Protein–RNA interactions for Protein: Q9GZZ0

HOXD1, Homeobox protein Hox-D1, humanhuman

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Length 328 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXD1Q9GZZ0 AC013401.1-202ENST00000422017 626 ntTSL 2 BASIC3.3□□□□□ -1.88
HOXD1Q9GZZ0 AL161935.3-201ENST00000433770 347 ntTSL 2 BASIC3.3□□□□□ -1.88
HOXD1Q9GZZ0 AL590103.1-201ENST00000434488 307 ntBASIC3.3□□□□□ -1.88
HOXD1Q9GZZ0 AP000477.1-202ENST00000434859 847 ntTSL 3 BASIC3.3□□□□□ -1.88
HOXD1Q9GZZ0 AC009299.3-202ENST00000445372 538 ntTSL 3 BASIC3.3□□□□□ -1.88
HOXD1Q9GZZ0 BX322784.1-201ENST00000455793 1077 ntBASIC3.3□□□□□ -1.88
HOXD1Q9GZZ0 AL080313.2-201ENST00000456440 489 ntTSL 3 BASIC3.3□□□□□ -1.88
HOXD1Q9GZZ0 AL359915.2-203ENST00000457043 540 ntTSL 3 BASIC3.3□□□□□ -1.88
HOXD1Q9GZZ0 U8.18-201ENST00000459285 133 ntBASIC3.3□□□□□ -1.88
HOXD1Q9GZZ0 AC121764.1-201ENST00000472238 563 ntTSL 4 BASIC3.3□□□□□ -1.88
HOXD1Q9GZZ0 IGKV2D-30-201ENST00000474213 395 ntAPPRIS P1 BASIC3.3□□□□□ -1.88
HOXD1Q9GZZ0 RPL30P6-201ENST00000475925 342 ntBASIC3.3□□□□□ -1.88
HOXD1Q9GZZ0 AC011396.1-201ENST00000507391 312 ntTSL 3 BASIC3.3□□□□□ -1.88
HOXD1Q9GZZ0 AC008957.1-201ENST00000510740 478 ntTSL 3 BASIC3.3□□□□□ -1.88
HOXD1Q9GZZ0 PAICSP4-201ENST00000517543 1253 ntBASIC3.3□□□□□ -1.88
HOXD1Q9GZZ0 AC024958.1-201ENST00000519364 902 ntTSL 5 BASIC3.3□□□□□ -1.88
HOXD1Q9GZZ0 AC022861.1-201ENST00000522981 663 ntBASIC3.3□□□□□ -1.88
HOXD1Q9GZZ0 KLRF2-201ENST00000535540 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.3□□□□□ -1.88
HOXD1Q9GZZ0 AC009803.1-201ENST00000551531 416 ntTSL 3 BASIC3.3□□□□□ -1.88
HOXD1Q9GZZ0 AC025265.2-201ENST00000551905 478 ntTSL 3 BASIC3.3□□□□□ -1.88
HOXD1Q9GZZ0 AC007954.1-201ENST00000554198 494 ntBASIC3.3□□□□□ -1.88
HOXD1Q9GZZ0 LINC01491-202ENST00000558792 439 ntTSL 3 BASIC3.3□□□□□ -1.88
HOXD1Q9GZZ0 AL133383.1-201ENST00000569292 901 ntTSL 1 (best) BASIC3.3□□□□□ -1.88
HOXD1Q9GZZ0 MIR7515HG-213ENST00000585872 758 ntTSL 5 BASIC3.3□□□□□ -1.88
HOXD1Q9GZZ0 AC097467.3-208ENST00000593486 670 ntTSL 5 BASIC3.3□□□□□ -1.88
HOXD1Q9GZZ0 AC098617.1-215ENST00000594798 1152 ntTSL 5 BASIC3.3□□□□□ -1.88
HOXD1Q9GZZ0 AC008277.1-203ENST00000594921 1149 ntTSL 5 BASIC3.3□□□□□ -1.88
HOXD1Q9GZZ0 WISP1-OT1-201ENST00000602893 642 ntBASIC3.3□□□□□ -1.88
HOXD1Q9GZZ0 AC010591.1-201ENST00000603941 649 ntBASIC3.3□□□□□ -1.88
HOXD1Q9GZZ0 AC112230.1-201ENST00000604342 547 ntBASIC3.3□□□□□ -1.88
HOXD1Q9GZZ0 ZRANB2-AS2-218ENST00000608360 722 ntTSL 5 BASIC3.3□□□□□ -1.88
HOXD1Q9GZZ0 AC107294.3-201ENST00000609211 526 ntBASIC3.3□□□□□ -1.88
HOXD1Q9GZZ0 AC093783.1-201ENST00000612976 329 ntBASIC3.3□□□□□ -1.88
HOXD1Q9GZZ0 CLECL1-204ENST00000621400 611 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.3□□□□□ -1.88
HOXD1Q9GZZ0 PLCE1P1-201ENST00000622094 305 ntBASIC3.3□□□□□ -1.88
HOXD1Q9GZZ0 AL356266.1-201ENST00000623311 483 ntBASIC3.3□□□□□ -1.88
HOXD1Q9GZZ0 AC099063.3-201ENST00000642066 185 ntBASIC3.3□□□□□ -1.88
HOXD1Q9GZZ0 UEVLD-208ENST00000535484 1963 ntTSL 2 BASIC3.3□□□□□ -1.88
HOXD1Q9GZZ0 TTN-204ENST00000360870 18218 ntTSL 5 BASIC3.3□□□□□ -1.88
HOXD1Q9GZZ0 KIAA0586-215ENST00000619722 5597 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC3.3□□□□□ -1.88
HOXD1Q9GZZ0 ANKRD62P1-201ENST00000434304 1623 ntBASIC3.3□□□□□ -1.88
HOXD1Q9GZZ0 MGAT4C-202ENST00000548651 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.29□□□□□ -1.88
HOXD1Q9GZZ0 MTND4P16-201ENST00000466108 1367 ntBASIC3.29□□□□□ -1.88
HOXD1Q9GZZ0 DDX43P2-201ENST00000604753 1354 ntBASIC3.29□□□□□ -1.88
HOXD1Q9GZZ0 AC019117.3-201ENST00000637807 3523 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.29□□□□□ -1.88
HOXD1Q9GZZ0 PPP1R12A-204ENST00000546369 2977 ntTSL 2 BASIC3.29□□□□□ -1.88
HOXD1Q9GZZ0 TAS2R14-202ENST00000537503 1858 ntAPPRIS P1 BASIC3.29□□□□□ -1.88
HOXD1Q9GZZ0 RPL23AP57-201ENST00000332361 466 ntBASIC3.29□□□□□ -1.88
HOXD1Q9GZZ0 MIR148B-201ENST00000362252 99 ntBASIC3.29□□□□□ -1.88
HOXD1Q9GZZ0 RNU6-500P-201ENST00000362349 107 ntBASIC3.29□□□□□ -1.88
HOXD1Q9GZZ0 RNU4-40P-201ENST00000364351 143 ntBASIC3.29□□□□□ -1.88
HOXD1Q9GZZ0 RNU6-343P-201ENST00000364709 104 ntBASIC3.29□□□□□ -1.88
HOXD1Q9GZZ0 RNA5SP51-201ENST00000364750 119 ntBASIC3.29□□□□□ -1.88
HOXD1Q9GZZ0 RNA5SP479-201ENST00000364858 117 ntBASIC3.29□□□□□ -1.88
HOXD1Q9GZZ0 EQTN-202ENST00000380032 1033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC3.29□□□□□ -1.88
HOXD1Q9GZZ0 AL583834.1-201ENST00000406943 343 ntBASIC3.29□□□□□ -1.88
HOXD1Q9GZZ0 RPS15AP38-201ENST00000413110 372 ntBASIC3.29□□□□□ -1.88
HOXD1Q9GZZ0 NDUFB4P5-201ENST00000415445 361 ntBASIC3.29□□□□□ -1.88
HOXD1Q9GZZ0 AL158834.1-201ENST00000419441 466 ntTSL 5 BASIC3.29□□□□□ -1.88
HOXD1Q9GZZ0 AC083875.1-201ENST00000419509 405 ntBASIC3.29□□□□□ -1.88
HOXD1Q9GZZ0 AL645937.4-201ENST00000419702 389 ntTSL 2 BASIC3.29□□□□□ -1.88
HOXD1Q9GZZ0 LINC01884-201ENST00000433429 440 ntTSL 3 BASIC3.29□□□□□ -1.88
HOXD1Q9GZZ0 SETP8-201ENST00000435341 628 ntBASIC3.29□□□□□ -1.88
HOXD1Q9GZZ0 LINC01423-202ENST00000436845 423 ntTSL 2 BASIC3.29□□□□□ -1.88
HOXD1Q9GZZ0 MIR548XHG-203ENST00000437492 853 ntTSL 1 (best) BASIC3.29□□□□□ -1.88
HOXD1Q9GZZ0 MTND5P14-201ENST00000441481 1267 ntBASIC3.29□□□□□ -1.88
HOXD1Q9GZZ0 HSPE1P28-201ENST00000443139 211 ntBASIC3.29□□□□□ -1.88
HOXD1Q9GZZ0 AC097262.1-201ENST00000452559 548 ntBASIC3.29□□□□□ -1.88
HOXD1Q9GZZ0 SUN3-208ENST00000453192 801 ntTSL 5 BASIC3.29□□□□□ -1.88
HOXD1Q9GZZ0 AL122001.1-201ENST00000457027 370 ntBASIC3.29□□□□□ -1.88
HOXD1Q9GZZ0 BTF3P5-201ENST00000457252 467 ntBASIC3.29□□□□□ -1.88
HOXD1Q9GZZ0 RPL30P9-201ENST00000465586 330 ntBASIC3.29□□□□□ -1.88
HOXD1Q9GZZ0 RN7SL594P-201ENST00000470590 287 ntBASIC3.29□□□□□ -1.88
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HOXD1Q9GZZ0 FAM172BP-201ENST00000487497 1089 ntBASIC3.29□□□□□ -1.88
HOXD1Q9GZZ0 LINC02465-201ENST00000507099 532 ntTSL 4 BASIC3.29□□□□□ -1.88
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HOXD1Q9GZZ0 AL450442.1-201ENST00000554042 854 ntTSL 1 (best) BASIC3.29□□□□□ -1.88
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HOXD1Q9GZZ0 OR4T1P-201ENST00000554933 911 ntBASIC3.29□□□□□ -1.88
HOXD1Q9GZZ0 AC026474.1-201ENST00000562422 428 ntTSL 2 BASIC3.29□□□□□ -1.88
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HOXD1Q9GZZ0 AP005380.1-201ENST00000584896 547 ntTSL 4 BASIC3.29□□□□□ -1.88
HOXD1Q9GZZ0 AC006116.10-201ENST00000591836 581 ntBASIC3.29□□□□□ -1.88
HOXD1Q9GZZ0 AC110760.3-201ENST00000598794 467 ntBASIC3.29□□□□□ -1.88
HOXD1Q9GZZ0 RPL23AP92-201ENST00000603609 255 ntBASIC3.29□□□□□ -1.88
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HOXD1Q9GZZ0 HMGN2P28-201ENST00000606102 262 ntBASIC3.29□□□□□ -1.88
HOXD1Q9GZZ0 RNU6-88P-201ENST00000606801 100 ntBASIC3.29□□□□□ -1.88
HOXD1Q9GZZ0 OR2AS2P-201ENST00000606902 342 ntBASIC3.29□□□□□ -1.88
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HOXD1Q9GZZ0 AC040168.1-201ENST00000623594 991 ntBASIC3.29□□□□□ -1.88
HOXD1Q9GZZ0 AC009039.2-201ENST00000624524 529 ntBASIC3.29□□□□□ -1.88
HOXD1Q9GZZ0 AC048347.1-201ENST00000624621 427 ntBASIC3.29□□□□□ -1.88
HOXD1Q9GZZ0 ATP2B1-203ENST00000393164 3127 ntTSL 1 (best) BASIC3.29□□□□□ -1.88
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