Protein–RNA interactions for Protein: Q15532

SS18, Protein SSXT, humanhuman

Predictions only

Length 418 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SS18Q15532 AF279873.4-202ENST00000521714 511 ntTSL 2 BASIC1.95□□□□□ -2.1
SS18Q15532 PSMA2P1-201ENST00000526365 646 ntBASIC1.95□□□□□ -2.1
SS18Q15532 AP002833.1-201ENST00000530572 566 ntTSL 3 BASIC1.95□□□□□ -2.1
SS18Q15532 AP002004.1-207ENST00000531371 526 ntTSL 1 (best) BASIC1.95□□□□□ -2.1
SS18Q15532 AP000857.1-201ENST00000532151 543 ntBASIC1.95□□□□□ -2.1
SS18Q15532 AP001458.1-201ENST00000532626 92 ntTSL 3 BASIC1.95□□□□□ -2.1
SS18Q15532 AC128657.1-201ENST00000549459 145 ntBASIC1.95□□□□□ -2.1
SS18Q15532 AC087481.2-201ENST00000565492 330 ntBASIC1.95□□□□□ -2.1
SS18Q15532 AC024270.4-201ENST00000570202 421 ntTSL 3 BASIC1.95□□□□□ -2.1
SS18Q15532 AC127024.3-201ENST00000582841 460 ntTSL 3 BASIC1.95□□□□□ -2.1
SS18Q15532 SNORD39.3-201ENST00000584451 71 ntBASIC1.95□□□□□ -2.1
SS18Q15532 AL683887.1-201ENST00000603401 287 ntTSL 3 BASIC1.95□□□□□ -2.1
SS18Q15532 AC128687.1-201ENST00000605304 619 ntBASIC1.95□□□□□ -2.1
SS18Q15532 AC024560.3-201ENST00000608482 349 ntBASIC1.95□□□□□ -2.1
SS18Q15532 AC009570.1-201ENST00000609599 745 ntBASIC1.95□□□□□ -2.1
SS18Q15532 SOX2-OT-255ENST00000630150 649 ntTSL 5 BASIC1.95□□□□□ -2.1
SS18Q15532 RAPGEF6-210ENST00000512052 3535 ntTSL 2 BASIC1.95□□□□□ -2.1
SS18Q15532 FGF7-201ENST00000267843 5467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.95□□□□□ -2.1
SS18Q15532 DENND4A-202ENST00000443035 8665 ntTSL 1 (best) BASIC1.95□□□□□ -2.1
SS18Q15532 RBBP8-202ENST00000360790 2962 ntTSL 1 (best) BASIC1.95□□□□□ -2.1
SS18Q15532 MYSM1-208ENST00000622766 6020 ntTSL 1 (best) BASIC1.94□□□□□ -2.1
SS18Q15532 ZNF66-201ENST00000344519 1745 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC1.94□□□□□ -2.1
SS18Q15532 ZMYM1-210ENST00000611874 4466 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC1.94□□□□□ -2.1
SS18Q15532 NETO1-202ENST00000397929 1849 ntTSL 1 (best) BASIC1.94□□□□□ -2.1
SS18Q15532 OSTN-202ENST00000445281 3134 ntTSL 5 BASIC1.94□□□□□ -2.1
SS18Q15532 RNA5SP139-201ENST00000364340 117 ntBASIC1.94□□□□□ -2.1
SS18Q15532 RNA5SP267-201ENST00000364893 126 ntBASIC1.94□□□□□ -2.1
SS18Q15532 SPANXN4-201ENST00000370504 560 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC1.94□□□□□ -2.1
SS18Q15532 TRAV41-201ENST00000390468 336 ntAPPRIS P1 BASIC1.94□□□□□ -2.1
SS18Q15532 MTCO2P31-201ENST00000402702 684 ntBASIC1.94□□□□□ -2.1
SS18Q15532 EIF4EBP2P3-201ENST00000403144 334 ntBASIC1.94□□□□□ -2.1
SS18Q15532 AL023807.1-201ENST00000407932 359 ntBASIC1.94□□□□□ -2.1
SS18Q15532 BX664727.1-201ENST00000416024 466 ntBASIC1.94□□□□□ -2.1
SS18Q15532 AC009276.1-201ENST00000422042 253 ntTSL 5 BASIC1.94□□□□□ -2.1
SS18Q15532 OFD1P12Y-201ENST00000427963 1207 ntBASIC1.94□□□□□ -2.1
SS18Q15532 OFD1P13Y-201ENST00000431179 1232 ntBASIC1.94□□□□□ -2.1
SS18Q15532 AC127537.2-201ENST00000439258 465 ntBASIC1.94□□□□□ -2.1
SS18Q15532 AL020998.1-201ENST00000444923 229 ntTSL 3 BASIC1.94□□□□□ -2.1
SS18Q15532 AL050341.1-201ENST00000447743 313 ntBASIC1.94□□□□□ -2.1
SS18Q15532 CASP12-207ENST00000447913 819 ntTSL 1 (best) BASIC1.94□□□□□ -2.1
SS18Q15532 TRBV26-201ENST00000456572 344 ntBASIC1.94□□□□□ -2.1
SS18Q15532 AC008379.1-201ENST00000463655 464 ntBASIC1.94□□□□□ -2.1
SS18Q15532 VPS26AP1-201ENST00000483197 979 ntBASIC1.94□□□□□ -2.1
SS18Q15532 LINC01612-201ENST00000504509 469 ntTSL 3 BASIC1.94□□□□□ -2.1
SS18Q15532 LINC02118-201ENST00000505899 407 ntTSL 3 BASIC1.94□□□□□ -2.1
SS18Q15532 AC093689.1-203ENST00000505967 299 ntTSL 3 BASIC1.94□□□□□ -2.1
SS18Q15532 AC118282.2-201ENST00000508739 374 ntBASIC1.94□□□□□ -2.1
SS18Q15532 RPPH1-2P-201ENST00000516688 293 ntBASIC1.94□□□□□ -2.1
SS18Q15532 AP000790.1-201ENST00000528891 737 ntBASIC1.94□□□□□ -2.1
SS18Q15532 RGS4-209ENST00000531057 544 ntTSL 4 BASIC1.94□□□□□ -2.1
SS18Q15532 MYRFL-202ENST00000535034 881 ntTSL 1 (best) BASIC1.94□□□□□ -2.1
SS18Q15532 ELOCP31-201ENST00000540463 467 ntBASIC1.94□□□□□ -2.1
SS18Q15532 AC011773.2-201ENST00000551479 285 ntTSL 5 BASIC1.94□□□□□ -2.1
SS18Q15532 LINC01481-201ENST00000552998 629 ntTSL 2 BASIC1.94□□□□□ -2.1
SS18Q15532 AL392023.2-202ENST00000555342 494 ntTSL 5 BASIC1.94□□□□□ -2.1
SS18Q15532 AL032819.1-201ENST00000568554 379 ntTSL 3 BASIC1.94□□□□□ -2.1
SS18Q15532 MTCO1P40-201ENST00000574371 625 ntBASIC1.94□□□□□ -2.1
SS18Q15532 MIR5004-201ENST00000579078 107 ntBASIC1.94□□□□□ -2.1
SS18Q15532 ZNF861P-201ENST00000588126 639 ntBASIC1.94□□□□□ -2.1
SS18Q15532 XIAPP1-201ENST00000603162 600 ntBASIC1.94□□□□□ -2.1
SS18Q15532 AP002906.1-201ENST00000603405 233 ntBASIC1.94□□□□□ -2.1
SS18Q15532 AL355376.2-201ENST00000603866 267 ntTSL 5 BASIC1.94□□□□□ -2.1
SS18Q15532 AC008277.2-201ENST00000605196 797 ntBASIC1.94□□□□□ -2.1
SS18Q15532 AL021368.1-201ENST00000607490 540 ntBASIC1.94□□□□□ -2.1
SS18Q15532 MIR663AHG-231ENST00000609044 590 ntTSL 5 BASIC1.94□□□□□ -2.1
SS18Q15532 MIR7112-201ENST00000616126 65 ntBASIC1.94□□□□□ -2.1
SS18Q15532 AL138880.2-201ENST00000616214 239 ntBASIC1.94□□□□□ -2.1
SS18Q15532 MIR6076-201ENST00000617521 113 ntBASIC1.94□□□□□ -2.1
SS18Q15532 AC012409.2-201ENST00000619812 751 ntTSL 5 BASIC1.94□□□□□ -2.1
SS18Q15532 AC010297.1-201ENST00000623948 149 ntBASIC1.94□□□□□ -2.1
SS18Q15532 ADGRG7-202ENST00000475887 2035 ntTSL 2 BASIC1.94□□□□□ -2.1
SS18Q15532 AC073130.1-201ENST00000457033 1958 ntTSL 2 BASIC1.94□□□□□ -2.1
SS18Q15532 CACNB4-228ENST00000636598 7808 ntTSL 5 BASIC1.94□□□□□ -2.1
SS18Q15532 AC244517.1-201ENST00000606030 2086 ntBASIC1.94□□□□□ -2.1
SS18Q15532 AC096644.4-201ENST00000563417 2912 ntBASIC1.94□□□□□ -2.1
SS18Q15532 RICTOR-202ENST00000357387 9543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.93□□□□□ -2.1
SS18Q15532 CCDC178-213ENST00000583930 3094 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC1.93□□□□□ -2.1
SS18Q15532 FAM214A-201ENST00000261844 4217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.93□□□□□ -2.1
SS18Q15532 HSFY1-202ENST00000309834 1038 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC1.93□□□□□ -2.1
SS18Q15532 HSFY2-202ENST00000344884 1038 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC1.93□□□□□ -2.1
SS18Q15532 RNU6-115P-201ENST00000364310 107 ntBASIC1.93□□□□□ -2.1
SS18Q15532 SNORA9-201ENST00000384215 133 ntBASIC1.93□□□□□ -2.1
SS18Q15532 RNU6-549P-201ENST00000384433 107 ntBASIC1.93□□□□□ -2.1
SS18Q15532 RNVU1-14-201ENST00000384770 164 ntBASIC1.93□□□□□ -2.1
SS18Q15532 AC013286.1-201ENST00000412137 381 ntTSL 5 BASIC1.93□□□□□ -2.1
SS18Q15532 AL133384.1-201ENST00000412744 351 ntBASIC1.93□□□□□ -2.1
SS18Q15532 CLYBL-AS1-201ENST00000416009 621 ntTSL 3 BASIC1.93□□□□□ -2.1
SS18Q15532 B3GALNT1P1-201ENST00000420569 975 ntBASIC1.93□□□□□ -2.1
SS18Q15532 DEFB130D-201ENST00000426866 237 ntBASIC1.93□□□□□ -2.1
SS18Q15532 AL035410.1-201ENST00000427409 427 ntBASIC1.93□□□□□ -2.1
SS18Q15532 RPL17P35-201ENST00000432217 549 ntBASIC1.93□□□□□ -2.1
SS18Q15532 RPL36AP6-201ENST00000435770 321 ntBASIC1.93□□□□□ -2.1
SS18Q15532 LINC01378-202ENST00000437514 783 ntTSL 3 BASIC1.93□□□□□ -2.1
SS18Q15532 AL390879.2-204ENST00000438602 582 ntTSL 3 BASIC1.93□□□□□ -2.1
SS18Q15532 AL513043.1-201ENST00000439124 535 ntBASIC1.93□□□□□ -2.1
SS18Q15532 LINC01307-201ENST00000439146 474 ntTSL 3 BASIC1.93□□□□□ -2.1
SS18Q15532 RPL23AP16-201ENST00000441715 421 ntBASIC1.93□□□□□ -2.1
SS18Q15532 GXYLT1P1-201ENST00000446657 490 ntBASIC1.93□□□□□ -2.1
SS18Q15532 OR51B8P-201ENST00000449892 769 ntBASIC1.93□□□□□ -2.1
SS18Q15532 NIPA2P5-201ENST00000452282 464 ntBASIC1.93□□□□□ -2.1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 83.1 ms