Protein–RNA interactions for Protein: Q1XH10

SKIDA1, SKI/DACH domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 827 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SKIDA1Q1XH10 AC012158.1-204ENST00000483430 465 ntBASIC4.81□□□□□ -1.64
SKIDA1Q1XH10 FTH1P24-201ENST00000503502 462 ntBASIC4.81□□□□□ -1.64
SKIDA1Q1XH10 AC104057.1-201ENST00000515547 497 ntBASIC4.81□□□□□ -1.64
SKIDA1Q1XH10 SNORD60.2-201ENST00000516883 86 ntBASIC4.81□□□□□ -1.64
SKIDA1Q1XH10 RNA5SP337-201ENST00000517007 109 ntBASIC4.81□□□□□ -1.64
SKIDA1Q1XH10 AC022690.1-201ENST00000526681 550 ntBASIC4.81□□□□□ -1.64
SKIDA1Q1XH10 AP000907.2-201ENST00000530827 353 ntBASIC4.81□□□□□ -1.64
SKIDA1Q1XH10 KIRREL3-AS2-201ENST00000532988 492 ntTSL 1 (best) BASIC4.81□□□□□ -1.64
SKIDA1Q1XH10 AC084819.1-201ENST00000537293 424 ntTSL 1 (best) BASIC4.81□□□□□ -1.64
SKIDA1Q1XH10 LINC01479-201ENST00000545520 509 ntTSL 2 BASIC4.81□□□□□ -1.64
SKIDA1Q1XH10 OR4T1P-201ENST00000554933 911 ntBASIC4.81□□□□□ -1.64
SKIDA1Q1XH10 AC009145.3-201ENST00000567386 476 ntTSL 3 BASIC4.81□□□□□ -1.64
SKIDA1Q1XH10 AC064805.2-201ENST00000582959 523 ntTSL 4 BASIC4.81□□□□□ -1.64
SKIDA1Q1XH10 MIR4737-201ENST00000583979 81 ntBASIC4.81□□□□□ -1.64
SKIDA1Q1XH10 DSCR9-205ENST00000585273 751 ntTSL 1 (best) BASIC4.81□□□□□ -1.64
SKIDA1Q1XH10 AC022726.1-201ENST00000587475 207 ntBASIC4.81□□□□□ -1.64
SKIDA1Q1XH10 AC022432.1-201ENST00000595739 310 ntBASIC4.81□□□□□ -1.64
SKIDA1Q1XH10 AC025588.3-201ENST00000604182 274 ntBASIC4.81□□□□□ -1.64
SKIDA1Q1XH10 AC008035.1-201ENST00000607353 448 ntTSL 3 BASIC4.81□□□□□ -1.64
SKIDA1Q1XH10 MIR7154-201ENST00000620673 73 ntBASIC4.81□□□□□ -1.64
SKIDA1Q1XH10 AC079597.1-201ENST00000624306 508 ntBASIC4.81□□□□□ -1.64
SKIDA1Q1XH10 PTP4A2-219ENST00000626355 606 ntTSL 5 BASIC4.81□□□□□ -1.64
SKIDA1Q1XH10 PTP4A2-220ENST00000627328 615 ntTSL 5 BASIC4.81□□□□□ -1.64
SKIDA1Q1XH10 TTN-AS1-263ENST00000627527 784 ntTSL 5 BASIC4.81□□□□□ -1.64
SKIDA1Q1XH10 CASP1-217ENST00000640184 327 ntTSL 1 (best) BASIC4.81□□□□□ -1.64
SKIDA1Q1XH10 CCDC91-201ENST00000381259 2334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.81□□□□□ -1.64
SKIDA1Q1XH10 OMG-201ENST00000247271 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.81□□□□□ -1.64
SKIDA1Q1XH10 MTND5P28-201ENST00000438005 1594 ntBASIC4.81□□□□□ -1.64
SKIDA1Q1XH10 MYB-226ENST00000528774 2277 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC4.81□□□□□ -1.64
SKIDA1Q1XH10 PLCB4-206ENST00000414679 3947 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC4.81□□□□□ -1.64
SKIDA1Q1XH10 THEMIS-205ENST00000626040 3179 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC4.81□□□□□ -1.64
SKIDA1Q1XH10 GDAP2-202ENST00000369443 8828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.81□□□□□ -1.64
SKIDA1Q1XH10 SYTL2-213ENST00000525702 2727 ntTSL 1 (best) BASIC4.81□□□□□ -1.64
SKIDA1Q1XH10 PPP1R9A-202ENST00000340694 9689 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.8□□□□□ -1.64
SKIDA1Q1XH10 SCAF11-212ENST00000549162 3934 ntTSL 1 (best) BASIC4.8□□□□□ -1.64
SKIDA1Q1XH10 GPR34-202ENST00000378142 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.8□□□□□ -1.64
SKIDA1Q1XH10 USP26-203ENST00000511190 3665 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.8□□□□□ -1.64
SKIDA1Q1XH10 ZMYND11-217ENST00000627286 3914 ntTSL 5 BASIC4.8□□□□□ -1.64
SKIDA1Q1XH10 ATP8A2P2-201ENST00000437678 1568 ntBASIC4.8□□□□□ -1.64
SKIDA1Q1XH10 CFTR-201ENST00000003084 6132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.8□□□□□ -1.64
SKIDA1Q1XH10 RPL7P26-201ENST00000333817 754 ntBASIC4.8□□□□□ -1.64
SKIDA1Q1XH10 AC068538.1-201ENST00000376856 336 ntBASIC4.8□□□□□ -1.64
SKIDA1Q1XH10 C9orf92-201ENST00000380683 359 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC4.8□□□□□ -1.64
SKIDA1Q1XH10 RNU6-74P-201ENST00000384235 107 ntBASIC4.8□□□□□ -1.64
SKIDA1Q1XH10 RNU6-1207P-201ENST00000384343 107 ntBASIC4.8□□□□□ -1.64
SKIDA1Q1XH10 RPL7P60-201ENST00000397636 735 ntBASIC4.8□□□□□ -1.64
SKIDA1Q1XH10 AL162578.1-201ENST00000406202 378 ntBASIC4.8□□□□□ -1.64
SKIDA1Q1XH10 IL6-206ENST00000407492 926 ntTSL 3 BASIC4.8□□□□□ -1.64
SKIDA1Q1XH10 AC069218.2-201ENST00000411665 344 ntBASIC4.8□□□□□ -1.64
SKIDA1Q1XH10 TTTY12-201ENST00000413466 979 ntTSL 1 (best) BASIC4.8□□□□□ -1.64
SKIDA1Q1XH10 AC127526.1-201ENST00000417526 366 ntBASIC4.8□□□□□ -1.64
SKIDA1Q1XH10 RPL35AP12-201ENST00000425362 338 ntBASIC4.8□□□□□ -1.64
SKIDA1Q1XH10 MTCO3P46-201ENST00000425787 232 ntBASIC4.8□□□□□ -1.64
SKIDA1Q1XH10 ATP5JP1-201ENST00000431631 322 ntBASIC4.8□□□□□ -1.64
SKIDA1Q1XH10 AC092013.1-201ENST00000438795 332 ntBASIC4.8□□□□□ -1.64
SKIDA1Q1XH10 RPL7P12-201ENST00000446719 750 ntBASIC4.8□□□□□ -1.64
SKIDA1Q1XH10 AC104651.2-201ENST00000447549 528 ntBASIC4.8□□□□□ -1.64
SKIDA1Q1XH10 LINC00395-202ENST00000451570 415 ntTSL 3 BASIC4.8□□□□□ -1.64
SKIDA1Q1XH10 AURKAPS2-201ENST00000454983 333 ntBASIC4.8□□□□□ -1.64
SKIDA1Q1XH10 RPS5P7-201ENST00000456664 608 ntBASIC4.8□□□□□ -1.64
SKIDA1Q1XH10 AC233702.1-201ENST00000482905 502 ntBASIC4.8□□□□□ -1.64
SKIDA1Q1XH10 ARNTL2-AS1-201ENST00000500498 804 ntTSL 1 (best) BASIC4.8□□□□□ -1.64
SKIDA1Q1XH10 AC093767.1-201ENST00000504523 156 ntBASIC4.8□□□□□ -1.64
SKIDA1Q1XH10 AC112198.3-201ENST00000505950 441 ntTSL 3 BASIC4.8□□□□□ -1.64
SKIDA1Q1XH10 RPS3A-208ENST00000509736 576 ntTSL 2 BASIC4.8□□□□□ -1.64
SKIDA1Q1XH10 PPBPP1-201ENST00000510807 373 ntBASIC4.8□□□□□ -1.64
SKIDA1Q1XH10 EGFLAM-AS2-202ENST00000514377 539 ntTSL 3 BASIC4.8□□□□□ -1.64
SKIDA1Q1XH10 RNU1-6P-201ENST00000516290 144 ntBASIC4.8□□□□□ -1.64
SKIDA1Q1XH10 AC025871.1-202ENST00000518819 432 ntTSL 3 BASIC4.8□□□□□ -1.64
SKIDA1Q1XH10 AC100782.1-201ENST00000520778 590 ntTSL 3 BASIC4.8□□□□□ -1.64
SKIDA1Q1XH10 OR4R1P-201ENST00000529879 463 ntBASIC4.8□□□□□ -1.64
SKIDA1Q1XH10 AC100770.1-201ENST00000532310 322 ntBASIC4.8□□□□□ -1.64
SKIDA1Q1XH10 ASB8-204ENST00000536071 568 ntTSL 4 BASIC4.8□□□□□ -1.64
SKIDA1Q1XH10 AC133555.2-201ENST00000550213 292 ntBASIC4.8□□□□□ -1.64
SKIDA1Q1XH10 AC011611.1-201ENST00000552179 197 ntBASIC4.8□□□□□ -1.64
SKIDA1Q1XH10 AL110118.1-201ENST00000553543 400 ntBASIC4.8□□□□□ -1.64
SKIDA1Q1XH10 AL121821.1-201ENST00000557067 530 ntTSL 3 BASIC4.8□□□□□ -1.64
SKIDA1Q1XH10 AC015912.2-201ENST00000571053 181 ntBASIC4.8□□□□□ -1.64
SKIDA1Q1XH10 LINC02185-201ENST00000575424 760 ntTSL 5 BASIC4.8□□□□□ -1.64
SKIDA1Q1XH10 MIR4284-201ENST00000578924 81 ntBASIC4.8□□□□□ -1.64
SKIDA1Q1XH10 MIR3146-201ENST00000580367 79 ntBASIC4.8□□□□□ -1.64
SKIDA1Q1XH10 AC007952.9-201ENST00000584365 191 ntTSL 3 BASIC4.8□□□□□ -1.64
SKIDA1Q1XH10 AC233702.6-201ENST00000584594 396 ntTSL 3 BASIC4.8□□□□□ -1.64
SKIDA1Q1XH10 AC026620.1-201ENST00000584815 326 ntTSL 3 BASIC4.8□□□□□ -1.64
SKIDA1Q1XH10 AC010525.2-201ENST00000590920 195 ntBASIC4.8□□□□□ -1.64
SKIDA1Q1XH10 AC005191.1-201ENST00000603950 358 ntBASIC4.8□□□□□ -1.64
SKIDA1Q1XH10 USP12-203ENST00000620323 349 ntTSL 3 BASIC4.8□□□□□ -1.64
SKIDA1Q1XH10 AC019278.1-201ENST00000623516 479 ntBASIC4.8□□□□□ -1.64
SKIDA1Q1XH10 CARF-203ENST00000414439 2099 ntTSL 2 BASIC4.8□□□□□ -1.64
SKIDA1Q1XH10 R3HDM1-203ENST00000409606 3673 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC4.8□□□□□ -1.64
SKIDA1Q1XH10 ZNF345-213ENST00000589046 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.8□□□□□ -1.64
SKIDA1Q1XH10 DDX18P3-201ENST00000404856 2007 ntBASIC4.8□□□□□ -1.64
SKIDA1Q1XH10 TOX-201ENST00000361421 4131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.8□□□□□ -1.64
SKIDA1Q1XH10 MAP3K19-203ENST00000375845 4369 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.8□□□□□ -1.64
SKIDA1Q1XH10 MFSD8-216ENST00000641147 4009 ntBASIC4.8□□□□□ -1.64
SKIDA1Q1XH10 ORC4-201ENST00000264169 6598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.8□□□□□ -1.64
SKIDA1Q1XH10 ZNF962P-201ENST00000443465 3140 ntBASIC4.79□□□□□ -1.64
SKIDA1Q1XH10 TRIQK-204ENST00000517858 1882 ntTSL 3 BASIC4.79□□□□□ -1.64
SKIDA1Q1XH10 OR8H2-203ENST00000641311 3092 ntAPPRIS P2 BASIC4.79□□□□□ -1.64
SKIDA1Q1XH10 STON1-GTF2A1L-201ENST00000394751 3534 ntTSL 2 BASIC4.79□□□□□ -1.64
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 79 ms