Protein–RNA interactions for Protein: Q15751

HERC1, Probable E3 ubiquitin-protein ligase HERC1, humanhuman

Predictions only

Length 4,861 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HERC1Q15751 MCMDC2-201ENST00000313616 2043 ntTSL 2 BASIC1.21□□□□□ -2.22
HERC1Q15751 ZNF355P-201ENST00000427301 3216 ntBASIC1.21□□□□□ -2.22
HERC1Q15751 FAM35CP-201ENST00000554755 2470 ntBASIC1.21□□□□□ -2.22
HERC1Q15751 DPP10-205ENST00000410059 6278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC1.21□□□□□ -2.22
HERC1Q15751 RNU1-75P-201ENST00000347264 129 ntBASIC1.21□□□□□ -2.22
HERC1Q15751 EI24P1-201ENST00000416584 867 ntBASIC1.21□□□□□ -2.22
HERC1Q15751 MLIP-IT1-201ENST00000441845 643 ntTSL 2 BASIC1.21□□□□□ -2.22
HERC1Q15751 AC090970.3-201ENST00000612566 866 ntBASIC1.21□□□□□ -2.22
HERC1Q15751 AL160287.1-202ENST00000638113 454 ntTSL 5 BASIC1.21□□□□□ -2.22
HERC1Q15751 ZNF518A-210ENST00000624776 7994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.21□□□□□ -2.22
HERC1Q15751 LINC00158-201ENST00000332587 1476 ntTSL 1 (best) BASIC1.21□□□□□ -2.22
HERC1Q15751 AC095050.2-201ENST00000510748 1458 ntBASIC1.21□□□□□ -2.22
HERC1Q15751 OR4C11-202ENST00000641580 2737 ntAPPRIS P1 BASIC1.21□□□□□ -2.22
HERC1Q15751 SNORA67.5-201ENST00000391036 107 ntBASIC1.21□□□□□ -2.22
HERC1Q15751 RNA5SP344-201ENST00000411081 104 ntBASIC1.21□□□□□ -2.22
HERC1Q15751 HMGB3P23-201ENST00000414981 585 ntBASIC1.21□□□□□ -2.22
HERC1Q15751 AC090539.1-201ENST00000523907 434 ntTSL 3 BASIC1.21□□□□□ -2.22
HERC1Q15751 AC036111.3-201ENST00000526389 112 ntBASIC1.21□□□□□ -2.22
HERC1Q15751 FOXP2-211ENST00000408937 6443 ntTSL 1 (best) BASIC1.21□□□□□ -2.22
HERC1Q15751 CYSLTR1-203ENST00000614798 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.21□□□□□ -2.22
HERC1Q15751 FSIP2-206ENST00000611759 3882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC1.21□□□□□ -2.22
HERC1Q15751 CCDC168-201ENST00000322527 21466 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC1.21□□□□□ -2.22
HERC1Q15751 CUL2-206ENST00000421317 2376 ntTSL 2 BASIC1.21□□□□□ -2.22
HERC1Q15751 EIF5P1-201ENST00000400019 1231 ntBASIC1.21□□□□□ -2.22
HERC1Q15751 RPS20P25-201ENST00000412447 352 ntBASIC1.21□□□□□ -2.22
HERC1Q15751 AL158825.1-201ENST00000414735 521 ntBASIC1.21□□□□□ -2.22
HERC1Q15751 AC012498.1-201ENST00000424037 437 ntBASIC1.21□□□□□ -2.22
HERC1Q15751 AC007560.1-201ENST00000426912 237 ntBASIC1.21□□□□□ -2.22
HERC1Q15751 YWHAZP7-201ENST00000436906 631 ntBASIC1.21□□□□□ -2.22
HERC1Q15751 AC105402.2-201ENST00000438503 358 ntBASIC1.21□□□□□ -2.22
HERC1Q15751 AL160408.1-203ENST00000453568 631 ntTSL 5 BASIC1.21□□□□□ -2.22
HERC1Q15751 FGF7P3-201ENST00000454645 303 ntBASIC1.21□□□□□ -2.22
HERC1Q15751 OR8B3-201ENST00000354597 942 ntAPPRIS P1 BASIC1.2□□□□□ -2.22
HERC1Q15751 OR8B2-201ENST00000375013 942 ntAPPRIS P1 BASIC1.2□□□□□ -2.22
HERC1Q15751 DEFB109C-201ENST00000382575 264 ntBASIC1.2□□□□□ -2.22
HERC1Q15751 DEFB109B-201ENST00000382656 264 ntBASIC1.2□□□□□ -2.22
HERC1Q15751 AMD1P2-201ENST00000412936 992 ntBASIC1.2□□□□□ -2.22
HERC1Q15751 ELF3-AS1-201ENST00000415582 500 ntTSL 2 BASIC1.2□□□□□ -2.22
HERC1Q15751 SLC44A3-AS1-205ENST00000424505 612 ntBASIC1.2□□□□□ -2.22
HERC1Q15751 AC104304.1-201ENST00000505797 291 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC1.2□□□□□ -2.22
HERC1Q15751 PDCL2P2-201ENST00000533651 189 ntBASIC1.2□□□□□ -2.22
HERC1Q15751 AL161757.2-201ENST00000553800 421 ntTSL 3 BASIC1.2□□□□□ -2.22
HERC1Q15751 AL133371.2-201ENST00000556624 294 ntTSL 3 BASIC1.2□□□□□ -2.22
HERC1Q15751 AC138207.6-203ENST00000581652 565 ntTSL 4 BASIC1.2□□□□□ -2.22
HERC1Q15751 AC006116.7-201ENST00000590141 756 ntBASIC1.2□□□□□ -2.22
HERC1Q15751 TUBD1-214ENST00000592426 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.2□□□□□ -2.22
HERC1Q15751 AC021237.1-201ENST00000504175 1643 ntTSL 2 BASIC1.2□□□□□ -2.22
HERC1Q15751 DST-201ENST00000244364 16742 ntTSL 1 (best) BASIC1.2□□□□□ -2.22
HERC1Q15751 IL6ST-201ENST00000336909 8776 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC1.2□□□□□ -2.22
HERC1Q15751 HAS2-201ENST00000303924 4190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.2□□□□□ -2.22
HERC1Q15751 Y_RNA.136-201ENST00000363444 102 ntBASIC1.2□□□□□ -2.22
HERC1Q15751 RNU4-41P-201ENST00000364426 143 ntBASIC1.2□□□□□ -2.22
HERC1Q15751 AL590762.3-201ENST00000436372 640 ntBASIC1.2□□□□□ -2.22
HERC1Q15751 KNTC1-205ENST00000450485 3655 ntTSL 2 BASIC1.2□□□□□ -2.22
HERC1Q15751 AL645939.1-201ENST00000453429 797 ntBASIC1.2□□□□□ -2.22
HERC1Q15751 AC083973.1-205ENST00000518994 601 ntTSL 2 BASIC1.2□□□□□ -2.22
HERC1Q15751 CYP3A51P-201ENST00000633513 256 ntBASIC1.2□□□□□ -2.22
HERC1Q15751 GLIPR1-201ENST00000266659 5877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.2□□□□□ -2.22
HERC1Q15751 PROS2P-201ENST00000474651 1951 ntBASIC1.2□□□□□ -2.22
HERC1Q15751 CHD9-218ENST00000566029 13110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.2□□□□□ -2.22
HERC1Q15751 DDX43P2-201ENST00000604753 1354 ntBASIC1.2□□□□□ -2.22
HERC1Q15751 AC025263.3-201ENST00000622965 1396 ntBASIC1.2□□□□□ -2.22
HERC1Q15751 MIR193B-201ENST00000384907 83 ntBASIC1.2□□□□□ -2.22
HERC1Q15751 MAGI2-AS2-201ENST00000411616 476 ntTSL 2 BASIC1.2□□□□□ -2.22
HERC1Q15751 AC003092.2-201ENST00000411946 446 ntTSL 2 BASIC1.2□□□□□ -2.22
HERC1Q15751 AL390023.1-201ENST00000428836 262 ntBASIC1.2□□□□□ -2.22
HERC1Q15751 LINC01332-201ENST00000506612 502 ntTSL 4 BASIC1.2□□□□□ -2.22
HERC1Q15751 WDR3-201ENST00000349139 9974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.2□□□□□ -2.22
HERC1Q15751 Y_RNA.60-201ENST00000362831 98 ntBASIC1.2□□□□□ -2.22
HERC1Q15751 AC234781.2-201ENST00000426370 994 ntBASIC1.2□□□□□ -2.22
HERC1Q15751 RPS15AP1-201ENST00000457423 391 ntBASIC1.2□□□□□ -2.22
HERC1Q15751 AC104574.1-201ENST00000561182 925 ntTSL 1 (best) BASIC1.2□□□□□ -2.22
HERC1Q15751 AC007193.1-201ENST00000599645 448 ntTSL 5 BASIC1.2□□□□□ -2.22
HERC1Q15751 ADGRV1-201ENST00000405460 19557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.19□□□□□ -2.22
HERC1Q15751 AIMP1P1-201ENST00000418670 937 ntBASIC1.19□□□□□ -2.22
HERC1Q15751 AC023669.2-201ENST00000436266 239 ntTSL 3 BASIC1.19□□□□□ -2.22
HERC1Q15751 AL590399.6-201ENST00000446396 307 ntBASIC1.19□□□□□ -2.22
HERC1Q15751 RPL36AP33-201ENST00000450395 310 ntBASIC1.19□□□□□ -2.22
HERC1Q15751 MIR5089-201ENST00000580047 84 ntBASIC1.19□□□□□ -2.22
HERC1Q15751 AC098657.3-201ENST00000620434 263 ntBASIC1.19□□□□□ -2.22
HERC1Q15751 TAS2R13-201ENST00000390677 1637 ntAPPRIS P1 BASIC1.19□□□□□ -2.22
HERC1Q15751 LRRC70-201ENST00000334994 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.19□□□□□ -2.22
HERC1Q15751 OXR1-215ENST00000531443 3599 ntTSL 5 BASIC1.19□□□□□ -2.22
HERC1Q15751 TMEM59-205ENST00000371348 1911 ntTSL 1 (best) BASIC1.19□□□□□ -2.22
HERC1Q15751 RNA5SP274-201ENST00000410484 108 ntBASIC1.19□□□□□ -2.22
HERC1Q15751 RFC5P1-201ENST00000454419 874 ntBASIC1.19□□□□□ -2.22
HERC1Q15751 BX322784.1-201ENST00000455793 1077 ntBASIC1.19□□□□□ -2.22
HERC1Q15751 MTAPP1-201ENST00000489154 819 ntBASIC1.19□□□□□ -2.22
HERC1Q15751 GPR34-203ENST00000620846 1282 ntTSL 1 (best) BASIC1.19□□□□□ -2.22
HERC1Q15751 RNU6-35P-201ENST00000384530 107 ntBASIC1.19□□□□□ -2.22
HERC1Q15751 AC069280.1-201ENST00000413094 439 ntTSL 3 BASIC1.19□□□□□ -2.22
HERC1Q15751 RAC1P3-201ENST00000416129 580 ntBASIC1.19□□□□□ -2.22
HERC1Q15751 AC017078.1-201ENST00000416146 368 ntBASIC1.19□□□□□ -2.22
HERC1Q15751 AIG1P1-201ENST00000503376 148 ntBASIC1.19□□□□□ -2.22
HERC1Q15751 PSMA4-204ENST00000558094 651 ntTSL 3 BASIC1.19□□□□□ -2.22
HERC1Q15751 AC007495.2-202ENST00000564102 535 ntTSL 4 BASIC1.19□□□□□ -2.22
HERC1Q15751 DNAH14-210ENST00000439375 13548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.19□□□□□ -2.22
HERC1Q15751 DMD-230ENST00000620040 13746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC1.19□□□□□ -2.22
HERC1Q15751 RPS27P29-201ENST00000463110 252 ntBASIC1.18□□□□□ -2.22
HERC1Q15751 AC117386.2-202ENST00000472821 522 ntTSL 3 BASIC1.18□□□□□ -2.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 101.4 ms