Protein–RNA interactions for Protein: P49638

TTPA, Alpha-tocopherol transfer protein, humanhuman

Predictions only

Length 278 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TTPAP49638 TAB3-205ENST00000378933 6671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.55□□□□□ -2
TTPAP49638 ZNF470-202ENST00000391709 6601 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.55□□□□□ -2
TTPAP49638 ROCK2-203ENST00000401753 4017 ntTSL 1 (best) BASIC2.55□□□□□ -2
TTPAP49638 AL023807.1-201ENST00000407932 359 ntBASIC2.55□□□□□ -2
TTPAP49638 AL391832.1-201ENST00000423963 423 ntTSL 5 BASIC2.55□□□□□ -2
TTPAP49638 LINC01307-201ENST00000439146 474 ntTSL 3 BASIC2.55□□□□□ -2
TTPAP49638 AL451164.2-201ENST00000445932 597 ntTSL 2 BASIC2.55□□□□□ -2
TTPAP49638 RPL23AP20-201ENST00000447965 421 ntBASIC2.55□□□□□ -2
TTPAP49638 MTND2P19-201ENST00000449129 1012 ntBASIC2.55□□□□□ -2
TTPAP49638 AC234781.5-202ENST00000453508 426 ntTSL 3 BASIC2.55□□□□□ -2
TTPAP49638 AC112695.1-201ENST00000504213 592 ntTSL 2 BASIC2.55□□□□□ -2
TTPAP49638 VN1R104P-201ENST00000505115 1009 ntBASIC2.55□□□□□ -2
TTPAP49638 AC004052.1-202ENST00000505680 516 ntTSL 3 BASIC2.55□□□□□ -2
TTPAP49638 MLLT10P2-201ENST00000506434 249 ntBASIC2.55□□□□□ -2
TTPAP49638 LINC02496-201ENST00000509559 584 ntTSL 3 BASIC2.55□□□□□ -2
TTPAP49638 SNORA31.8-201ENST00000516327 108 ntBASIC2.55□□□□□ -2
TTPAP49638 AC009435.1-201ENST00000519555 574 ntTSL 4 BASIC2.55□□□□□ -2
TTPAP49638 PCM1-222ENST00000524226 5955 ntTSL 1 (best) BASIC2.55□□□□□ -2
TTPAP49638 AL136146.2-201ENST00000534594 494 ntTSL 2 BASIC2.55□□□□□ -2
TTPAP49638 MAL2-203ENST00000534619 578 ntTSL 4 BASIC2.55□□□□□ -2
TTPAP49638 AC092747.1-201ENST00000538920 351 ntTSL 5 BASIC2.55□□□□□ -2
TTPAP49638 AP002373.1-201ENST00000544347 729 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC2.55□□□□□ -2
TTPAP49638 SNORD39.3-201ENST00000584451 71 ntBASIC2.55□□□□□ -2
TTPAP49638 VN1R90P-201ENST00000595717 726 ntBASIC2.55□□□□□ -2
TTPAP49638 VN1R92P-201ENST00000598511 928 ntBASIC2.55□□□□□ -2
TTPAP49638 AC012669.1-201ENST00000603209 283 ntBASIC2.55□□□□□ -2
TTPAP49638 DLEU1_1.1-201ENST00000618107 190 ntBASIC2.55□□□□□ -2
TTPAP49638 AC092608.2-201ENST00000624427 218 ntBASIC2.55□□□□□ -2
TTPAP49638 BX649567.1-201ENST00000642071 1134 ntBASIC2.55□□□□□ -2
TTPAP49638 FAM184A-202ENST00000352896 3700 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC2.55□□□□□ -2
TTPAP49638 HIF1A-201ENST00000323441 3555 ntTSL 1 (best) BASIC2.54□□□□□ -2
TTPAP49638 DENND4A-202ENST00000443035 8665 ntTSL 1 (best) BASIC2.54□□□□□ -2
TTPAP49638 ANKRD62P1-201ENST00000434304 1623 ntBASIC2.54□□□□□ -2
TTPAP49638 NEB-203ENST00000397345 26202 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.54□□□□□ -2
TTPAP49638 NEB-209ENST00000427231 26202 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.54□□□□□ -2
TTPAP49638 TSGA10-205ENST00000410001 3036 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC2.54□□□□□ -2
TTPAP49638 TOPORSLP1-203ENST00000493279 2871 ntTSL 4 BASIC2.54□□□□□ -2
TTPAP49638 SNORA80A-201ENST00000363922 136 ntBASIC2.54□□□□□ -2
TTPAP49638 RNU1-109P-201ENST00000383960 147 ntBASIC2.54□□□□□ -2
TTPAP49638 UQCRFS1P3-201ENST00000407697 385 ntBASIC2.54□□□□□ -2
TTPAP49638 STAT4-203ENST00000409995 709 ntTSL 5 BASIC2.54□□□□□ -2
TTPAP49638 AC080125.1-201ENST00000414888 684 ntBASIC2.54□□□□□ -2
TTPAP49638 RPL21P32-201ENST00000419877 477 ntBASIC2.54□□□□□ -2
TTPAP49638 ARL5AP4-201ENST00000430731 512 ntBASIC2.54□□□□□ -2
TTPAP49638 SNRPG-206ENST00000454893 527 ntTSL 3 BASIC2.54□□□□□ -2
TTPAP49638 TPRKBP1-201ENST00000456243 481 ntBASIC2.54□□□□□ -2
TTPAP49638 RPS20P24-201ENST00000457473 361 ntBASIC2.54□□□□□ -2
TTPAP49638 NAP1L1P3-201ENST00000462291 880 ntBASIC2.54□□□□□ -2
TTPAP49638 PABPC1P3-201ENST00000469174 459 ntBASIC2.54□□□□□ -2
TTPAP49638 VPS26AP1-201ENST00000483197 979 ntBASIC2.54□□□□□ -2
TTPAP49638 AC074131.1-201ENST00000514662 253 ntTSL 2 BASIC2.54□□□□□ -2
TTPAP49638 RNU6-826P-201ENST00000516827 104 ntBASIC2.54□□□□□ -2
TTPAP49638 SNORA76.2-201ENST00000517095 137 ntBASIC2.54□□□□□ -2
TTPAP49638 UQCRB-202ENST00000517523 515 ntTSL 2 BASIC2.54□□□□□ -2
TTPAP49638 AC084116.3-201ENST00000519123 429 ntTSL 3 BASIC2.54□□□□□ -2
TTPAP49638 AC087439.2-201ENST00000519498 552 ntTSL 3 BASIC2.54□□□□□ -2
TTPAP49638 AP000790.1-201ENST00000528891 737 ntBASIC2.54□□□□□ -2
TTPAP49638 AC124293.1-201ENST00000530034 493 ntBASIC2.54□□□□□ -2
TTPAP49638 OR4P1P-201ENST00000530808 1136 ntBASIC2.54□□□□□ -2
TTPAP49638 AC063948.1-201ENST00000547360 379 ntTSL 5 BASIC2.54□□□□□ -2
TTPAP49638 AL049835.1-201ENST00000555850 514 ntTSL 3 BASIC2.54□□□□□ -2
TTPAP49638 NIFKP8-201ENST00000560500 874 ntBASIC2.54□□□□□ -2
TTPAP49638 AC090695.1-201ENST00000561269 1222 ntBASIC2.54□□□□□ -2
TTPAP49638 AC090772.1-201ENST00000583782 507 ntTSL 5 BASIC2.54□□□□□ -2
TTPAP49638 AC104365.3-201ENST00000587011 625 ntTSL 5 BASIC2.54□□□□□ -2
TTPAP49638 AC091132.5-202ENST00000587078 501 ntTSL 3 BASIC2.54□□□□□ -2
TTPAP49638 AC100781.1-203ENST00000598549 399 ntTSL 5 BASIC2.54□□□□□ -2
TTPAP49638 AL035413.2-201ENST00000604801 525 ntBASIC2.54□□□□□ -2
TTPAP49638 AC106900.2-201ENST00000604994 317 ntBASIC2.54□□□□□ -2
TTPAP49638 AL033523.1-201ENST00000605153 153 ntBASIC2.54□□□□□ -2
TTPAP49638 ACYP2-208ENST00000606865 674 ntTSL 5 BASIC2.54□□□□□ -2
TTPAP49638 OR2AS2P-201ENST00000606902 342 ntBASIC2.54□□□□□ -2
TTPAP49638 AC009570.1-201ENST00000609599 745 ntBASIC2.54□□□□□ -2
TTPAP49638 AC009318.4-201ENST00000620496 486 ntBASIC2.54□□□□□ -2
TTPAP49638 AC106730.3-201ENST00000624568 641 ntBASIC2.54□□□□□ -2
TTPAP49638 AL139220.2-223ENST00000625982 921 ntTSL 5 BASIC2.54□□□□□ -2
TTPAP49638 CYLC2-201ENST00000374798 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.54□□□□□ -2
TTPAP49638 AC091564.4-201ENST00000533934 2194 ntBASIC2.54□□□□□ -2
TTPAP49638 TPTE2-202ENST00000382978 1677 ntTSL 5 BASIC2.53□□□□□ -2
TTPAP49638 PKIB-201ENST00000258014 1595 ntTSL 2 BASIC2.53□□□□□ -2
TTPAP49638 AL049780.3-201ENST00000624612 1583 ntBASIC2.53□□□□□ -2
TTPAP49638 C1D-201ENST00000355848 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.53□□□□□ -2
TTPAP49638 ZNF732-202ENST00000619749 2179 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC2.53□□□□□ -2
TTPAP49638 AC008432.1-201ENST00000615912 1320 ntBASIC2.53□□□□□ -2
TTPAP49638 ATP6V1G3-202ENST00000309309 678 ntTSL 5 BASIC2.53□□□□□ -2
TTPAP49638 KRTAP22-2-201ENST00000382830 293 ntAPPRIS P1 BASIC2.53□□□□□ -2
TTPAP49638 MIR34A-201ENST00000385130 110 ntBASIC2.53□□□□□ -2
TTPAP49638 AL139039.1-201ENST00000401900 692 ntBASIC2.53□□□□□ -2
TTPAP49638 AC092447.6-201ENST00000414578 210 ntBASIC2.53□□□□□ -2
TTPAP49638 AC008173.1-201ENST00000418901 264 ntBASIC2.53□□□□□ -2
TTPAP49638 LINC01378-202ENST00000437514 783 ntTSL 3 BASIC2.53□□□□□ -2
TTPAP49638 MTCYBP34-201ENST00000439552 670 ntBASIC2.53□□□□□ -2
TTPAP49638 LAMTOR5P1-201ENST00000444290 270 ntBASIC2.53□□□□□ -2
TTPAP49638 MTND2P3-201ENST00000452458 470 ntBASIC2.53□□□□□ -2
TTPAP49638 TRBV26-201ENST00000456572 344 ntBASIC2.53□□□□□ -2
TTPAP49638 AC008571.1-201ENST00000467232 300 ntBASIC2.53□□□□□ -2
TTPAP49638 RPL21P47-201ENST00000483696 477 ntBASIC2.53□□□□□ -2
TTPAP49638 PRELID3BP4-201ENST00000515476 571 ntBASIC2.53□□□□□ -2
TTPAP49638 AC091053.2-201ENST00000534169 537 ntTSL 4 BASIC2.53□□□□□ -2
TTPAP49638 AP000462.3-201ENST00000545593 330 ntTSL 5 BASIC2.53□□□□□ -2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 145.3 ms