Protein–RNA interactions for Protein: Q14956

GPNMB, Transmembrane glycoprotein NMB, humanhuman

Predictions only

Length 572 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GPNMBQ14956 IL33-205ENST00000611532 757 ntTSL 1 (best) BASIC3.03□□□□□ -1.92
GPNMBQ14956 AL450489.1-201ENST00000612071 468 ntBASIC3.03□□□□□ -1.92
GPNMBQ14956 AL590808.1-201ENST00000618696 141 ntBASIC3.03□□□□□ -1.92
GPNMBQ14956 AC109454.4-201ENST00000623411 649 ntBASIC3.03□□□□□ -1.92
GPNMBQ14956 AC010608.3-201ENST00000625048 527 ntBASIC3.03□□□□□ -1.92
GPNMBQ14956 AC011139.1-202ENST00000637744 563 ntTSL 5 BASIC3.03□□□□□ -1.92
GPNMBQ14956 C6orf10-205ENST00000527965 2076 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC3.03□□□□□ -1.92
GPNMBQ14956 GABRG2-215ENST00000639213 9960 ntTSL 1 (best) BASIC3.03□□□□□ -1.92
GPNMBQ14956 NEB-204ENST00000409198 20637 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC3.02□□□□□ -1.93
GPNMBQ14956 VNN1-201ENST00000367928 3106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.02□□□□□ -1.93
GPNMBQ14956 MTND5P31-201ENST00000419366 1374 ntBASIC3.02□□□□□ -1.93
GPNMBQ14956 AC073130.1-201ENST00000457033 1958 ntTSL 2 BASIC3.02□□□□□ -1.93
GPNMBQ14956 UEVLD-208ENST00000535484 1963 ntTSL 2 BASIC3.02□□□□□ -1.93
GPNMBQ14956 RNA5SP383-201ENST00000362934 120 ntBASIC3.02□□□□□ -1.93
GPNMBQ14956 RNU6-236P-201ENST00000363886 106 ntBASIC3.02□□□□□ -1.93
GPNMBQ14956 HTN3-201ENST00000381057 493 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC3.02□□□□□ -1.93
GPNMBQ14956 RNU6-1181P-201ENST00000384191 106 ntBASIC3.02□□□□□ -1.93
GPNMBQ14956 AL121978.1-201ENST00000402778 359 ntBASIC3.02□□□□□ -1.93
GPNMBQ14956 RPL32P35-201ENST00000415214 394 ntBASIC3.02□□□□□ -1.93
GPNMBQ14956 AL589946.1-201ENST00000421465 420 ntTSL 3 BASIC3.02□□□□□ -1.93
GPNMBQ14956 AC005517.2-201ENST00000424673 553 ntBASIC3.02□□□□□ -1.93
GPNMBQ14956 TRIAP1P1-201ENST00000427062 225 ntBASIC3.02□□□□□ -1.93
GPNMBQ14956 VDAC1P3-201ENST00000434069 851 ntBASIC3.02□□□□□ -1.93
GPNMBQ14956 AL590103.1-201ENST00000434488 307 ntBASIC3.02□□□□□ -1.93
GPNMBQ14956 AC091133.1-201ENST00000435491 483 ntTSL 3 BASIC3.02□□□□□ -1.93
GPNMBQ14956 NUTM2A-AS1-209ENST00000447424 571 ntTSL 3 BASIC3.02□□□□□ -1.93
GPNMBQ14956 RPL7P52-201ENST00000449200 742 ntBASIC3.02□□□□□ -1.93
GPNMBQ14956 LINC01828-202ENST00000450294 955 ntTSL 5 BASIC3.02□□□□□ -1.93
GPNMBQ14956 AC244505.3-201ENST00000454598 187 ntBASIC3.02□□□□□ -1.93
GPNMBQ14956 AC104982.1-201ENST00000478775 574 ntBASIC3.02□□□□□ -1.93
GPNMBQ14956 HSPE1P6-201ENST00000479457 291 ntBASIC3.02□□□□□ -1.93
GPNMBQ14956 MTCO3P35-201ENST00000485582 781 ntBASIC3.02□□□□□ -1.93
GPNMBQ14956 RN7SL633P-201ENST00000488974 297 ntBASIC3.02□□□□□ -1.93
GPNMBQ14956 ZBTB20-AS3-201ENST00000498630 464 ntTSL 3 BASIC3.02□□□□□ -1.93
GPNMBQ14956 AC010210.1-203ENST00000513905 260 ntTSL 3 BASIC3.02□□□□□ -1.93
GPNMBQ14956 snoZ278.1-201ENST00000517059 112 ntBASIC3.02□□□□□ -1.93
GPNMBQ14956 AC011586.1-201ENST00000521055 458 ntTSL 3 BASIC3.02□□□□□ -1.93
GPNMBQ14956 AF279873.4-202ENST00000521714 511 ntTSL 2 BASIC3.02□□□□□ -1.93
GPNMBQ14956 TMEM68-214ENST00000523073 536 ntTSL 3 BASIC3.02□□□□□ -1.93
GPNMBQ14956 MTCYBP41-201ENST00000528913 1123 ntBASIC3.02□□□□□ -1.93
GPNMBQ14956 ZNF971P-201ENST00000562068 1249 ntBASIC3.02□□□□□ -1.93
GPNMBQ14956 AC016493.1-201ENST00000586106 688 ntTSL 1 (best) BASIC3.02□□□□□ -1.93
GPNMBQ14956 TUG1_1.1-201ENST00000610654 145 ntBASIC3.02□□□□□ -1.93
GPNMBQ14956 VN1R7P-201ENST00000619242 903 ntBASIC3.02□□□□□ -1.93
GPNMBQ14956 AC084824.4-201ENST00000620106 731 ntBASIC3.02□□□□□ -1.93
GPNMBQ14956 AL359757.2-201ENST00000624309 274 ntBASIC3.02□□□□□ -1.93
GPNMBQ14956 SATB1-AS1-227ENST00000625533 743 ntTSL 5 BASIC3.02□□□□□ -1.93
GPNMBQ14956 AL445984.1-201ENST00000637834 659 ntBASIC3.02□□□□□ -1.93
GPNMBQ14956 LRRC49-224ENST00000560691 2531 ntTSL 2 BASIC3.02□□□□□ -1.93
GPNMBQ14956 CYLC2-201ENST00000374798 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.02□□□□□ -1.93
GPNMBQ14956 CACNB4-222ENST00000636350 7654 ntTSL 5 BASIC3.02□□□□□ -1.93
GPNMBQ14956 SPAM1-205ENST00000439500 2220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.01□□□□□ -1.93
GPNMBQ14956 ASNSP3-201ENST00000451989 1306 ntBASIC3.01□□□□□ -1.93
GPNMBQ14956 AC092593.1-201ENST00000515413 1815 ntBASIC3.01□□□□□ -1.93
GPNMBQ14956 GABRG2-229ENST00000641017 3628 ntBASIC3.01□□□□□ -1.93
GPNMBQ14956 BCLAF1-205ENST00000527536 5371 ntTSL 5 BASIC3.01□□□□□ -1.93
GPNMBQ14956 U3.6-201ENST00000363622 211 ntBASIC3.01□□□□□ -1.93
GPNMBQ14956 RNU6-115P-201ENST00000364310 107 ntBASIC3.01□□□□□ -1.93
GPNMBQ14956 RNU6-1226P-201ENST00000384317 107 ntBASIC3.01□□□□□ -1.93
GPNMBQ14956 RNU6-921P-201ENST00000384361 107 ntBASIC3.01□□□□□ -1.93
GPNMBQ14956 RNU6-441P-201ENST00000384545 106 ntBASIC3.01□□□□□ -1.93
GPNMBQ14956 MT-TC-201ENST00000387405 66 ntBASIC3.01□□□□□ -1.93
GPNMBQ14956 AL139098.1-201ENST00000407291 389 ntBASIC3.01□□□□□ -1.93
GPNMBQ14956 HMGB3P23-201ENST00000414981 585 ntBASIC3.01□□□□□ -1.93
GPNMBQ14956 AL451127.1-201ENST00000422909 624 ntTSL 3 BASIC3.01□□□□□ -1.93
GPNMBQ14956 LINC01318-201ENST00000423593 597 ntTSL 4 BASIC3.01□□□□□ -1.93
GPNMBQ14956 LINC01611-201ENST00000428896 477 ntTSL 5 BASIC3.01□□□□□ -1.93
GPNMBQ14956 AC078883.3-201ENST00000458314 512 ntTSL 2 BASIC3.01□□□□□ -1.93
GPNMBQ14956 GAPDHP39-201ENST00000481866 979 ntBASIC3.01□□□□□ -1.93
GPNMBQ14956 YWHAEP4-201ENST00000505390 198 ntBASIC3.01□□□□□ -1.93
GPNMBQ14956 PPP2R2B-IT1-201ENST00000505921 447 ntTSL 3 BASIC3.01□□□□□ -1.93
GPNMBQ14956 LINC02353-201ENST00000515181 849 ntTSL 1 (best) BASIC3.01□□□□□ -1.93
GPNMBQ14956 AC104057.1-201ENST00000515547 497 ntBASIC3.01□□□□□ -1.93
GPNMBQ14956 AC023632.1-201ENST00000518463 375 ntBASIC3.01□□□□□ -1.93
GPNMBQ14956 AC109329.2-201ENST00000519658 482 ntBASIC3.01□□□□□ -1.93
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GPNMBQ14956 AL035078.2-201ENST00000533832 326 ntTSL 3 BASIC3.01□□□□□ -1.93
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GPNMBQ14956 AC046158.1-201ENST00000563408 719 ntTSL 3 BASIC3.01□□□□□ -1.93
GPNMBQ14956 AL670729.3-201ENST00000602345 574 ntTSL 4 BASIC3.01□□□□□ -1.93
GPNMBQ14956 AC007953.2-201ENST00000603299 193 ntTSL 5 BASIC3.01□□□□□ -1.93
GPNMBQ14956 LINC02098-202ENST00000609260 554 ntTSL 3 BASIC3.01□□□□□ -1.93
GPNMBQ14956 AC093673.2-201ENST00000609674 331 ntBASIC3.01□□□□□ -1.93
GPNMBQ14956 AC016597.2-201ENST00000613256 341 ntBASIC3.01□□□□□ -1.93
GPNMBQ14956 AC105265.4-201ENST00000618391 306 ntTSL 5 BASIC3.01□□□□□ -1.93
GPNMBQ14956 AL355493.4-201ENST00000618530 292 ntBASIC3.01□□□□□ -1.93
GPNMBQ14956 AC068722.2-201ENST00000618734 544 ntBASIC3.01□□□□□ -1.93
GPNMBQ14956 AC007527.2-201ENST00000621825 546 ntTSL 5 BASIC3.01□□□□□ -1.93
GPNMBQ14956 AP003485.1-201ENST00000625093 753 ntBASIC3.01□□□□□ -1.93
GPNMBQ14956 OR4G3P-201ENST00000633500 913 ntBASIC3.01□□□□□ -1.93
GPNMBQ14956 THEMIS-201ENST00000368248 3866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC3.01□□□□□ -1.93
GPNMBQ14956 DBF4P1-201ENST00000412976 1892 ntBASIC3.01□□□□□ -1.93
GPNMBQ14956 SLC8A1-207ENST00000406785 20987 ntTSL 1 (best) BASIC3□□□□□ -1.93
GPNMBQ14956 SOCS4-201ENST00000339298 6667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3□□□□□ -1.93
GPNMBQ14956 MYOT-208ENST00000515645 1578 ntTSL 2 BASIC3□□□□□ -1.93
GPNMBQ14956 AL355578.1-201ENST00000607405 1328 ntBASIC3□□□□□ -1.93
GPNMBQ14956 TAB2-201ENST00000367456 4553 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3□□□□□ -1.93
GPNMBQ14956 AC103988.1-201ENST00000566382 2177 ntBASIC3□□□□□ -1.93
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