Protein–RNA interactions for Protein: Q16740

CLPP, ATP-dependent Clp protease proteolytic subunit, mitochondrial, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 277 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLPPQ16740 LINC00457-201ENST00000428706 413 ntTSL 3 BASIC3.3□□□□□ -1.88
CLPPQ16740 USP9YP24-201ENST00000434374 697 ntBASIC3.3□□□□□ -1.88
CLPPQ16740 AC007179.2-207ENST00000435557 556 ntTSL 4 BASIC3.3□□□□□ -1.88
CLPPQ16740 RPL23AP76-201ENST00000441860 458 ntBASIC3.3□□□□□ -1.88
CLPPQ16740 USP9YP17-201ENST00000444617 696 ntBASIC3.3□□□□□ -1.88
CLPPQ16740 DARS-AS1-205ENST00000444649 558 ntTSL 3 BASIC3.3□□□□□ -1.88
CLPPQ16740 DNM3-IT1-201ENST00000450800 396 ntTSL 3 BASIC3.3□□□□□ -1.88
CLPPQ16740 DCLRE1CP1-201ENST00000454630 470 ntBASIC3.3□□□□□ -1.88
CLPPQ16740 DUXAP8-207ENST00000456786 622 ntBASIC3.3□□□□□ -1.88
CLPPQ16740 RPS4XP10-201ENST00000465034 731 ntBASIC3.3□□□□□ -1.88
CLPPQ16740 AC010285.1-201ENST00000470580 392 ntBASIC3.3□□□□□ -1.88
CLPPQ16740 RPS29P2-201ENST00000479278 136 ntBASIC3.3□□□□□ -1.88
CLPPQ16740 ACTG1P13-201ENST00000486987 1043 ntBASIC3.3□□□□□ -1.88
CLPPQ16740 SCOC-205ENST00000502535 679 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC3.3□□□□□ -1.88
CLPPQ16740 LINC02122-201ENST00000511395 577 ntTSL 4 BASIC3.3□□□□□ -1.88
CLPPQ16740 RNU6-27P-201ENST00000516146 107 ntBASIC3.3□□□□□ -1.88
CLPPQ16740 AC011377.1-201ENST00000517708 275 ntTSL 3 BASIC3.3□□□□□ -1.88
CLPPQ16740 OR4P1P-201ENST00000530808 1136 ntBASIC3.3□□□□□ -1.88
CLPPQ16740 SLC2A13P1-201ENST00000531560 322 ntBASIC3.3□□□□□ -1.88
CLPPQ16740 LINC00301-204ENST00000532591 470 ntTSL 2 BASIC3.3□□□□□ -1.88
CLPPQ16740 AC090503.2-201ENST00000551135 981 ntTSL 3 BASIC3.3□□□□□ -1.88
CLPPQ16740 AL160191.1-202ENST00000554008 576 ntTSL 4 BASIC3.3□□□□□ -1.88
CLPPQ16740 AL359233.1-201ENST00000554029 364 ntTSL 3 BASIC3.3□□□□□ -1.88
CLPPQ16740 MTND1P8-201ENST00000571424 950 ntBASIC3.3□□□□□ -1.88
CLPPQ16740 FOPNL-204ENST00000573396 735 ntTSL 3 BASIC3.3□□□□□ -1.88
CLPPQ16740 MIR5004-201ENST00000579078 107 ntBASIC3.3□□□□□ -1.88
CLPPQ16740 AC015911.6-201ENST00000588445 457 ntTSL 3 BASIC3.3□□□□□ -1.88
CLPPQ16740 AC097467.3-205ENST00000597955 594 ntTSL 5 BASIC3.3□□□□□ -1.88
CLPPQ16740 CKS1BP3-201ENST00000600888 237 ntBASIC3.3□□□□□ -1.88
CLPPQ16740 XIAPP1-201ENST00000603162 600 ntBASIC3.3□□□□□ -1.88
CLPPQ16740 AD001527.1-201ENST00000604228 379 ntTSL 5 BASIC3.3□□□□□ -1.88
CLPPQ16740 AC005000.2-201ENST00000605468 310 ntBASIC3.3□□□□□ -1.88
CLPPQ16740 AC073657.2-201ENST00000605661 303 ntBASIC3.3□□□□□ -1.88
CLPPQ16740 DUXAP10-204ENST00000612052 616 ntBASIC3.3□□□□□ -1.88
CLPPQ16740 UGP2-231ENST00000627474 264 ntTSL 5 BASIC3.3□□□□□ -1.88
CLPPQ16740 FLG-AS1-207ENST00000628475 497 ntTSL 5 BASIC3.3□□□□□ -1.88
CLPPQ16740 MIR1322-201ENST00000638013 71 ntBASIC3.3□□□□□ -1.88
CLPPQ16740 OSBPL9P4-201ENST00000371707 1800 ntBASIC3.3□□□□□ -1.88
CLPPQ16740 TAS2R30-201ENST00000539585 1687 ntAPPRIS P1 BASIC3.3□□□□□ -1.88
CLPPQ16740 LRRC70-201ENST00000334994 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.29□□□□□ -1.88
CLPPQ16740 AL049780.3-201ENST00000624612 1583 ntBASIC3.29□□□□□ -1.88
CLPPQ16740 BRCA2-206ENST00000544455 10984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.29□□□□□ -1.88
CLPPQ16740 AGTR1-204ENST00000418473 2071 ntTSL 5 BASIC3.29□□□□□ -1.88
CLPPQ16740 ADAM18-206ENST00000520772 1429 ntTSL 1 (best) BASIC3.29□□□□□ -1.88
CLPPQ16740 DST-204ENST00000361203 22431 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.29□□□□□ -1.88
CLPPQ16740 SLC10A5P1-201ENST00000379063 1306 ntBASIC3.29□□□□□ -1.88
CLPPQ16740 MT-ND5-201ENST00000361567 1812 ntAPPRIS P1 BASIC3.29□□□□□ -1.88
CLPPQ16740 UTS2-202ENST00000361696 559 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.29□□□□□ -1.88
CLPPQ16740 SNORD51-201ENST00000384320 80 ntBASIC3.29□□□□□ -1.88
CLPPQ16740 RNU6-584P-201ENST00000410350 95 ntBASIC3.29□□□□□ -1.88
CLPPQ16740 RNA5SP107-201ENST00000411358 122 ntBASIC3.29□□□□□ -1.88
CLPPQ16740 AC096664.2-201ENST00000411843 406 ntBASIC3.29□□□□□ -1.88
CLPPQ16740 AL365277.2-201ENST00000415255 551 ntTSL 3 BASIC3.29□□□□□ -1.88
CLPPQ16740 RBM6-203ENST00000421682 684 ntTSL 2 BASIC3.29□□□□□ -1.88
CLPPQ16740 AC092648.1-201ENST00000425870 423 ntBASIC3.29□□□□□ -1.88
CLPPQ16740 UBE2E2-AS1-202ENST00000430018 499 ntTSL 2 BASIC3.29□□□□□ -1.88
CLPPQ16740 LINC01986-201ENST00000440867 590 ntTSL 5 BASIC3.29□□□□□ -1.88
CLPPQ16740 AC026410.2-201ENST00000460281 156 ntBASIC3.29□□□□□ -1.88
CLPPQ16740 AC005410.1-202ENST00000460347 485 ntBASIC3.29□□□□□ -1.88
CLPPQ16740 RPS15AP17-201ENST00000470598 390 ntBASIC3.29□□□□□ -1.88
CLPPQ16740 RN7SL499P-201ENST00000481141 276 ntBASIC3.29□□□□□ -1.88
CLPPQ16740 AC118282.1-201ENST00000506408 765 ntBASIC3.29□□□□□ -1.88
CLPPQ16740 AC026412.2-201ENST00000512270 1075 ntBASIC3.29□□□□□ -1.88
CLPPQ16740 AC027701.1-201ENST00000520155 823 ntTSL 3 BASIC3.29□□□□□ -1.88
CLPPQ16740 KLRF1-203ENST00000537723 598 ntTSL 1 (best) BASIC3.29□□□□□ -1.88
CLPPQ16740 DIAPH2-AS1-203ENST00000542084 450 ntTSL 5 BASIC3.29□□□□□ -1.88
CLPPQ16740 AC004024.1-201ENST00000549244 247 ntBASIC3.29□□□□□ -1.88
CLPPQ16740 DUXAP6-201ENST00000553858 601 ntBASIC3.29□□□□□ -1.88
CLPPQ16740 AL160191.1-201ENST00000555480 566 ntTSL 4 BASIC3.29□□□□□ -1.88
CLPPQ16740 AC087481.2-201ENST00000565492 330 ntBASIC3.29□□□□□ -1.88
CLPPQ16740 AC133065.1-201ENST00000572017 575 ntTSL 3 BASIC3.29□□□□□ -1.88
CLPPQ16740 MIR4276-201ENST00000584832 70 ntBASIC3.29□□□□□ -1.88
CLPPQ16740 AC055876.5-201ENST00000605667 259 ntBASIC3.29□□□□□ -1.88
CLPPQ16740 Metazoa_SRP.117-201ENST00000615106 292 ntBASIC3.29□□□□□ -1.88
CLPPQ16740 MIR7112-201ENST00000616126 65 ntBASIC3.29□□□□□ -1.88
CLPPQ16740 AC018755.4-201ENST00000619715 454 ntBASIC3.29□□□□□ -1.88
CLPPQ16740 AC104971.4-201ENST00000622763 249 ntTSL 5 BASIC3.29□□□□□ -1.88
CLPPQ16740 FIGNL1-212ENST00000613602 3187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.29□□□□□ -1.88
CLPPQ16740 AL645937.1-201ENST00000641739 1652 ntBASIC3.29□□□□□ -1.88
CLPPQ16740 AC093010.3-201ENST00000570269 15214 ntBASIC3.29□□□□□ -1.88
CLPPQ16740 BCLAF1P1-201ENST00000505813 2752 ntBASIC3.29□□□□□ -1.88
CLPPQ16740 AP002907.1-201ENST00000606361 1430 ntBASIC3.28□□□□□ -1.88
CLPPQ16740 DMD-203ENST00000357033 13956 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC3.28□□□□□ -1.88
CLPPQ16740 LPP-220ENST00000617246 18220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.28□□□□□ -1.88
CLPPQ16740 ZNF29P-201ENST00000225587 168 ntBASIC3.28□□□□□ -1.88
CLPPQ16740 OR5I1-201ENST00000301532 945 ntAPPRIS P1 BASIC3.28□□□□□ -1.88
CLPPQ16740 KRTAP15-1-201ENST00000334067 671 ntAPPRIS P1 BASIC3.28□□□□□ -1.88
CLPPQ16740 MIR30E-201ENST00000362104 92 ntBASIC3.28□□□□□ -1.88
CLPPQ16740 RNA5SP383-201ENST00000362934 120 ntBASIC3.28□□□□□ -1.88
CLPPQ16740 CRP-202ENST00000368110 667 ntTSL 3 BASIC3.28□□□□□ -1.88
CLPPQ16740 CFHR3-203ENST00000391985 1043 ntTSL 2 BASIC3.28□□□□□ -1.88
CLPPQ16740 AL136116.1-201ENST00000403591 381 ntBASIC3.28□□□□□ -1.88
CLPPQ16740 RNU6-712P-201ENST00000410558 100 ntBASIC3.28□□□□□ -1.88
CLPPQ16740 RNU2-15P-201ENST00000410692 191 ntBASIC3.28□□□□□ -1.88
CLPPQ16740 ATG3P1-201ENST00000419507 911 ntBASIC3.28□□□□□ -1.88
CLPPQ16740 AC233728.2-201ENST00000425348 757 ntBASIC3.28□□□□□ -1.88
CLPPQ16740 USP9YP11-201ENST00000427537 717 ntBASIC3.28□□□□□ -1.88
CLPPQ16740 PSMA6P3-201ENST00000428242 164 ntBASIC3.28□□□□□ -1.88
CLPPQ16740 AL512649.1-201ENST00000428997 581 ntBASIC3.28□□□□□ -1.88
CLPPQ16740 AC244505.4-201ENST00000434905 287 ntBASIC3.28□□□□□ -1.88
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