Protein–RNA interactions for Protein: Q9UPQ4

TRIM35, Tripartite motif-containing protein 35, humanhuman

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Length 493 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIM35Q9UPQ4 OR2H1-201ENST00000377132 2253 ntAPPRIS P1 BASIC7.45□□□□□ -1.22
TRIM35Q9UPQ4 ZNF92-203ENST00000431504 2947 ntTSL 1 (best) BASIC7.45□□□□□ -1.22
TRIM35Q9UPQ4 CNGA1-203ENST00000420489 2746 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC7.45□□□□□ -1.22
TRIM35Q9UPQ4 RIMKLB-207ENST00000538135 5392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.45□□□□□ -1.22
TRIM35Q9UPQ4 MAPK10-370ENST00000641943 4117 ntAPPRIS P2 BASIC7.45□□□□□ -1.22
TRIM35Q9UPQ4 TTC6-201ENST00000267368 1681 ntTSL 5 BASIC7.45□□□□□ -1.22
TRIM35Q9UPQ4 OMG-201ENST00000247271 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.45□□□□□ -1.22
TRIM35Q9UPQ4 NSD3-206ENST00000527502 4471 ntTSL 1 (best) BASIC7.45□□□□□ -1.22
TRIM35Q9UPQ4 AGBL4-201ENST00000334103 881 ntTSL 5 BASIC7.45□□□□□ -1.22
TRIM35Q9UPQ4 RN7SKP69-201ENST00000365390 305 ntBASIC7.45□□□□□ -1.22
TRIM35Q9UPQ4 RNU6-514P-201ENST00000384208 107 ntBASIC7.45□□□□□ -1.22
TRIM35Q9UPQ4 Y_RNA.569-201ENST00000384749 103 ntBASIC7.45□□□□□ -1.22
TRIM35Q9UPQ4 Y_RNA.623-201ENST00000411128 95 ntBASIC7.45□□□□□ -1.22
TRIM35Q9UPQ4 NME1P1-201ENST00000420914 382 ntBASIC7.45□□□□□ -1.22
TRIM35Q9UPQ4 CHEK2P5-201ENST00000423877 246 ntBASIC7.45□□□□□ -1.22
TRIM35Q9UPQ4 RPL12P16-201ENST00000431098 498 ntBASIC7.45□□□□□ -1.22
TRIM35Q9UPQ4 EEF1B2P6-201ENST00000445713 673 ntBASIC7.45□□□□□ -1.22
TRIM35Q9UPQ4 AL353691.1-201ENST00000451332 387 ntBASIC7.45□□□□□ -1.22
TRIM35Q9UPQ4 AL022329.1-203ENST00000453811 451 ntTSL 3 BASIC7.45□□□□□ -1.22
TRIM35Q9UPQ4 RN7SL72P-201ENST00000460697 269 ntBASIC7.45□□□□□ -1.22
TRIM35Q9UPQ4 RNU4ATAC15P-201ENST00000516415 126 ntBASIC7.45□□□□□ -1.22
TRIM35Q9UPQ4 AC099520.1-208ENST00000518276 472 ntTSL 3 BASIC7.45□□□□□ -1.22
TRIM35Q9UPQ4 LDHC-203ENST00000535809 757 ntTSL 5 BASIC7.45□□□□□ -1.22
TRIM35Q9UPQ4 LINC02442-202ENST00000540761 382 ntTSL 2 BASIC7.45□□□□□ -1.22
TRIM35Q9UPQ4 TRPT1-216ENST00000546133 382 ntTSL 2 BASIC7.45□□□□□ -1.22
TRIM35Q9UPQ4 AC003687.1-201ENST00000578040 427 ntTSL 3 BASIC7.45□□□□□ -1.22
TRIM35Q9UPQ4 BRDTP1-201ENST00000605735 677 ntBASIC7.45□□□□□ -1.22
TRIM35Q9UPQ4 SNORD113-5-201ENST00000607261 78 ntBASIC7.45□□□□□ -1.22
TRIM35Q9UPQ4 TANC2-202ENST00000424789 11721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.45□□□□□ -1.22
TRIM35Q9UPQ4 ENTPD1-201ENST00000371205 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.45□□□□□ -1.22
TRIM35Q9UPQ4 PTPRD-206ENST00000397617 8248 ntTSL 5 BASIC7.45□□□□□ -1.22
TRIM35Q9UPQ4 NLRP8-201ENST00000291971 3934 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.45□□□□□ -1.22
TRIM35Q9UPQ4 ZNF227-208ENST00000589005 2943 ntTSL 2 BASIC7.45□□□□□ -1.22
TRIM35Q9UPQ4 TLR2-201ENST00000260010 4200 ntAPPRIS P1 BASIC7.44□□□□□ -1.22
TRIM35Q9UPQ4 AC245100.2-201ENST00000454544 1679 ntBASIC7.44□□□□□ -1.22
TRIM35Q9UPQ4 BDNF-211ENST00000439476 4532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.44□□□□□ -1.22
TRIM35Q9UPQ4 LMOD3-201ENST00000420581 4086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.44□□□□□ -1.22
TRIM35Q9UPQ4 MKL2-202ENST00000571589 8799 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC7.44□□□□□ -1.22
TRIM35Q9UPQ4 STK3-216ENST00000523601 3107 ntTSL 2 BASIC7.44□□□□□ -1.22
TRIM35Q9UPQ4 AC116667.1-201ENST00000604855 2072 ntBASIC7.44□□□□□ -1.22
TRIM35Q9UPQ4 TTI1-203ENST00000449821 3791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.44□□□□□ -1.22
TRIM35Q9UPQ4 Y_RNA.357-201ENST00000365487 109 ntBASIC7.44□□□□□ -1.22
TRIM35Q9UPQ4 RNU6-1289P-201ENST00000384431 106 ntBASIC7.44□□□□□ -1.22
TRIM35Q9UPQ4 SNORD78.2-201ENST00000391076 69 ntBASIC7.44□□□□□ -1.22
TRIM35Q9UPQ4 MIR190B-201ENST00000401119 79 ntBASIC7.44□□□□□ -1.22
TRIM35Q9UPQ4 OOSP1P1-201ENST00000423265 274 ntBASIC7.44□□□□□ -1.22
TRIM35Q9UPQ4 AC092573.2-201ENST00000434546 243 ntBASIC7.44□□□□□ -1.22
TRIM35Q9UPQ4 AL391987.1-201ENST00000441025 200 ntBASIC7.44□□□□□ -1.22
TRIM35Q9UPQ4 AL357134.1-201ENST00000445848 426 ntBASIC7.44□□□□□ -1.22
TRIM35Q9UPQ4 RPS17P13-201ENST00000448974 407 ntBASIC7.44□□□□□ -1.22
TRIM35Q9UPQ4 AC023141.9-201ENST00000458734 412 ntBASIC7.44□□□□□ -1.22
TRIM35Q9UPQ4 AC092440.1-201ENST00000512563 571 ntTSL 4 BASIC7.44□□□□□ -1.22
TRIM35Q9UPQ4 Y_RNA.689-201ENST00000516589 107 ntBASIC7.44□□□□□ -1.22
TRIM35Q9UPQ4 LECT2-205ENST00000522943 574 ntTSL 3 BASIC7.44□□□□□ -1.22
TRIM35Q9UPQ4 AC011363.1-201ENST00000524198 458 ntTSL 5 BASIC7.44□□□□□ -1.22
TRIM35Q9UPQ4 LINC02186-201ENST00000575767 885 ntTSL 1 (best) BASIC7.44□□□□□ -1.22
TRIM35Q9UPQ4 AC007922.3-201ENST00000581648 543 ntTSL 3 BASIC7.44□□□□□ -1.22
TRIM35Q9UPQ4 AC115085.1-201ENST00000588924 229 ntBASIC7.44□□□□□ -1.22
TRIM35Q9UPQ4 BDH2P1-201ENST00000602288 736 ntBASIC7.44□□□□□ -1.22
TRIM35Q9UPQ4 HCG18-243ENST00000602498 327 ntTSL 3 BASIC7.44□□□□□ -1.22
TRIM35Q9UPQ4 AC105265.4-201ENST00000618391 306 ntTSL 5 BASIC7.44□□□□□ -1.22
TRIM35Q9UPQ4 AC007998.5-201ENST00000622938 237 ntBASIC7.44□□□□□ -1.22
TRIM35Q9UPQ4 NCBP1-205ENST00000629069 249 ntTSL 5 BASIC7.44□□□□□ -1.22
TRIM35Q9UPQ4 AL592430.2-201ENST00000633779 486 ntTSL 5 BASIC7.44□□□□□ -1.22
TRIM35Q9UPQ4 ZC3H11A-202ENST00000367210 5877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.44□□□□□ -1.22
TRIM35Q9UPQ4 SIAH1-202ENST00000380006 3352 ntAPPRIS P3 BASIC7.44□□□□□ -1.22
TRIM35Q9UPQ4 PCNX4-201ENST00000317623 17339 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC7.44□□□□□ -1.22
TRIM35Q9UPQ4 DLG1-213ENST00000443183 2516 ntTSL 2 BASIC7.44□□□□□ -1.22
TRIM35Q9UPQ4 SLMAP-208ENST00000449503 4027 ntTSL 1 (best) BASIC7.44□□□□□ -1.22
TRIM35Q9UPQ4 ADAM29-202ENST00000404450 3171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.44□□□□□ -1.22
TRIM35Q9UPQ4 ZNF253-203ENST00000589717 3519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.44□□□□□ -1.22
TRIM35Q9UPQ4 RAD17P1-201ENST00000418130 2042 ntBASIC7.44□□□□□ -1.22
TRIM35Q9UPQ4 LAMA2-201ENST00000421865 9640 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC7.43□□□□□ -1.22
TRIM35Q9UPQ4 MR1-209ENST00000617803 7584 ntTSL 5 BASIC7.43□□□□□ -1.22
TRIM35Q9UPQ4 PTPRZ1-202ENST00000449182 4627 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.43□□□□□ -1.22
TRIM35Q9UPQ4 NBPF11-204ENST00000614785 4343 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.43□□□□□ -1.22
TRIM35Q9UPQ4 NHS-202ENST00000398097 8213 ntTSL 1 (best) BASIC7.43□□□□□ -1.22
TRIM35Q9UPQ4 LEPR-208ENST00000616738 5081 ntTSL 1 (best) BASIC7.43□□□□□ -1.22
TRIM35Q9UPQ4 Y_RNA.262-201ENST00000364641 102 ntBASIC7.43□□□□□ -1.22
TRIM35Q9UPQ4 RN7SKP81-201ENST00000365603 331 ntBASIC7.43□□□□□ -1.22
TRIM35Q9UPQ4 MIR323B-201ENST00000385269 82 ntBASIC7.43□□□□□ -1.22
TRIM35Q9UPQ4 AL022722.2-201ENST00000402519 180 ntBASIC7.43□□□□□ -1.22
TRIM35Q9UPQ4 RNU6-516P-201ENST00000411381 104 ntBASIC7.43□□□□□ -1.22
TRIM35Q9UPQ4 CBX1P3-201ENST00000413296 527 ntBASIC7.43□□□□□ -1.22
TRIM35Q9UPQ4 AL021153.1-201ENST00000427360 308 ntTSL 3 BASIC7.43□□□□□ -1.22
TRIM35Q9UPQ4 PTMAP6-201ENST00000439110 327 ntBASIC7.43□□□□□ -1.22
TRIM35Q9UPQ4 AC114814.3-201ENST00000449362 663 ntTSL 2 BASIC7.43□□□□□ -1.22
TRIM35Q9UPQ4 RPS11P1-201ENST00000451072 473 ntBASIC7.43□□□□□ -1.22
TRIM35Q9UPQ4 AL136126.1-201ENST00000473603 402 ntBASIC7.43□□□□□ -1.22
TRIM35Q9UPQ4 CLEC19A-204ENST00000493231 557 ntTSL 3 BASIC7.43□□□□□ -1.22
TRIM35Q9UPQ4 AC005726.1-201ENST00000494679 427 ntBASIC7.43□□□□□ -1.22
TRIM35Q9UPQ4 AC108043.1-201ENST00000512696 574 ntBASIC7.43□□□□□ -1.22
TRIM35Q9UPQ4 SNORD95-201ENST00000579879 68 ntBASIC7.43□□□□□ -1.22
TRIM35Q9UPQ4 MIR4659A-201ENST00000580269 81 ntBASIC7.43□□□□□ -1.22
TRIM35Q9UPQ4 ZNF667-AS1-207ENST00000592146 668 ntTSL 5 BASIC7.43□□□□□ -1.22
TRIM35Q9UPQ4 AC174048.1-201ENST00000603389 144 ntBASIC7.43□□□□□ -1.22
TRIM35Q9UPQ4 AL049539.1-201ENST00000611964 459 ntBASIC7.43□□□□□ -1.22
TRIM35Q9UPQ4 MIR6862-1-201ENST00000613016 70 ntBASIC7.43□□□□□ -1.22
TRIM35Q9UPQ4 MIR6862-2-201ENST00000614755 70 ntBASIC7.43□□□□□ -1.22
TRIM35Q9UPQ4 SNHG22-203ENST00000617833 660 ntBASIC7.43□□□□□ -1.22
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