Protein–RNA interactions for Protein: Q5VTT2

C9orf135, Protein C9orf135, humanhuman

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Length 229 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C9orf135Q5VTT2 DNAJC8P1-201ENST00000554535 372 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
C9orf135Q5VTT2 AC023908.1-201ENST00000559899 567 ntTSL 4 BASIC2.74□□□□□ -1.97
C9orf135Q5VTT2 AC023825.1-201ENST00000566704 1030 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
C9orf135Q5VTT2 AC091588.1-201ENST00000578504 359 ntTSL 3 BASIC2.74□□□□□ -1.97
C9orf135Q5VTT2 MIR5004-201ENST00000579078 107 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
C9orf135Q5VTT2 AC118755.2-201ENST00000584676 212 ntTSL 3 BASIC2.74□□□□□ -1.97
C9orf135Q5VTT2 LINC01482-203ENST00000589610 468 ntTSL 3 BASIC2.74□□□□□ -1.97
C9orf135Q5VTT2 SATB1-AS1-207ENST00000593741 955 ntTSL 5 BASIC2.74□□□□□ -1.97
C9orf135Q5VTT2 AL035411.2-201ENST00000604022 421 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
C9orf135Q5VTT2 AL031176.1-201ENST00000604554 466 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
C9orf135Q5VTT2 MIR4458HG-202ENST00000605918 1057 ntTSL 1 (best) BASIC2.74□□□□□ -1.97
C9orf135Q5VTT2 AC097504.2-201ENST00000608088 454 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
C9orf135Q5VTT2 AP002826.1-201ENST00000608835 315 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
C9orf135Q5VTT2 U1.23-201ENST00000610293 146 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
C9orf135Q5VTT2 AC084824.5-201ENST00000612009 413 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
C9orf135Q5VTT2 RNU1-68P-201ENST00000615382 146 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
C9orf135Q5VTT2 AL138880.2-201ENST00000616214 239 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
C9orf135Q5VTT2 ATP5A1P2-202ENST00000616464 443 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
C9orf135Q5VTT2 U1.39-201ENST00000621562 146 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
C9orf135Q5VTT2 LRRC77P-213ENST00000637727 880 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
C9orf135Q5VTT2 HTR2B-201ENST00000258400 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.74□□□□□ -1.97
C9orf135Q5VTT2 UGT2A2-201ENST00000604021 1544 ntTSL 1 (best) BASIC2.73□□□□□ -1.97
C9orf135Q5VTT2 USP45-208ENST00000500704 5826 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.73□□□□□ -1.97
C9orf135Q5VTT2 MIS12-201ENST00000381165 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.73□□□□□ -1.97
C9orf135Q5VTT2 FTX-214ENST00000638437 12267 ntTSL 5 BASIC2.73□□□□□ -1.97
C9orf135Q5VTT2 HDX-206ENST00000506585 6158 ntTSL 2 BASIC2.73□□□□□ -1.97
C9orf135Q5VTT2 SPAM1-202ENST00000340011 2349 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC2.73□□□□□ -1.97
C9orf135Q5VTT2 FIGNL1-212ENST00000613602 3187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.73□□□□□ -1.97
C9orf135Q5VTT2 GYPA-201ENST00000324022 751 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.73□□□□□ -1.97
C9orf135Q5VTT2 SNORD56.3-201ENST00000363507 71 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
C9orf135Q5VTT2 RNU6-799P-201ENST00000363567 107 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
C9orf135Q5VTT2 SNORA9-201ENST00000384215 133 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
C9orf135Q5VTT2 MIR135A2-201ENST00000384854 100 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
C9orf135Q5VTT2 MIR506-201ENST00000384998 124 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
C9orf135Q5VTT2 SNORA48.2-201ENST00000390926 124 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
C9orf135Q5VTT2 OR5H8-201ENST00000394191 1045 ntAPPRIS P1 BASIC2.73□□□□□ -1.97
C9orf135Q5VTT2 RNA5SP31-201ENST00000411144 127 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
C9orf135Q5VTT2 RPL32P35-201ENST00000415214 394 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
C9orf135Q5VTT2 AC006960.1-201ENST00000419980 153 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
C9orf135Q5VTT2 ZNF736P7Y-201ENST00000425158 820 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
C9orf135Q5VTT2 LINC01052-201ENST00000437777 496 ntTSL 3 BASIC2.73□□□□□ -1.97
C9orf135Q5VTT2 COX6CP2-201ENST00000444980 225 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
C9orf135Q5VTT2 AC018643.1-201ENST00000445459 414 ntTSL 5 BASIC2.73□□□□□ -1.97
C9orf135Q5VTT2 AC112492.1-201ENST00000449607 712 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
C9orf135Q5VTT2 AC099499.1-201ENST00000505040 558 ntTSL 3 BASIC2.73□□□□□ -1.97
C9orf135Q5VTT2 AC018752.1-201ENST00000507813 206 ntTSL 5 BASIC2.73□□□□□ -1.97
C9orf135Q5VTT2 LINC02144-201ENST00000511417 592 ntTSL 4 BASIC2.73□□□□□ -1.97
C9orf135Q5VTT2 AC008885.1-201ENST00000514930 301 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
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C9orf135Q5VTT2 AC104027.1-201ENST00000521887 300 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
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C9orf135Q5VTT2 AP003730.2-201ENST00000526385 546 ntTSL 3 BASIC2.73□□□□□ -1.97
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C9orf135Q5VTT2 TTN-AS1-212ENST00000582847 1036 ntTSL 5 BASIC2.73□□□□□ -1.97
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C9orf135Q5VTT2 PRKACB-219ENST00000614872 4306 ntTSL 1 (best) BASIC2.73□□□□□ -1.97
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C9orf135Q5VTT2 OSTN-202ENST00000445281 3134 ntTSL 5 BASIC2.73□□□□□ -1.97
C9orf135Q5VTT2 AGTR1-204ENST00000418473 2071 ntTSL 5 BASIC2.73□□□□□ -1.97
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C9orf135Q5VTT2 HPGDS-201ENST00000295256 1636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.72□□□□□ -1.97
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C9orf135Q5VTT2 CSN3-201ENST00000304954 836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.72□□□□□ -1.97
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C9orf135Q5VTT2 SAR1AP4-201ENST00000429225 591 ntBASIC2.72□□□□□ -1.97
C9orf135Q5VTT2 MTCO1P3-201ENST00000429327 192 ntBASIC2.72□□□□□ -1.97
C9orf135Q5VTT2 UBE2E2-AS1-202ENST00000430018 499 ntTSL 2 BASIC2.72□□□□□ -1.97
C9orf135Q5VTT2 AF212831.1-201ENST00000430064 377 ntTSL 3 BASIC2.72□□□□□ -1.97
C9orf135Q5VTT2 AC022018.1-201ENST00000430685 241 ntBASIC2.72□□□□□ -1.97
C9orf135Q5VTT2 SEPT7P5-201ENST00000434048 306 ntBASIC2.72□□□□□ -1.97
C9orf135Q5VTT2 AC024082.2-201ENST00000434771 238 ntBASIC2.72□□□□□ -1.97
C9orf135Q5VTT2 RPL23AP74-201ENST00000437246 471 ntBASIC2.72□□□□□ -1.97
C9orf135Q5VTT2 CYCSP32-201ENST00000440548 321 ntBASIC2.72□□□□□ -1.97
C9orf135Q5VTT2 AF127577.1-201ENST00000446301 562 ntTSL 3 BASIC2.72□□□□□ -1.97
C9orf135Q5VTT2 AL133351.1-201ENST00000456189 417 ntTSL 2 BASIC2.72□□□□□ -1.97
C9orf135Q5VTT2 AP001992.1-205ENST00000462248 379 ntBASIC2.72□□□□□ -1.97
C9orf135Q5VTT2 LINC02053-202ENST00000488262 940 ntTSL 1 (best) BASIC2.72□□□□□ -1.97
C9orf135Q5VTT2 LINC02469-201ENST00000506460 741 ntTSL 3 BASIC2.72□□□□□ -1.97
C9orf135Q5VTT2 AC008837.1-201ENST00000511513 412 ntBASIC2.72□□□□□ -1.97
C9orf135Q5VTT2 DEFB130C-201ENST00000528518 237 ntTSL 1 (best) BASIC2.72□□□□□ -1.97
C9orf135Q5VTT2 AC037487.2-201ENST00000581796 537 ntTSL 3 BASIC2.72□□□□□ -1.97
C9orf135Q5VTT2 AC091691.2-201ENST00000581940 567 ntTSL 4 BASIC2.72□□□□□ -1.97
C9orf135Q5VTT2 GLUD1P4-201ENST00000590914 418 ntBASIC2.72□□□□□ -1.97
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