Protein–RNA interactions for Protein: P31415

CASQ1, Calsequestrin-1, humanhuman

Predictions only

Length 396 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CASQ1P31415 AC128685.1-201ENST00000490357 1834 ntTSL 5 BASIC2.91□□□□□ -1.94
CASQ1P31415 RGPD6-201ENST00000329516 7165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.91□□□□□ -1.94
CASQ1P31415 MTCO1P6-201ENST00000481192 1384 ntBASIC2.91□□□□□ -1.94
CASQ1P31415 C2orf76-201ENST00000334816 676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.91□□□□□ -1.94
CASQ1P31415 IVNS1ABP-201ENST00000367497 746 ntTSL 5 BASIC2.91□□□□□ -1.94
CASQ1P31415 AL138760.1-201ENST00000423283 435 ntTSL 3 BASIC2.91□□□□□ -1.94
CASQ1P31415 AC072062.1-204ENST00000437897 1132 ntTSL 5 BASIC2.91□□□□□ -1.94
CASQ1P31415 AL020998.1-201ENST00000444923 229 ntTSL 3 BASIC2.91□□□□□ -1.94
CASQ1P31415 TEX41-209ENST00000451478 452 ntTSL 2 BASIC2.91□□□□□ -1.94
CASQ1P31415 snoU13.22-201ENST00000459428 104 ntBASIC2.91□□□□□ -1.94
CASQ1P31415 MTND4LP3-201ENST00000468320 276 ntBASIC2.91□□□□□ -1.94
CASQ1P31415 AC135721.1-201ENST00000497954 479 ntBASIC2.91□□□□□ -1.94
CASQ1P31415 LINC02377-201ENST00000500169 450 ntTSL 3 BASIC2.91□□□□□ -1.94
CASQ1P31415 AC093767.1-201ENST00000504523 156 ntBASIC2.91□□□□□ -1.94
CASQ1P31415 AC097521.1-201ENST00000505488 567 ntTSL 3 BASIC2.91□□□□□ -1.94
CASQ1P31415 HMGB3P3-201ENST00000510526 400 ntBASIC2.91□□□□□ -1.94
CASQ1P31415 LNX1-AS1-202ENST00000510785 550 ntTSL 2 BASIC2.91□□□□□ -1.94
CASQ1P31415 SCGB1D5P-201ENST00000515134 247 ntBASIC2.91□□□□□ -1.94
CASQ1P31415 AC018437.2-201ENST00000517369 389 ntTSL 5 BASIC2.91□□□□□ -1.94
CASQ1P31415 AC013509.1-201ENST00000524269 339 ntTSL 3 BASIC2.91□□□□□ -1.94
CASQ1P31415 GLYCAM1-201ENST00000546596 285 ntBASIC2.91□□□□□ -1.94
CASQ1P31415 LINC02386-203ENST00000552182 501 ntTSL 3 BASIC2.91□□□□□ -1.94
CASQ1P31415 LINC02329-201ENST00000554753 511 ntTSL 5 BASIC2.91□□□□□ -1.94
CASQ1P31415 TRAV28-201ENST00000557548 323 ntBASIC2.91□□□□□ -1.94
CASQ1P31415 ZRANB2-AS2-212ENST00000590186 686 ntTSL 5 BASIC2.91□□□□□ -1.94
CASQ1P31415 AC008277.2-201ENST00000605196 797 ntBASIC2.91□□□□□ -1.94
CASQ1P31415 AL137847.3-201ENST00000611521 109 ntBASIC2.91□□□□□ -1.94
CASQ1P31415 AC012442.3-202ENST00000636742 206 ntBASIC2.91□□□□□ -1.94
CASQ1P31415 AP003481.1-201ENST00000637808 351 ntTSL 5 BASIC2.91□□□□□ -1.94
CASQ1P31415 SAMD9-201ENST00000379958 6852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.91□□□□□ -1.94
CASQ1P31415 TAB3P1-202ENST00000452645 1634 ntBASIC2.9□□□□□ -1.94
CASQ1P31415 AC096644.4-201ENST00000563417 2912 ntBASIC2.9□□□□□ -1.94
CASQ1P31415 CFH-202ENST00000367429 4127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.9□□□□□ -1.94
CASQ1P31415 ARHGAP28-204ENST00000419673 5492 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC2.9□□□□□ -1.94
CASQ1P31415 TRAV7-201ENST00000390429 337 ntAPPRIS P1 BASIC2.9□□□□□ -1.95
CASQ1P31415 RNA5SP210-201ENST00000391034 120 ntBASIC2.9□□□□□ -1.95
CASQ1P31415 AC007557.4-201ENST00000421907 430 ntTSL 1 (best) BASIC2.9□□□□□ -1.95
CASQ1P31415 AC005300.1-201ENST00000428401 373 ntBASIC2.9□□□□□ -1.95
CASQ1P31415 AC093422.3-201ENST00000428506 305 ntBASIC2.9□□□□□ -1.95
CASQ1P31415 ZRANB2-AS2-204ENST00000430605 213 ntTSL 2 BASIC2.9□□□□□ -1.95
CASQ1P31415 AC090774.1-201ENST00000435925 246 ntBASIC2.9□□□□□ -1.95
CASQ1P31415 RPS26P30-201ENST00000443431 335 ntBASIC2.9□□□□□ -1.95
CASQ1P31415 AC095032.1-201ENST00000444810 527 ntTSL 3 BASIC2.9□□□□□ -1.95
CASQ1P31415 RPS15AP27-201ENST00000449183 343 ntBASIC2.9□□□□□ -1.95
CASQ1P31415 BTF3P5-201ENST00000457252 467 ntBASIC2.9□□□□□ -1.95
CASQ1P31415 AC133134.1-201ENST00000466800 359 ntBASIC2.9□□□□□ -1.95
CASQ1P31415 AC079340.1-201ENST00000504799 552 ntTSL 4 BASIC2.9□□□□□ -1.95
CASQ1P31415 AL359273.1-203ENST00000506295 602 ntTSL 1 (best) BASIC2.9□□□□□ -1.95
CASQ1P31415 TEMN3-AS1-201ENST00000510211 401 ntTSL 3 BASIC2.9□□□□□ -1.95
CASQ1P31415 AL359273.1-201ENST00000510918 627 ntBASIC2.9□□□□□ -1.95
CASQ1P31415 AC026780.1-201ENST00000512237 952 ntTSL 3 BASIC2.9□□□□□ -1.95
CASQ1P31415 SNORA31.18-201ENST00000517043 134 ntBASIC2.9□□□□□ -1.95
CASQ1P31415 IGKV3OR22-2-201ENST00000517943 313 ntBASIC2.9□□□□□ -1.95
CASQ1P31415 PIGY-201ENST00000527353 217 ntAPPRIS P1 BASIC2.9□□□□□ -1.95
CASQ1P31415 SAMD15-202ENST00000533095 412 ntTSL 5 BASIC2.9□□□□□ -1.95
CASQ1P31415 GLIPR1L1-204ENST00000548623 484 ntTSL 3 BASIC2.9□□□□□ -1.95
CASQ1P31415 ANKRD36BP2-206ENST00000575193 1245 ntBASIC2.9□□□□□ -1.95
CASQ1P31415 MIR4658-201ENST00000584344 65 ntBASIC2.9□□□□□ -1.95
CASQ1P31415 AC093227.2-201ENST00000589357 285 ntBASIC2.9□□□□□ -1.95
CASQ1P31415 AC002487.1-201ENST00000604565 994 ntBASIC2.9□□□□□ -1.95
CASQ1P31415 AC097504.2-201ENST00000608088 454 ntBASIC2.9□□□□□ -1.95
CASQ1P31415 AC112503.2-201ENST00000609005 552 ntBASIC2.9□□□□□ -1.95
CASQ1P31415 AP005137.2-201ENST00000609238 400 ntBASIC2.9□□□□□ -1.95
CASQ1P31415 AC039056.2-201ENST00000622261 511 ntBASIC2.9□□□□□ -1.95
CASQ1P31415 IL33-201ENST00000381434 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.9□□□□□ -1.95
CASQ1P31415 TMPRSS11A-201ENST00000334830 3054 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC2.9□□□□□ -1.95
CASQ1P31415 FOXP2-210ENST00000403559 6415 ntTSL 2 BASIC2.9□□□□□ -1.95
CASQ1P31415 N4BP2L2-205ENST00000446957 2071 ntTSL 5 BASIC2.89□□□□□ -1.95
CASQ1P31415 ZNF117-203ENST00000610793 1374 ntTSL 2 BASIC2.89□□□□□ -1.95
CASQ1P31415 RPAP3-202ENST00000380650 2149 ntTSL 1 (best) BASIC2.89□□□□□ -1.95
CASQ1P31415 MDM2-203ENST00000299252 966 ntTSL 1 (best) BASIC2.89□□□□□ -1.95
CASQ1P31415 AC010745.2-201ENST00000420404 839 ntTSL 3 BASIC2.89□□□□□ -1.95
CASQ1P31415 LINC01884-201ENST00000433429 440 ntTSL 3 BASIC2.89□□□□□ -1.95
CASQ1P31415 RPS20P5-201ENST00000434808 360 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
CASQ1P31415 AC093579.1-201ENST00000439455 352 ntTSL 2 BASIC2.89□□□□□ -1.95
CASQ1P31415 AC010157.1-201ENST00000440589 527 ntTSL 4 BASIC2.89□□□□□ -1.95
CASQ1P31415 RPL23AP16-201ENST00000441715 421 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
CASQ1P31415 AC104389.3-201ENST00000445629 235 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
CASQ1P31415 AL358232.1-201ENST00000448030 501 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
CASQ1P31415 AC011753.1-201ENST00000451001 220 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
CASQ1P31415 RPL23AP23-201ENST00000452590 471 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
CASQ1P31415 POMP-202ENST00000460403 1428 ntTSL 3 BASIC2.89□□□□□ -1.95
CASQ1P31415 RPL31P60-201ENST00000478450 367 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
CASQ1P31415 AL135752.1-201ENST00000479477 471 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
CASQ1P31415 FAM172BP-201ENST00000487497 1089 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
CASQ1P31415 RNA5SP82-201ENST00000516707 92 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
CASQ1P31415 AC009812.2-201ENST00000517657 457 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
CASQ1P31415 AC109329.2-201ENST00000519658 482 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
CASQ1P31415 SUB1P1-201ENST00000524415 382 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
CASQ1P31415 RGS4-209ENST00000531057 544 ntTSL 4 BASIC2.89□□□□□ -1.95
CASQ1P31415 A2ML1-AS1-201ENST00000537288 452 ntTSL 3 BASIC2.89□□□□□ -1.95
CASQ1P31415 AC012414.2-201ENST00000559474 187 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
CASQ1P31415 AC012404.1-201ENST00000560876 476 ntTSL 3 BASIC2.89□□□□□ -1.95
CASQ1P31415 MYL12BP1-201ENST00000569826 507 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
CASQ1P31415 MIR3921-201ENST00000577308 85 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
CASQ1P31415 BNIP3P11-201ENST00000603878 563 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
CASQ1P31415 AC079395.3-201ENST00000615161 484 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
CASQ1P31415 AC020763.5-201ENST00000623298 430 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
CASQ1P31415 AC026422.1-201ENST00000623961 452 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
CASQ1P31415 NEB-203ENST00000397345 26202 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.88□□□□□ -1.95
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 92.4 ms