Protein–RNA interactions for Protein: Q14050

COL9A3, Collagen alpha-3(IX) chain, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 684 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COL9A3Q14050 AC139712.2-201ENST00000424302 339 ntBASIC5.72□□□□□ -1.49
COL9A3Q14050 EIF4HP2-201ENST00000424380 563 ntBASIC5.72□□□□□ -1.49
COL9A3Q14050 OR2AH1P-201ENST00000425717 928 ntBASIC5.72□□□□□ -1.49
COL9A3Q14050 MTATP6P16-201ENST00000434543 526 ntBASIC5.72□□□□□ -1.49
COL9A3Q14050 AL031663.1-201ENST00000437445 219 ntBASIC5.72□□□□□ -1.49
COL9A3Q14050 RPL7P28-201ENST00000437739 740 ntBASIC5.72□□□□□ -1.49
COL9A3Q14050 PLCB1-IT1-201ENST00000441231 373 ntTSL 3 BASIC5.72□□□□□ -1.49
COL9A3Q14050 DYNLT3P2-201ENST00000442517 295 ntBASIC5.72□□□□□ -1.49
COL9A3Q14050 C10orf128-207ENST00000474718 614 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.72□□□□□ -1.49
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COL9A3Q14050 AC055855.1-201ENST00000489563 579 ntBASIC5.72□□□□□ -1.49
COL9A3Q14050 UBA52P3-201ENST00000491303 382 ntBASIC5.72□□□□□ -1.49
COL9A3Q14050 RN7SL558P-201ENST00000497468 299 ntBASIC5.72□□□□□ -1.49
COL9A3Q14050 RPS26P24-201ENST00000497656 331 ntBASIC5.72□□□□□ -1.49
COL9A3Q14050 SLC25A15P5-201ENST00000508033 253 ntBASIC5.72□□□□□ -1.49
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COL9A3Q14050 SAMD15-202ENST00000533095 412 ntTSL 5 BASIC5.72□□□□□ -1.49
COL9A3Q14050 AC087318.1-201ENST00000536786 389 ntTSL 3 BASIC5.72□□□□□ -1.49
COL9A3Q14050 LINC01905-206ENST00000593180 524 ntTSL 2 BASIC5.72□□□□□ -1.49
COL9A3Q14050 AP001972.3-202ENST00000603012 375 ntTSL 3 BASIC5.72□□□□□ -1.49
COL9A3Q14050 AC097478.4-201ENST00000615968 522 ntTSL 5 BASIC5.72□□□□□ -1.49
COL9A3Q14050 ATP5A1P2-202ENST00000616464 443 ntBASIC5.72□□□□□ -1.49
COL9A3Q14050 AC008781.3-201ENST00000622826 335 ntTSL 2 BASIC5.72□□□□□ -1.49
COL9A3Q14050 LDHA-225ENST00000625635 141 ntTSL 5 BASIC5.72□□□□□ -1.49
COL9A3Q14050 IGSF11-AS1-201ENST00000477009 1604 ntTSL 2 BASIC5.72□□□□□ -1.49
COL9A3Q14050 ZNF85-201ENST00000300540 1531 ntTSL 1 (best) BASIC5.72□□□□□ -1.49
COL9A3Q14050 EXPH5-203ENST00000525344 6542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.72□□□□□ -1.49
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COL9A3Q14050 AC245100.2-201ENST00000454544 1679 ntBASIC5.72□□□□□ -1.49
COL9A3Q14050 OR11H4-202ENST00000641082 1585 ntAPPRIS P1 BASIC5.72□□□□□ -1.49
COL9A3Q14050 CCNT2-201ENST00000264157 6917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.71□□□□□ -1.49
COL9A3Q14050 GCSAML-201ENST00000366488 3820 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.71□□□□□ -1.49
COL9A3Q14050 OR10Z1-202ENST00000641002 6323 ntAPPRIS P1 BASIC5.71□□□□□ -1.49
COL9A3Q14050 DCC-203ENST00000442544 10206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.71□□□□□ -1.49
COL9A3Q14050 MYBPC1-202ENST00000361685 3871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.71□□□□□ -1.5
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COL9A3Q14050 HELZ-207ENST00000580168 6279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.7□□□□□ -1.5
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COL9A3Q14050 FAM69A-202ENST00000613047 2646 ntTSL 4 BASIC5.7□□□□□ -1.5
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COL9A3Q14050 ECT2L-201ENST00000367682 4343 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.7□□□□□ -1.5
COL9A3Q14050 ZNF845-201ENST00000458035 4311 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC5.7□□□□□ -1.5
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COL9A3Q14050 RNY3P13-201ENST00000365542 102 ntBASIC5.7□□□□□ -1.5
COL9A3Q14050 RNU6-641P-201ENST00000384006 107 ntBASIC5.7□□□□□ -1.5
COL9A3Q14050 Y_RNA.461-201ENST00000384263 103 ntBASIC5.7□□□□□ -1.5
COL9A3Q14050 UBE2V1P2-201ENST00000397758 440 ntBASIC5.7□□□□□ -1.5
COL9A3Q14050 AC007738.1-201ENST00000413892 348 ntBASIC5.7□□□□□ -1.5
COL9A3Q14050 AL391704.1-203ENST00000414903 462 ntTSL 3 BASIC5.7□□□□□ -1.5
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COL9A3Q14050 TIMM9P1-201ENST00000436122 256 ntBASIC5.7□□□□□ -1.5
COL9A3Q14050 AL590399.4-201ENST00000436561 601 ntBASIC5.7□□□□□ -1.5
COL9A3Q14050 RPL23AP89-201ENST00000439324 255 ntBASIC5.7□□□□□ -1.5
COL9A3Q14050 AC104332.1-201ENST00000440471 797 ntBASIC5.7□□□□□ -1.5
COL9A3Q14050 AL118520.1-201ENST00000450770 291 ntBASIC5.7□□□□□ -1.5
COL9A3Q14050 AC011998.3-201ENST00000457053 254 ntTSL 3 BASIC5.7□□□□□ -1.5
COL9A3Q14050 SNORD127-201ENST00000458892 86 ntBASIC5.7□□□□□ -1.5
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