Protein–RNA interactions for Protein: Q13813

SPTAN1, Spectrin alpha chain, non-erythrocytic 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 2,472 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPTAN1Q13813 AASDH-207ENST00000513376 3241 ntTSL 1 (best) BASIC1.69□□□□□ -2.14
SPTAN1Q13813 Z98749.2-208ENST00000381646 500 ntBASIC1.69□□□□□ -2.14
SPTAN1Q13813 AC005005.2-201ENST00000420779 380 ntBASIC1.69□□□□□ -2.14
SPTAN1Q13813 AL159169.1-201ENST00000421119 127 ntBASIC1.69□□□□□ -2.14
SPTAN1Q13813 AC015971.1-202ENST00000439077 514 ntTSL 3 BASIC1.69□□□□□ -2.14
SPTAN1Q13813 AC002553.2-201ENST00000453217 340 ntBASIC1.69□□□□□ -2.14
SPTAN1Q13813 AC011979.1-201ENST00000472300 483 ntBASIC1.69□□□□□ -2.14
SPTAN1Q13813 IGHV3-76-201ENST00000522465 295 ntBASIC1.69□□□□□ -2.14
SPTAN1Q13813 AC068790.3-201ENST00000602988 553 ntBASIC1.69□□□□□ -2.14
SPTAN1Q13813 AC131902.3-201ENST00000611767 581 ntBASIC1.69□□□□□ -2.14
SPTAN1Q13813 uc_338.5-201ENST00000611839 155 ntBASIC1.69□□□□□ -2.14
SPTAN1Q13813 AC073869.7-201ENST00000640874 297 ntBASIC1.69□□□□□ -2.14
SPTAN1Q13813 SOBP-204ENST00000618129 1550 ntTSL 1 (best) BASIC1.69□□□□□ -2.14
SPTAN1Q13813 SNORA7.1-201ENST00000363750 139 ntBASIC1.68□□□□□ -2.14
SPTAN1Q13813 AC006076.1-201ENST00000423233 345 ntTSL 3 BASIC1.68□□□□□ -2.14
SPTAN1Q13813 SAR1AP4-201ENST00000429225 591 ntBASIC1.68□□□□□ -2.14
SPTAN1Q13813 YWHAZP7-201ENST00000436906 631 ntBASIC1.68□□□□□ -2.14
SPTAN1Q13813 MED6P1-201ENST00000439659 713 ntBASIC1.68□□□□□ -2.14
SPTAN1Q13813 MAGI1-AS1-201ENST00000472514 591 ntTSL 3 BASIC1.68□□□□□ -2.14
SPTAN1Q13813 LEKR1-205ENST00000477399 621 ntTSL 2 BASIC1.68□□□□□ -2.14
SPTAN1Q13813 AC097512.1-203ENST00000506425 957 ntTSL 3 BASIC1.68□□□□□ -2.14
SPTAN1Q13813 AP003354.2-201ENST00000517983 563 ntTSL 4 BASIC1.68□□□□□ -2.14
SPTAN1Q13813 OR4G1P-201ENST00000588632 938 ntBASIC1.68□□□□□ -2.14
SPTAN1Q13813 AC020910.1-201ENST00000599404 413 ntTSL 5 BASIC1.68□□□□□ -2.14
SPTAN1Q13813 OR5B12-202ENST00000641921 1807 ntAPPRIS P1 BASIC1.68□□□□□ -2.14
SPTAN1Q13813 SKIL-202ENST00000413427 2702 ntTSL 1 (best) BASIC1.68□□□□□ -2.14
SPTAN1Q13813 SEPT7P7-201ENST00000420492 1301 ntBASIC1.68□□□□□ -2.14
SPTAN1Q13813 LIPI-203ENST00000536861 1529 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC1.68□□□□□ -2.14
SPTAN1Q13813 OXR1-209ENST00000517566 4501 ntTSL 1 (best) BASIC1.68□□□□□ -2.14
SPTAN1Q13813 RXFP1-201ENST00000307765 3842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.68□□□□□ -2.14
SPTAN1Q13813 RNA5SP181-201ENST00000410246 98 ntBASIC1.68□□□□□ -2.14
SPTAN1Q13813 AL136133.1-201ENST00000413694 376 ntBASIC1.68□□□□□ -2.14
SPTAN1Q13813 AL358453.1-201ENST00000422522 250 ntBASIC1.68□□□□□ -2.14
SPTAN1Q13813 ATP5F1P1-201ENST00000433775 569 ntBASIC1.68□□□□□ -2.14
SPTAN1Q13813 AL441989.1-201ENST00000454204 382 ntTSL 3 BASIC1.68□□□□□ -2.14
SPTAN1Q13813 AL356270.1-201ENST00000456587 522 ntTSL 3 BASIC1.68□□□□□ -2.14
SPTAN1Q13813 RNU7-170P-201ENST00000459303 61 ntBASIC1.68□□□□□ -2.14
SPTAN1Q13813 AC091906.1-201ENST00000511310 391 ntTSL 2 BASIC1.68□□□□□ -2.14
SPTAN1Q13813 RAB3IP-214ENST00000550847 670 ntTSL 3 BASIC1.68□□□□□ -2.14
SPTAN1Q13813 LRRD1-203ENST00000430130 2661 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.68□□□□□ -2.14
SPTAN1Q13813 SENP7-206ENST00000394094 4703 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC1.68□□□□□ -2.14
SPTAN1Q13813 CPXCR1-203ENST00000614120 1485 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC1.67□□□□□ -2.14
SPTAN1Q13813 BTLA-202ENST00000383680 726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC1.67□□□□□ -2.14
SPTAN1Q13813 AC093157.1-203ENST00000416329 713 ntTSL 5 BASIC1.67□□□□□ -2.14
SPTAN1Q13813 AC073310.1-201ENST00000423226 1033 ntBASIC1.67□□□□□ -2.14
SPTAN1Q13813 RPS29P11-201ENST00000496507 171 ntBASIC1.67□□□□□ -2.14
SPTAN1Q13813 SLC7A11-AS1-201ENST00000510066 817 ntTSL 2 BASIC1.67□□□□□ -2.14
SPTAN1Q13813 AF131216.2-201ENST00000512316 564 ntBASIC1.67□□□□□ -2.14
SPTAN1Q13813 UGP2-230ENST00000626380 276 ntTSL 5 BASIC1.67□□□□□ -2.14
SPTAN1Q13813 PALMD-205ENST00000615664 1844 ntTSL 5 BASIC1.67□□□□□ -2.14
SPTAN1Q13813 MGAT4C-211ENST00000621808 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.67□□□□□ -2.14
SPTAN1Q13813 USP53-202ENST00000450251 6072 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.67□□□□□ -2.14
SPTAN1Q13813 CCDC158-202ENST00000434846 1728 ntTSL 1 (best) BASIC1.67□□□□□ -2.14
SPTAN1Q13813 AGTR1-208ENST00000475347 1669 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC1.67□□□□□ -2.14
SPTAN1Q13813 TEX21P-201ENST00000447107 1476 ntBASIC1.67□□□□□ -2.14
SPTAN1Q13813 OR6C65-201ENST00000379665 1076 ntAPPRIS P1 BASIC1.67□□□□□ -2.14
SPTAN1Q13813 SNORA70.7-201ENST00000384159 133 ntBASIC1.67□□□□□ -2.14
SPTAN1Q13813 RNY1P4-201ENST00000384595 115 ntBASIC1.67□□□□□ -2.14
SPTAN1Q13813 BTBD10P2-201ENST00000404779 676 ntBASIC1.67□□□□□ -2.14
SPTAN1Q13813 LINC01359-202ENST00000436350 710 ntTSL 3 BASIC1.67□□□□□ -2.14
SPTAN1Q13813 EHHADH-202ENST00000440662 656 ntTSL 3 BASIC1.67□□□□□ -2.14
SPTAN1Q13813 snoU109.4-201ENST00000458953 143 ntBASIC1.67□□□□□ -2.14
SPTAN1Q13813 AC019176.1-201ENST00000518519 225 ntBASIC1.67□□□□□ -2.14
SPTAN1Q13813 AC093331.1-201ENST00000521474 169 ntBASIC1.67□□□□□ -2.14
SPTAN1Q13813 AC066612.2-201ENST00000559875 695 ntTSL 2 BASIC1.67□□□□□ -2.14
SPTAN1Q13813 AC105094.2-202ENST00000590968 566 ntTSL 2 BASIC1.67□□□□□ -2.14
SPTAN1Q13813 AC005858.1-201ENST00000620193 677 ntTSL 2 BASIC1.67□□□□□ -2.14
SPTAN1Q13813 ESF1-202ENST00000617257 1470 ntTSL 5 BASIC1.67□□□□□ -2.14
SPTAN1Q13813 PKIB-201ENST00000258014 1595 ntTSL 2 BASIC1.66□□□□□ -2.14
SPTAN1Q13813 RNU4-41P-201ENST00000364426 143 ntBASIC1.66□□□□□ -2.14
SPTAN1Q13813 SNORD21-201ENST00000383953 95 ntBASIC1.66□□□□□ -2.14
SPTAN1Q13813 TRAPPC13-204ENST00000438419 1437 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC1.66□□□□□ -2.14
SPTAN1Q13813 RPS29P1-201ENST00000465274 159 ntBASIC1.66□□□□□ -2.14
SPTAN1Q13813 LINC01481-201ENST00000552998 629 ntTSL 2 BASIC1.66□□□□□ -2.14
SPTAN1Q13813 FAM106DP-201ENST00000586416 501 ntBASIC1.66□□□□□ -2.14
SPTAN1Q13813 SOX2-OT-224ENST00000595313 716 ntTSL 5 BASIC1.66□□□□□ -2.14
SPTAN1Q13813 AC136443.5-201ENST00000603741 370 ntBASIC1.66□□□□□ -2.14
SPTAN1Q13813 AC016727.2-201ENST00000603988 621 ntBASIC1.66□□□□□ -2.14
SPTAN1Q13813 AL139286.1-201ENST00000604465 483 ntBASIC1.66□□□□□ -2.14
SPTAN1Q13813 HIKESHI-208ENST00000618164 499 ntTSL 5 BASIC1.66□□□□□ -2.14
SPTAN1Q13813 C3orf79-201ENST00000623038 580 ntTSL 1 (best) BASIC1.66□□□□□ -2.14
SPTAN1Q13813 OR5T1-201ENST00000641368 1118 ntAPPRIS P1 BASIC1.66□□□□□ -2.14
SPTAN1Q13813 RNA5SP62-201ENST00000363457 110 ntBASIC1.66□□□□□ -2.14
SPTAN1Q13813 Y_RNA.433-201ENST00000384089 102 ntBASIC1.66□□□□□ -2.14
SPTAN1Q13813 RNU1-138P-201ENST00000384093 164 ntBASIC1.66□□□□□ -2.14
SPTAN1Q13813 RNU6ATAC20P-201ENST00000408436 127 ntBASIC1.66□□□□□ -2.14
SPTAN1Q13813 RN7SKP123-201ENST00000410732 291 ntBASIC1.66□□□□□ -2.14
SPTAN1Q13813 AC005208.1-201ENST00000435112 599 ntTSL 3 BASIC1.66□□□□□ -2.14
SPTAN1Q13813 HMGB1P31-201ENST00000437242 427 ntBASIC1.66□□□□□ -2.14
SPTAN1Q13813 MTRNR2L5-201ENST00000512524 739 ntAPPRIS P1 BASIC1.66□□□□□ -2.14
SPTAN1Q13813 RNU6-1223P-201ENST00000517124 104 ntBASIC1.66□□□□□ -2.14
SPTAN1Q13813 AP003467.2-201ENST00000520175 319 ntBASIC1.66□□□□□ -2.14
SPTAN1Q13813 OR4P1P-201ENST00000530808 1136 ntBASIC1.66□□□□□ -2.14
SPTAN1Q13813 AL161670.1-201ENST00000554348 137 ntBASIC1.66□□□□□ -2.14
SPTAN1Q13813 MIR3670-2-201ENST00000582974 65 ntBASIC1.66□□□□□ -2.14
SPTAN1Q13813 MIR3670-1-201ENST00000584160 65 ntBASIC1.66□□□□□ -2.14
SPTAN1Q13813 MIR3670-3-201ENST00000584855 65 ntBASIC1.66□□□□□ -2.14
SPTAN1Q13813 AC003973.1-201ENST00000600071 546 ntTSL 4 BASIC1.66□□□□□ -2.14
SPTAN1Q13813 MIR3670-4-201ENST00000612260 65 ntBASIC1.66□□□□□ -2.14
SPTAN1Q13813 GPR34-203ENST00000620846 1282 ntTSL 1 (best) BASIC1.66□□□□□ -2.14
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