Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZT12

UBR3, E3 ubiquitin-protein ligase UBR3, humanhuman

Predictions only

Length 1,888 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBR3Q6ZT12 SATB1-AS1-266ENST00000630271 813 ntTSL 5 BASIC2.3□□□□□ -2.04
UBR3Q6ZT12 MIR4278-201ENST00000636094 69 ntBASIC2.3□□□□□ -2.04
UBR3Q6ZT12 AL139811.1-201ENST00000424779 2299 ntBASIC2.29□□□□□ -2.04
UBR3Q6ZT12 CATSPERB-201ENST00000256343 3623 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC2.29□□□□□ -2.04
UBR3Q6ZT12 NDUFAF4-201ENST00000316149 2399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.29□□□□□ -2.04
UBR3Q6ZT12 SET-203ENST00000372688 801 ntTSL 2 BASIC2.29□□□□□ -2.04
UBR3Q6ZT12 Y_RNA.540-201ENST00000384638 111 ntBASIC2.29□□□□□ -2.04
UBR3Q6ZT12 HMGB1P13-201ENST00000406019 642 ntBASIC2.29□□□□□ -2.04
UBR3Q6ZT12 MIR1323-201ENST00000408090 73 ntBASIC2.29□□□□□ -2.04
UBR3Q6ZT12 PGAP1-203ENST00000409188 1246 ntTSL 2 BASIC2.29□□□□□ -2.04
UBR3Q6ZT12 RNU2-20P-201ENST00000410425 191 ntBASIC2.29□□□□□ -2.04
UBR3Q6ZT12 AC093151.3-203ENST00000422305 514 ntTSL 3 BASIC2.29□□□□□ -2.04
UBR3Q6ZT12 AC027124.2-201ENST00000428249 105 ntBASIC2.29□□□□□ -2.04
UBR3Q6ZT12 RPL39L-202ENST00000433055 749 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.29□□□□□ -2.04
UBR3Q6ZT12 LINC00529-201ENST00000443854 241 ntTSL 2 BASIC2.29□□□□□ -2.04
UBR3Q6ZT12 SNRPGP3-201ENST00000469405 227 ntBASIC2.29□□□□□ -2.04
UBR3Q6ZT12 TMEM248P1-201ENST00000510579 951 ntBASIC2.29□□□□□ -2.04
UBR3Q6ZT12 AC090138.1-201ENST00000524493 578 ntTSL 4 BASIC2.29□□□□□ -2.04
UBR3Q6ZT12 TIMM9-203ENST00000555061 598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.29□□□□□ -2.04
UBR3Q6ZT12 AC012435.2-201ENST00000562869 361 ntTSL 3 BASIC2.29□□□□□ -2.04
UBR3Q6ZT12 AC087463.1-201ENST00000568541 556 ntTSL 2 BASIC2.29□□□□□ -2.04
UBR3Q6ZT12 ALDH3A2-208ENST00000571163 590 ntTSL 5 BASIC2.29□□□□□ -2.04
UBR3Q6ZT12 AC009314.1-201ENST00000603871 304 ntBASIC2.29□□□□□ -2.04
UBR3Q6ZT12 MGAT4C-210ENST00000620241 3194 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.29□□□□□ -2.04
UBR3Q6ZT12 MTND5P12-201ENST00000502851 1449 ntBASIC2.29□□□□□ -2.04
UBR3Q6ZT12 LINC01592-202ENST00000518540 2367 ntTSL 2 BASIC2.29□□□□□ -2.04
UBR3Q6ZT12 RNU2-68P-201ENST00000410878 191 ntBASIC2.28□□□□□ -2.04
UBR3Q6ZT12 AC073310.1-201ENST00000423226 1033 ntBASIC2.28□□□□□ -2.04
UBR3Q6ZT12 AC104332.2-201ENST00000429959 156 ntBASIC2.28□□□□□ -2.04
UBR3Q6ZT12 AL139294.1-201ENST00000435739 512 ntTSL 2 BASIC2.28□□□□□ -2.04
UBR3Q6ZT12 AC093579.1-201ENST00000439455 352 ntTSL 2 BASIC2.28□□□□□ -2.04
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UBR3Q6ZT12 CBX3P4-201ENST00000538909 354 ntBASIC2.28□□□□□ -2.04
UBR3Q6ZT12 CACNB4-228ENST00000636598 7808 ntTSL 5 BASIC2.28□□□□□ -2.04
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UBR3Q6ZT12 U3.37-201ENST00000408528 213 ntBASIC2.28□□□□□ -2.04
UBR3Q6ZT12 LINC01040-201ENST00000425048 666 ntTSL 2 BASIC2.28□□□□□ -2.04
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UBR3Q6ZT12 RPL34P26-201ENST00000445636 354 ntBASIC2.28□□□□□ -2.04
UBR3Q6ZT12 AC010976.1-211ENST00000454503 644 ntTSL 2 BASIC2.28□□□□□ -2.04
UBR3Q6ZT12 LINC01333-201ENST00000508083 724 ntTSL 1 (best) BASIC2.28□□□□□ -2.04
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UBR3Q6ZT12 ART3-202ENST00000349321 1528 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.26□□□□□ -2.05
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UBR3Q6ZT12 CXADR-203ENST00000400165 603 ntTSL 1 (best) BASIC2.26□□□□□ -2.05
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UBR3Q6ZT12 PTGES3P5-201ENST00000455109 434 ntBASIC2.26□□□□□ -2.05
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UBR3Q6ZT12 PHF3-202ENST00000393387 6947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.25□□□□□ -2.05
UBR3Q6ZT12 AC110774.1-201ENST00000623567 2018 ntBASIC2.25□□□□□ -2.05
UBR3Q6ZT12 AL512283.1-201ENST00000606756 1384 ntBASIC2.25□□□□□ -2.05
UBR3Q6ZT12 BTBD10P2-201ENST00000404779 676 ntBASIC2.25□□□□□ -2.05
UBR3Q6ZT12 HSPE1P28-201ENST00000443139 211 ntBASIC2.25□□□□□ -2.05
UBR3Q6ZT12 SNX5P1-201ENST00000505757 1041 ntBASIC2.25□□□□□ -2.05
UBR3Q6ZT12 AC104012.1-201ENST00000517848 719 ntTSL 3 BASIC2.25□□□□□ -2.05
UBR3Q6ZT12 HMGN1P28-201ENST00000521340 364 ntBASIC2.25□□□□□ -2.05
UBR3Q6ZT12 AC109466.1-214ENST00000522762 583 ntTSL 2 BASIC2.25□□□□□ -2.05
UBR3Q6ZT12 AC016987.2-201ENST00000560696 351 ntTSL 3 BASIC2.25□□□□□ -2.05
UBR3Q6ZT12 AC027458.1-201ENST00000563639 613 ntTSL 1 (best) BASIC2.25□□□□□ -2.05
UBR3Q6ZT12 AC002984.1-201ENST00000591692 448 ntBASIC2.25□□□□□ -2.05
UBR3Q6ZT12 VIS1.1-201ENST00000610517 203 ntBASIC2.25□□□□□ -2.05
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