Protein–RNA interactions for Protein: Q14028

CNGB1, Cyclic nucleotide-gated cation channel beta-1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,251 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CNGB1Q14028 RAB11AP1-201ENST00000442978 646 ntBASIC5.08□□□□□ -1.6
CNGB1Q14028 CDKN3-205ENST00000458126 845 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.08□□□□□ -1.6
CNGB1Q14028 MSMO1-203ENST00000504317 1026 ntTSL 1 (best) BASIC5.08□□□□□ -1.6
CNGB1Q14028 AC027613.1-201ENST00000508414 457 ntTSL 3 BASIC5.08□□□□□ -1.6
CNGB1Q14028 HTN1-204ENST00000511674 623 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.08□□□□□ -1.6
CNGB1Q14028 RNU6-507P-201ENST00000516045 100 ntBASIC5.08□□□□□ -1.6
CNGB1Q14028 RNU6-314P-201ENST00000516574 104 ntBASIC5.08□□□□□ -1.6
CNGB1Q14028 TRMT10BP1-201ENST00000519377 943 ntBASIC5.08□□□□□ -1.6
CNGB1Q14028 LINC02365-202ENST00000520280 607 ntTSL 3 BASIC5.08□□□□□ -1.6
CNGB1Q14028 AP001646.1-201ENST00000527936 915 ntBASIC5.08□□□□□ -1.6
CNGB1Q14028 SPAG11B-207ENST00000528168 481 ntTSL 5 BASIC5.08□□□□□ -1.6
CNGB1Q14028 AC004217.3-201ENST00000551552 878 ntBASIC5.08□□□□□ -1.6
CNGB1Q14028 IGKV2OR2-8-201ENST00000558710 300 ntBASIC5.08□□□□□ -1.6
CNGB1Q14028 AC015818.4-201ENST00000580931 353 ntTSL 5 BASIC5.08□□□□□ -1.6
CNGB1Q14028 AC005304.3-201ENST00000581533 511 ntTSL 3 BASIC5.08□□□□□ -1.6
CNGB1Q14028 LLPHP1-201ENST00000603571 367 ntBASIC5.08□□□□□ -1.6
CNGB1Q14028 AC092636.1-201ENST00000608609 415 ntTSL 2 BASIC5.08□□□□□ -1.6
CNGB1Q14028 STARD13-AS-239ENST00000609588 982 ntTSL 5 BASIC5.08□□□□□ -1.6
CNGB1Q14028 PCBP1-AS1-348ENST00000629506 667 ntTSL 5 BASIC5.08□□□□□ -1.6
CNGB1Q14028 CCDC141-202ENST00000409284 6960 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.08□□□□□ -1.6
CNGB1Q14028 XPOTP1-201ENST00000443317 2398 ntBASIC5.08□□□□□ -1.6
CNGB1Q14028 CD36-221ENST00000534394 1741 ntTSL 2 BASIC5.08□□□□□ -1.6
CNGB1Q14028 ZNF682-207ENST00000595736 1710 ntTSL 2 BASIC5.08□□□□□ -1.6
CNGB1Q14028 KIAA1107-203ENST00000637221 4337 ntTSL 1 (best) BASIC5.08□□□□□ -1.6
CNGB1Q14028 AC093274.1-201ENST00000503488 5454 ntTSL 5 BASIC5.07□□□□□ -1.6
CNGB1Q14028 BDP1P-201ENST00000582658 1990 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
CNGB1Q14028 CEP44-201ENST00000296519 4173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.07□□□□□ -1.6
CNGB1Q14028 WHAMMP2-201ENST00000512149 5482 ntTSL 5 BASIC5.07□□□□□ -1.6
CNGB1Q14028 KIF2A-205ENST00000506857 2219 ntTSL 2 BASIC5.07□□□□□ -1.6
CNGB1Q14028 TCEAL7-202ENST00000372666 852 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.07□□□□□ -1.6
CNGB1Q14028 RNU6-1151P-201ENST00000384684 107 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
CNGB1Q14028 OR5H8-201ENST00000394191 1045 ntAPPRIS P1 BASIC5.07□□□□□ -1.6
CNGB1Q14028 OR51A3P-201ENST00000413596 924 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
CNGB1Q14028 DBIP2-201ENST00000419076 262 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
CNGB1Q14028 RPS15AP40-201ENST00000419621 391 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
CNGB1Q14028 RPL21P32-201ENST00000419877 477 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
CNGB1Q14028 AL159169.1-201ENST00000421119 127 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
CNGB1Q14028 AC017002.2-201ENST00000426124 792 ntTSL 2 BASIC5.07□□□□□ -1.6
CNGB1Q14028 AL033504.1-201ENST00000427015 773 ntTSL 2 BASIC5.07□□□□□ -1.6
CNGB1Q14028 ENOX1-AS2-201ENST00000434273 609 ntTSL 3 BASIC5.07□□□□□ -1.6
CNGB1Q14028 YWHAZP8-201ENST00000436935 731 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
CNGB1Q14028 AC098824.1-201ENST00000453565 980 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
CNGB1Q14028 AL049548.1-201ENST00000458194 385 ntTSL 2 BASIC5.07□□□□□ -1.6
CNGB1Q14028 KLF3P2-201ENST00000465138 268 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
CNGB1Q14028 AC146507.1-201ENST00000468335 354 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
CNGB1Q14028 AC092989.1-201ENST00000481235 277 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
CNGB1Q14028 RPL7P38-201ENST00000488396 739 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
CNGB1Q14028 LINC01206-205ENST00000490001 949 ntTSL 5 BASIC5.07□□□□□ -1.6
CNGB1Q14028 SNX5P1-201ENST00000505757 1041 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
CNGB1Q14028 IL7R-204ENST00000506850 1004 ntTSL 2 BASIC5.07□□□□□ -1.6
CNGB1Q14028 AC104619.4-201ENST00000510773 249 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
CNGB1Q14028 ARL2BPP6-201ENST00000512757 439 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
CNGB1Q14028 RNU6-202P-201ENST00000515998 96 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
CNGB1Q14028 Vault.1-201ENST00000516474 102 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
CNGB1Q14028 AC022784.3-202ENST00000517816 826 ntTSL 3 BASIC5.07□□□□□ -1.6
CNGB1Q14028 SUMO2P20-201ENST00000520803 283 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
CNGB1Q14028 HIGD1AP6-201ENST00000521833 279 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
CNGB1Q14028 AC013509.1-201ENST00000524269 339 ntTSL 3 BASIC5.07□□□□□ -1.6
CNGB1Q14028 AL133166.1-202ENST00000550975 565 ntTSL 4 BASIC5.07□□□□□ -1.6
CNGB1Q14028 LINC02311-202ENST00000556819 477 ntTSL 3 BASIC5.07□□□□□ -1.6
CNGB1Q14028 AC009292.2-201ENST00000558889 291 ntTSL 5 BASIC5.07□□□□□ -1.6
CNGB1Q14028 PCLAF-207ENST00000559519 749 ntTSL 2 BASIC5.07□□□□□ -1.6
CNGB1Q14028 AC026462.4-202ENST00000564331 532 ntTSL 3 BASIC5.07□□□□□ -1.6
CNGB1Q14028 AC091691.2-201ENST00000581940 567 ntTSL 4 BASIC5.07□□□□□ -1.6
CNGB1Q14028 AL157786.1-204ENST00000594870 506 ntTSL 3 BASIC5.07□□□□□ -1.6
CNGB1Q14028 AC097467.3-204ENST00000595229 827 ntTSL 5 BASIC5.07□□□□□ -1.6
CNGB1Q14028 AL390838.2-201ENST00000602394 274 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
CNGB1Q14028 AC112230.1-201ENST00000604342 547 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
CNGB1Q14028 AL022154.1-201ENST00000604698 785 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
CNGB1Q14028 AC107214.2-201ENST00000608204 634 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
CNGB1Q14028 AP004247.3-201ENST00000608682 624 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
CNGB1Q14028 RPL36A-210ENST00000614077 881 ntTSL 1 (best) BASIC5.07□□□□□ -1.6
CNGB1Q14028 DUXAP9-208ENST00000622815 614 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
CNGB1Q14028 CR381653.2-201ENST00000624041 768 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
CNGB1Q14028 AC007823.1-201ENST00000569932 1566 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
CNGB1Q14028 FAM35DP-201ENST00000323387 2712 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
CNGB1Q14028 ZNF726-205ENST00000575986 1522 ntTSL 1 (best) BASIC5.07□□□□□ -1.6
CNGB1Q14028 NMD3P1-201ENST00000439704 1488 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
CNGB1Q14028 EPC1-203ENST00000375110 3909 ntTSL 1 (best) BASIC5.06□□□□□ -1.6
CNGB1Q14028 SUGT1-201ENST00000310528 14131 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.06□□□□□ -1.6
CNGB1Q14028 MBNL1-220ENST00000493459 4205 ntTSL 1 (best) BASIC5.06□□□□□ -1.6
CNGB1Q14028 TSHB-201ENST00000256592 537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.06□□□□□ -1.6
CNGB1Q14028 RNU6-839P-201ENST00000363347 108 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
CNGB1Q14028 SNORA72.1-201ENST00000363485 129 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
CNGB1Q14028 RNU6-501P-201ENST00000364072 100 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
CNGB1Q14028 RNA5SP51-201ENST00000364750 119 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
CNGB1Q14028 RNU4-12P-201ENST00000365233 139 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
CNGB1Q14028 RNA5SP88-201ENST00000365560 109 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
CNGB1Q14028 EEF1E1-201ENST00000379715 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.06□□□□□ -1.6
CNGB1Q14028 AL359837.1-201ENST00000381357 287 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
CNGB1Q14028 RNU6-114P-201ENST00000384704 105 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
CNGB1Q14028 RPL23AP47-201ENST00000408017 460 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
CNGB1Q14028 RN7SKP56-201ENST00000410513 331 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
CNGB1Q14028 MTCO1P17-201ENST00000411522 491 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
CNGB1Q14028 RAB9AP3-201ENST00000412737 573 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
CNGB1Q14028 AC009237.2-201ENST00000421358 284 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
CNGB1Q14028 AC008065.1-201ENST00000428525 348 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
CNGB1Q14028 AC116035.1-201ENST00000431057 517 ntTSL 3 BASIC5.06□□□□□ -1.6
CNGB1Q14028 AC000111.3-201ENST00000433478 193 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
CNGB1Q14028 MTND3P21-201ENST00000433774 331 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 135.9 ms