Protein–RNA interactions for Protein: Q16384

SSX1, Protein SSX1, humanhuman

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Length 188 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SSX1Q16384 LINC01515-204ENST00000595269 402 ntTSL 5 BASIC2.4□□□□□ -2.03
SSX1Q16384 AL353811.1-201ENST00000602851 736 ntTSL 5 BASIC2.4□□□□□ -2.03
SSX1Q16384 AC002487.1-201ENST00000604565 994 ntBASIC2.4□□□□□ -2.03
SSX1Q16384 AC055876.5-201ENST00000605667 259 ntBASIC2.4□□□□□ -2.03
SSX1Q16384 AC026741.1-201ENST00000605892 482 ntBASIC2.4□□□□□ -2.03
SSX1Q16384 AL118556.2-201ENST00000614375 824 ntBASIC2.4□□□□□ -2.03
SSX1Q16384 LINC00836-203ENST00000628620 1179 ntTSL 5 BASIC2.4□□□□□ -2.03
SSX1Q16384 TEX41-300ENST00000631048 69 ntTSL 5 BASIC2.4□□□□□ -2.03
SSX1Q16384 MFSD8-245ENST00000641743 948 ntBASIC2.4□□□□□ -2.03
SSX1Q16384 SLC38A9-201ENST00000318672 2369 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.4□□□□□ -2.03
SSX1Q16384 AC011124.1-201ENST00000521221 1762 ntTSL 2 BASIC2.4□□□□□ -2.03
SSX1Q16384 OSTN-202ENST00000445281 3134 ntTSL 5 BASIC2.4□□□□□ -2.03
SSX1Q16384 MTCO1P4-201ENST00000520516 1409 ntBASIC2.4□□□□□ -2.03
SSX1Q16384 TAB2-201ENST00000367456 4553 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.4□□□□□ -2.03
SSX1Q16384 ATP11C-201ENST00000327569 6115 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.39□□□□□ -2.03
SSX1Q16384 AC000403.1-201ENST00000613696 3585 ntBASIC2.39□□□□□ -2.03
SSX1Q16384 ZNF117-203ENST00000610793 1374 ntTSL 2 BASIC2.39□□□□□ -2.03
SSX1Q16384 RICTOR-202ENST00000357387 9543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.39□□□□□ -2.03
SSX1Q16384 TPTE2-202ENST00000382978 1677 ntTSL 5 BASIC2.39□□□□□ -2.03
SSX1Q16384 VTRNA1-1-201ENST00000363120 99 ntBASIC2.39□□□□□ -2.03
SSX1Q16384 HTN3-201ENST00000381057 493 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC2.39□□□□□ -2.03
SSX1Q16384 AL024474.1-201ENST00000404655 591 ntBASIC2.39□□□□□ -2.03
SSX1Q16384 PTGES3P2-201ENST00000407942 482 ntBASIC2.39□□□□□ -2.03
SSX1Q16384 MIR1289-1-201ENST00000408836 144 ntBASIC2.39□□□□□ -2.03
SSX1Q16384 RNA5SP120-201ENST00000410900 112 ntBASIC2.39□□□□□ -2.03
SSX1Q16384 RNU6-575P-201ENST00000411326 105 ntBASIC2.39□□□□□ -2.03
SSX1Q16384 AC092638.1-201ENST00000411966 1275 ntBASIC2.39□□□□□ -2.03
SSX1Q16384 CLYBL-AS1-201ENST00000416009 621 ntTSL 3 BASIC2.39□□□□□ -2.03
SSX1Q16384 AP003025.1-201ENST00000421650 149 ntTSL 1 (best) BASIC2.39□□□□□ -2.03
SSX1Q16384 MTCO1P39-201ENST00000426148 480 ntBASIC2.39□□□□□ -2.03
SSX1Q16384 MTND4LP10-201ENST00000435146 291 ntBASIC2.39□□□□□ -2.03
SSX1Q16384 Z96811.1-201ENST00000445880 108 ntBASIC2.39□□□□□ -2.03
SSX1Q16384 PRDX3P3-201ENST00000447765 522 ntBASIC2.39□□□□□ -2.03
SSX1Q16384 AC007953.1-201ENST00000450500 560 ntTSL 4 BASIC2.39□□□□□ -2.03
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SSX1Q16384 TPTE2P6-203ENST00000450973 649 ntTSL 5 BASIC2.39□□□□□ -2.03
SSX1Q16384 AC092162.2-204ENST00000451851 566 ntTSL 4 BASIC2.39□□□□□ -2.03
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SSX1Q16384 RPL21P131-201ENST00000497298 483 ntBASIC2.39□□□□□ -2.03
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SSX1Q16384 RNU6-549P-201ENST00000384433 107 ntBASIC2.38□□□□□ -2.03
SSX1Q16384 RNA5SP38-201ENST00000410750 119 ntBASIC2.38□□□□□ -2.03
SSX1Q16384 RPS15AP38-201ENST00000413110 372 ntBASIC2.38□□□□□ -2.03
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SSX1Q16384 OFD1P2Y-201ENST00000421895 1149 ntBASIC2.38□□□□□ -2.03
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SSX1Q16384 RNA5SP310-201ENST00000459084 116 ntBASIC2.38□□□□□ -2.03
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SSX1Q16384 LINC01335-201ENST00000507890 389 ntTSL 3 BASIC2.38□□□□□ -2.03
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SSX1Q16384 RNU6-1095P-201ENST00000516148 108 ntBASIC2.38□□□□□ -2.03
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SSX1Q16384 AC096708.3-201ENST00000584226 559 ntTSL 2 BASIC2.38□□□□□ -2.03
SSX1Q16384 AC009220.3-201ENST00000604318 586 ntBASIC2.38□□□□□ -2.03
SSX1Q16384 AC104237.2-201ENST00000612456 443 ntBASIC2.38□□□□□ -2.03
SSX1Q16384 RPL36A-210ENST00000614077 881 ntTSL 1 (best) BASIC2.38□□□□□ -2.03
SSX1Q16384 AC008083.4-201ENST00000615076 444 ntBASIC2.38□□□□□ -2.03
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