Protein–RNA interactions for Protein: Q9ULB1

NRXN1, Neurexin-1, humanhuman

Predictions only

Length 1,477 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NRXN1Q9ULB1 AL606534.3-201ENST00000437499 373 ntTSL 5 BASIC2.8□□□□□ -1.96
NRXN1Q9ULB1 AC003989.2-201ENST00000440224 169 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
NRXN1Q9ULB1 AC009237.8-201ENST00000445492 379 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
NRXN1Q9ULB1 AC245517.4-201ENST00000448601 281 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
NRXN1Q9ULB1 HSPE1P22-201ENST00000456856 327 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
NRXN1Q9ULB1 RPS29P11-201ENST00000496507 171 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
NRXN1Q9ULB1 MIR5089-201ENST00000580047 84 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
NRXN1Q9ULB1 AC007256.1-201ENST00000392253 2765 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
NRXN1Q9ULB1 AGTR1-204ENST00000418473 2071 ntTSL 5 BASIC2.8□□□□□ -1.96
NRXN1Q9ULB1 ZNF720P1-201ENST00000562403 1939 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
NRXN1Q9ULB1 KERA-201ENST00000266719 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.79□□□□□ -1.96
NRXN1Q9ULB1 OR5AC2-201ENST00000358642 930 ntAPPRIS P1 BASIC2.79□□□□□ -1.96
NRXN1Q9ULB1 VTRNA1-1-201ENST00000363120 99 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
NRXN1Q9ULB1 NPM1P10-201ENST00000398310 865 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
NRXN1Q9ULB1 AL353729.1-201ENST00000425044 720 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
NRXN1Q9ULB1 LINC01040-201ENST00000425048 666 ntTSL 2 BASIC2.79□□□□□ -1.96
NRXN1Q9ULB1 MTCO3P30-201ENST00000426425 670 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
NRXN1Q9ULB1 HMGB3P15-201ENST00000507326 574 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
NRXN1Q9ULB1 LNX1-AS1-203ENST00000511989 488 ntTSL 2 BASIC2.79□□□□□ -1.96
NRXN1Q9ULB1 LINC01256-201ENST00000513270 508 ntTSL 2 BASIC2.79□□□□□ -1.96
NRXN1Q9ULB1 RNA5SP182-201ENST00000516064 82 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
NRXN1Q9ULB1 GNAI2P1-201ENST00000541815 315 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
NRXN1Q9ULB1 AL160191.1-202ENST00000554008 576 ntTSL 4 BASIC2.79□□□□□ -1.96
NRXN1Q9ULB1 CDK1-209ENST00000614696 1884 ntTSL 5 BASIC2.79□□□□□ -1.96
NRXN1Q9ULB1 AC244517.12-201ENST00000623581 663 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
NRXN1Q9ULB1 GMFB-210ENST00000628554 639 ntTSL 4 BASIC2.79□□□□□ -1.96
NRXN1Q9ULB1 Clostridiales-1.2-201ENST00000636724 160 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
NRXN1Q9ULB1 AC138649.5-201ENST00000637456 137 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
NRXN1Q9ULB1 XPO4-202ENST00000400602 9884 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC2.79□□□□□ -1.96
NRXN1Q9ULB1 PCDH11Y-203ENST00000362095 4220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.79□□□□□ -1.96
NRXN1Q9ULB1 AL359715.4-201ENST00000606629 1436 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
NRXN1Q9ULB1 CLEC4A-201ENST00000229332 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.78□□□□□ -1.96
NRXN1Q9ULB1 METTL21EP-201ENST00000298105 713 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
NRXN1Q9ULB1 IL20-201ENST00000367096 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.78□□□□□ -1.96
NRXN1Q9ULB1 TSACC-205ENST00000368255 751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.78□□□□□ -1.96
NRXN1Q9ULB1 Z82205.1-201ENST00000428456 297 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
NRXN1Q9ULB1 AC109583.1-201ENST00000432156 268 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
NRXN1Q9ULB1 AC093689.1-201ENST00000514737 246 ntTSL 5 BASIC2.78□□□□□ -1.96
NRXN1Q9ULB1 GCSAML-207ENST00000527541 1094 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.78□□□□□ -1.96
NRXN1Q9ULB1 FAM92A1P1-201ENST00000528023 890 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
NRXN1Q9ULB1 AC007450.1-201ENST00000536492 188 ntTSL 3 BASIC2.78□□□□□ -1.96
NRXN1Q9ULB1 RGS18-201ENST00000367460 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.78□□□□□ -1.96
NRXN1Q9ULB1 LIFR-201ENST00000263409 10089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.78□□□□□ -1.97
NRXN1Q9ULB1 ACTR3BP6-201ENST00000422332 1241 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
NRXN1Q9ULB1 AC110995.1-201ENST00000444185 628 ntTSL 3 BASIC2.77□□□□□ -1.97
NRXN1Q9ULB1 FABP5P13-201ENST00000452144 328 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
NRXN1Q9ULB1 AC007182.2-201ENST00000489251 402 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
NRXN1Q9ULB1 LINC01455-201ENST00000503167 561 ntTSL 4 BASIC2.77□□□□□ -1.97
NRXN1Q9ULB1 RN7SKP82-201ENST00000516786 223 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
NRXN1Q9ULB1 SDHAF2-205ENST00000537782 559 ntTSL 4 BASIC2.77□□□□□ -1.97
NRXN1Q9ULB1 LINC02300-201ENST00000549742 665 ntTSL 4 BASIC2.77□□□□□ -1.97
NRXN1Q9ULB1 DUXAP3-201ENST00000603616 594 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
NRXN1Q9ULB1 ATP11C-201ENST00000327569 6115 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.77□□□□□ -1.97
NRXN1Q9ULB1 AC107021.2-201ENST00000567714 2095 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
NRXN1Q9ULB1 NBPF20-202ENST00000392971 18450 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC2.77□□□□□ -1.97
NRXN1Q9ULB1 LINC01737-201ENST00000412647 403 ntTSL 1 (best) BASIC2.77□□□□□ -1.97
NRXN1Q9ULB1 TRAPPC2P10-201ENST00000415662 323 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
NRXN1Q9ULB1 RPS26P30-201ENST00000443431 335 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
NRXN1Q9ULB1 AC011753.1-201ENST00000451001 220 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
NRXN1Q9ULB1 LINC02276-201ENST00000508388 138 ntTSL 3 BASIC2.77□□□□□ -1.97
NRXN1Q9ULB1 AC004053.1-201ENST00000515127 575 ntTSL 5 BASIC2.77□□□□□ -1.97
NRXN1Q9ULB1 AC007686.2-201ENST00000554043 469 ntTSL 2 BASIC2.77□□□□□ -1.97
NRXN1Q9ULB1 OR4U1P-201ENST00000554958 912 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
NRXN1Q9ULB1 AC128687.1-201ENST00000605304 619 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
NRXN1Q9ULB1 RBM12B-AS1-201ENST00000623283 653 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
NRXN1Q9ULB1 AC002064.3-201ENST00000623448 346 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
NRXN1Q9ULB1 AC004943.3-201ENST00000624116 600 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
NRXN1Q9ULB1 AL121594.5-201ENST00000631724 573 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
NRXN1Q9ULB1 AC114546.3-201ENST00000623582 1734 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
NRXN1Q9ULB1 C2orf73-202ENST00000398634 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.76□□□□□ -1.97
NRXN1Q9ULB1 AC110774.1-201ENST00000623567 2018 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
NRXN1Q9ULB1 MUC15-202ENST00000436318 3118 ntTSL 5 BASIC2.76□□□□□ -1.97
NRXN1Q9ULB1 MIR499A-201ENST00000384903 122 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
NRXN1Q9ULB1 MIR7-2-201ENST00000384970 110 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
NRXN1Q9ULB1 OR4K11P-201ENST00000431829 904 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
NRXN1Q9ULB1 RPL39L-202ENST00000433055 749 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.76□□□□□ -1.97
NRXN1Q9ULB1 AF274573.2-201ENST00000437772 520 ntTSL 5 BASIC2.76□□□□□ -1.97
NRXN1Q9ULB1 AC233279.1-201ENST00000455300 423 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
NRXN1Q9ULB1 AC073901.1-201ENST00000462471 408 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
NRXN1Q9ULB1 CFHR2-203ENST00000476712 1020 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC2.76□□□□□ -1.97
NRXN1Q9ULB1 AC017007.3-201ENST00000479865 435 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
NRXN1Q9ULB1 MTAPP1-201ENST00000489154 819 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
NRXN1Q9ULB1 AC078918.1-201ENST00000498515 228 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
NRXN1Q9ULB1 CSN1S1-203ENST00000507763 597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.76□□□□□ -1.97
NRXN1Q9ULB1 SNORA31.15-201ENST00000516771 132 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
NRXN1Q9ULB1 AC103810.1-201ENST00000579873 453 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
NRXN1Q9ULB1 SNRPGP19-201ENST00000603826 189 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
NRXN1Q9ULB1 RPL23AP88-201ENST00000605759 454 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
NRXN1Q9ULB1 AL391813.2-201ENST00000609113 322 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
NRXN1Q9ULB1 AP005901.5-201ENST00000545779 1796 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
NRXN1Q9ULB1 ESF1-202ENST00000617257 1470 ntTSL 5 BASIC2.75□□□□□ -1.97
NRXN1Q9ULB1 OR8K5-201ENST00000313447 924 ntAPPRIS P1 BASIC2.75□□□□□ -1.97
NRXN1Q9ULB1 LRRC69-201ENST00000343709 720 ntTSL 2 BASIC2.75□□□□□ -1.97
NRXN1Q9ULB1 Y_RNA.116-201ENST00000363292 103 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
NRXN1Q9ULB1 RPL7P46-201ENST00000425129 740 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
NRXN1Q9ULB1 AC092162.2-204ENST00000451851 566 ntTSL 4 BASIC2.75□□□□□ -1.97
NRXN1Q9ULB1 AL133166.1-201ENST00000551040 1034 ntTSL 4 BASIC2.75□□□□□ -1.97
NRXN1Q9ULB1 AC011890.2-201ENST00000613393 294 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
NRXN1Q9ULB1 DPY19L2P1-203ENST00000458672 3347 ntTSL 1 (best) BASIC2.75□□□□□ -1.97
NRXN1Q9ULB1 MRPL42-202ENST00000393128 1983 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC2.75□□□□□ -1.97
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 119.2 ms