Protein–RNA interactions for Protein: Q15386

UBE3C, Ubiquitin-protein ligase E3C, humanhuman

Predictions only

Length 1,083 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBE3CQ15386 ZNF863P-201ENST00000426746 417 ntBASIC4.75□□□□□ -1.65
UBE3CQ15386 MYCBP2-AS1-202ENST00000448470 333 ntTSL 3 BASIC4.75□□□□□ -1.65
UBE3CQ15386 MTND3P10-201ENST00000450967 341 ntBASIC4.75□□□□□ -1.65
UBE3CQ15386 LINC00374-201ENST00000454780 800 ntTSL 3 BASIC4.75□□□□□ -1.65
UBE3CQ15386 C1DP4-201ENST00000455429 424 ntBASIC4.75□□□□□ -1.65
UBE3CQ15386 RPL31P61-201ENST00000496160 376 ntBASIC4.75□□□□□ -1.65
UBE3CQ15386 AC114967.1-201ENST00000504890 259 ntBASIC4.75□□□□□ -1.65
UBE3CQ15386 AC008780.1-201ENST00000513392 409 ntTSL 5 BASIC4.75□□□□□ -1.65
UBE3CQ15386 LINC01969-201ENST00000514468 455 ntTSL 3 BASIC4.75□□□□□ -1.65
UBE3CQ15386 AC010255.3-204ENST00000514637 454 ntTSL 2 BASIC4.75□□□□□ -1.65
UBE3CQ15386 LINC00944-201ENST00000536517 421 ntTSL 2 BASIC4.75□□□□□ -1.65
UBE3CQ15386 AC009511.1-201ENST00000543527 191 ntTSL 5 BASIC4.75□□□□□ -1.65
UBE3CQ15386 AC069061.2-202ENST00000580280 357 ntTSL 3 BASIC4.75□□□□□ -1.65
UBE3CQ15386 AC008277.2-201ENST00000605196 797 ntBASIC4.75□□□□□ -1.65
UBE3CQ15386 AL390208.1-201ENST00000605885 644 ntBASIC4.75□□□□□ -1.65
UBE3CQ15386 AL158196.1-201ENST00000616786 434 ntBASIC4.75□□□□□ -1.65
UBE3CQ15386 AC009268.2-201ENST00000621925 457 ntBASIC4.75□□□□□ -1.65
UBE3CQ15386 AC004009.2-201ENST00000623016 728 ntBASIC4.75□□□□□ -1.65
UBE3CQ15386 AC010149.2-201ENST00000637608 315 ntBASIC4.75□□□□□ -1.65
UBE3CQ15386 AC092017.3-201ENST00000638880 536 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.75□□□□□ -1.65
UBE3CQ15386 CAPZA2-215ENST00000639546 129 ntTSL 5 BASIC4.75□□□□□ -1.65
UBE3CQ15386 CPB2-202ENST00000439329 1655 ntTSL 5 BASIC4.75□□□□□ -1.65
UBE3CQ15386 PTPN13-202ENST00000411767 8119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.75□□□□□ -1.65
UBE3CQ15386 ELL2P4-201ENST00000446870 1376 ntBASIC4.75□□□□□ -1.65
UBE3CQ15386 RBBP6-202ENST00000348022 5739 ntTSL 1 (best) BASIC4.75□□□□□ -1.65
UBE3CQ15386 GPR180-201ENST00000376958 8822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.74□□□□□ -1.65
UBE3CQ15386 TPTE2-201ENST00000255310 1562 ntTSL 5 BASIC4.74□□□□□ -1.65
UBE3CQ15386 AC011978.2-201ENST00000569835 2054 ntBASIC4.74□□□□□ -1.65
UBE3CQ15386 AFTPH-205ENST00000422803 1525 ntTSL 5 BASIC4.74□□□□□ -1.65
UBE3CQ15386 SCEL-201ENST00000349847 2386 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC4.74□□□□□ -1.65
UBE3CQ15386 Y_RNA.1-201ENST00000352915 104 ntBASIC4.74□□□□□ -1.65
UBE3CQ15386 RNU6-28P-201ENST00000362378 107 ntBASIC4.74□□□□□ -1.65
UBE3CQ15386 LZIC-201ENST00000377213 945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.74□□□□□ -1.65
UBE3CQ15386 MRPL42P2-201ENST00000403169 426 ntBASIC4.74□□□□□ -1.65
UBE3CQ15386 CBLL1-202ENST00000415884 804 ntTSL 5 BASIC4.74□□□□□ -1.65
UBE3CQ15386 MTATP6P27-201ENST00000416987 621 ntBASIC4.74□□□□□ -1.65
UBE3CQ15386 ELOCP14-201ENST00000428070 331 ntBASIC4.74□□□□□ -1.65
UBE3CQ15386 AC002486.1-201ENST00000435098 391 ntBASIC4.74□□□□□ -1.65
UBE3CQ15386 LINC00411-201ENST00000436722 461 ntTSL 3 BASIC4.74□□□□□ -1.65
UBE3CQ15386 HMGB1P37-201ENST00000439613 609 ntBASIC4.74□□□□□ -1.65
UBE3CQ15386 ELOCP7-201ENST00000439968 331 ntBASIC4.74□□□□□ -1.65
UBE3CQ15386 MTND2P24-201ENST00000453434 806 ntBASIC4.74□□□□□ -1.65
UBE3CQ15386 PLGLA-201ENST00000465668 449 ntBASIC4.74□□□□□ -1.65
UBE3CQ15386 AC007182.2-201ENST00000489251 402 ntBASIC4.74□□□□□ -1.65
UBE3CQ15386 C4orf33-204ENST00000502887 1126 ntTSL 1 (best) BASIC4.74□□□□□ -1.65
UBE3CQ15386 TXNP6-201ENST00000510190 310 ntBASIC4.74□□□□□ -1.65
UBE3CQ15386 AP001992.1-204ENST00000525104 687 ntTSL 3 BASIC4.74□□□□□ -1.65
UBE3CQ15386 AC025030.2-201ENST00000552558 567 ntTSL 2 BASIC4.74□□□□□ -1.65
UBE3CQ15386 AL157687.1-201ENST00000554853 619 ntBASIC4.74□□□□□ -1.65
UBE3CQ15386 AL845331.3-202ENST00000562856 261 ntBASIC4.74□□□□□ -1.65
UBE3CQ15386 BLOC1S6-206ENST00000564765 706 ntTSL 4 BASIC4.74□□□□□ -1.65
UBE3CQ15386 AC106785.1-201ENST00000565935 262 ntBASIC4.74□□□□□ -1.65
UBE3CQ15386 ALDH3A2-208ENST00000571163 590 ntTSL 5 BASIC4.74□□□□□ -1.65
UBE3CQ15386 AC053481.3-201ENST00000577881 843 ntBASIC4.74□□□□□ -1.65
UBE3CQ15386 AC093227.2-201ENST00000589357 285 ntBASIC4.74□□□□□ -1.65
UBE3CQ15386 AC012603.1-201ENST00000606424 528 ntBASIC4.74□□□□□ -1.65
UBE3CQ15386 AC011816.2-201ENST00000607089 556 ntBASIC4.74□□□□□ -1.65
UBE3CQ15386 OR10AB1P-201ENST00000609613 938 ntBASIC4.74□□□□□ -1.65
UBE3CQ15386 AL161734.1-201ENST00000609720 557 ntBASIC4.74□□□□□ -1.65
UBE3CQ15386 AP003171.2-202ENST00000634657 355 ntTSL 5 BASIC4.74□□□□□ -1.65
UBE3CQ15386 OR8D1-202ENST00000641015 8286 ntAPPRIS P1 BASIC4.74□□□□□ -1.65
UBE3CQ15386 FAP-214ENST00000627638 2569 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC4.74□□□□□ -1.65
UBE3CQ15386 LINC00648-202ENST00000555985 2885 ntTSL 2 BASIC4.74□□□□□ -1.65
UBE3CQ15386 AC092447.10-201ENST00000620607 1652 ntBASIC4.73□□□□□ -1.65
UBE3CQ15386 MSTN-201ENST00000260950 2822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.73□□□□□ -1.65
UBE3CQ15386 AK9-201ENST00000285397 2566 ntTSL 1 (best) BASIC4.73□□□□□ -1.65
UBE3CQ15386 DLD-204ENST00000437604 1859 ntTSL 2 BASIC4.73□□□□□ -1.65
UBE3CQ15386 FILIP1L-209ENST00000487087 2321 ntTSL 5 BASIC4.73□□□□□ -1.65
UBE3CQ15386 MYCBP2-211ENST00000544440 14664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.73□□□□□ -1.65
UBE3CQ15386 FRG1BP-201ENST00000278882 761 ntBASIC4.73□□□□□ -1.65
UBE3CQ15386 OR5B3-201ENST00000309403 945 ntAPPRIS P1 BASIC4.73□□□□□ -1.65
UBE3CQ15386 HSFY1-202ENST00000309834 1038 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.73□□□□□ -1.65
UBE3CQ15386 HSFY2-202ENST00000344884 1038 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.73□□□□□ -1.65
UBE3CQ15386 SNORA72.1-201ENST00000363485 129 ntBASIC4.73□□□□□ -1.65
UBE3CQ15386 MIR513A2-201ENST00000385249 127 ntBASIC4.73□□□□□ -1.65
UBE3CQ15386 RNU6-780P-201ENST00000391030 104 ntBASIC4.73□□□□□ -1.65
UBE3CQ15386 RPA3-203ENST00000401447 414 ntTSL 3 BASIC4.73□□□□□ -1.65
UBE3CQ15386 RNU2-21P-201ENST00000410368 188 ntBASIC4.73□□□□□ -1.65
UBE3CQ15386 AC138393.2-201ENST00000414742 246 ntBASIC4.73□□□□□ -1.65
UBE3CQ15386 AC012065.2-201ENST00000421295 375 ntBASIC4.73□□□□□ -1.65
UBE3CQ15386 AL353777.1-201ENST00000425552 326 ntBASIC4.73□□□□□ -1.65
UBE3CQ15386 AL590233.1-201ENST00000430017 456 ntBASIC4.73□□□□□ -1.65
UBE3CQ15386 AC004875.1-201ENST00000432702 378 ntTSL 3 BASIC4.73□□□□□ -1.65
UBE3CQ15386 ST7-AS2-203ENST00000434993 918 ntTSL 1 (best) BASIC4.73□□□□□ -1.65
UBE3CQ15386 MTND5P20-201ENST00000448677 143 ntBASIC4.73□□□□□ -1.65
UBE3CQ15386 AC132479.1-201ENST00000449160 144 ntBASIC4.73□□□□□ -1.65
UBE3CQ15386 RPL7P15-201ENST00000461190 712 ntBASIC4.73□□□□□ -1.65
UBE3CQ15386 AC087312.1-201ENST00000471411 480 ntBASIC4.73□□□□□ -1.65
UBE3CQ15386 AC093767.1-201ENST00000504523 156 ntBASIC4.73□□□□□ -1.65
UBE3CQ15386 AC117522.1-201ENST00000509821 380 ntBASIC4.73□□□□□ -1.65
UBE3CQ15386 AC016550.2-202ENST00000511940 581 ntTSL 2 BASIC4.73□□□□□ -1.65
UBE3CQ15386 IGKV3OR22-2-201ENST00000517943 313 ntBASIC4.73□□□□□ -1.65
UBE3CQ15386 AC022616.6-201ENST00000520479 119 ntBASIC4.73□□□□□ -1.65
UBE3CQ15386 AK6P1-201ENST00000540219 478 ntBASIC4.73□□□□□ -1.65
UBE3CQ15386 MIR4458-201ENST00000578872 75 ntBASIC4.73□□□□□ -1.65
UBE3CQ15386 AC027514.2-201ENST00000591014 637 ntTSL 3 BASIC4.73□□□□□ -1.65
UBE3CQ15386 AC005255.1-201ENST00000593748 216 ntBASIC4.73□□□□□ -1.65
UBE3CQ15386 AC007363.1-201ENST00000604736 620 ntBASIC4.73□□□□□ -1.65
UBE3CQ15386 AC017083.3-201ENST00000609955 700 ntBASIC4.73□□□□□ -1.65
UBE3CQ15386 AC009159.1-201ENST00000618386 642 ntBASIC4.73□□□□□ -1.65
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 82.9 ms