Protein–RNA interactions for Protein: Q16665

HIF1A, Hypoxia-inducible factor 1-alpha, humanhuman

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Length 826 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HIF1AQ16665 GRID2-208ENST00000611049 4844 ntTSL 1 (best) BASIC5.55□□□□□ -1.52
HIF1AQ16665 TRDN-206ENST00000628709 1661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.55□□□□□ -1.52
HIF1AQ16665 BRIP1-202ENST00000577598 3969 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.55□□□□□ -1.52
HIF1AQ16665 DOCK9-207ENST00000442173 7643 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.55□□□□□ -1.52
HIF1AQ16665 SRRM1P3-201ENST00000426911 2678 ntBASIC5.55□□□□□ -1.52
HIF1AQ16665 WDR72-202ENST00000396328 7507 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.55□□□□□ -1.52
HIF1AQ16665 MNS1-201ENST00000260453 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.55□□□□□ -1.52
HIF1AQ16665 TJP1-209ENST00000545208 5007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.55□□□□□ -1.52
HIF1AQ16665 FGF13-202ENST00000315930 19519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.55□□□□□ -1.52
HIF1AQ16665 NOX4-205ENST00000424319 4184 ntTSL 5 BASIC5.55□□□□□ -1.52
HIF1AQ16665 LGI1-202ENST00000371418 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.55□□□□□ -1.52
HIF1AQ16665 LRP1B-201ENST00000389484 16535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.55□□□□□ -1.52
HIF1AQ16665 SPATA1-206ENST00000490879 2888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.54□□□□□ -1.52
HIF1AQ16665 ADAM2-207ENST00000622267 2480 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.54□□□□□ -1.52
HIF1AQ16665 C17orf78-204ENST00000615133 1862 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.54□□□□□ -1.52
HIF1AQ16665 TNRC6B-206ENST00000454349 18279 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.54□□□□□ -1.52
HIF1AQ16665 ADGRL2-206ENST00000370721 5023 ntTSL 5 BASIC5.54□□□□□ -1.52
HIF1AQ16665 OR2AT4-205ENST00000641931 8357 ntAPPRIS P1 BASIC5.54□□□□□ -1.52
HIF1AQ16665 PLEKHG7-201ENST00000344636 3868 ntTSL 5 BASIC5.54□□□□□ -1.52
HIF1AQ16665 UBXN7-201ENST00000296328 10568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.54□□□□□ -1.52
HIF1AQ16665 RNU6-1303P-201ENST00000364841 107 ntBASIC5.54□□□□□ -1.52
HIF1AQ16665 TMLHE-202ENST00000369439 1248 ntTSL 1 (best) BASIC5.54□□□□□ -1.52
HIF1AQ16665 OR5L2-201ENST00000378397 936 ntAPPRIS P1 BASIC5.54□□□□□ -1.52
HIF1AQ16665 RNU6-214P-201ENST00000384130 107 ntBASIC5.54□□□□□ -1.52
HIF1AQ16665 RNU6-190P-201ENST00000384154 102 ntBASIC5.54□□□□□ -1.52
HIF1AQ16665 RNU6-713P-201ENST00000384761 107 ntBASIC5.54□□□□□ -1.52
HIF1AQ16665 MIR551A-201ENST00000385042 96 ntBASIC5.54□□□□□ -1.52
HIF1AQ16665 MT-TC-201ENST00000387405 66 ntBASIC5.54□□□□□ -1.52
HIF1AQ16665 AL590609.3-201ENST00000411815 210 ntTSL 3 BASIC5.54□□□□□ -1.52
HIF1AQ16665 AL590999.1-206ENST00000437947 436 ntTSL 3 BASIC5.54□□□□□ -1.52
HIF1AQ16665 CYCSP43-201ENST00000438233 310 ntBASIC5.54□□□□□ -1.52
HIF1AQ16665 GEMIN8P3-201ENST00000445417 720 ntBASIC5.54□□□□□ -1.52
HIF1AQ16665 AC006482.1-201ENST00000448898 273 ntTSL 3 BASIC5.54□□□□□ -1.52
HIF1AQ16665 IGHV5-78-201ENST00000450948 295 ntBASIC5.54□□□□□ -1.52
HIF1AQ16665 AC084198.1-201ENST00000477747 402 ntBASIC5.54□□□□□ -1.52
HIF1AQ16665 AC093725.2-201ENST00000507808 356 ntTSL 2 BASIC5.54□□□□□ -1.52
HIF1AQ16665 AC109464.3-201ENST00000509456 204 ntTSL 5 BASIC5.54□□□□□ -1.52
HIF1AQ16665 AC092436.3-201ENST00000511788 257 ntBASIC5.54□□□□□ -1.52
HIF1AQ16665 AC011389.1-203ENST00000513790 573 ntTSL 4 BASIC5.54□□□□□ -1.52
HIF1AQ16665 RNU6-615P-201ENST00000516065 106 ntBASIC5.54□□□□□ -1.52
HIF1AQ16665 SKP1-203ENST00000517625 876 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC5.54□□□□□ -1.52
HIF1AQ16665 AC006065.3-201ENST00000541769 419 ntTSL 5 BASIC5.54□□□□□ -1.52
HIF1AQ16665 AC091516.1-201ENST00000549191 703 ntBASIC5.54□□□□□ -1.52
HIF1AQ16665 LINC02284-202ENST00000560924 566 ntTSL 4 BASIC5.54□□□□□ -1.52
HIF1AQ16665 OR1F2P-201ENST00000570470 933 ntBASIC5.54□□□□□ -1.52
HIF1AQ16665 MIR4433B-201ENST00000581329 102 ntBASIC5.54□□□□□ -1.52
HIF1AQ16665 GMFG-212ENST00000602185 423 ntTSL 3 BASIC5.54□□□□□ -1.52
HIF1AQ16665 AC016727.2-201ENST00000603988 621 ntBASIC5.54□□□□□ -1.52
HIF1AQ16665 AC104687.2-201ENST00000604442 342 ntBASIC5.54□□□□□ -1.52
HIF1AQ16665 AC002044.1-201ENST00000606707 158 ntBASIC5.54□□□□□ -1.52
HIF1AQ16665 MIR6826-201ENST00000617808 98 ntBASIC5.54□□□□□ -1.52
HIF1AQ16665 HOXA11-AS1_4.1-201ENST00000620901 233 ntBASIC5.54□□□□□ -1.52
HIF1AQ16665 MIR8062-201ENST00000621515 85 ntBASIC5.54□□□□□ -1.52
HIF1AQ16665 KERA-201ENST00000266719 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.54□□□□□ -1.52
HIF1AQ16665 ZEB1-201ENST00000320985 5423 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.54□□□□□ -1.52
HIF1AQ16665 PLD1-203ENST00000356327 5855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.54□□□□□ -1.52
HIF1AQ16665 NDUFS1-207ENST00000455934 3361 ntTSL 2 BASIC5.54□□□□□ -1.52
HIF1AQ16665 PDS5B-201ENST00000315596 7497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.54□□□□□ -1.52
HIF1AQ16665 HSPA13-201ENST00000285667 3986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.54□□□□□ -1.52
HIF1AQ16665 AC000374.1-201ENST00000434698 1745 ntBASIC5.54□□□□□ -1.52
HIF1AQ16665 ZNF285-204ENST00000591679 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC5.53□□□□□ -1.52
HIF1AQ16665 FAT3-201ENST00000409404 19030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.53□□□□□ -1.52
HIF1AQ16665 CDH19-201ENST00000262150 6341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.53□□□□□ -1.52
HIF1AQ16665 TRAPPC13-201ENST00000231526 2715 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC5.53□□□□□ -1.52
HIF1AQ16665 AGBL4-201ENST00000334103 881 ntTSL 5 BASIC5.53□□□□□ -1.52
HIF1AQ16665 MIR375-201ENST00000362103 64 ntBASIC5.53□□□□□ -1.52
HIF1AQ16665 Y_RNA.151-201ENST00000363566 112 ntBASIC5.53□□□□□ -1.52
HIF1AQ16665 Y_RNA.288-201ENST00000364854 92 ntBASIC5.53□□□□□ -1.52
HIF1AQ16665 Y_RNA.461-201ENST00000384263 103 ntBASIC5.53□□□□□ -1.52
HIF1AQ16665 RPS3AP2-201ENST00000407190 754 ntBASIC5.53□□□□□ -1.52
HIF1AQ16665 RPL31P2-201ENST00000413849 377 ntBASIC5.53□□□□□ -1.52
HIF1AQ16665 EEF1A1P29-201ENST00000416082 1096 ntBASIC5.53□□□□□ -1.52
HIF1AQ16665 AL158071.1-201ENST00000430315 461 ntBASIC5.53□□□□□ -1.52
HIF1AQ16665 AC078993.1-203ENST00000435789 1037 ntTSL 5 BASIC5.53□□□□□ -1.52
HIF1AQ16665 AL136140.1-201ENST00000436113 473 ntTSL 3 BASIC5.53□□□□□ -1.52
HIF1AQ16665 OR6D1P-201ENST00000436165 939 ntBASIC5.53□□□□□ -1.52
HIF1AQ16665 AP000281.1-201ENST00000444036 316 ntBASIC5.53□□□□□ -1.52
HIF1AQ16665 AL450023.1-201ENST00000450868 751 ntBASIC5.53□□□□□ -1.52
HIF1AQ16665 AC112492.4-201ENST00000456549 352 ntBASIC5.53□□□□□ -1.52
HIF1AQ16665 RPL21P103-201ENST00000479921 488 ntBASIC5.53□□□□□ -1.52
HIF1AQ16665 RPS24P16-201ENST00000497294 392 ntBASIC5.53□□□□□ -1.52
HIF1AQ16665 AC022447.4-201ENST00000504053 364 ntBASIC5.53□□□□□ -1.52
HIF1AQ16665 AC010255.3-204ENST00000514637 454 ntTSL 2 BASIC5.53□□□□□ -1.52
HIF1AQ16665 AP000889.1-201ENST00000530968 660 ntBASIC5.53□□□□□ -1.52
HIF1AQ16665 PWRN4-201ENST00000563016 420 ntTSL 5 BASIC5.53□□□□□ -1.52
HIF1AQ16665 AC109446.1-201ENST00000566172 220 ntBASIC5.53□□□□□ -1.52
HIF1AQ16665 PRPF19P1-201ENST00000584766 898 ntBASIC5.53□□□□□ -1.52
HIF1AQ16665 DSCR9-205ENST00000585273 751 ntTSL 1 (best) BASIC5.53□□□□□ -1.52
HIF1AQ16665 AC090621.1-201ENST00000592121 419 ntTSL 3 BASIC5.53□□□□□ -1.52
HIF1AQ16665 AL391422.2-201ENST00000602854 361 ntTSL 2 BASIC5.53□□□□□ -1.52
HIF1AQ16665 AC011626.1-201ENST00000604710 562 ntBASIC5.53□□□□□ -1.52
HIF1AQ16665 RNA5SP440-201ENST00000612665 119 ntBASIC5.53□□□□□ -1.52
HIF1AQ16665 AC022467.1-201ENST00000614738 749 ntBASIC5.53□□□□□ -1.52
HIF1AQ16665 AL359893.1-201ENST00000447628 1580 ntBASIC5.53□□□□□ -1.52
HIF1AQ16665 LINC01963-201ENST00000562038 3148 ntBASIC5.53□□□□□ -1.52
HIF1AQ16665 CEP164P1-202ENST00000456938 2472 ntTSL 1 (best) BASIC5.53□□□□□ -1.52
HIF1AQ16665 PWRN2-202ENST00000567246 4295 ntTSL 1 (best) BASIC5.53□□□□□ -1.52
HIF1AQ16665 MEIOB-201ENST00000325962 1694 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.53□□□□□ -1.52
HIF1AQ16665 EMSY-206ENST00000525038 4376 ntTSL 1 (best) BASIC5.53□□□□□ -1.52
HIF1AQ16665 ST8SIA4-201ENST00000231461 6303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.53□□□□□ -1.52
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