Protein–RNA interactions for Protein: Q13309

SKP2, S-phase kinase-associated protein 2, humanhuman

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Length 424 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SKP2Q13309 AC063944.1-210ENST00000593837 519 ntTSL 5 BASIC2.42□□□□□ -2.02
SKP2Q13309 AC072062.1-205ENST00000595058 962 ntTSL 3 BASIC2.42□□□□□ -2.02
SKP2Q13309 LINC01515-204ENST00000595269 402 ntTSL 5 BASIC2.42□□□□□ -2.02
SKP2Q13309 AL020997.3-201ENST00000602843 359 ntBASIC2.42□□□□□ -2.02
SKP2Q13309 AC245100.7-201ENST00000609678 442 ntBASIC2.42□□□□□ -2.02
SKP2Q13309 C17orf112-201ENST00000623702 835 ntTSL 2 BASIC2.42□□□□□ -2.02
SKP2Q13309 AC103798.2-201ENST00000624292 632 ntBASIC2.42□□□□□ -2.02
SKP2Q13309 CNOT1-223ENST00000628857 291 ntTSL 5 BASIC2.42□□□□□ -2.02
SKP2Q13309 AKAP9-203ENST00000359028 12247 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.42□□□□□ -2.02
SKP2Q13309 LUZP4-201ENST00000371920 1701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC2.42□□□□□ -2.02
SKP2Q13309 NOC3L-201ENST00000371361 3455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.41□□□□□ -2.02
SKP2Q13309 TMEM232-201ENST00000455884 2501 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC2.41□□□□□ -2.02
SKP2Q13309 AC026241.1-201ENST00000517873 2142 ntBASIC2.41□□□□□ -2.02
SKP2Q13309 CRP-202ENST00000368110 667 ntTSL 3 BASIC2.41□□□□□ -2.02
SKP2Q13309 DEFB119-202ENST00000376315 324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.41□□□□□ -2.02
SKP2Q13309 SNORD21-201ENST00000383953 95 ntBASIC2.41□□□□□ -2.02
SKP2Q13309 RNU6-1074P-201ENST00000383995 104 ntBASIC2.41□□□□□ -2.02
SKP2Q13309 MOB4-205ENST00000409916 829 ntTSL 3 BASIC2.41□□□□□ -2.02
SKP2Q13309 Z92545.1-201ENST00000411782 234 ntBASIC2.41□□□□□ -2.02
SKP2Q13309 RPS20P25-201ENST00000412447 352 ntBASIC2.41□□□□□ -2.02
SKP2Q13309 AL513175.2-201ENST00000422071 443 ntBASIC2.41□□□□□ -2.02
SKP2Q13309 LINC01307-201ENST00000439146 474 ntTSL 3 BASIC2.41□□□□□ -2.02
SKP2Q13309 AC019330.1-202ENST00000440609 504 ntTSL 4 BASIC2.41□□□□□ -2.02
SKP2Q13309 AL691517.1-201ENST00000440833 1235 ntBASIC2.41□□□□□ -2.02
SKP2Q13309 AC025750.2-201ENST00000442609 450 ntBASIC2.41□□□□□ -2.02
SKP2Q13309 AC005002.1-201ENST00000447458 540 ntBASIC2.41□□□□□ -2.02
SKP2Q13309 LINC00692-201ENST00000451284 932 ntTSL 1 (best) BASIC2.41□□□□□ -2.02
SKP2Q13309 CACYBPP2-201ENST00000453625 678 ntBASIC2.41□□□□□ -2.02
SKP2Q13309 PCCA-AS1-203ENST00000455958 356 ntTSL 3 BASIC2.41□□□□□ -2.02
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SKP2Q13309 AL159163.1-201ENST00000507747 600 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.41□□□□□ -2.02
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SKP2Q13309 HMGB1P41-201ENST00000520234 440 ntBASIC2.41□□□□□ -2.02
SKP2Q13309 AP005357.1-201ENST00000520749 476 ntTSL 3 BASIC2.41□□□□□ -2.02
SKP2Q13309 AC100870.1-201ENST00000522035 505 ntBASIC2.41□□□□□ -2.02
SKP2Q13309 AC124293.1-201ENST00000530034 493 ntBASIC2.41□□□□□ -2.02
SKP2Q13309 AC091053.2-201ENST00000534169 537 ntTSL 4 BASIC2.41□□□□□ -2.02
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SKP2Q13309 AC008083.3-201ENST00000547777 329 ntTSL 3 BASIC2.41□□□□□ -2.02
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SKP2Q13309 TIMM9-209ENST00000556367 572 ntTSL 2 BASIC2.41□□□□□ -2.02
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SKP2Q13309 MTATP6P25-201ENST00000574491 261 ntBASIC2.41□□□□□ -2.02
SKP2Q13309 AC022809.1-201ENST00000579247 428 ntTSL 3 BASIC2.41□□□□□ -2.02
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SKP2Q13309 MIR3670-1-201ENST00000584160 65 ntBASIC2.41□□□□□ -2.02
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SKP2Q13309 IL33-205ENST00000611532 757 ntTSL 1 (best) BASIC2.41□□□□□ -2.02
SKP2Q13309 MIR3670-4-201ENST00000612260 65 ntBASIC2.41□□□□□ -2.02
SKP2Q13309 AC104307.1-201ENST00000616142 196 ntBASIC2.41□□□□□ -2.02
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SKP2Q13309 AC012005.1-201ENST00000624575 75 ntBASIC2.41□□□□□ -2.02
SKP2Q13309 AC098617.1-218ENST00000628836 624 ntTSL 5 BASIC2.41□□□□□ -2.02
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SKP2Q13309 OLFM3-206ENST00000536598 2801 ntTSL 5 BASIC2.41□□□□□ -2.02
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SKP2Q13309 APOH-201ENST00000205948 1176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.4□□□□□ -2.03
SKP2Q13309 RNU6-859P-201ENST00000362728 107 ntBASIC2.4□□□□□ -2.03
SKP2Q13309 SNORD56.4-201ENST00000363883 71 ntBASIC2.4□□□□□ -2.03
SKP2Q13309 SNORA25.6-201ENST00000364121 118 ntBASIC2.4□□□□□ -2.03
SKP2Q13309 MIR592-201ENST00000384959 97 ntBASIC2.4□□□□□ -2.03
SKP2Q13309 TANK-204ENST00000403609 555 ntTSL 1 (best) BASIC2.4□□□□□ -2.03
SKP2Q13309 STAT4-203ENST00000409995 709 ntTSL 5 BASIC2.4□□□□□ -2.03
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SKP2Q13309 MLLT10P2-201ENST00000506434 249 ntBASIC2.4□□□□□ -2.03
SKP2Q13309 AC034159.1-201ENST00000513885 583 ntBASIC2.4□□□□□ -2.03
SKP2Q13309 RNA5SP282-201ENST00000516355 108 ntBASIC2.4□□□□□ -2.03
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SKP2Q13309 OR10V3P-201ENST00000525712 725 ntBASIC2.4□□□□□ -2.03
SKP2Q13309 LINC01481-201ENST00000552998 629 ntTSL 2 BASIC2.4□□□□□ -2.03
SKP2Q13309 AL132819.1-201ENST00000555595 208 ntTSL 3 BASIC2.4□□□□□ -2.03
SKP2Q13309 AC104229.1-201ENST00000561364 255 ntBASIC2.4□□□□□ -2.03
SKP2Q13309 AC023824.3-201ENST00000569003 562 ntBASIC2.4□□□□□ -2.03
SKP2Q13309 LARP7P3-201ENST00000579888 337 ntBASIC2.4□□□□□ -2.03
SKP2Q13309 AC097467.3-205ENST00000597955 594 ntTSL 5 BASIC2.4□□□□□ -2.03
SKP2Q13309 VN1R92P-201ENST00000598511 928 ntBASIC2.4□□□□□ -2.03
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