Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y3L3

SH3BP1, SH3 domain-binding protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 701 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SH3BP1Q9Y3L3 AC034234.1-201ENST00000502993 465 ntTSL 3 BASIC4.71□□□□□ -1.66
SH3BP1Q9Y3L3 AP002075.1-201ENST00000505091 603 ntTSL 3 BASIC4.71□□□□□ -1.66
SH3BP1Q9Y3L3 AC097521.1-201ENST00000505488 567 ntTSL 3 BASIC4.71□□□□□ -1.66
SH3BP1Q9Y3L3 MTCO3P9-201ENST00000506989 781 ntBASIC4.71□□□□□ -1.66
SH3BP1Q9Y3L3 AC018437.2-201ENST00000517369 389 ntTSL 5 BASIC4.71□□□□□ -1.66
SH3BP1Q9Y3L3 AP001330.2-201ENST00000523121 979 ntTSL 2 BASIC4.71□□□□□ -1.66
SH3BP1Q9Y3L3 LINC01495-202ENST00000534135 343 ntTSL 2 BASIC4.71□□□□□ -1.66
SH3BP1Q9Y3L3 AC125611.2-201ENST00000551907 647 ntBASIC4.71□□□□□ -1.66
SH3BP1Q9Y3L3 PARP1P2-201ENST00000556806 195 ntBASIC4.71□□□□□ -1.66
SH3BP1Q9Y3L3 NUDT7-203ENST00000563839 316 ntTSL 3 BASIC4.71□□□□□ -1.66
SH3BP1Q9Y3L3 AC003009.1-201ENST00000571611 686 ntTSL 3 BASIC4.71□□□□□ -1.66
SH3BP1Q9Y3L3 ZEB2-AS1-204ENST00000595109 855 ntTSL 5 BASIC4.71□□□□□ -1.66
SH3BP1Q9Y3L3 5S_rRNA.16-201ENST00000612928 119 ntBASIC4.71□□□□□ -1.66
SH3BP1Q9Y3L3 TMBIM4-213ENST00000613669 851 ntTSL 5 BASIC4.71□□□□□ -1.66
SH3BP1Q9Y3L3 AC244472.2-201ENST00000617639 406 ntAPPRIS P1 BASIC4.71□□□□□ -1.66
SH3BP1Q9Y3L3 AC006504.8-201ENST00000621046 635 ntBASIC4.71□□□□□ -1.66
SH3BP1Q9Y3L3 ZNF33CP-201ENST00000432492 2030 ntBASIC4.71□□□□□ -1.66
SH3BP1Q9Y3L3 MAPK10-253ENST00000641010 4072 ntBASIC4.71□□□□□ -1.66
SH3BP1Q9Y3L3 ZNF33BP1-201ENST00000452497 1834 ntBASIC4.71□□□□□ -1.66
SH3BP1Q9Y3L3 NUP205-201ENST00000285968 6266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.71□□□□□ -1.66
SH3BP1Q9Y3L3 AC139713.2-215ENST00000641428 5037 ntBASIC4.71□□□□□ -1.66
SH3BP1Q9Y3L3 SEC31A-215ENST00000505472 4159 ntTSL 5 BASIC4.71□□□□□ -1.66
SH3BP1Q9Y3L3 IFT80-220ENST00000483465 4044 ntTSL 1 (best) BASIC4.7□□□□□ -1.66
SH3BP1Q9Y3L3 RAPH1-203ENST00000374493 3909 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.7□□□□□ -1.66
SH3BP1Q9Y3L3 LGI1-228ENST00000637689 1802 ntTSL 5 BASIC4.7□□□□□ -1.66
SH3BP1Q9Y3L3 PPIP5K2-215ENST00000613674 4933 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC4.7□□□□□ -1.66
SH3BP1Q9Y3L3 MUCL1-201ENST00000308796 470 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC4.7□□□□□ -1.66
SH3BP1Q9Y3L3 Y_RNA.72-201ENST00000362894 103 ntBASIC4.7□□□□□ -1.66
SH3BP1Q9Y3L3 Y_RNA.159-201ENST00000363674 87 ntBASIC4.7□□□□□ -1.66
SH3BP1Q9Y3L3 RNY3P3-201ENST00000363816 102 ntBASIC4.7□□□□□ -1.66
SH3BP1Q9Y3L3 RNU6-1322P-201ENST00000364309 107 ntBASIC4.7□□□□□ -1.66
SH3BP1Q9Y3L3 SNORA70.2-201ENST00000364506 135 ntBASIC4.7□□□□□ -1.66
SH3BP1Q9Y3L3 RNU6-282P-201ENST00000365357 103 ntBASIC4.7□□□□□ -1.66
SH3BP1Q9Y3L3 U1.1-201ENST00000384101 164 ntBASIC4.7□□□□□ -1.66
SH3BP1Q9Y3L3 TRAV21-201ENST00000390449 343 ntAPPRIS P1 BASIC4.7□□□□□ -1.66
SH3BP1Q9Y3L3 RPL7P25-201ENST00000404151 721 ntBASIC4.7□□□□□ -1.66
SH3BP1Q9Y3L3 MEIG1-202ENST00000407572 625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.7□□□□□ -1.66
SH3BP1Q9Y3L3 RPL31-205ENST00000409320 716 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC4.7□□□□□ -1.66
SH3BP1Q9Y3L3 RNU2-37P-201ENST00000410695 177 ntBASIC4.7□□□□□ -1.66
SH3BP1Q9Y3L3 RNU2-8P-201ENST00000410727 190 ntBASIC4.7□□□□□ -1.66
SH3BP1Q9Y3L3 FAM230B-202ENST00000415704 396 ntTSL 3 BASIC4.7□□□□□ -1.66
SH3BP1Q9Y3L3 AC007390.1-201ENST00000415722 356 ntBASIC4.7□□□□□ -1.66
SH3BP1Q9Y3L3 LINC01341-201ENST00000419361 552 ntTSL 2 BASIC4.7□□□□□ -1.66
SH3BP1Q9Y3L3 AC112518.1-201ENST00000436089 575 ntTSL 4 BASIC4.7□□□□□ -1.66
SH3BP1Q9Y3L3 AC004485.1-201ENST00000439839 527 ntTSL 5 BASIC4.7□□□□□ -1.66
SH3BP1Q9Y3L3 AL162386.2-201ENST00000442428 457 ntTSL 3 BASIC4.7□□□□□ -1.66
SH3BP1Q9Y3L3 RPL21P133-201ENST00000443666 476 ntBASIC4.7□□□□□ -1.66
SH3BP1Q9Y3L3 AC007677.1-201ENST00000445757 515 ntBASIC4.7□□□□□ -1.66
SH3BP1Q9Y3L3 RPL31P50-201ENST00000471002 296 ntBASIC4.7□□□□□ -1.66
SH3BP1Q9Y3L3 PLCH1-AS2-201ENST00000472913 408 ntTSL 2 BASIC4.7□□□□□ -1.66
SH3BP1Q9Y3L3 HMGN1P10-201ENST00000474557 553 ntBASIC4.7□□□□□ -1.66
SH3BP1Q9Y3L3 AC078785.3-201ENST00000476607 425 ntBASIC4.7□□□□□ -1.66
SH3BP1Q9Y3L3 RPL36AP51-201ENST00000487216 318 ntBASIC4.7□□□□□ -1.66
SH3BP1Q9Y3L3 AC023194.1-201ENST00000493084 308 ntBASIC4.7□□□□□ -1.66
SH3BP1Q9Y3L3 EIF4E-208ENST00000505992 898 ntTSL 5 BASIC4.7□□□□□ -1.66
SH3BP1Q9Y3L3 Y_RNA.675-201ENST00000516389 149 ntBASIC4.7□□□□□ -1.66
SH3BP1Q9Y3L3 RNU2-58P-201ENST00000516403 183 ntBASIC4.7□□□□□ -1.66
SH3BP1Q9Y3L3 AC104986.1-201ENST00000517978 436 ntBASIC4.7□□□□□ -1.66
SH3BP1Q9Y3L3 AC068880.2-201ENST00000521016 362 ntTSL 5 BASIC4.7□□□□□ -1.66
SH3BP1Q9Y3L3 COX6CP8-201ENST00000522620 226 ntBASIC4.7□□□□□ -1.66
SH3BP1Q9Y3L3 HSPA8P13-201ENST00000523715 472 ntBASIC4.7□□□□□ -1.66
SH3BP1Q9Y3L3 AP000827.1-201ENST00000527814 258 ntBASIC4.7□□□□□ -1.66
SH3BP1Q9Y3L3 AP006287.2-201ENST00000529036 502 ntTSL 2 BASIC4.7□□□□□ -1.66
SH3BP1Q9Y3L3 LINC02384-208ENST00000546086 565 ntTSL 3 BASIC4.7□□□□□ -1.66
SH3BP1Q9Y3L3 AC068643.2-202ENST00000552759 622 ntTSL 3 BASIC4.7□□□□□ -1.66
SH3BP1Q9Y3L3 HIF1AP1-201ENST00000553642 175 ntBASIC4.7□□□□□ -1.66
SH3BP1Q9Y3L3 AC068831.4-201ENST00000556118 109 ntBASIC4.7□□□□□ -1.66
SH3BP1Q9Y3L3 ZNF192P1-203ENST00000565888 810 ntBASIC4.7□□□□□ -1.66
SH3BP1Q9Y3L3 AC090844.2-203ENST00000582263 632 ntTSL 5 BASIC4.7□□□□□ -1.66
SH3BP1Q9Y3L3 AC118757.1-201ENST00000586982 453 ntTSL 2 BASIC4.7□□□□□ -1.66
SH3BP1Q9Y3L3 LINC01533-202ENST00000588694 632 ntTSL 2 BASIC4.7□□□□□ -1.66
SH3BP1Q9Y3L3 AC007621.1-201ENST00000604544 437 ntBASIC4.7□□□□□ -1.66
SH3BP1Q9Y3L3 MIR98-201ENST00000606724 119 ntBASIC4.7□□□□□ -1.66
SH3BP1Q9Y3L3 AC135507.2-201ENST00000612443 309 ntBASIC4.7□□□□□ -1.66
SH3BP1Q9Y3L3 KIAA1524-208ENST00000625495 147 ntTSL 5 BASIC4.7□□□□□ -1.66
SH3BP1Q9Y3L3 MIR6830-201ENST00000636015 70 ntBASIC4.7□□□□□ -1.66
SH3BP1Q9Y3L3 LYST-201ENST00000389793 13480 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.7□□□□□ -1.66
SH3BP1Q9Y3L3 CEP152-203ENST00000399334 5097 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.7□□□□□ -1.66
SH3BP1Q9Y3L3 RTKN2-201ENST00000315289 2383 ntTSL 2 BASIC4.7□□□□□ -1.66
SH3BP1Q9Y3L3 EEF1A1P42-201ENST00000613436 1331 ntBASIC4.7□□□□□ -1.66
SH3BP1Q9Y3L3 RIMS1-204ENST00000401910 3542 ntTSL 2 BASIC4.69□□□□□ -1.66
SH3BP1Q9Y3L3 WDR49-201ENST00000308378 2594 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC4.69□□□□□ -1.66
SH3BP1Q9Y3L3 AC024560.2-201ENST00000507981 1497 ntBASIC4.69□□□□□ -1.66
SH3BP1Q9Y3L3 THOC2-202ENST00000355725 4930 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.69□□□□□ -1.66
SH3BP1Q9Y3L3 ANK3-202ENST00000355288 3811 ntTSL 1 (best) BASIC4.69□□□□□ -1.66
SH3BP1Q9Y3L3 BCLAF1-207ENST00000527759 4373 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.69□□□□□ -1.66
SH3BP1Q9Y3L3 CUL2-201ENST00000374746 3903 ntTSL 5 BASIC4.69□□□□□ -1.66
SH3BP1Q9Y3L3 API5-210ENST00000534600 1760 ntTSL 5 BASIC4.69□□□□□ -1.66
SH3BP1Q9Y3L3 RPL23AP57-201ENST00000332361 466 ntBASIC4.69□□□□□ -1.66
SH3BP1Q9Y3L3 IL18R1-202ENST00000334376 537 ntTSL 1 (best) BASIC4.69□□□□□ -1.66
SH3BP1Q9Y3L3 Y_RNA.46-201ENST00000362695 102 ntBASIC4.69□□□□□ -1.66
SH3BP1Q9Y3L3 Y_RNA.86-201ENST00000363020 111 ntBASIC4.69□□□□□ -1.66
SH3BP1Q9Y3L3 Y_RNA.548-201ENST00000384656 105 ntBASIC4.69□□□□□ -1.66
SH3BP1Q9Y3L3 SNORD96B-201ENST00000386148 79 ntBASIC4.69□□□□□ -1.66
SH3BP1Q9Y3L3 LIPN-201ENST00000404459 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.69□□□□□ -1.66
SH3BP1Q9Y3L3 FAT1P1-201ENST00000406588 507 ntBASIC4.69□□□□□ -1.66
SH3BP1Q9Y3L3 RNA5SP118-201ENST00000410385 109 ntBASIC4.69□□□□□ -1.66
SH3BP1Q9Y3L3 AL359704.1-201ENST00000411586 781 ntBASIC4.69□□□□□ -1.66
SH3BP1Q9Y3L3 TMSB10P2-201ENST00000416049 131 ntBASIC4.69□□□□□ -1.66
SH3BP1Q9Y3L3 AL161935.1-201ENST00000420945 421 ntTSL 3 BASIC4.69□□□□□ -1.66
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 88.7 ms