Protein–RNA interactions for Protein: Q16799

RTN1, Reticulon-1, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RTN1Q16799 FILIP1-201ENST00000237172 4580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.82□□□□□ -1.48
RTN1Q16799 USF3-202ENST00000478658 8461 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC5.82□□□□□ -1.48
RTN1Q16799 EMSY-205ENST00000524767 4116 ntTSL 1 (best) BASIC5.82□□□□□ -1.48
RTN1Q16799 TRBV21OR9-2-201ENST00000331828 367 ntAPPRIS P1 BASIC5.82□□□□□ -1.48
RTN1Q16799 RNA5SP305-201ENST00000362665 119 ntBASIC5.82□□□□□ -1.48
RTN1Q16799 Y_RNA.476-201ENST00000384347 108 ntBASIC5.82□□□□□ -1.48
RTN1Q16799 SNORD3H-201ENST00000384486 214 ntBASIC5.82□□□□□ -1.48
RTN1Q16799 RNU6-1222P-201ENST00000384615 107 ntBASIC5.82□□□□□ -1.48
RTN1Q16799 AC013442.1-201ENST00000397347 228 ntBASIC5.82□□□□□ -1.48
RTN1Q16799 RNU4-25P-201ENST00000410569 230 ntBASIC5.82□□□□□ -1.48
RTN1Q16799 RNU6-516P-201ENST00000411381 104 ntBASIC5.82□□□□□ -1.48
RTN1Q16799 LINC01507-201ENST00000417801 446 ntTSL 5 BASIC5.82□□□□□ -1.48
RTN1Q16799 AC093106.2-201ENST00000428212 385 ntBASIC5.82□□□□□ -1.48
RTN1Q16799 AC244035.3-201ENST00000428399 271 ntTSL 2 BASIC5.82□□□□□ -1.48
RTN1Q16799 KCNIP1-205ENST00000434108 726 ntTSL 1 (best) BASIC5.82□□□□□ -1.48
RTN1Q16799 RPL7P28-201ENST00000437739 740 ntBASIC5.82□□□□□ -1.48
RTN1Q16799 AC005094.1-201ENST00000440420 368 ntBASIC5.82□□□□□ -1.48
RTN1Q16799 H2AFZP6-201ENST00000444403 394 ntBASIC5.82□□□□□ -1.48
RTN1Q16799 AL354949.1-201ENST00000446438 170 ntTSL 2 BASIC5.82□□□□□ -1.48
RTN1Q16799 AL133481.3-201ENST00000456546 333 ntTSL 3 BASIC5.82□□□□□ -1.48
RTN1Q16799 AC116533.1-201ENST00000459748 321 ntBASIC5.82□□□□□ -1.48
RTN1Q16799 RPS17P2-201ENST00000461663 408 ntBASIC5.82□□□□□ -1.48
RTN1Q16799 RN7SL808P-201ENST00000496066 299 ntBASIC5.82□□□□□ -1.48
RTN1Q16799 RPL23AP55-201ENST00000498163 452 ntBASIC5.82□□□□□ -1.48
RTN1Q16799 MGC32805-203ENST00000506053 652 ntTSL 3 BASIC5.82□□□□□ -1.48
RTN1Q16799 RNU6ATAC24P-201ENST00000516811 135 ntBASIC5.82□□□□□ -1.48
RTN1Q16799 AC091987.1-201ENST00000517758 464 ntTSL 3 BASIC5.82□□□□□ -1.48
RTN1Q16799 IGLVIV-53-201ENST00000520107 367 ntBASIC5.82□□□□□ -1.48
RTN1Q16799 AC090023.2-201ENST00000540875 545 ntTSL 3 BASIC5.82□□□□□ -1.48
RTN1Q16799 APPL2-203ENST00000546731 684 ntTSL 2 BASIC5.82□□□□□ -1.48
RTN1Q16799 AC025265.1-201ENST00000551299 497 ntTSL 3 BASIC5.82□□□□□ -1.48
RTN1Q16799 AL359219.2-201ENST00000555184 348 ntBASIC5.82□□□□□ -1.48
RTN1Q16799 AC087500.2-201ENST00000575056 498 ntTSL 5 BASIC5.82□□□□□ -1.48
RTN1Q16799 AP001120.2-201ENST00000589395 296 ntTSL 3 BASIC5.82□□□□□ -1.48
RTN1Q16799 AC123786.2-201ENST00000603459 275 ntBASIC5.82□□□□□ -1.48
RTN1Q16799 AC006157.1-201ENST00000611750 366 ntBASIC5.82□□□□□ -1.48
RTN1Q16799 AC011890.2-201ENST00000613393 294 ntBASIC5.82□□□□□ -1.48
RTN1Q16799 AL138726.1-201ENST00000614873 333 ntBASIC5.82□□□□□ -1.48
RTN1Q16799 AP002799.1-201ENST00000623552 423 ntBASIC5.82□□□□□ -1.48
RTN1Q16799 ZNF33CP-201ENST00000432492 2030 ntBASIC5.82□□□□□ -1.48
RTN1Q16799 POLK-210ENST00000508526 2019 ntTSL 1 (best) BASIC5.82□□□□□ -1.48
RTN1Q16799 LINC01748-204ENST00000635048 5678 ntTSL 5 BASIC5.82□□□□□ -1.48
RTN1Q16799 AL589740.1-207ENST00000607823 1962 ntTSL 5 BASIC5.82□□□□□ -1.48
RTN1Q16799 FRYL-209ENST00000506685 1940 ntTSL 5 BASIC5.82□□□□□ -1.48
RTN1Q16799 PDS5B-201ENST00000315596 7497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.81□□□□□ -1.48
RTN1Q16799 NOX4-205ENST00000424319 4184 ntTSL 5 BASIC5.81□□□□□ -1.48
RTN1Q16799 SLC35A1-201ENST00000369552 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.81□□□□□ -1.48
RTN1Q16799 AC125336.1-201ENST00000508893 2827 ntBASIC5.81□□□□□ -1.48
RTN1Q16799 CPXCR1-202ENST00000373111 1577 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.81□□□□□ -1.48
RTN1Q16799 PIK3C3-217ENST00000639914 2722 ntTSL 5 BASIC5.81□□□□□ -1.48
RTN1Q16799 RNU6-960P-201ENST00000364056 120 ntBASIC5.81□□□□□ -1.48
RTN1Q16799 TEX35-202ENST00000367639 785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.81□□□□□ -1.48
RTN1Q16799 AL078599.1-201ENST00000402075 293 ntBASIC5.81□□□□□ -1.48
RTN1Q16799 RNU2-21P-201ENST00000410368 188 ntBASIC5.81□□□□□ -1.48
RTN1Q16799 AC068483.1-201ENST00000413403 660 ntTSL 3 BASIC5.81□□□□□ -1.48
RTN1Q16799 ATG3P1-201ENST00000419507 911 ntBASIC5.81□□□□□ -1.48
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RTN1Q16799 TBX18-AS1-202ENST00000441863 382 ntTSL 2 BASIC5.81□□□□□ -1.48
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RTN1Q16799 RPS15AP27-201ENST00000449183 343 ntBASIC5.81□□□□□ -1.48
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RTN1Q16799 HTN3-202ENST00000526767 578 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.81□□□□□ -1.48
RTN1Q16799 DEFB130C-201ENST00000528518 237 ntTSL 1 (best) BASIC5.81□□□□□ -1.48
RTN1Q16799 RANP3-201ENST00000530970 276 ntBASIC5.81□□□□□ -1.48
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RTN1Q16799 AC092608.2-201ENST00000624427 218 ntBASIC5.81□□□□□ -1.48
RTN1Q16799 CCT5-215ENST00000625723 135 ntTSL 5 BASIC5.81□□□□□ -1.48
RTN1Q16799 GLRA2-202ENST00000355020 1730 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC5.81□□□□□ -1.48
RTN1Q16799 MTND5P30-201ENST00000452896 1731 ntBASIC5.81□□□□□ -1.48
RTN1Q16799 CCDC62-205ENST00000537566 3537 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.81□□□□□ -1.48
RTN1Q16799 SYTL2-204ENST00000389958 1943 ntTSL 2 BASIC5.81□□□□□ -1.48
RTN1Q16799 INPP4B-201ENST00000262992 3741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.81□□□□□ -1.48
RTN1Q16799 CCDC169-204ENST00000379864 5944 ntTSL 1 (best) BASIC5.81□□□□□ -1.48
RTN1Q16799 NRK-204ENST00000540278 1687 ntTSL 2 BASIC5.81□□□□□ -1.48
RTN1Q16799 LINC01933-204ENST00000524295 3591 ntTSL 2 BASIC5.81□□□□□ -1.48
RTN1Q16799 XKR4-201ENST00000327381 19880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.81□□□□□ -1.48
RTN1Q16799 FYB1-201ENST00000351578 4750 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.8□□□□□ -1.48
RTN1Q16799 GABPAP-201ENST00000419271 1356 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
RTN1Q16799 EIF4EBP2-201ENST00000373218 7257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.8□□□□□ -1.48
RTN1Q16799 PPIG-201ENST00000260970 6368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.8□□□□□ -1.48
RTN1Q16799 CLCN5-202ENST00000376088 10108 ntTSL 2 BASIC5.8□□□□□ -1.48
RTN1Q16799 TIPARP-205ENST00000486483 2150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.8□□□□□ -1.48
RTN1Q16799 IPO11-203ENST00000409534 1725 ntTSL 2 BASIC5.8□□□□□ -1.48
RTN1Q16799 AC010329.2-201ENST00000595195 2737 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
RTN1Q16799 MYBPC1-201ENST00000361466 3899 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC5.8□□□□□ -1.48
RTN1Q16799 PRUNE2-204ENST00000376718 12584 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC5.8□□□□□ -1.48
RTN1Q16799 OR2M2-201ENST00000359682 1044 ntAPPRIS P1 BASIC5.8□□□□□ -1.48
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