Protein–RNA interactions for Protein: Q15811

ITSN1, Intersectin-1, humanhuman

Predictions only

Length 1,721 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ITSN1Q15811 MRPL42-202ENST00000393128 1983 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC2.55□□□□□ -2
ITSN1Q15811 SOCS4-201ENST00000339298 6667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.55□□□□□ -2
ITSN1Q15811 MT-ND3-201ENST00000361227 346 ntAPPRIS P1 BASIC2.55□□□□□ -2
ITSN1Q15811 MIR518E-201ENST00000385252 88 ntBASIC2.55□□□□□ -2
ITSN1Q15811 TAF9P1-201ENST00000445421 515 ntBASIC2.55□□□□□ -2
ITSN1Q15811 AC093392.2-201ENST00000450682 337 ntBASIC2.55□□□□□ -2
ITSN1Q15811 TAF9P2-201ENST00000454958 515 ntBASIC2.55□□□□□ -2
ITSN1Q15811 TVP23BP2-201ENST00000455082 615 ntBASIC2.55□□□□□ -2
ITSN1Q15811 LINC01941-201ENST00000455174 624 ntTSL 2 BASIC2.55□□□□□ -2
ITSN1Q15811 AL049548.1-201ENST00000458194 385 ntTSL 2 BASIC2.55□□□□□ -2
ITSN1Q15811 AC087623.1-201ENST00000533301 377 ntTSL 3 BASIC2.55□□□□□ -2
ITSN1Q15811 RPS3AP23-202ENST00000574601 686 ntBASIC2.55□□□□□ -2
ITSN1Q15811 AL391813.2-201ENST00000609113 322 ntBASIC2.55□□□□□ -2
ITSN1Q15811 DYNC2H1-203ENST00000398093 12945 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC2.55□□□□□ -2
ITSN1Q15811 ZBED5-201ENST00000413761 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.55□□□□□ -2
ITSN1Q15811 DEFB106A-201ENST00000335186 303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.54□□□□□ -2
ITSN1Q15811 AC019129.1-201ENST00000403786 261 ntBASIC2.54□□□□□ -2
ITSN1Q15811 NDUFA5P4-201ENST00000436704 385 ntBASIC2.54□□□□□ -2
ITSN1Q15811 AL606534.3-201ENST00000437499 373 ntTSL 5 BASIC2.54□□□□□ -2
ITSN1Q15811 AL590664.1-201ENST00000448065 339 ntBASIC2.54□□□□□ -2
ITSN1Q15811 AKIRIN1P1-201ENST00000547384 544 ntBASIC2.54□□□□□ -2
ITSN1Q15811 G2E3-AS1-204ENST00000552511 402 ntTSL 2 BASIC2.54□□□□□ -2
ITSN1Q15811 DNAJC19P9-201ENST00000555084 351 ntBASIC2.54□□□□□ -2
ITSN1Q15811 CMC2-208ENST00000564249 890 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.54□□□□□ -2
ITSN1Q15811 ZNF788-206ENST00000596883 692 ntTSL 3 BASIC2.54□□□□□ -2
ITSN1Q15811 AP000553.5-201ENST00000641933 54 ntBASIC2.54□□□□□ -2
ITSN1Q15811 AC005336.3-201ENST00000623833 2679 ntBASIC2.54□□□□□ -2
ITSN1Q15811 NDUFAF4-201ENST00000316149 2399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.54□□□□□ -2
ITSN1Q15811 Y_RNA.116-201ENST00000363292 103 ntBASIC2.54□□□□□ -2
ITSN1Q15811 SNORA67.5-201ENST00000391036 107 ntBASIC2.54□□□□□ -2
ITSN1Q15811 MIR1294-201ENST00000408503 142 ntBASIC2.54□□□□□ -2
ITSN1Q15811 RNU4-62P-201ENST00000410125 130 ntBASIC2.54□□□□□ -2
ITSN1Q15811 AL139294.1-201ENST00000435739 512 ntTSL 2 BASIC2.54□□□□□ -2
ITSN1Q15811 AL157827.1-201ENST00000447622 132 ntBASIC2.54□□□□□ -2
ITSN1Q15811 snoZ278.1-201ENST00000517059 112 ntBASIC2.54□□□□□ -2
ITSN1Q15811 NCRNA00250-201ENST00000519500 519 ntTSL 4 BASIC2.54□□□□□ -2
ITSN1Q15811 COX6CP5-201ENST00000527162 228 ntBASIC2.54□□□□□ -2
ITSN1Q15811 AC090751.1-201ENST00000566966 267 ntBASIC2.54□□□□□ -2
ITSN1Q15811 AC020978.4-201ENST00000569088 460 ntTSL 3 BASIC2.54□□□□□ -2
ITSN1Q15811 AC106796.1-201ENST00000577173 615 ntTSL 3 BASIC2.54□□□□□ -2
ITSN1Q15811 AC015813.2-201ENST00000578794 711 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC2.54□□□□□ -2
ITSN1Q15811 AL356280.1-201ENST00000603614 379 ntBASIC2.54□□□□□ -2
ITSN1Q15811 AC092954.1-201ENST00000609121 445 ntBASIC2.54□□□□□ -2
ITSN1Q15811 AC107021.2-201ENST00000567714 2095 ntBASIC2.53□□□□□ -2
ITSN1Q15811 CKAP2P1-201ENST00000555477 2049 ntBASIC2.53□□□□□ -2
ITSN1Q15811 AC103988.1-201ENST00000566382 2177 ntBASIC2.53□□□□□ -2
ITSN1Q15811 LINC01021-204ENST00000512067 1610 ntTSL 1 (best) BASIC2.53□□□□□ -2
ITSN1Q15811 RNA5SP138-201ENST00000365098 114 ntBASIC2.53□□□□□ -2
ITSN1Q15811 SNRPGP9-201ENST00000456025 225 ntBASIC2.53□□□□□ -2
ITSN1Q15811 AL024497.2-201ENST00000457081 317 ntTSL 3 BASIC2.53□□□□□ -2
ITSN1Q15811 AC025033.1-201ENST00000463883 194 ntBASIC2.53□□□□□ -2
ITSN1Q15811 AC139718.1-201ENST00000508010 300 ntTSL 5 BASIC2.53□□□□□ -2
ITSN1Q15811 HMGB1P1-201ENST00000522557 636 ntBASIC2.53□□□□□ -2
ITSN1Q15811 AC007001.1-201ENST00000590912 670 ntTSL 5 BASIC2.53□□□□□ -2
ITSN1Q15811 AL359821.1-201ENST00000605519 182 ntBASIC2.53□□□□□ -2
ITSN1Q15811 CCDC54-201ENST00000261058 1444 ntAPPRIS P1 BASIC2.53□□□□□ -2.01
ITSN1Q15811 NETO1-202ENST00000397929 1849 ntTSL 1 (best) BASIC2.53□□□□□ -2.01
ITSN1Q15811 OR1A2-201ENST00000381951 930 ntAPPRIS P1 BASIC2.52□□□□□ -2.01
ITSN1Q15811 RNU2-20P-201ENST00000410425 191 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
ITSN1Q15811 AC004946.1-201ENST00000421825 751 ntTSL 3 BASIC2.52□□□□□ -2.01
ITSN1Q15811 AL157884.2-201ENST00000424177 551 ntTSL 3 BASIC2.52□□□□□ -2.01
ITSN1Q15811 HIGD1AP11-201ENST00000438361 280 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
ITSN1Q15811 LINC00529-201ENST00000443854 241 ntTSL 2 BASIC2.52□□□□□ -2.01
ITSN1Q15811 RPL23AP20-201ENST00000447965 421 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
ITSN1Q15811 LINC01455-201ENST00000503167 561 ntTSL 4 BASIC2.52□□□□□ -2.01
ITSN1Q15811 LINC02488-201ENST00000504287 652 ntTSL 2 BASIC2.52□□□□□ -2.01
ITSN1Q15811 AC090071.1-201ENST00000507713 644 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
ITSN1Q15811 C1GALT1P2-201ENST00000510813 1104 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
ITSN1Q15811 RNU6-250P-201ENST00000516958 103 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
ITSN1Q15811 MIR5089-201ENST00000580047 84 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
ITSN1Q15811 MIR4448-201ENST00000584360 86 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
ITSN1Q15811 RPL19P1-201ENST00000411635 428 ntBASIC2.51□□□□□ -2.01
ITSN1Q15811 AC092832.1-201ENST00000422934 400 ntBASIC2.51□□□□□ -2.01
ITSN1Q15811 RPL23AP76-201ENST00000441860 458 ntBASIC2.51□□□□□ -2.01
ITSN1Q15811 AC009987.1-201ENST00000446888 806 ntTSL 5 BASIC2.51□□□□□ -2.01
ITSN1Q15811 AC090023.1-201ENST00000545750 443 ntTSL 3 BASIC2.51□□□□□ -2.01
ITSN1Q15811 AC011468.4-201ENST00000603942 409 ntBASIC2.51□□□□□ -2.01
ITSN1Q15811 AC005156.1-201ENST00000613371 573 ntBASIC2.51□□□□□ -2.01
ITSN1Q15811 AC114546.3-201ENST00000623582 1734 ntBASIC2.51□□□□□ -2.01
ITSN1Q15811 XKRY2-202ENST00000623874 1581 ntBASIC2.51□□□□□ -2.01
ITSN1Q15811 XKRY-202ENST00000624960 1581 ntBASIC2.51□□□□□ -2.01
ITSN1Q15811 TDRD15-202ENST00000622654 5805 ntAPPRIS P1 BASIC2.51□□□□□ -2.01
ITSN1Q15811 NBPF20-202ENST00000392971 18450 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC2.51□□□□□ -2.01
ITSN1Q15811 AK9-203ENST00000368948 2478 ntTSL 5 BASIC2.51□□□□□ -2.01
ITSN1Q15811 Y_RNA.355-201ENST00000365462 98 ntBASIC2.51□□□□□ -2.01
ITSN1Q15811 SNRPFP2-201ENST00000440710 251 ntBASIC2.51□□□□□ -2.01
ITSN1Q15811 AL133260.2-201ENST00000445833 396 ntTSL 3 BASIC2.51□□□□□ -2.01
ITSN1Q15811 AC107393.1-201ENST00000512403 346 ntBASIC2.51□□□□□ -2.01
ITSN1Q15811 SNORA31.11-201ENST00000516528 139 ntBASIC2.51□□□□□ -2.01
ITSN1Q15811 AC018682.2-201ENST00000517716 399 ntTSL 5 BASIC2.51□□□□□ -2.01
ITSN1Q15811 AP003385.6-201ENST00000531603 374 ntBASIC2.51□□□□□ -2.01
ITSN1Q15811 LINC02300-201ENST00000549742 665 ntTSL 4 BASIC2.51□□□□□ -2.01
ITSN1Q15811 MIR4303-201ENST00000581299 66 ntBASIC2.51□□□□□ -2.01
ITSN1Q15811 AC092159.4-201ENST00000624944 550 ntBASIC2.51□□□□□ -2.01
ITSN1Q15811 SLCO1B3-201ENST00000261196 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.51□□□□□ -2.01
ITSN1Q15811 KPNA5-202ENST00000368564 11311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.5□□□□□ -2.01
ITSN1Q15811 ART3-202ENST00000349321 1528 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.5□□□□□ -2.01
ITSN1Q15811 CFHR4-202ENST00000367416 2178 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.5□□□□□ -2.01
ITSN1Q15811 DDIAS-201ENST00000329143 3367 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC2.5□□□□□ -2.01
ITSN1Q15811 AL139276.1-201ENST00000311910 1001 ntBASIC2.5□□□□□ -2.01
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