Protein–RNA interactions for Protein: Q12791

KCNMA1, Calcium-activated potassium channel subunit alpha-1, humanhuman

Predictions only

Length 1,236 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KCNMA1Q12791 RNA5SP234-201ENST00000363916 119 ntBASIC5.79□□□□□ -1.48
KCNMA1Q12791 Y_RNA.240-201ENST00000364469 95 ntBASIC5.79□□□□□ -1.48
KCNMA1Q12791 RNY4P16-201ENST00000364768 94 ntBASIC5.79□□□□□ -1.48
KCNMA1Q12791 OR14A2-201ENST00000366485 945 ntAPPRIS P1 BASIC5.79□□□□□ -1.48
KCNMA1Q12791 LST1-207ENST00000376092 285 ntTSL 1 (best) BASIC5.79□□□□□ -1.48
KCNMA1Q12791 DPRX-201ENST00000376650 648 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.79□□□□□ -1.48
KCNMA1Q12791 SNORA41-201ENST00000384675 132 ntBASIC5.79□□□□□ -1.48
KCNMA1Q12791 TRGV5-201ENST00000390344 552 ntAPPRIS P1 BASIC5.79□□□□□ -1.48
KCNMA1Q12791 RNA5SP105-201ENST00000391123 113 ntBASIC5.79□□□□□ -1.48
KCNMA1Q12791 AL133388.1-201ENST00000404509 287 ntBASIC5.79□□□□□ -1.48
KCNMA1Q12791 RN7SKP126-201ENST00000411143 300 ntBASIC5.79□□□□□ -1.48
KCNMA1Q12791 RPL23AP36-201ENST00000413895 458 ntBASIC5.79□□□□□ -1.48
KCNMA1Q12791 AC109779.1-201ENST00000414475 573 ntTSL 5 BASIC5.79□□□□□ -1.48
KCNMA1Q12791 AC244035.3-201ENST00000428399 271 ntTSL 2 BASIC5.79□□□□□ -1.48
KCNMA1Q12791 AL355303.1-201ENST00000428920 680 ntTSL 3 BASIC5.79□□□□□ -1.48
KCNMA1Q12791 LAMTOR5P1-201ENST00000444290 270 ntBASIC5.79□□□□□ -1.48
KCNMA1Q12791 AC073909.1-201ENST00000447112 999 ntBASIC5.79□□□□□ -1.48
KCNMA1Q12791 RPS26P39-201ENST00000469206 341 ntBASIC5.79□□□□□ -1.48
KCNMA1Q12791 RN7SL814P-201ENST00000487715 300 ntBASIC5.79□□□□□ -1.48
KCNMA1Q12791 RN7SL629P-201ENST00000489622 285 ntBASIC5.79□□□□□ -1.48
KCNMA1Q12791 RNU2-10P-201ENST00000516375 211 ntBASIC5.79□□□□□ -1.48
KCNMA1Q12791 RNU6-307P-201ENST00000516743 106 ntBASIC5.79□□□□□ -1.48
KCNMA1Q12791 SCARNA16.4-201ENST00000516956 187 ntBASIC5.79□□□□□ -1.48
KCNMA1Q12791 AC039056.1-201ENST00000552704 467 ntTSL 3 BASIC5.79□□□□□ -1.48
KCNMA1Q12791 MIR4489-201ENST00000578869 62 ntBASIC5.79□□□□□ -1.48
KCNMA1Q12791 MIR4433B-201ENST00000581329 102 ntBASIC5.79□□□□□ -1.48
KCNMA1Q12791 AC011494.1-201ENST00000596454 237 ntBASIC5.79□□□□□ -1.48
KCNMA1Q12791 AL031320.1-201ENST00000604177 357 ntBASIC5.79□□□□□ -1.48
KCNMA1Q12791 AL121992.2-201ENST00000606262 256 ntBASIC5.79□□□□□ -1.48
KCNMA1Q12791 OR6R2P-201ENST00000609216 300 ntBASIC5.79□□□□□ -1.48
KCNMA1Q12791 AC109583.2-201ENST00000617367 129 ntBASIC5.79□□□□□ -1.48
KCNMA1Q12791 MAGI2-AS3-224ENST00000619135 205 ntTSL 5 BASIC5.79□□□□□ -1.48
KCNMA1Q12791 PXT1-202ENST00000619547 619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.79□□□□□ -1.48
KCNMA1Q12791 ZNF410-211ENST00000555044 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.79□□□□□ -1.48
KCNMA1Q12791 LINC01619-207ENST00000551843 2205 ntTSL 1 (best) BASIC5.79□□□□□ -1.48
KCNMA1Q12791 DLD-204ENST00000437604 1859 ntTSL 2 BASIC5.79□□□□□ -1.48
KCNMA1Q12791 AL442639.1-201ENST00000625030 1899 ntBASIC5.79□□□□□ -1.48
KCNMA1Q12791 GTDC1-220ENST00000618778 2317 ntTSL 5 BASIC5.79□□□□□ -1.48
KCNMA1Q12791 NDRG3-202ENST00000359675 2917 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC5.78□□□□□ -1.48
KCNMA1Q12791 MTERF1-201ENST00000351870 1997 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.78□□□□□ -1.48
KCNMA1Q12791 PCGF5-201ENST00000336126 7018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.78□□□□□ -1.48
KCNMA1Q12791 DLG1-210ENST00000422288 2854 ntTSL 5 BASIC5.78□□□□□ -1.48
KCNMA1Q12791 SLFN12L-205ENST00000628453 1767 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.78□□□□□ -1.48
KCNMA1Q12791 AFTPH-204ENST00000409933 2811 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC5.78□□□□□ -1.48
KCNMA1Q12791 SYT14-206ENST00000537238 5208 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.78□□□□□ -1.48
KCNMA1Q12791 SNRPEP3-201ENST00000338402 276 ntBASIC5.78□□□□□ -1.48
KCNMA1Q12791 Y_RNA.76-201ENST00000362931 109 ntBASIC5.78□□□□□ -1.48
KCNMA1Q12791 SNORA62.1-201ENST00000364287 154 ntBASIC5.78□□□□□ -1.48
KCNMA1Q12791 RNU4-42P-201ENST00000364738 142 ntBASIC5.78□□□□□ -1.48
KCNMA1Q12791 OR5L2-201ENST00000378397 936 ntAPPRIS P1 BASIC5.78□□□□□ -1.48
KCNMA1Q12791 SNORD116-23-201ENST00000384645 92 ntBASIC5.78□□□□□ -1.48
KCNMA1Q12791 POLHP1-201ENST00000411806 470 ntBASIC5.78□□□□□ -1.48
KCNMA1Q12791 AC073257.2-201ENST00000413991 528 ntTSL 3 BASIC5.78□□□□□ -1.48
KCNMA1Q12791 LINC01507-201ENST00000417801 446 ntTSL 5 BASIC5.78□□□□□ -1.48
KCNMA1Q12791 BX510359.3-201ENST00000422168 306 ntBASIC5.78□□□□□ -1.48
KCNMA1Q12791 AL590632.1-201ENST00000424289 371 ntBASIC5.78□□□□□ -1.48
KCNMA1Q12791 AC018865.1-201ENST00000433507 578 ntTSL 4 BASIC5.78□□□□□ -1.48
KCNMA1Q12791 CYCSP51-201ENST00000443545 318 ntBASIC5.78□□□□□ -1.48
KCNMA1Q12791 SNRPFP3-201ENST00000457792 225 ntBASIC5.78□□□□□ -1.48
KCNMA1Q12791 AC110749.1-201ENST00000462007 357 ntBASIC5.78□□□□□ -1.48
KCNMA1Q12791 AC098583.1-201ENST00000480875 255 ntBASIC5.78□□□□□ -1.48
KCNMA1Q12791 LINC02014-201ENST00000514010 713 ntTSL 3 BASIC5.78□□□□□ -1.48
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KCNMA1Q12791 CLMN-206ENST00000556441 452 ntTSL 5 BASIC5.78□□□□□ -1.48
KCNMA1Q12791 AC005341.1-201ENST00000571086 708 ntBASIC5.78□□□□□ -1.48
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KCNMA1Q12791 Z98949.1-203ENST00000597284 851 ntTSL 5 BASIC5.78□□□□□ -1.48
KCNMA1Q12791 AL162431.4-201ENST00000604674 411 ntBASIC5.78□□□□□ -1.48
KCNMA1Q12791 AC110774.1-201ENST00000623567 2018 ntBASIC5.78□□□□□ -1.48
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KCNMA1Q12791 MIPOL1-204ENST00000539062 2389 ntTSL 1 (best) BASIC5.78□□□□□ -1.48
KCNMA1Q12791 ADAM29-213ENST00000615367 3386 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.78□□□□□ -1.48
KCNMA1Q12791 DBT-202ENST00000370132 10799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.78□□□□□ -1.48
KCNMA1Q12791 TRPM6-203ENST00000361255 8271 ntTSL 1 (best) BASIC5.77□□□□□ -1.48
KCNMA1Q12791 NR3C2-202ENST00000344721 5712 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.77□□□□□ -1.48
KCNMA1Q12791 PPARGC1A-201ENST00000264867 6318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.77□□□□□ -1.49
KCNMA1Q12791 AP005212.5-201ENST00000577614 3505 ntTSL 5 BASIC5.77□□□□□ -1.49
KCNMA1Q12791 AMY2B-208ENST00000610648 1736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.77□□□□□ -1.49
KCNMA1Q12791 AC011604.2-201ENST00000381541 2268 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.77□□□□□ -1.49
KCNMA1Q12791 LMO3-209ENST00000447609 3365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.77□□□□□ -1.49
KCNMA1Q12791 NSD1-204ENST00000439151 12892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.77□□□□□ -1.49
KCNMA1Q12791 DNAH7-202ENST00000409063 1845 ntTSL 1 (best) BASIC5.77□□□□□ -1.49
KCNMA1Q12791 LPAR4-201ENST00000435339 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.77□□□□□ -1.49
KCNMA1Q12791 PTPRC-209ENST00000442510 5164 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC5.77□□□□□ -1.49
KCNMA1Q12791 RNU1-19P-201ENST00000363306 165 ntBASIC5.77□□□□□ -1.49
KCNMA1Q12791 RN7SKP160-201ENST00000363804 340 ntBASIC5.77□□□□□ -1.49
KCNMA1Q12791 RNA5SP132-201ENST00000364725 118 ntBASIC5.77□□□□□ -1.49
KCNMA1Q12791 Y_RNA.526-201ENST00000384572 110 ntBASIC5.77□□□□□ -1.49
KCNMA1Q12791 MTERF4-204ENST00000406593 802 ntTSL 2 BASIC5.77□□□□□ -1.49
KCNMA1Q12791 MIR1302-4-201ENST00000408701 150 ntBASIC5.77□□□□□ -1.49
KCNMA1Q12791 Y_RNA.626-201ENST00000411288 95 ntBASIC5.77□□□□□ -1.49
KCNMA1Q12791 Z99755.1-201ENST00000414048 380 ntBASIC5.77□□□□□ -1.49
KCNMA1Q12791 AL136320.1-201ENST00000417273 430 ntTSL 3 BASIC5.77□□□□□ -1.49
KCNMA1Q12791 LINC01037-201ENST00000427337 424 ntTSL 5 BASIC5.77□□□□□ -1.49
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