Protein–RNA interactions for Protein: Q13278

RIG, Putative protein RIG, humanhuman

Predictions only

Length 110 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RIGQ13278 IGHVIII-67-4-201ENST00000524281 296 ntBASIC3□□□□□ -1.93
RIGQ13278 SYF2P1-201ENST00000550658 413 ntBASIC3□□□□□ -1.93
RIGQ13278 AC104002.2-201ENST00000553919 318 ntTSL 5 BASIC3□□□□□ -1.93
RIGQ13278 AF099810.1-201ENST00000554219 525 ntTSL 3 BASIC3□□□□□ -1.93
RIGQ13278 AC022968.1-201ENST00000567372 442 ntBASIC3□□□□□ -1.93
RIGQ13278 AC007493.1-202ENST00000567899 517 ntTSL 2 BASIC3□□□□□ -1.93
RIGQ13278 MIR5697-201ENST00000578045 78 ntBASIC3□□□□□ -1.93
RIGQ13278 AC002546.2-201ENST00000585537 584 ntTSL 3 BASIC3□□□□□ -1.93
RIGQ13278 ZNF573-209ENST00000585724 453 ntTSL 5 BASIC3□□□□□ -1.93
RIGQ13278 LINC01905-206ENST00000593180 524 ntTSL 2 BASIC3□□□□□ -1.93
RIGQ13278 AP001429.1-201ENST00000602568 530 ntBASIC3□□□□□ -1.93
RIGQ13278 AC012443.1-201ENST00000605605 231 ntBASIC3□□□□□ -1.93
RIGQ13278 BRDTP1-201ENST00000605735 677 ntBASIC3□□□□□ -1.93
RIGQ13278 AC007684.1-201ENST00000609671 477 ntBASIC3□□□□□ -1.93
RIGQ13278 AC104010.1-201ENST00000616889 150 ntBASIC3□□□□□ -1.93
RIGQ13278 ZRANB2-AS2-221ENST00000624050 629 ntTSL 5 BASIC3□□□□□ -1.93
RIGQ13278 AC099654.12-201ENST00000639868 649 ntBASIC3□□□□□ -1.93
RIGQ13278 OR5H6-203ENST00000642105 978 ntBASIC3□□□□□ -1.93
RIGQ13278 LINC00907-209ENST00000593234 3376 ntTSL 1 (best) BASIC3□□□□□ -1.93
RIGQ13278 FAM126A-204ENST00000432176 13177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3□□□□□ -1.93
RIGQ13278 CNOT2-231ENST00000551483 4753 ntTSL 2 BASIC3□□□□□ -1.93
RIGQ13278 AC008725.1-201ENST00000605123 2263 ntBASIC3□□□□□ -1.93
RIGQ13278 RAP1GDS1-205ENST00000408927 3681 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC3□□□□□ -1.93
RIGQ13278 TAB3P1-202ENST00000452645 1634 ntBASIC3□□□□□ -1.93
RIGQ13278 ASPN-201ENST00000375543 2237 ntTSL 2 BASIC3□□□□□ -1.93
RIGQ13278 CACNB4-260ENST00000637762 3800 ntTSL 5 BASIC3□□□□□ -1.93
RIGQ13278 RAD17-202ENST00000305138 3164 ntTSL 1 (best) BASIC3□□□□□ -1.93
RIGQ13278 AC015813.1-202ENST00000577267 4056 ntTSL 2 BASIC2.99□□□□□ -1.93
RIGQ13278 AF117829.1-206ENST00000621883 3802 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
RIGQ13278 C5orf51-201ENST00000381647 5241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.99□□□□□ -1.93
RIGQ13278 CCDC178-209ENST00000579947 2925 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.99□□□□□ -1.93
RIGQ13278 MIR331-201ENST00000362302 94 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
RIGQ13278 Y_RNA.6-201ENST00000362350 114 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
RIGQ13278 RN7SKP226-201ENST00000364912 300 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
RIGQ13278 RNU5E-5P-201ENST00000365379 116 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
RIGQ13278 C1orf100-202ENST00000366537 483 ntTSL 1 (best) BASIC2.99□□□□□ -1.93
RIGQ13278 AL354864.1-201ENST00000373226 539 ntTSL 2 BASIC2.99□□□□□ -1.93
RIGQ13278 PARD3-204ENST00000374768 799 ntTSL 3 BASIC2.99□□□□□ -1.93
RIGQ13278 Y_RNA.548-201ENST00000384656 105 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
RIGQ13278 MIR765-201ENST00000390226 114 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
RIGQ13278 TRAV21-201ENST00000390449 343 ntAPPRIS P1 BASIC2.99□□□□□ -1.93
RIGQ13278 U3.20-201ENST00000390909 217 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
RIGQ13278 AL136372.1-201ENST00000403060 228 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
RIGQ13278 PPP1R1C-203ENST00000409702 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.99□□□□□ -1.93
RIGQ13278 RPL37P18-201ENST00000411602 243 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
RIGQ13278 AC022028.1-201ENST00000412054 408 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
RIGQ13278 MTND1P21-201ENST00000412991 285 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
RIGQ13278 AC011754.1-201ENST00000415201 491 ntTSL 5 BASIC2.99□□□□□ -1.93
RIGQ13278 AL139095.3-201ENST00000419672 1203 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
RIGQ13278 OR8F1P-201ENST00000425243 930 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
RIGQ13278 AL157831.1-201ENST00000426134 473 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
RIGQ13278 AL445669.1-201ENST00000426743 755 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
RIGQ13278 DIAPH3-AS2-201ENST00000428656 367 ntTSL 3 BASIC2.99□□□□□ -1.93
RIGQ13278 AL512649.1-201ENST00000428997 581 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
RIGQ13278 AC131571.1-201ENST00000429821 577 ntTSL 5 BASIC2.99□□□□□ -1.93
RIGQ13278 AC011998.1-201ENST00000433403 117 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
RIGQ13278 AC024082.2-201ENST00000434771 238 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
RIGQ13278 AC091862.1-201ENST00000438016 1100 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
RIGQ13278 FAM103A2P-201ENST00000444122 354 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
RIGQ13278 AC104308.1-201ENST00000454621 333 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
RIGQ13278 AL390730.1-201ENST00000457106 692 ntTSL 2 BASIC2.99□□□□□ -1.93
RIGQ13278 ARHGEF3-AS1-201ENST00000477246 489 ntTSL 2 BASIC2.99□□□□□ -1.93
RIGQ13278 AC011005.3-201ENST00000491624 395 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
RIGQ13278 AL139099.1-201ENST00000497398 403 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
RIGQ13278 AC108062.1-201ENST00000505133 637 ntTSL 3 BASIC2.99□□□□□ -1.93
RIGQ13278 AC021678.1-201ENST00000505195 936 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
RIGQ13278 AC008572.1-201ENST00000507269 442 ntTSL 5 BASIC2.99□□□□□ -1.93
RIGQ13278 LINC02112-202ENST00000512976 464 ntTSL 3 BASIC2.99□□□□□ -1.93
RIGQ13278 AC022483.1-201ENST00000514020 567 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
RIGQ13278 AC026801.2-201ENST00000515352 425 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
RIGQ13278 RNU1-61P-201ENST00000516107 151 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
RIGQ13278 SMIM18-201ENST00000517349 905 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.99□□□□□ -1.93
RIGQ13278 AF117829.1-203ENST00000520306 421 ntTSL 5 BASIC2.99□□□□□ -1.93
RIGQ13278 HMGN1P28-201ENST00000521340 364 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
RIGQ13278 AP006287.2-201ENST00000529036 502 ntTSL 2 BASIC2.99□□□□□ -1.93
RIGQ13278 AP003781.1-201ENST00000543403 404 ntTSL 3 BASIC2.99□□□□□ -1.93
RIGQ13278 AC007513.1-201ENST00000548740 379 ntTSL 3 BASIC2.99□□□□□ -1.93
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RIGQ13278 AC083760.1-201ENST00000589621 670 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
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RIGQ13278 AC113403.1-201ENST00000604910 193 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
RIGQ13278 AP002360.4-201ENST00000606980 481 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
RIGQ13278 AC083798.2-205ENST00000608015 575 ntTSL 5 BASIC2.99□□□□□ -1.93
RIGQ13278 AL161637.1-201ENST00000622380 412 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
RIGQ13278 AL603839.4-201ENST00000624658 1005 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
RIGQ13278 AL157786.1-207ENST00000627771 695 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
RIGQ13278 AC093591.3-201ENST00000634516 308 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
RIGQ13278 FAN1-202ENST00000561594 2738 ntTSL 1 (best) BASIC2.99□□□□□ -1.93
RIGQ13278 OPRM1-206ENST00000419506 1402 ntTSL 1 (best) BASIC2.99□□□□□ -1.93
RIGQ13278 ADGRG4-203ENST00000394143 9931 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC2.99□□□□□ -1.93
RIGQ13278 LINC00630-205ENST00000440496 2101 ntTSL 1 (best) BASIC2.99□□□□□ -1.93
RIGQ13278 WDR72-204ENST00000559418 3602 ntTSL 5 BASIC2.99□□□□□ -1.93
RIGQ13278 ATP2B1-202ENST00000359142 6977 ntTSL 5 BASIC2.99□□□□□ -1.93
RIGQ13278 SLC8A1-207ENST00000406785 20987 ntTSL 1 (best) BASIC2.98□□□□□ -1.93
RIGQ13278 PSG1-204ENST00000436291 2047 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.98□□□□□ -1.93
RIGQ13278 TTN-204ENST00000360870 18218 ntTSL 5 BASIC2.98□□□□□ -1.93
RIGQ13278 SLC17A4-203ENST00000439485 3699 ntTSL 5 BASIC2.98□□□□□ -1.93
RIGQ13278 CD84-204ENST00000368048 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.98□□□□□ -1.93
RIGQ13278 RNU6-259P-201ENST00000383999 107 ntBASIC2.98□□□□□ -1.93
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