Protein–RNA interactions for Protein: Q16384

SSX1, Protein SSX1, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SSX1Q16384 MIR6075-201ENST00000620782 95 ntBASIC2.38□□□□□ -2.03
SSX1Q16384 AC092442.1-201ENST00000636216 138 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.38□□□□□ -2.03
SSX1Q16384 OGN-201ENST00000262551 2971 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.38□□□□□ -2.03
SSX1Q16384 ZMYM1-203ENST00000373330 4203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.38□□□□□ -2.03
SSX1Q16384 TUBD1-214ENST00000592426 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.38□□□□□ -2.03
SSX1Q16384 ATF2-204ENST00000409437 3697 ntTSL 5 BASIC2.38□□□□□ -2.03
SSX1Q16384 TMPRSS11A-201ENST00000334830 3054 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC2.38□□□□□ -2.03
SSX1Q16384 FRG1BP-201ENST00000278882 761 ntBASIC2.37□□□□□ -2.03
SSX1Q16384 TTTY13-201ENST00000330337 659 ntTSL 1 (best) BASIC2.37□□□□□ -2.03
SSX1Q16384 RNU6-839P-201ENST00000363347 108 ntBASIC2.37□□□□□ -2.03
SSX1Q16384 MIR134-201ENST00000385258 73 ntBASIC2.37□□□□□ -2.03
SSX1Q16384 MS4A4E-202ENST00000398986 522 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.37□□□□□ -2.03
SSX1Q16384 TMSB4XP8-201ENST00000402089 135 ntBASIC2.37□□□□□ -2.03
SSX1Q16384 AL136133.1-201ENST00000413694 376 ntBASIC2.37□□□□□ -2.03
SSX1Q16384 TMSB4XP6-201ENST00000415187 135 ntBASIC2.37□□□□□ -2.03
SSX1Q16384 AC069157.1-201ENST00000421749 137 ntBASIC2.37□□□□□ -2.03
SSX1Q16384 TMSB4XP1-201ENST00000424567 135 ntBASIC2.37□□□□□ -2.03
SSX1Q16384 VN1R34P-201ENST00000447387 883 ntBASIC2.37□□□□□ -2.03
SSX1Q16384 AC112492.1-201ENST00000449607 712 ntBASIC2.37□□□□□ -2.03
SSX1Q16384 CEP70-205ENST00000464035 1054 ntTSL 1 (best) BASIC2.37□□□□□ -2.03
SSX1Q16384 AC006445.1-201ENST00000491925 405 ntBASIC2.37□□□□□ -2.03
SSX1Q16384 AL358832.1-201ENST00000497800 389 ntBASIC2.37□□□□□ -2.03
SSX1Q16384 CBX3P3-201ENST00000508108 532 ntBASIC2.37□□□□□ -2.03
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SSX1Q16384 AC100870.1-201ENST00000522035 505 ntBASIC2.37□□□□□ -2.03
SSX1Q16384 AC109466.1-214ENST00000522762 583 ntTSL 2 BASIC2.37□□□□□ -2.03
SSX1Q16384 AL133330.2-201ENST00000532760 776 ntTSL 2 BASIC2.37□□□□□ -2.03
SSX1Q16384 MED28P6-201ENST00000558776 231 ntBASIC2.37□□□□□ -2.03
SSX1Q16384 AC104564.2-201ENST00000581240 270 ntTSL 3 BASIC2.37□□□□□ -2.03
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SSX1Q16384 AC090772.1-201ENST00000583782 507 ntTSL 5 BASIC2.37□□□□□ -2.03
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SSX1Q16384 C3orf79-201ENST00000623038 580 ntTSL 1 (best) BASIC2.37□□□□□ -2.03
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SSX1Q16384 AL158064.1-201ENST00000627044 2242 ntTSL 4 BASIC2.36□□□□□ -2.03
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SSX1Q16384 NPPA-AS1_3.1-201ENST00000617059 108 ntBASIC2.36□□□□□ -2.03
SSX1Q16384 AC243585.2-201ENST00000619099 508 ntTSL 3 BASIC2.36□□□□□ -2.03
SSX1Q16384 THOC1-220ENST00000621904 1083 ntTSL 5 BASIC2.36□□□□□ -2.03
SSX1Q16384 AP003122.6-201ENST00000623831 495 ntBASIC2.36□□□□□ -2.03
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SSX1Q16384 LINC02246-204ENST00000625278 740 ntTSL 5 BASIC2.36□□□□□ -2.03
SSX1Q16384 SATB1-AS1-266ENST00000630271 813 ntTSL 5 BASIC2.36□□□□□ -2.03
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SSX1Q16384 NOC3L-201ENST00000371361 3455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.35□□□□□ -2.03
SSX1Q16384 LCORL-202ENST00000382224 4984 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.35□□□□□ -2.03
SSX1Q16384 STATH-201ENST00000246895 598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.35□□□□□ -2.03
SSX1Q16384 RNU1-100P-201ENST00000365255 165 ntBASIC2.35□□□□□ -2.03
SSX1Q16384 DNAH14-203ENST00000366848 929 ntTSL 1 (best) BASIC2.35□□□□□ -2.03
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