Protein–RNA interactions for Protein: Q13156

RPA4, Replication protein A 30 kDa subunit, humanhuman

Predictions only

Length 261 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPA4Q13156 SDHAF2-203ENST00000534878 523 ntTSL 2 BASIC3.33□□□□□ -1.88
RPA4Q13156 AC007458.1-201ENST00000542812 373 ntBASIC3.33□□□□□ -1.88
RPA4Q13156 LINC02410-201ENST00000553095 393 ntTSL 2 BASIC3.33□□□□□ -1.88
RPA4Q13156 TGIF1P1-201ENST00000558095 802 ntBASIC3.33□□□□□ -1.88
RPA4Q13156 AC093515.1-201ENST00000567103 445 ntTSL 5 BASIC3.33□□□□□ -1.88
RPA4Q13156 AC015911.6-201ENST00000588445 457 ntTSL 3 BASIC3.33□□□□□ -1.88
RPA4Q13156 AP001269.3-201ENST00000588718 329 ntBASIC3.33□□□□□ -1.88
RPA4Q13156 AL031985.2-201ENST00000600955 480 ntBASIC3.33□□□□□ -1.88
RPA4Q13156 AL133393.1-201ENST00000603277 287 ntBASIC3.33□□□□□ -1.88
RPA4Q13156 AL450489.1-201ENST00000612071 468 ntBASIC3.33□□□□□ -1.88
RPA4Q13156 AL450472.3-201ENST00000615578 367 ntBASIC3.33□□□□□ -1.88
RPA4Q13156 AC022306.3-201ENST00000619930 550 ntBASIC3.33□□□□□ -1.88
RPA4Q13156 AC002550.2-201ENST00000621246 394 ntBASIC3.33□□□□□ -1.88
RPA4Q13156 U6.105-201ENST00000637379 88 ntBASIC3.33□□□□□ -1.88
RPA4Q13156 SYCP2-201ENST00000357552 5567 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC3.33□□□□□ -1.88
RPA4Q13156 ZNF804B-202ENST00000611114 3968 ntTSL 5 BASIC3.33□□□□□ -1.88
RPA4Q13156 SYTL2-203ENST00000359152 4123 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC3.33□□□□□ -1.88
RPA4Q13156 AC099786.3-201ENST00000565735 1410 ntBASIC3.33□□□□□ -1.88
RPA4Q13156 CYYR1-AS1-201ENST00000357401 3412 ntTSL 2 BASIC3.33□□□□□ -1.88
RPA4Q13156 DST-204ENST00000361203 22431 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.32□□□□□ -1.88
RPA4Q13156 LGI1-201ENST00000371413 1247 ntTSL 1 (best) BASIC3.32□□□□□ -1.88
RPA4Q13156 SAR1AP2-201ENST00000392696 594 ntBASIC3.32□□□□□ -1.88
RPA4Q13156 RNU4-22P-201ENST00000411058 166 ntBASIC3.32□□□□□ -1.88
RPA4Q13156 AL355303.1-201ENST00000428920 680 ntTSL 3 BASIC3.32□□□□□ -1.88
RPA4Q13156 AC006369.2-201ENST00000431712 384 ntTSL 3 BASIC3.32□□□□□ -1.88
RPA4Q13156 AL583835.2-201ENST00000435483 500 ntTSL 2 BASIC3.32□□□□□ -1.88
RPA4Q13156 PRDX3P3-201ENST00000447765 522 ntBASIC3.32□□□□□ -1.88
RPA4Q13156 AL358232.1-201ENST00000448030 501 ntBASIC3.32□□□□□ -1.88
RPA4Q13156 MYCBP2-AS1-202ENST00000448470 333 ntTSL 3 BASIC3.32□□□□□ -1.88
RPA4Q13156 ZNF886P-201ENST00000450781 723 ntBASIC3.32□□□□□ -1.88
RPA4Q13156 MAST4-AS1-201ENST00000451496 777 ntTSL 2 BASIC3.32□□□□□ -1.88
RPA4Q13156 AC005410.1-202ENST00000460347 485 ntBASIC3.32□□□□□ -1.88
RPA4Q13156 GUCA1C-203ENST00000471108 633 ntTSL 2 BASIC3.32□□□□□ -1.88
RPA4Q13156 RPL31P60-201ENST00000478450 367 ntBASIC3.32□□□□□ -1.88
RPA4Q13156 WDR78-207ENST00000488333 613 ntTSL 3 BASIC3.32□□□□□ -1.88
RPA4Q13156 PCBP2P3-201ENST00000509726 843 ntBASIC3.32□□□□□ -1.88
RPA4Q13156 TXNP6-201ENST00000510190 310 ntBASIC3.32□□□□□ -1.88
RPA4Q13156 LINC02378-201ENST00000540399 1003 ntTSL 5 BASIC3.32□□□□□ -1.88
RPA4Q13156 OR6C7P-201ENST00000547875 934 ntBASIC3.32□□□□□ -1.88
RPA4Q13156 OR4T1P-201ENST00000554933 911 ntBASIC3.32□□□□□ -1.88
RPA4Q13156 CYCSP2-201ENST00000558168 301 ntBASIC3.32□□□□□ -1.88
RPA4Q13156 MTCO3P24-201ENST00000572729 782 ntBASIC3.32□□□□□ -1.88
RPA4Q13156 AC067852.3-201ENST00000589177 561 ntBASIC3.32□□□□□ -1.88
RPA4Q13156 AP001429.1-201ENST00000602568 530 ntBASIC3.32□□□□□ -1.88
RPA4Q13156 AL160237.3-201ENST00000604114 1013 ntBASIC3.32□□□□□ -1.88
RPA4Q13156 AC131235.4-201ENST00000609288 620 ntBASIC3.32□□□□□ -1.88
RPA4Q13156 AL391834.2-201ENST00000609982 546 ntBASIC3.32□□□□□ -1.88
RPA4Q13156 AC099778.2-201ENST00000610904 211 ntBASIC3.32□□□□□ -1.88
RPA4Q13156 AC090772.4-201ENST00000623599 362 ntBASIC3.32□□□□□ -1.88
RPA4Q13156 UGP2-231ENST00000627474 264 ntTSL 5 BASIC3.32□□□□□ -1.88
RPA4Q13156 MTCO1P12-201ENST00000414273 1543 ntBASIC3.32□□□□□ -1.88
RPA4Q13156 ADGRG2-206ENST00000360279 4702 ntTSL 1 (best) BASIC3.31□□□□□ -1.88
RPA4Q13156 CR383658.2-201ENST00000547576 1525 ntBASIC3.31□□□□□ -1.88
RPA4Q13156 ADAM18-206ENST00000520772 1429 ntTSL 1 (best) BASIC3.31□□□□□ -1.88
RPA4Q13156 RNU4-68P-201ENST00000364314 141 ntBASIC3.31□□□□□ -1.88
RPA4Q13156 RNU6-76P-201ENST00000384060 104 ntBASIC3.31□□□□□ -1.88
RPA4Q13156 Y_RNA.465-201ENST00000384293 102 ntBASIC3.31□□□□□ -1.88
RPA4Q13156 RNU6-1197P-201ENST00000391183 107 ntBASIC3.31□□□□□ -1.88
RPA4Q13156 TAF9BP1-201ENST00000396646 746 ntBASIC3.31□□□□□ -1.88
RPA4Q13156 RPL23AP29-201ENST00000397284 453 ntBASIC3.31□□□□□ -1.88
RPA4Q13156 MIR1284-201ENST00000408337 120 ntBASIC3.31□□□□□ -1.88
RPA4Q13156 AC126124.2-201ENST00000413542 321 ntBASIC3.31□□□□□ -1.88
RPA4Q13156 Z99755.1-201ENST00000414048 380 ntBASIC3.31□□□□□ -1.88
RPA4Q13156 AL355989.1-202ENST00000419406 408 ntTSL 3 BASIC3.31□□□□□ -1.88
RPA4Q13156 AC245052.1-201ENST00000426213 410 ntTSL 3 BASIC3.31□□□□□ -1.88
RPA4Q13156 ATP6V0E1P4-201ENST00000427294 242 ntBASIC3.31□□□□□ -1.88
RPA4Q13156 AC097713.2-201ENST00000430199 356 ntBASIC3.31□□□□□ -1.88
RPA4Q13156 AC006333.1-202ENST00000440504 555 ntTSL 4 BASIC3.31□□□□□ -1.88
RPA4Q13156 MRPS31P2-201ENST00000451581 518 ntBASIC3.31□□□□□ -1.88
RPA4Q13156 AC006539.3-201ENST00000454258 129 ntBASIC3.31□□□□□ -1.88
RPA4Q13156 AC010890.1-201ENST00000454699 469 ntTSL 4 BASIC3.31□□□□□ -1.88
RPA4Q13156 ZNF736P4Y-201ENST00000454995 1243 ntBASIC3.31□□□□□ -1.88
RPA4Q13156 LINC01510-203ENST00000458082 626 ntTSL 3 BASIC3.31□□□□□ -1.88
RPA4Q13156 AC104472.2-201ENST00000469035 601 ntBASIC3.31□□□□□ -1.88
RPA4Q13156 AC021205.2-201ENST00000480069 347 ntBASIC3.31□□□□□ -1.88
RPA4Q13156 RPL21P13-201ENST00000488305 481 ntBASIC3.31□□□□□ -1.88
RPA4Q13156 KCTD9P5-201ENST00000504141 1170 ntBASIC3.31□□□□□ -1.88
RPA4Q13156 APOOP4-201ENST00000513530 597 ntBASIC3.31□□□□□ -1.88
RPA4Q13156 AC026801.2-201ENST00000515352 425 ntBASIC3.31□□□□□ -1.88
RPA4Q13156 RNU6-150P-201ENST00000516237 95 ntBASIC3.31□□□□□ -1.88
RPA4Q13156 LINC02143-201ENST00000519929 520 ntTSL 3 BASIC3.31□□□□□ -1.88
RPA4Q13156 AC090857.2-201ENST00000526362 723 ntTSL 2 BASIC3.31□□□□□ -1.88
RPA4Q13156 AP002768.1-201ENST00000526741 320 ntTSL 3 BASIC3.31□□□□□ -1.88
RPA4Q13156 AP001458.1-201ENST00000532626 92 ntTSL 3 BASIC3.31□□□□□ -1.88
RPA4Q13156 GLYCAM1-202ENST00000546607 553 ntTSL 1 (best) BASIC3.31□□□□□ -1.88
RPA4Q13156 LINC01467-201ENST00000554211 1187 ntTSL 1 (best) BASIC3.31□□□□□ -1.88
RPA4Q13156 NCAPGP2-201ENST00000557911 754 ntBASIC3.31□□□□□ -1.88
RPA4Q13156 AC009712.1-201ENST00000564938 316 ntBASIC3.31□□□□□ -1.88
RPA4Q13156 AC118755.1-201ENST00000572923 195 ntTSL 3 BASIC3.31□□□□□ -1.88
RPA4Q13156 AC138207.5-201ENST00000579561 409 ntTSL 3 BASIC3.31□□□□□ -1.88
RPA4Q13156 AP001029.2-202ENST00000588197 739 ntTSL 3 BASIC3.31□□□□□ -1.88
RPA4Q13156 IGKV1OR2-6-201ENST00000603485 277 ntBASIC3.31□□□□□ -1.88
RPA4Q13156 AL139022.2-201ENST00000606934 443 ntBASIC3.31□□□□□ -1.88
RPA4Q13156 STARD13-AS-239ENST00000609588 982 ntTSL 5 BASIC3.31□□□□□ -1.88
RPA4Q13156 AC107075.1-201ENST00000613695 314 ntBASIC3.31□□□□□ -1.88
RPA4Q13156 MIR7975-201ENST00000619350 68 ntBASIC3.31□□□□□ -1.88
RPA4Q13156 AL356321.1-201ENST00000621360 228 ntBASIC3.31□□□□□ -1.88
RPA4Q13156 AP003122.6-201ENST00000623831 495 ntBASIC3.31□□□□□ -1.88
RPA4Q13156 AC244517.5-201ENST00000624139 722 ntTSL 3 BASIC3.31□□□□□ -1.88
RPA4Q13156 LINC02246-205ENST00000627623 417 ntTSL 5 BASIC3.31□□□□□ -1.88
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 125.5 ms