Protein–RNA interactions for Protein: P31415

CASQ1, Calsequestrin-1, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CASQ1P31415 NEB-209ENST00000427231 26202 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.88□□□□□ -1.95
CASQ1P31415 ZNF883-201ENST00000619044 2051 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.88□□□□□ -1.95
CASQ1P31415 SYCP2-201ENST00000357552 5567 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC2.88□□□□□ -1.95
CASQ1P31415 SNORA63.1-201ENST00000362493 131 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
CASQ1P31415 SNORA68.1-201ENST00000364537 132 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
CASQ1P31415 RNU6-851P-201ENST00000384565 107 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
CASQ1P31415 SNORA80E-201ENST00000384744 137 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
CASQ1P31415 MIR524-201ENST00000385242 87 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
CASQ1P31415 MIR1290-201ENST00000408735 78 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
CASQ1P31415 RNU6-77P-201ENST00000410554 91 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
CASQ1P31415 RPL7P44-201ENST00000424827 742 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
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CASQ1P31415 AP002512.3-201ENST00000440231 985 ntAPPRIS P1 BASIC2.88□□□□□ -1.95
CASQ1P31415 AC112653.1-201ENST00000443851 386 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
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CASQ1P31415 AL139081.1-201ENST00000452207 382 ntTSL 3 BASIC2.88□□□□□ -1.95
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CASQ1P31415 AC090096.1-201ENST00000489168 390 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
CASQ1P31415 NAA50-206ENST00000493454 964 ntTSL 2 BASIC2.88□□□□□ -1.95
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CASQ1P31415 AC093535.1-201ENST00000515808 747 ntTSL 3 BASIC2.88□□□□□ -1.95
CASQ1P31415 SNORA74D-201ENST00000516404 141 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
CASQ1P31415 RNU1-45P-201ENST00000517191 141 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
CASQ1P31415 AC123904.3-201ENST00000547218 814 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
CASQ1P31415 OR6C68-201ENST00000548615 939 ntAPPRIS P1 BASIC2.88□□□□□ -1.95
CASQ1P31415 AC018904.1-201ENST00000560594 542 ntTSL 3 BASIC2.88□□□□□ -1.95
CASQ1P31415 AC022335.1-204ENST00000590779 600 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC2.88□□□□□ -1.95
CASQ1P31415 AC005498.1-201ENST00000592125 465 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
CASQ1P31415 BNIP3P4-201ENST00000604946 565 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
CASQ1P31415 AC091925.2-201ENST00000625059 256 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
CASQ1P31415 FGF7-201ENST00000267843 5467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.87□□□□□ -1.95
CASQ1P31415 RGS18-201ENST00000367460 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.87□□□□□ -1.95
CASQ1P31415 CYLC2-201ENST00000374798 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.87□□□□□ -1.95
CASQ1P31415 AC009812.4-201ENST00000569134 1805 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
CASQ1P31415 AL139276.1-201ENST00000311910 1001 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
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CASQ1P31415 AC022509.2-201ENST00000540392 699 ntTSL 3 BASIC2.86□□□□□ -1.95
CASQ1P31415 MIR4635-201ENST00000583759 79 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
CASQ1P31415 MIR3616-201ENST00000584070 92 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
CASQ1P31415 MIR6895-201ENST00000613497 78 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
CASQ1P31415 AC073308.1-201ENST00000623696 305 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
CASQ1P31415 OR8K3-202ENST00000623845 939 ntAPPRIS P1 BASIC2.86□□□□□ -1.95
CASQ1P31415 OR51G1-201ENST00000623849 966 ntAPPRIS P1 BASIC2.86□□□□□ -1.95
CASQ1P31415 C8orf89-203ENST00000625134 507 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.86□□□□□ -1.95
CASQ1P31415 U3.20-201ENST00000390909 217 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
CASQ1P31415 AP003170.3-201ENST00000399123 158 ntTSL 5 BASIC2.85□□□□□ -1.95
CASQ1P31415 RNU4ATAC16P-201ENST00000408512 126 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
CASQ1P31415 ARL4AP4-201ENST00000434170 518 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
CASQ1P31415 AL714022.1-201ENST00000439897 151 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
CASQ1P31415 CACYBPP2-201ENST00000453625 678 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
CASQ1P31415 ITCH-AS1-201ENST00000454205 299 ntTSL 5 BASIC2.85□□□□□ -1.95
CASQ1P31415 MTCO3P2-201ENST00000457365 171 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
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