST00000615334 372 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
CAPN6Q9Y6Q1 AC073172.1-201ENST00000636967 851 ntTSL 5 BASIC5.07□□□□□ -1.6
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CAPN6Q9Y6Q1 AL596275.2-206ENST00000641957 626 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
CAPN6Q9Y6Q1 KCTD16-201ENST00000507359 13950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.07□□□□□ -1.6
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CAPN6Q9Y6Q1 STIL-204ENST00000396221 4558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.07□□□□□ -1.6
CAPN6Q9Y6Q1 VPS13D-213ENST00000613099 16245 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC5.07□□□□□ -1.6
CAPN6Q9Y6Q1 ZNF681-201ENST00000402377 6497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.07□□□□□ -1.6
CAPN6Q9Y6Q1 FAM111A-201ENST00000361723 3592 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.07□□□□□ -1.6
CAPN6Q9Y6Q1 AC092079.1-201ENST00000558620 1985 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
CAPN6Q9Y6Q1 POSTN-210ENST00000541481 3113 ntTSL 1 (best) BASIC5.07□□□□□ -1.6
CAPN6Q9Y6Q1 POU2F1-202ENST00000367862 14038 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.07□□□□□ -1.6
CAPN6Q9Y6Q1 CCNT2-201ENST00000264157 6917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.07□□□□□ -1.6
CAPN6Q9Y6Q1 TMEM154-201ENST00000304385 10698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.07□□□□□ -1.6
CAPN6Q9Y6Q1 SPAM1-203ENST00000402183 1860 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC5.07□□□□□ -1.6
CAPN6Q9Y6Q1 DNAJC9-AS1-204ENST00000440197 2865 ntTSL 1 (best) BASIC5.06□□□□□ -1.6
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CAPN6Q9Y6Q1 IPO11-203ENST00000409534 1725 ntTSL 2 BASIC5.06□□□□□ -1.6
CAPN6Q9Y6Q1 FCHO2-207ENST00000512348 2700 ntTSL 2 BASIC5.06□□□□□ -1.6
CAPN6Q9Y6Q1 HYKK-206ENST00000569878 4097 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.06□□□□□ -1.6
CAPN6Q9Y6Q1 LRRC77P-206ENST00000481578 2350 ntTSL 1 (best) BASIC5.06□□□□□ -1.6
CAPN6Q9Y6Q1 ROBO2-213ENST00000614793 7662 ntTSL 5 BASIC5.06□□□□□ -1.6
CAPN6Q9Y6Q1 DEFB107A-201ENST00000335021 389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.06□□□□□ -1.6
CAPN6Q9Y6Q1 DEFB107B-201ENST00000355602 389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.06□□□□□ -1.6
CAPN6Q9Y6Q1 RNU6-82P-201ENST00000363970 107 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
CAPN6Q9Y6Q1 HEATR1-201ENST00000366579 793 ntTSL 2 BASIC5.06□□□□□ -1.6
CAPN6Q9Y6Q1 RNU6-601P-201ENST00000384540 107 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
CAPN6Q9Y6Q1 AL136372.1-201ENST00000403060 228 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
CAPN6Q9Y6Q1 OR3A2-201ENST00000408891 1076 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
CAPN6Q9Y6Q1 SRGAP3-AS1-201ENST00000414633 428 ntTSL 2 BASIC5.06□□□□□ -1.6
CAPN6Q9Y6Q1 AL356134.1-201ENST00000419815 373 ntTSL 3 BASIC5.06□□□□□ -1.6
CAPN6Q9Y6Q1 RPS17P8-201ENST00000434525 335 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
CAPN6Q9Y6Q1 IKZF2-209ENST00000442445 551 ntTSL 5 BASIC5.06□□□□□ -1.6
CAPN6Q9Y6Q1 AL080313.2-201ENST00000456440 489 ntTSL 3 BASIC5.06□□□□□ -1.6
CAPN6Q9Y6Q1 RPL23AP56-201ENST00000460778 453 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
CAPN6Q9Y6Q1 MTATP8P1-201ENST00000467115 207 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
CAPN6Q9Y6Q1 RN7SL817P-201ENST00000480777 288 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
CAPN6Q9Y6Q1 MTND4LP22-201ENST00000508209 276 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
CAPN6Q9Y6Q1 SSX6-203ENST00000509958 336 ntTSL 3 BASIC5.06□□□□□ -1.6
CAPN6Q9Y6Q1 AC021146.3-201ENST00000511911 260 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
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