Protein–RNA interactions for Protein: Q14139

UBE4A, Ubiquitin conjugation factor E4 A, humanhuman

Predictions only

Length 1,066 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBE4AQ14139 AC087341.1-201ENST00000521490 491 ntTSL 2 BASIC4.56□□□□□ -1.68
UBE4AQ14139 AC090739.1-201ENST00000522190 708 ntTSL 3 BASIC4.56□□□□□ -1.68
UBE4AQ14139 LINC02384-205ENST00000539404 785 ntTSL 3 BASIC4.56□□□□□ -1.68
UBE4AQ14139 AC027288.1-203ENST00000552167 567 ntTSL 4 BASIC4.56□□□□□ -1.68
UBE4AQ14139 AF099810.1-201ENST00000554219 525 ntTSL 3 BASIC4.56□□□□□ -1.68
UBE4AQ14139 AC025272.1-201ENST00000569661 483 ntTSL 2 BASIC4.56□□□□□ -1.68
UBE4AQ14139 LINC01470-205ENST00000584829 681 ntTSL 3 BASIC4.56□□□□□ -1.68
UBE4AQ14139 MIR3922-201ENST00000585192 84 ntBASIC4.56□□□□□ -1.68
UBE4AQ14139 AC097467.3-208ENST00000593486 670 ntTSL 5 BASIC4.56□□□□□ -1.68
UBE4AQ14139 AC024603.1-201ENST00000597938 592 ntTSL 4 BASIC4.56□□□□□ -1.68
UBE4AQ14139 AP001429.1-201ENST00000602568 530 ntBASIC4.56□□□□□ -1.68
UBE4AQ14139 AC107214.2-201ENST00000608204 634 ntBASIC4.56□□□□□ -1.68
UBE4AQ14139 CLECL1-204ENST00000621400 611 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.56□□□□□ -1.68
UBE4AQ14139 AC006927.3-201ENST00000638789 384 ntBASIC4.56□□□□□ -1.68
UBE4AQ14139 AC119674.1-207ENST00000641355 633 ntBASIC4.56□□□□□ -1.68
UBE4AQ14139 EXOC5P1-201ENST00000510543 1969 ntBASIC4.56□□□□□ -1.68
UBE4AQ14139 C12orf4-201ENST00000261250 3826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.55□□□□□ -1.68
UBE4AQ14139 GCSAML-203ENST00000366491 4130 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC4.55□□□□□ -1.68
UBE4AQ14139 MTND4P16-201ENST00000466108 1367 ntBASIC4.55□□□□□ -1.68
UBE4AQ14139 DNAJC10-201ENST00000264065 20129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.55□□□□□ -1.68
UBE4AQ14139 AL513185.3-201ENST00000433335 1300 ntBASIC4.55□□□□□ -1.68
UBE4AQ14139 SERPINA7-201ENST00000327674 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.55□□□□□ -1.68
UBE4AQ14139 MGA-207ENST00000566586 14439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.55□□□□□ -1.68
UBE4AQ14139 RNU6-500P-201ENST00000362349 107 ntBASIC4.55□□□□□ -1.68
UBE4AQ14139 RNA5SP387-201ENST00000364226 106 ntBASIC4.55□□□□□ -1.68
UBE4AQ14139 CASP3-203ENST00000393588 677 ntTSL 4 BASIC4.55□□□□□ -1.68
UBE4AQ14139 RSU1P2-202ENST00000437884 485 ntBASIC4.55□□□□□ -1.68
UBE4AQ14139 AC008278.2-201ENST00000438178 409 ntTSL 3 BASIC4.55□□□□□ -1.68
UBE4AQ14139 THAP5P1-201ENST00000439089 262 ntBASIC4.55□□□□□ -1.68
UBE4AQ14139 AL662791.1-201ENST00000441992 928 ntBASIC4.55□□□□□ -1.68
UBE4AQ14139 AP1S3-208ENST00000446015 499 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC4.55□□□□□ -1.68
UBE4AQ14139 AL365318.1-201ENST00000453128 705 ntTSL 3 BASIC4.55□□□□□ -1.68
UBE4AQ14139 AP1S2P1-201ENST00000457344 379 ntBASIC4.55□□□□□ -1.68
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UBE4AQ14139 NIPA2P2-201ENST00000496376 1083 ntBASIC4.55□□□□□ -1.68
UBE4AQ14139 AC010486.2-201ENST00000505572 483 ntBASIC4.55□□□□□ -1.68
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UBE4AQ14139 AP003781.1-201ENST00000543403 404 ntTSL 3 BASIC4.54□□□□□ -1.68
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UBE4AQ14139 AC098617.1-203ENST00000609865 277 ntTSL 5 BASIC4.54□□□□□ -1.68
UBE4AQ14139 MESTIT1_2.1-201ENST00000616328 235 ntBASIC4.54□□□□□ -1.68
UBE4AQ14139 AC012314.7-201ENST00000619693 93 ntBASIC4.54□□□□□ -1.68
UBE4AQ14139 AC078883.4-201ENST00000623218 367 ntBASIC4.54□□□□□ -1.68
UBE4AQ14139 AL159972.1-201ENST00000625150 448 ntBASIC4.54□□□□□ -1.68
UBE4AQ14139 LINC01002-206ENST00000631772 539 ntTSL 4 BASIC4.54□□□□□ -1.68
UBE4AQ14139 AC244258.1-201ENST00000637553 1071 ntBASIC4.54□□□□□ -1.68
UBE4AQ14139 AC066616.2-201ENST00000559334 1481 ntBASIC4.54□□□□□ -1.68
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UBE4AQ14139 AF117829.1-206ENST00000621883 3802 ntBASIC4.54□□□□□ -1.68
UBE4AQ14139 RTKN2-201ENST00000315289 2383 ntTSL 2 BASIC4.54□□□□□ -1.68
UBE4AQ14139 CASP1-210ENST00000528974 1402 ntTSL 2 BASIC4.54□□□□□ -1.68
UBE4AQ14139 SCAI-201ENST00000336505 12079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.54□□□□□ -1.68
UBE4AQ14139 FIGNL1-202ENST00000395556 3485 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.53□□□□□ -1.68
UBE4AQ14139 HEATR5B-201ENST00000233099 6905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.53□□□□□ -1.68
UBE4AQ14139 ZNF883-201ENST00000619044 2051 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.53□□□□□ -1.68
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