Protein–RNA interactions for Protein: Q12830

BPTF, Nucleosome-remodeling factor subunit BPTF, humanhuman

Predictions only

Length 3,046 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BPTFQ12830 IGKV2D-36-201ENST00000518643 226 ntBASIC2.05□□□□□ -2.08
BPTFQ12830 AP000755.2-201ENST00000526777 571 ntTSL 5 BASIC2.05□□□□□ -2.08
BPTFQ12830 AC103810.1-201ENST00000579873 453 ntBASIC2.05□□□□□ -2.08
BPTFQ12830 AL031274.2-201ENST00000599419 203 ntBASIC2.05□□□□□ -2.08
BPTFQ12830 AC103710.1-201ENST00000610003 901 ntBASIC2.05□□□□□ -2.08
BPTFQ12830 NEB-220ENST00000618972 26307 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.05□□□□□ -2.08
BPTFQ12830 CFHR4-201ENST00000251424 1292 ntTSL 1 (best) BASIC2.04□□□□□ -2.08
BPTFQ12830 HSFY1-202ENST00000309834 1038 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.04□□□□□ -2.08
BPTFQ12830 HSFY2-202ENST00000344884 1038 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.04□□□□□ -2.08
BPTFQ12830 U8.10-201ENST00000384260 133 ntBASIC2.04□□□□□ -2.08
BPTFQ12830 RSL24D1P2-201ENST00000445584 366 ntBASIC2.04□□□□□ -2.08
BPTFQ12830 AC121154.1-201ENST00000507299 430 ntTSL 3 BASIC2.04□□□□□ -2.08
BPTFQ12830 MTCO1P14-201ENST00000441695 1559 ntBASIC2.04□□□□□ -2.08
BPTFQ12830 FOXP2-217ENST00000462331 1388 ntTSL 1 (best) BASIC2.04□□□□□ -2.08
BPTFQ12830 C2orf73-208ENST00000615983 1376 ntTSL 1 (best) BASIC2.04□□□□□ -2.08
BPTFQ12830 RNA5SP181-201ENST00000410246 98 ntBASIC2.04□□□□□ -2.08
BPTFQ12830 AF274854.1-201ENST00000413236 615 ntBASIC2.04□□□□□ -2.08
BPTFQ12830 AC093151.3-203ENST00000422305 514 ntTSL 3 BASIC2.04□□□□□ -2.08
BPTFQ12830 LINC01040-201ENST00000425048 666 ntTSL 2 BASIC2.04□□□□□ -2.08
BPTFQ12830 NFIA-AS1-201ENST00000442027 384 ntTSL 2 BASIC2.04□□□□□ -2.08
BPTFQ12830 AC092159.4-201ENST00000624944 550 ntBASIC2.04□□□□□ -2.08
BPTFQ12830 SLC16A7-201ENST00000261187 11777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.04□□□□□ -2.08
BPTFQ12830 NBPF20-202ENST00000392971 18450 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC2.04□□□□□ -2.08
BPTFQ12830 ASPM-202ENST00000367408 3747 ntTSL 1 (best) BASIC2.04□□□□□ -2.08
BPTFQ12830 AC093911.1-201ENST00000419129 552 ntTSL 4 BASIC2.04□□□□□ -2.08
BPTFQ12830 LINC02532-205ENST00000430094 628 ntTSL 5 BASIC2.04□□□□□ -2.08
BPTFQ12830 AP000852.1-201ENST00000472460 573 ntBASIC2.04□□□□□ -2.08
BPTFQ12830 AC020900.1-201ENST00000502568 565 ntTSL 4 BASIC2.04□□□□□ -2.08
BPTFQ12830 snoZ278.1-201ENST00000517059 112 ntBASIC2.04□□□□□ -2.08
BPTFQ12830 AC109466.1-214ENST00000522762 583 ntTSL 2 BASIC2.04□□□□□ -2.08
BPTFQ12830 AMZ2P1-203ENST00000565833 850 ntBASIC2.04□□□□□ -2.08
BPTFQ12830 KIAA1107-202ENST00000636278 4065 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.03□□□□□ -2.08
BPTFQ12830 LINC01592-202ENST00000518540 2367 ntTSL 2 BASIC2.03□□□□□ -2.08
BPTFQ12830 LINC02510-201ENST00000509798 1576 ntTSL 1 (best) BASIC2.03□□□□□ -2.08
BPTFQ12830 ATXN3L-201ENST00000380622 2164 ntAPPRIS P1 BASIC2.03□□□□□ -2.08
BPTFQ12830 NEBL-202ENST00000377122 9216 ntTSL 1 (best) BASIC2.03□□□□□ -2.08
BPTFQ12830 AC004946.1-201ENST00000421825 751 ntTSL 3 BASIC2.03□□□□□ -2.08
BPTFQ12830 AL358075.3-201ENST00000426289 226 ntBASIC2.03□□□□□ -2.08
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BPTFQ12830 RPS4XP11-201ENST00000446897 772 ntBASIC2.03□□□□□ -2.08
BPTFQ12830 FABP5P13-201ENST00000452144 328 ntBASIC2.03□□□□□ -2.08
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BPTFQ12830 LINC02305-201ENST00000554142 476 ntTSL 3 BASIC2.03□□□□□ -2.08
BPTFQ12830 AC110774.1-201ENST00000623567 2018 ntBASIC2.03□□□□□ -2.08
BPTFQ12830 OR4K2-204ENST00000641885 8681 ntAPPRIS P1 BASIC2.03□□□□□ -2.08
BPTFQ12830 AC025682.1-201ENST00000582389 437 ntTSL 5 BASIC2.03□□□□□ -2.08
BPTFQ12830 ZEB2-AS1-204ENST00000595109 855 ntTSL 5 BASIC2.03□□□□□ -2.08
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BPTFQ12830 MTND4P35-201ENST00000604257 1375 ntBASIC2.02□□□□□ -2.09
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BPTFQ12830 AC140059.1-201ENST00000489238 361 ntBASIC2.02□□□□□ -2.09
BPTFQ12830 RN7SKP40-201ENST00000517211 242 ntBASIC2.02□□□□□ -2.09
BPTFQ12830 AL359233.1-201ENST00000554029 364 ntTSL 3 BASIC2.02□□□□□ -2.09
BPTFQ12830 ZNF788-206ENST00000596883 692 ntTSL 3 BASIC2.02□□□□□ -2.09
BPTFQ12830 CSNK1G3-202ENST00000360683 4047 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.02□□□□□ -2.09
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BPTFQ12830 HSFY1-201ENST00000307393 1444 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC2.02□□□□□ -2.09
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BPTFQ12830 AC068058.1-201ENST00000435782 389 ntTSL 5 BASIC2.02□□□□□ -2.09
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BPTFQ12830 RPL23AP7-203ENST00000449021 469 ntBASIC2.02□□□□□ -2.09
BPTFQ12830 USP9YP32-201ENST00000452432 430 ntBASIC2.02□□□□□ -2.09
BPTFQ12830 AC135999.1-201ENST00000478962 479 ntBASIC2.02□□□□□ -2.09
BPTFQ12830 RNA5SP337-201ENST00000517007 109 ntBASIC2.02□□□□□ -2.09
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BPTFQ12830 PIK3C2G-202ENST00000433979 4840 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.01□□□□□ -2.09
BPTFQ12830 LINC01701-201ENST00000419614 451 ntTSL 2 BASIC2.01□□□□□ -2.09
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BPTFQ12830 PLGLA-202ENST00000482249 475 ntTSL 3 BASIC2.01□□□□□ -2.09
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BPTFQ12830 AC007001.1-201ENST00000590912 670 ntTSL 5 BASIC2.01□□□□□ -2.09
BPTFQ12830 RPL23AP61-201ENST00000623642 466 ntBASIC2.01□□□□□ -2.09
BPTFQ12830 Clostridiales-1.2-201ENST00000636724 160 ntBASIC2.01□□□□□ -2.09
BPTFQ12830 GABRA2-209ENST00000510861 3411 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.01□□□□□ -2.09
BPTFQ12830 MME-216ENST00000615825 5523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.01□□□□□ -2.09
BPTFQ12830 HSP90AA5P-201ENST00000438353 2192 ntBASIC2.01□□□□□ -2.09
BPTFQ12830 AC010976.1-211ENST00000454503 644 ntTSL 2 BASIC2.01□□□□□ -2.09
BPTFQ12830 RPL21P5-201ENST00000554662 472 ntBASIC2.01□□□□□ -2.09
BPTFQ12830 AC010511.1-202ENST00000590229 573 ntTSL 4 BASIC2.01□□□□□ -2.09
BPTFQ12830 CALCRL-203ENST00000410068 1984 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.01□□□□□ -2.09
BPTFQ12830 THUMPD3P1-201ENST00000506556 1480 ntBASIC2.01□□□□□ -2.09
BPTFQ12830 RNA5SP190-201ENST00000365222 118 ntBASIC2.01□□□□□ -2.09
BPTFQ12830 CASP3-203ENST00000393588 677 ntTSL 4 BASIC2.01□□□□□ -2.09
BPTFQ12830 AC133106.1-201ENST00000419029 397 ntTSL 3 BASIC2.01□□□□□ -2.09
BPTFQ12830 MTND3P6-201ENST00000485242 339 ntBASIC2.01□□□□□ -2.09
BPTFQ12830 MTND5P12-201ENST00000502851 1449 ntBASIC2.01□□□□□ -2.09
BPTFQ12830 RNU6-1334P-201ENST00000516032 105 ntBASIC2.01□□□□□ -2.09
BPTFQ12830 RNA5SP476-201ENST00000516613 103 ntBASIC2.01□□□□□ -2.09
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