Protein–RNA interactions for Protein: Q13224

GRIN2B, Glutamate receptor ionotropic, NMDA 2B, humanhuman

Predictions only

Length 1,484 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GRIN2BQ13224 MIR4458-201ENST00000578872 75 ntBASIC3.28□□□□□ -1.88
GRIN2BQ13224 AC060766.3-201ENST00000591442 263 ntBASIC3.28□□□□□ -1.88
GRIN2BQ13224 AC012213.4-201ENST00000606457 354 ntBASIC3.28□□□□□ -1.88
GRIN2BQ13224 AC092159.4-201ENST00000624944 550 ntBASIC3.28□□□□□ -1.88
GRIN2BQ13224 CCDC178-205ENST00000406524 3039 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.28□□□□□ -1.88
GRIN2BQ13224 DEFB106A-201ENST00000335186 303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.28□□□□□ -1.88
GRIN2BQ13224 C1orf189-201ENST00000368525 387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.28□□□□□ -1.88
GRIN2BQ13224 DYNLT3P1-201ENST00000378574 347 ntBASIC3.28□□□□□ -1.88
GRIN2BQ13224 SAR1AP2-201ENST00000392696 594 ntBASIC3.28□□□□□ -1.88
GRIN2BQ13224 NT5C3A-205ENST00000409467 1032 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC3.28□□□□□ -1.88
GRIN2BQ13224 SAR1AP4-201ENST00000429225 591 ntBASIC3.28□□□□□ -1.88
GRIN2BQ13224 AL591719.1-201ENST00000444669 744 ntBASIC3.28□□□□□ -1.88
GRIN2BQ13224 AC015813.2-201ENST00000578794 711 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC3.28□□□□□ -1.88
GRIN2BQ13224 MIR5002-201ENST00000584713 97 ntBASIC3.28□□□□□ -1.88
GRIN2BQ13224 AL359094.1-202ENST00000629917 1113 ntTSL 5 BASIC3.28□□□□□ -1.88
GRIN2BQ13224 ZNF639-210ENST00000621687 1458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.27□□□□□ -1.89
GRIN2BQ13224 CCDC30-203ENST00000428554 3063 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC3.27□□□□□ -1.89
GRIN2BQ13224 RGS21-201ENST00000417209 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.27□□□□□ -1.89
GRIN2BQ13224 EFCAB3-202ENST00000450662 1694 ntTSL 5 BASIC3.27□□□□□ -1.89
GRIN2BQ13224 SNX16-212ENST00000615066 1918 ntTSL 5 BASIC3.27□□□□□ -1.89
GRIN2BQ13224 RNU4-62P-201ENST00000410125 130 ntBASIC3.27□□□□□ -1.89
GRIN2BQ13224 AC007390.1-201ENST00000415722 356 ntBASIC3.27□□□□□ -1.89
GRIN2BQ13224 AC023050.1-201ENST00000498198 304 ntBASIC3.27□□□□□ -1.89
GRIN2BQ13224 AP001486.2-201ENST00000561652 5113 ntBASIC3.26□□□□□ -1.89
GRIN2BQ13224 EYS-211ENST00000503581 10589 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC3.26□□□□□ -1.89
GRIN2BQ13224 Y_RNA.116-201ENST00000363292 103 ntBASIC3.26□□□□□ -1.89
GRIN2BQ13224 RPL30P3-201ENST00000424262 333 ntBASIC3.26□□□□□ -1.89
GRIN2BQ13224 TAF9P1-201ENST00000445421 515 ntBASIC3.26□□□□□ -1.89
GRIN2BQ13224 AP000705.1-201ENST00000454567 350 ntBASIC3.26□□□□□ -1.89
GRIN2BQ13224 TAF9P2-201ENST00000454958 515 ntBASIC3.26□□□□□ -1.89
GRIN2BQ13224 RN7SKP96-201ENST00000516948 297 ntBASIC3.26□□□□□ -1.89
GRIN2BQ13224 AL353811.1-201ENST00000602851 736 ntTSL 5 BASIC3.26□□□□□ -1.89
GRIN2BQ13224 AL137847.3-201ENST00000611521 109 ntBASIC3.26□□□□□ -1.89
GRIN2BQ13224 ZFAT-AS1_2.1-201ENST00000613742 201 ntBASIC3.26□□□□□ -1.89
GRIN2BQ13224 TAB2-205ENST00000538427 4240 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.26□□□□□ -1.89
GRIN2BQ13224 ATP13A3-201ENST00000256031 7322 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.25□□□□□ -1.89
GRIN2BQ13224 SERPINI2-201ENST00000264677 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.25□□□□□ -1.89
GRIN2BQ13224 AL627390.1-201ENST00000396055 340 ntBASIC3.25□□□□□ -1.89
GRIN2BQ13224 DHFRP5-201ENST00000406944 564 ntBASIC3.25□□□□□ -1.89
GRIN2BQ13224 AL353093.1-201ENST00000441292 436 ntBASIC3.25□□□□□ -1.89
GRIN2BQ13224 AC068633.1-201ENST00000482142 787 ntTSL 5 BASIC3.25□□□□□ -1.89
GRIN2BQ13224 EIF4EP5-201ENST00000528228 640 ntBASIC3.25□□□□□ -1.89
GRIN2BQ13224 PLSCR2-206ENST00000610787 1001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.25□□□□□ -1.89
GRIN2BQ13224 AC099778.2-201ENST00000610904 211 ntBASIC3.25□□□□□ -1.89
GRIN2BQ13224 AC012531.5-201ENST00000611375 151 ntBASIC3.25□□□□□ -1.89
GRIN2BQ13224 AC004520.1-201ENST00000608362 1413 ntBASIC3.25□□□□□ -1.89
GRIN2BQ13224 AC010733.2-201ENST00000589496 5702 ntBASIC3.25□□□□□ -1.89
GRIN2BQ13224 CFHR4-202ENST00000367416 2178 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC3.24□□□□□ -1.89
GRIN2BQ13224 CFHR4-201ENST00000251424 1292 ntTSL 1 (best) BASIC3.24□□□□□ -1.89
GRIN2BQ13224 Y_RNA.466-201ENST00000384294 113 ntBASIC3.24□□□□□ -1.89
GRIN2BQ13224 AL158834.2-201ENST00000415731 696 ntTSL 2 BASIC3.24□□□□□ -1.89
GRIN2BQ13224 AL445685.2-201ENST00000422551 342 ntBASIC3.24□□□□□ -1.89
GRIN2BQ13224 AL683807.1-202ENST00000432272 382 ntTSL 2 BASIC3.24□□□□□ -1.89
GRIN2BQ13224 SDR42E1P3-201ENST00000438345 502 ntBASIC3.24□□□□□ -1.89
GRIN2BQ13224 PGRMC2-203ENST00000503588 818 ntTSL 4 BASIC3.24□□□□□ -1.89
GRIN2BQ13224 TBCAP3-201ENST00000512475 312 ntBASIC3.24□□□□□ -1.89
GRIN2BQ13224 EGLN3-AS1-201ENST00000555922 308 ntTSL 3 BASIC3.24□□□□□ -1.89
GRIN2BQ13224 AL136298.1-202ENST00000556520 518 ntTSL 3 BASIC3.24□□□□□ -1.89
GRIN2BQ13224 AC098617.1-216ENST00000602099 708 ntTSL 5 BASIC3.24□□□□□ -1.89
GRIN2BQ13224 RMST_5.1-201ENST00000618704 126 ntBASIC3.24□□□□□ -1.89
GRIN2BQ13224 Xist_exon1.1-201ENST00000618930 85 ntBASIC3.24□□□□□ -1.89
GRIN2BQ13224 AC010297.1-201ENST00000623948 149 ntBASIC3.24□□□□□ -1.89
GRIN2BQ13224 ZNF93-209ENST00000638737 1020 ntTSL 5 BASIC3.24□□□□□ -1.89
GRIN2BQ13224 ENAM-201ENST00000396073 5679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.24□□□□□ -1.89
GRIN2BQ13224 MUC15-201ENST00000281268 2968 ntTSL 5 BASIC3.24□□□□□ -1.89
GRIN2BQ13224 MIR124-3-201ENST00000384866 87 ntBASIC3.23□□□□□ -1.89
GRIN2BQ13224 MIR4435-2HG-213ENST00000451884 423 ntTSL 3 BASIC3.23□□□□□ -1.89
GRIN2BQ13224 AC012170.1-201ENST00000495139 359 ntBASIC3.23□□□□□ -1.89
GRIN2BQ13224 AC113398.2-201ENST00000507630 558 ntBASIC3.23□□□□□ -1.89
GRIN2BQ13224 AC010280.3-201ENST00000515504 587 ntTSL 4 BASIC3.23□□□□□ -1.89
GRIN2BQ13224 RN7SKP82-201ENST00000516786 223 ntBASIC3.23□□□□□ -1.89
GRIN2BQ13224 RAB3IP-214ENST00000550847 670 ntTSL 3 BASIC3.23□□□□□ -1.89
GRIN2BQ13224 FAM35CP-201ENST00000554755 2470 ntBASIC3.23□□□□□ -1.89
GRIN2BQ13224 5S_rRNA.12-201ENST00000617631 107 ntBASIC3.23□□□□□ -1.89
GRIN2BQ13224 AC004943.3-201ENST00000624116 600 ntBASIC3.23□□□□□ -1.89
GRIN2BQ13224 AC011139.1-202ENST00000637744 563 ntTSL 5 BASIC3.23□□□□□ -1.89
GRIN2BQ13224 PHF3-202ENST00000393387 6947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.23□□□□□ -1.89
GRIN2BQ13224 KCNIP4-IT1-201ENST00000627566 9848 ntBASIC3.23□□□□□ -1.89
GRIN2BQ13224 DEFB106B-201ENST00000335479 316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.22□□□□□ -1.89
GRIN2BQ13224 MIR518E-201ENST00000385252 88 ntBASIC3.22□□□□□ -1.89
GRIN2BQ13224 AC240504.1-201ENST00000395709 845 ntBASIC3.22□□□□□ -1.89
GRIN2BQ13224 CTNNA2-204ENST00000409266 432 ntTSL 3 BASIC3.22□□□□□ -1.89
GRIN2BQ13224 RPL9P9-201ENST00000418824 636 ntTSL 2 BASIC3.22□□□□□ -1.89
GRIN2BQ13224 MTCYBP29-201ENST00000436327 1006 ntBASIC3.22□□□□□ -1.89
GRIN2BQ13224 AP000852.1-201ENST00000472460 573 ntBASIC3.22□□□□□ -1.89
GRIN2BQ13224 AL163540.1-201ENST00000485382 386 ntBASIC3.22□□□□□ -1.89
GRIN2BQ13224 LINC02350-201ENST00000544419 480 ntTSL 3 BASIC3.22□□□□□ -1.89
GRIN2BQ13224 MIR3670-2-201ENST00000582974 65 ntBASIC3.22□□□□□ -1.89
GRIN2BQ13224 MIR3670-1-201ENST00000584160 65 ntBASIC3.22□□□□□ -1.89
GRIN2BQ13224 MIR3670-3-201ENST00000584855 65 ntBASIC3.22□□□□□ -1.89
GRIN2BQ13224 MIR3670-4-201ENST00000612260 65 ntBASIC3.22□□□□□ -1.89
GRIN2BQ13224 AC010678.1-201ENST00000614118 713 ntBASIC3.22□□□□□ -1.89
GRIN2BQ13224 SATB1-AS1-226ENST00000625515 776 ntTSL 5 BASIC3.22□□□□□ -1.89
GRIN2BQ13224 SATB1-AS1-259ENST00000629477 853 ntTSL 5 BASIC3.22□□□□□ -1.89
GRIN2BQ13224 ST7-AS2-206ENST00000456577 1351 ntTSL 1 (best) BASIC3.22□□□□□ -1.89
GRIN2BQ13224 CNOT6LP1-201ENST00000559681 1462 ntBASIC3.22□□□□□ -1.89
GRIN2BQ13224 AL139276.1-201ENST00000311910 1001 ntBASIC3.22□□□□□ -1.89
GRIN2BQ13224 SNORA25.9-201ENST00000365087 128 ntBASIC3.22□□□□□ -1.89
GRIN2BQ13224 U3.15-201ENST00000365398 212 ntBASIC3.22□□□□□ -1.89
GRIN2BQ13224 TUG1-202ENST00000521091 2110 ntTSL 1 (best) BASIC3.22□□□□□ -1.89
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