Protein–RNA interactions for Protein: Q13352

ITGB3BP, Centromere protein R, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 177 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ITGB3BPQ13352 AC128713.1-201ENST00000471495 306 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
ITGB3BPQ13352 SEM1P1-201ENST00000506694 209 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
ITGB3BPQ13352 AC099520.1-205ENST00000524083 316 ntTSL 3 BASIC2.81□□□□□ -1.96
ITGB3BPQ13352 AP001646.1-201ENST00000527936 915 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
ITGB3BPQ13352 AL353699.1-201ENST00000529078 365 ntTSL 3 BASIC2.81□□□□□ -1.96
ITGB3BPQ13352 AL133330.2-201ENST00000532760 776 ntTSL 2 BASIC2.81□□□□□ -1.96
ITGB3BPQ13352 AL442163.2-201ENST00000553912 710 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
ITGB3BPQ13352 CKS1BP1-201ENST00000555221 240 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
ITGB3BPQ13352 AC027807.1-201ENST00000559921 996 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
ITGB3BPQ13352 AC009145.1-201ENST00000563230 433 ntTSL 3 BASIC2.81□□□□□ -1.96
ITGB3BPQ13352 AC087481.2-201ENST00000565492 330 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
ITGB3BPQ13352 DNAJC19P3-201ENST00000594491 331 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
ITGB3BPQ13352 RPL23AP78-201ENST00000599928 470 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
ITGB3BPQ13352 NUTF2P8-201ENST00000604593 363 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
ITGB3BPQ13352 AC011374.2-201ENST00000607135 526 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
ITGB3BPQ13352 AL355810.1-201ENST00000614629 552 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
ITGB3BPQ13352 OR51F1-202ENST00000624103 939 ntAPPRIS ALT1 BASIC2.81□□□□□ -1.96
ITGB3BPQ13352 AC009501.3-201ENST00000605001 1352 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
ITGB3BPQ13352 NUCB2-220ENST00000622082 1369 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC2.81□□□□□ -1.96
ITGB3BPQ13352 CFHR3-201ENST00000367425 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.81□□□□□ -1.96
ITGB3BPQ13352 SCFD1-207ENST00000544052 2058 ntTSL 2 BASIC2.81□□□□□ -1.96
ITGB3BPQ13352 SLC30A6-202ENST00000357055 4758 ntTSL 2 BASIC2.81□□□□□ -1.96
ITGB3BPQ13352 ARHGAP15-202ENST00000409869 2968 ntTSL 5 BASIC2.8□□□□□ -1.96
ITGB3BPQ13352 RFESD-202ENST00000380005 2587 ntTSL 2 BASIC2.8□□□□□ -1.96
ITGB3BPQ13352 UHMK1-204ENST00000545294 8117 ntTSL 2 BASIC2.8□□□□□ -1.96
ITGB3BPQ13352 RNU6-339P-201ENST00000384310 107 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
ITGB3BPQ13352 SNORA51.12-201ENST00000384448 134 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
ITGB3BPQ13352 SNORA1.3-201ENST00000384676 136 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
ITGB3BPQ13352 FO393413.1-201ENST00000402892 195 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
ITGB3BPQ13352 AL353680.1-201ENST00000433788 337 ntTSL 3 BASIC2.8□□□□□ -1.96
ITGB3BPQ13352 AL441989.1-201ENST00000454204 382 ntTSL 3 BASIC2.8□□□□□ -1.96
ITGB3BPQ13352 RNA5SP310-201ENST00000459084 116 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
ITGB3BPQ13352 AC133134.1-201ENST00000466800 359 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
ITGB3BPQ13352 HSPE1P6-201ENST00000479457 291 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
ITGB3BPQ13352 THAP6-205ENST00000504190 1004 ntTSL 1 (best) BASIC2.8□□□□□ -1.96
ITGB3BPQ13352 AP003122.3-201ENST00000526316 255 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
ITGB3BPQ13352 DPRXP5-201ENST00000604662 539 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
ITGB3BPQ13352 AC128687.1-201ENST00000605304 619 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
ITGB3BPQ13352 ZNF382-210ENST00000639288 834 ntTSL 5 BASIC2.8□□□□□ -1.96
ITGB3BPQ13352 OGN-202ENST00000375561 2743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.8□□□□□ -1.96
ITGB3BPQ13352 RTL4-201ENST00000340433 2613 ntAPPRIS P1 BASIC2.8□□□□□ -1.96
ITGB3BPQ13352 SACS-201ENST00000382292 15324 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.8□□□□□ -1.96
ITGB3BPQ13352 ZNF90P1-201ENST00000480493 1951 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
ITGB3BPQ13352 GPBP1-201ENST00000264779 1786 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.79□□□□□ -1.96
ITGB3BPQ13352 ATF2-204ENST00000409437 3697 ntTSL 5 BASIC2.79□□□□□ -1.96
ITGB3BPQ13352 SLC38A9-201ENST00000318672 2369 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.79□□□□□ -1.96
ITGB3BPQ13352 APOH-201ENST00000205948 1176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.79□□□□□ -1.96
ITGB3BPQ13352 RNA5SP258-201ENST00000362750 119 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
ITGB3BPQ13352 AC010967.2-201ENST00000418451 333 ntTSL 2 BASIC2.79□□□□□ -1.96
ITGB3BPQ13352 MTCO1P39-201ENST00000426148 480 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
ITGB3BPQ13352 LINC01378-202ENST00000437514 783 ntTSL 3 BASIC2.79□□□□□ -1.96
ITGB3BPQ13352 NHS-AS1-201ENST00000452788 366 ntTSL 3 BASIC2.79□□□□□ -1.96
ITGB3BPQ13352 SETP11-201ENST00000473027 690 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
ITGB3BPQ13352 RPL30P14-201ENST00000482744 348 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
ITGB3BPQ13352 PKIA-203ENST00000518467 588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.79□□□□□ -1.96
ITGB3BPQ13352 PTK2-220ENST00000520151 573 ntTSL 4 BASIC2.79□□□□□ -1.96
ITGB3BPQ13352 AC091814.1-201ENST00000545258 719 ntTSL 3 BASIC2.79□□□□□ -1.96
ITGB3BPQ13352 LINC02410-201ENST00000553095 393 ntTSL 2 BASIC2.79□□□□□ -1.96
ITGB3BPQ13352 AL133279.2-201ENST00000556546 428 ntTSL 3 BASIC2.79□□□□□ -1.96
ITGB3BPQ13352 MIR4446-201ENST00000578505 67 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
ITGB3BPQ13352 GLUD1P4-201ENST00000590914 418 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
ITGB3BPQ13352 AC060766.3-201ENST00000591442 263 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
ITGB3BPQ13352 TPMTP1-201ENST00000592307 737 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
ITGB3BPQ13352 AL355812.1-201ENST00000603215 216 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
ITGB3BPQ13352 CTSLP2-204ENST00000629029 392 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
ITGB3BPQ13352 RGS22-214ENST00000523287 4033 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC2.79□□□□□ -1.96
ITGB3BPQ13352 NETO1-202ENST00000397929 1849 ntTSL 1 (best) BASIC2.79□□□□□ -1.96
ITGB3BPQ13352 SPAM1-202ENST00000340011 2349 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC2.79□□□□□ -1.96
ITGB3BPQ13352 RICTOR-202ENST00000357387 9543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.79□□□□□ -1.96
ITGB3BPQ13352 OFD1P6Y-202ENST00000451061 2724 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
ITGB3BPQ13352 AC046144.1-201ENST00000478559 1853 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
ITGB3BPQ13352 CFHR4-201ENST00000251424 1292 ntTSL 1 (best) BASIC2.78□□□□□ -1.96
ITGB3BPQ13352 RNA5SP456-201ENST00000364002 114 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
ITGB3BPQ13352 RNVU1-3-201ENST00000364313 161 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
ITGB3BPQ13352 MDM4-202ENST00000367180 547 ntTSL 3 BASIC2.78□□□□□ -1.96
ITGB3BPQ13352 CFHR4-203ENST00000367418 1066 ntTSL 1 (best) BASIC2.78□□□□□ -1.96
ITGB3BPQ13352 TRAV41-201ENST00000390468 336 ntAPPRIS P1 BASIC2.78□□□□□ -1.96
ITGB3BPQ13352 RPS4XP3-201ENST00000398541 413 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
ITGB3BPQ13352 SSXP10-201ENST00000402595 565 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
ITGB3BPQ13352 AL359511.1-201ENST00000402970 211 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
ITGB3BPQ13352 FO393419.3-201ENST00000428741 282 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
ITGB3BPQ13352 AC126182.1-201ENST00000478134 357 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
ITGB3BPQ13352 PLCXD2-AS1-201ENST00000493131 491 ntTSL 3 BASIC2.78□□□□□ -1.96
ITGB3BPQ13352 OR5H5P-201ENST00000503164 928 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
ITGB3BPQ13352 AC093689.1-203ENST00000505967 299 ntTSL 3 BASIC2.78□□□□□ -1.96
ITGB3BPQ13352 AC017037.2-201ENST00000513850 890 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
ITGB3BPQ13352 AC090833.1-201ENST00000513853 806 ntTSL 3 BASIC2.78□□□□□ -1.96
ITGB3BPQ13352 AC104057.1-201ENST00000515547 497 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
ITGB3BPQ13352 SNORA31.8-201ENST00000516327 108 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
ITGB3BPQ13352 ZDHHC20P3-201ENST00000531576 336 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
ITGB3BPQ13352 AC108721.1-201ENST00000547088 348 ntTSL 3 BASIC2.78□□□□□ -1.96
ITGB3BPQ13352 AC011773.2-201ENST00000551479 285 ntTSL 5 BASIC2.78□□□□□ -1.96
ITGB3BPQ13352 XIAPP1-201ENST00000603162 600 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
ITGB3BPQ13352 HSPE1P14-201ENST00000605812 302 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
ITGB3BPQ13352 FO624990.1-201ENST00000636373 85 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
ITGB3BPQ13352 CRYM-AS1-204ENST00000637983 556 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
ITGB3BPQ13352 RNU6-819P-201ENST00000364116 107 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
ITGB3BPQ13352 SNORA36C-201ENST00000384289 132 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
ITGB3BPQ13352 MTND4LP20-201ENST00000402379 270 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
ITGB3BPQ13352 FAT1P1-201ENST00000406588 507 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 85.9 ms