Protein–RNA interactions for Protein: Q15012

LAPTM4A, Lysosomal-associated transmembrane protein 4A, humanhuman

Predictions only

Length 233 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LAPTM4AQ15012 RN7SKP78-201ENST00000364711 318 ntBASIC5.75□□□□□ -1.49
LAPTM4AQ15012 RNU6-1180P-201ENST00000364935 107 ntBASIC5.75□□□□□ -1.49
LAPTM4AQ15012 MIR29B2-201ENST00000385055 81 ntBASIC5.75□□□□□ -1.49
LAPTM4AQ15012 MIR323B-201ENST00000385269 82 ntBASIC5.75□□□□□ -1.49
LAPTM4AQ15012 AL590290.1-201ENST00000405336 380 ntBASIC5.75□□□□□ -1.49
LAPTM4AQ15012 AL023807.1-201ENST00000407932 359 ntBASIC5.75□□□□□ -1.49
LAPTM4AQ15012 C1orf195-201ENST00000424792 255 ntTSL 2 BASIC5.75□□□□□ -1.49
LAPTM4AQ15012 AC073069.1-201ENST00000428657 441 ntBASIC5.75□□□□□ -1.49
LAPTM4AQ15012 LINC02095-201ENST00000430908 346 ntTSL 2 BASIC5.75□□□□□ -1.49
LAPTM4AQ15012 AC004938.1-201ENST00000438468 308 ntBASIC5.75□□□□□ -1.49
LAPTM4AQ15012 COL11A2P1-205ENST00000441798 676 ntBASIC5.75□□□□□ -1.49
LAPTM4AQ15012 AC245088.1-201ENST00000486508 384 ntTSL 3 BASIC5.75□□□□□ -1.49
LAPTM4AQ15012 AC073429.1-201ENST00000511749 503 ntTSL 3 BASIC5.75□□□□□ -1.49
LAPTM4AQ15012 AC006065.4-203ENST00000541065 526 ntTSL 2 BASIC5.75□□□□□ -1.49
LAPTM4AQ15012 PWRN1-208ENST00000567647 561 ntTSL 5 BASIC5.75□□□□□ -1.49
LAPTM4AQ15012 RPL7AP69-201ENST00000595306 806 ntBASIC5.75□□□□□ -1.49
LAPTM4AQ15012 MPHOSPH9-220ENST00000606320 6351 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC5.75□□□□□ -1.49
LAPTM4AQ15012 AL596245.1-201ENST00000618994 362 ntBASIC5.75□□□□□ -1.49
LAPTM4AQ15012 ZFYVE9-202ENST00000357206 4567 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC5.75□□□□□ -1.49
LAPTM4AQ15012 HDAC9-203ENST00000406072 4102 ntTSL 5 BASIC5.75□□□□□ -1.49
LAPTM4AQ15012 LINC00891-201ENST00000627173 4113 ntTSL 2 BASIC5.75□□□□□ -1.49
LAPTM4AQ15012 MACF1-232ENST00000567887 24319 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC5.75□□□□□ -1.49
LAPTM4AQ15012 ELOVL6-202ENST00000394607 6454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.75□□□□□ -1.49
LAPTM4AQ15012 AC083837.1-201ENST00000565297 2994 ntBASIC5.75□□□□□ -1.49
LAPTM4AQ15012 CSNK1G1-204ENST00000606793 1658 ntTSL 5 BASIC5.75□□□□□ -1.49
LAPTM4AQ15012 FLG2-201ENST00000388718 9124 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.75□□□□□ -1.49
LAPTM4AQ15012 SREK1-203ENST00000380918 2433 ntTSL 1 (best) BASIC5.75□□□□□ -1.49
LAPTM4AQ15012 MMP13-201ENST00000260302 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.75□□□□□ -1.49
LAPTM4AQ15012 CLMN-201ENST00000298912 12747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.75□□□□□ -1.49
LAPTM4AQ15012 FILIP1L-202ENST00000354552 3970 ntTSL 1 (best) BASIC5.74□□□□□ -1.49
LAPTM4AQ15012 ZCCHC6-204ENST00000375957 2262 ntTSL 2 BASIC5.74□□□□□ -1.49
LAPTM4AQ15012 AC068870.1-201ENST00000563737 2455 ntBASIC5.74□□□□□ -1.49
LAPTM4AQ15012 ROCK1P1-203ENST00000608049 2457 ntTSL 1 (best) BASIC5.74□□□□□ -1.49
LAPTM4AQ15012 AC099654.7-201ENST00000635788 2127 ntBASIC5.74□□□□□ -1.49
LAPTM4AQ15012 MOCS2-201ENST00000361377 3568 ntTSL 4 BASIC5.74□□□□□ -1.49
LAPTM4AQ15012 AC108866.1-201ENST00000503073 2339 ntTSL 5 BASIC5.74□□□□□ -1.49
LAPTM4AQ15012 FIGN-201ENST00000333129 9536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.74□□□□□ -1.49
LAPTM4AQ15012 SCN2A-202ENST00000375427 8553 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC5.74□□□□□ -1.49
LAPTM4AQ15012 ARHGEF12-213ENST00000532993 8753 ntTSL 1 (best) BASIC5.74□□□□□ -1.49
LAPTM4AQ15012 ZNF300P1-202ENST00000520773 3115 ntTSL 5 BASIC5.74□□□□□ -1.49
LAPTM4AQ15012 PTPRB-210ENST00000551525 5291 ntTSL 1 (best) BASIC5.74□□□□□ -1.49
LAPTM4AQ15012 SNORD16-201ENST00000362803 99 ntBASIC5.74□□□□□ -1.49
LAPTM4AQ15012 RGS10-201ENST00000369101 738 ntTSL 1 (best) BASIC5.74□□□□□ -1.49
LAPTM4AQ15012 Y_RNA.480-201ENST00000384364 102 ntBASIC5.74□□□□□ -1.49
LAPTM4AQ15012 RNU6-19P-201ENST00000384718 107 ntBASIC5.74□□□□□ -1.49
LAPTM4AQ15012 IGKV5-2-201ENST00000390244 408 ntAPPRIS P1 BASIC5.74□□□□□ -1.49
LAPTM4AQ15012 RNA5SP231-201ENST00000410496 138 ntBASIC5.74□□□□□ -1.49
LAPTM4AQ15012 AC121342.1-201ENST00000423914 550 ntTSL 3 BASIC5.74□□□□□ -1.49
LAPTM4AQ15012 WARS2P1-201ENST00000429678 537 ntBASIC5.74□□□□□ -1.49
LAPTM4AQ15012 AL591704.1-201ENST00000432574 275 ntBASIC5.74□□□□□ -1.49
LAPTM4AQ15012 AL138767.3-201ENST00000438082 495 ntTSL 3 BASIC5.74□□□□□ -1.49
LAPTM4AQ15012 AL513043.1-201ENST00000439124 535 ntBASIC5.74□□□□□ -1.49
LAPTM4AQ15012 AL590399.6-201ENST00000446396 307 ntBASIC5.74□□□□□ -1.49
LAPTM4AQ15012 RNU7-27P-201ENST00000459281 62 ntBASIC5.74□□□□□ -1.49
LAPTM4AQ15012 KCNIP2-211ENST00000461105 858 ntTSL 1 (best) BASIC5.74□□□□□ -1.49
LAPTM4AQ15012 RN7SL432P-201ENST00000484057 298 ntBASIC5.74□□□□□ -1.49
LAPTM4AQ15012 ANXA2P1-201ENST00000505539 926 ntBASIC5.74□□□□□ -1.49
LAPTM4AQ15012 AC093870.1-201ENST00000506837 213 ntBASIC5.74□□□□□ -1.49
LAPTM4AQ15012 B4GALNT2P1-201ENST00000508857 307 ntBASIC5.74□□□□□ -1.49
LAPTM4AQ15012 AC093664.1-201ENST00000511779 289 ntBASIC5.74□□□□□ -1.49
LAPTM4AQ15012 IGKV2-36-201ENST00000519999 223 ntBASIC5.74□□□□□ -1.49
LAPTM4AQ15012 PWRN1-202ENST00000562501 642 ntTSL 3 BASIC5.74□□□□□ -1.49
LAPTM4AQ15012 CASC22-201ENST00000569713 386 ntTSL 5 BASIC5.74□□□□□ -1.49
LAPTM4AQ15012 RNU4ATAC-201ENST00000580972 127 ntBASIC5.74□□□□□ -1.49
LAPTM4AQ15012 AC008738.1-201ENST00000590117 375 ntTSL 5 BASIC5.74□□□□□ -1.49
LAPTM4AQ15012 AC020916.2-201ENST00000591242 360 ntBASIC5.74□□□□□ -1.49
LAPTM4AQ15012 KLKP1-201ENST00000595979 403 ntBASIC5.74□□□□□ -1.49
LAPTM4AQ15012 BPIFA4P-203ENST00000603168 689 ntBASIC5.74□□□□□ -1.49
LAPTM4AQ15012 AC004805.3-201ENST00000603178 310 ntBASIC5.74□□□□□ -1.49
LAPTM4AQ15012 AC006329.2-201ENST00000611491 394 ntBASIC5.74□□□□□ -1.49
LAPTM4AQ15012 AP001340.1-201ENST00000624405 217 ntBASIC5.74□□□□□ -1.49
LAPTM4AQ15012 TRIM36-209ENST00000514154 1952 ntTSL 1 (best) BASIC5.74□□□□□ -1.49
LAPTM4AQ15012 ARIH1-201ENST00000379887 21681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.74□□□□□ -1.49
LAPTM4AQ15012 LRRC49-201ENST00000260382 2784 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.74□□□□□ -1.49
LAPTM4AQ15012 ZNF699-203ENST00000591998 3358 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.74□□□□□ -1.49
LAPTM4AQ15012 MELK-210ENST00000543751 2400 ntTSL 1 (best) BASIC5.74□□□□□ -1.49
LAPTM4AQ15012 AL136164.4-201ENST00000625013 2135 ntBASIC5.74□□□□□ -1.49
LAPTM4AQ15012 ECT2-216ENST00000540509 4406 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC5.73□□□□□ -1.49
LAPTM4AQ15012 MAPK10-370ENST00000641943 4117 ntAPPRIS P2 BASIC5.73□□□□□ -1.49
LAPTM4AQ15012 RBMS2-201ENST00000262031 8382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.73□□□□□ -1.49
LAPTM4AQ15012 ZBTB25-201ENST00000394715 2094 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.73□□□□□ -1.49
LAPTM4AQ15012 LINC00698-203ENST00000468072 1957 ntTSL 1 (best) BASIC5.73□□□□□ -1.49
LAPTM4AQ15012 HELZ-207ENST00000580168 6279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.73□□□□□ -1.49
LAPTM4AQ15012 SNORD72-201ENST00000390994 80 ntBASIC5.73□□□□□ -1.49
LAPTM4AQ15012 U3.22-201ENST00000391120 215 ntBASIC5.73□□□□□ -1.49
LAPTM4AQ15012 RNU5A-5P-201ENST00000411054 116 ntBASIC5.73□□□□□ -1.49
LAPTM4AQ15012 RPS26P40-201ENST00000435209 294 ntBASIC5.73□□□□□ -1.49
LAPTM4AQ15012 AL590399.4-201ENST00000436561 601 ntBASIC5.73□□□□□ -1.49
LAPTM4AQ15012 POLR2KP2-201ENST00000438155 177 ntBASIC5.73□□□□□ -1.49
LAPTM4AQ15012 AC004386.2-201ENST00000441858 148 ntBASIC5.73□□□□□ -1.49
LAPTM4AQ15012 HMGN2P32-201ENST00000444648 269 ntBASIC5.73□□□□□ -1.49
LAPTM4AQ15012 LINC01203-202ENST00000456091 476 ntTSL 3 BASIC5.73□□□□□ -1.49
LAPTM4AQ15012 RANP2-201ENST00000456833 229 ntBASIC5.73□□□□□ -1.49
LAPTM4AQ15012 LINC01753-201ENST00000458145 631 ntTSL 3 BASIC5.73□□□□□ -1.49
LAPTM4AQ15012 AC073901.1-201ENST00000462471 408 ntBASIC5.73□□□□□ -1.49
LAPTM4AQ15012 AC139453.2-201ENST00000487255 133 ntBASIC5.73□□□□□ -1.49
LAPTM4AQ15012 AL159163.1-201ENST00000507747 600 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.73□□□□□ -1.49
LAPTM4AQ15012 MINOS1P4-201ENST00000515470 318 ntBASIC5.73□□□□□ -1.49
LAPTM4AQ15012 MIR2355-201ENST00000517199 87 ntBASIC5.73□□□□□ -1.49
LAPTM4AQ15012 AP000842.2-202ENST00000526211 569 ntTSL 4 BASIC5.73□□□□□ -1.49
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