Protein–RNA interactions for Protein: B1AMM8

LINC00587, Putative uncharacterized protein encoded by LINC00587, humanhuman

Predictions only

Length 73 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LINC00587B1AMM8 MTCO2P17-201ENST00000424336 677 ntBASIC1.8□□□□□ -2.12
LINC00587B1AMM8 AL357832.1-201ENST00000427460 420 ntTSL 3 BASIC1.8□□□□□ -2.12
LINC00587B1AMM8 AC018644.1-201ENST00000429934 551 ntBASIC1.8□□□□□ -2.12
LINC00587B1AMM8 AL445584.1-201ENST00000431451 330 ntBASIC1.8□□□□□ -2.12
LINC00587B1AMM8 LINC01078-201ENST00000434832 387 ntTSL 5 BASIC1.8□□□□□ -2.12
LINC00587B1AMM8 AC004022.1-201ENST00000447766 1066 ntBASIC1.8□□□□□ -2.12
LINC00587B1AMM8 LINC01474-202ENST00000449235 628 ntTSL 3 BASIC1.8□□□□□ -2.12
LINC00587B1AMM8 LINC01941-201ENST00000455174 624 ntTSL 2 BASIC1.8□□□□□ -2.12
LINC00587B1AMM8 RPL31P53-201ENST00000457065 348 ntBASIC1.8□□□□□ -2.12
LINC00587B1AMM8 CABYRP1-201ENST00000465493 1045 ntBASIC1.8□□□□□ -2.12
LINC00587B1AMM8 AC096751.1-202ENST00000502691 1067 ntBASIC1.8□□□□□ -2.12
LINC00587B1AMM8 AC006499.5-201ENST00000505037 514 ntBASIC1.8□□□□□ -2.12
LINC00587B1AMM8 AC021146.7-201ENST00000509604 775 ntBASIC1.8□□□□□ -2.12
LINC00587B1AMM8 AC114284.1-201ENST00000511422 1114 ntTSL 2 BASIC1.8□□□□□ -2.12
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LINC00587B1AMM8 RRM2B-206ENST00000519317 420 ntTSL 1 (best) BASIC1.8□□□□□ -2.12
LINC00587B1AMM8 AC102945.1-201ENST00000522640 407 ntTSL 2 BASIC1.8□□□□□ -2.12
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LINC00587B1AMM8 AC091053.2-201ENST00000534169 537 ntTSL 4 BASIC1.8□□□□□ -2.12
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LINC00587B1AMM8 OR11H5P-201ENST00000554039 926 ntBASIC1.8□□□□□ -2.12
LINC00587B1AMM8 AL392023.2-202ENST00000555342 494 ntTSL 5 BASIC1.8□□□□□ -2.12
LINC00587B1AMM8 LINC02253-201ENST00000559321 448 ntTSL 2 BASIC1.8□□□□□ -2.12
LINC00587B1AMM8 AC005498.1-201ENST00000592125 465 ntBASIC1.8□□□□□ -2.12
LINC00587B1AMM8 AC004542.1-201ENST00000602955 264 ntTSL 3 BASIC1.8□□□□□ -2.12
LINC00587B1AMM8 AC004908.2-201ENST00000609090 574 ntBASIC1.8□□□□□ -2.12
LINC00587B1AMM8 SATB1-AS1-266ENST00000630271 813 ntTSL 5 BASIC1.8□□□□□ -2.12
LINC00587B1AMM8 OR2M2-202ENST00000641211 1229 ntAPPRIS P1 BASIC1.8□□□□□ -2.12
LINC00587B1AMM8 OR2M2-203ENST00000641836 1151 ntAPPRIS P1 BASIC1.8□□□□□ -2.12
LINC00587B1AMM8 ST7-AS2-206ENST00000456577 1351 ntTSL 1 (best) BASIC1.8□□□□□ -2.12
LINC00587B1AMM8 ZNF567-201ENST00000360729 2691 ntTSL 1 (best) BASIC1.8□□□□□ -2.12
LINC00587B1AMM8 CFHR3-201ENST00000367425 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.8□□□□□ -2.12
LINC00587B1AMM8 AMY2B-208ENST00000610648 1736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.8□□□□□ -2.12
LINC00587B1AMM8 PYGO1-201ENST00000302000 8488 ntTSL 1 (best) BASIC1.79□□□□□ -2.12
LINC00587B1AMM8 LINC01967-201ENST00000356047 755 ntTSL 5 BASIC1.79□□□□□ -2.12
LINC00587B1AMM8 RNU6-374P-201ENST00000364146 108 ntBASIC1.79□□□□□ -2.12
LINC00587B1AMM8 SNORA16B-201ENST00000364674 135 ntBASIC1.79□□□□□ -2.12
LINC00587B1AMM8 RNA5-8SP4-201ENST00000365096 150 ntBASIC1.79□□□□□ -2.12
LINC00587B1AMM8 MDM4-202ENST00000367180 547 ntTSL 3 BASIC1.79□□□□□ -2.12
LINC00587B1AMM8 Y_RNA.493-201ENST00000384422 102 ntBASIC1.79□□□□□ -2.12
LINC00587B1AMM8 MIR493-201ENST00000385254 89 ntBASIC1.79□□□□□ -2.12
LINC00587B1AMM8 AC096664.2-201ENST00000411843 406 ntBASIC1.79□□□□□ -2.12
LINC00587B1AMM8 MCF2-204ENST00000414978 3813 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC1.79□□□□□ -2.12
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LINC00587B1AMM8 ZNF833P-201ENST00000424938 1494 ntBASIC1.79□□□□□ -2.12
LINC00587B1AMM8 LINC02030-201ENST00000492683 1602 ntTSL 5 BASIC1.79□□□□□ -2.12
LINC00587B1AMM8 ZMYM1-210ENST00000611874 4466 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC1.79□□□□□ -2.12
LINC00587B1AMM8 SNHG14-215ENST00000551631 4008 ntTSL 5 BASIC1.78□□□□□ -2.12
LINC00587B1AMM8 AP006437.1-201ENST00000641440 3685 ntBASIC1.78□□□□□ -2.12
LINC00587B1AMM8 AL158064.1-201ENST00000627044 2242 ntTSL 4 BASIC1.78□□□□□ -2.12
LINC00587B1AMM8 RNF219-AS1-214ENST00000607862 6001 ntTSL 1 (best) BASIC1.78□□□□□ -2.12
LINC00587B1AMM8 MTRNR2L10-201ENST00000545075 1530 ntAPPRIS P1 BASIC1.78□□□□□ -2.12
LINC00587B1AMM8 LINC00343-202ENST00000415294 1320 ntTSL 5 BASIC1.78□□□□□ -2.12
LINC00587B1AMM8 ANKRD36P1-201ENST00000344424 659 ntBASIC1.78□□□□□ -2.12
LINC00587B1AMM8 CFHR4-203ENST00000367418 1066 ntTSL 1 (best) BASIC1.78□□□□□ -2.12
LINC00587B1AMM8 MIR554-201ENST00000384874 96 ntBASIC1.78□□□□□ -2.12
LINC00587B1AMM8 MIR200C-201ENST00000384980 68 ntBASIC1.78□□□□□ -2.12
LINC00587B1AMM8 TRAJ35-201ENST00000390502 59 ntAPPRIS P1 BASIC1.78□□□□□ -2.12
LINC00587B1AMM8 PPP3R1-202ENST00000409377 684 ntTSL 3 BASIC1.78□□□□□ -2.12
LINC00587B1AMM8 RPS27L-202ENST00000411926 528 ntTSL 3 BASIC1.78□□□□□ -2.12
LINC00587B1AMM8 AC245052.5-201ENST00000416320 649 ntBASIC1.78□□□□□ -2.12
LINC00587B1AMM8 AL034347.1-201ENST00000420766 835 ntTSL 3 BASIC1.78□□□□□ -2.12
LINC00587B1AMM8 RPL31P63-201ENST00000422565 375 ntBASIC1.78□□□□□ -2.12
LINC00587B1AMM8 AC234781.2-201ENST00000426370 994 ntBASIC1.78□□□□□ -2.12
LINC00587B1AMM8 AC004975.1-201ENST00000428733 208 ntBASIC1.78□□□□□ -2.12
LINC00587B1AMM8 GNGT1-202ENST00000428834 731 ntTSL 3 BASIC1.78□□□□□ -2.12
LINC00587B1AMM8 AC091286.1-201ENST00000431233 461 ntBASIC1.78□□□□□ -2.12
LINC00587B1AMM8 NDUFA5P10-201ENST00000432147 357 ntBASIC1.78□□□□□ -2.12
LINC00587B1AMM8 HMGN2P31-201ENST00000432430 273 ntBASIC1.78□□□□□ -2.12
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