Protein–RNA interactions for Protein: Q9P2H5

USP35, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 35, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP35Q9P2H5 AC096577.2-201ENST00000611455 153 ntBASIC5.6□□□□□ -1.51
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USP35Q9P2H5 AC025594.3-201ENST00000613068 790 ntBASIC5.6□□□□□ -1.51
USP35Q9P2H5 AC027807.2-201ENST00000616099 408 ntBASIC5.6□□□□□ -1.51
USP35Q9P2H5 AL359715.5-201ENST00000623431 443 ntBASIC5.6□□□□□ -1.51
USP35Q9P2H5 PUS7L-207ENST00000551923 3313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.6□□□□□ -1.51
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USP35Q9P2H5 KCNJ13-201ENST00000233826 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.6□□□□□ -1.51
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USP35Q9P2H5 ABI3BP-201ENST00000284322 4498 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.6□□□□□ -1.51
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USP35Q9P2H5 CEP295-201ENST00000325212 8057 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC5.59□□□□□ -1.51
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USP35Q9P2H5 NPSR1-AS1-205ENST00000436945 1406 ntTSL 1 (best) BASIC5.59□□□□□ -1.51
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USP35Q9P2H5 LINC01813-201ENST00000451034 712 ntTSL 1 (best) BASIC5.59□□□□□ -1.51
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USP35Q9P2H5 HMGB1P50-201ENST00000605814 607 ntBASIC5.58□□□□□ -1.52
USP35Q9P2H5 Z98200.1-201ENST00000607298 470 ntBASIC5.58□□□□□ -1.52
USP35Q9P2H5 AC006023.2-201ENST00000609916 167 ntBASIC5.58□□□□□ -1.52
USP35Q9P2H5 C8orf59-207ENST00000611854 563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.58□□□□□ -1.52
USP35Q9P2H5 AC104010.1-201ENST00000616889 150 ntBASIC5.58□□□□□ -1.52
USP35Q9P2H5 AC091905.2-201ENST00000623143 306 ntBASIC5.58□□□□□ -1.52
USP35Q9P2H5 OSBPL8-202ENST00000393249 7047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC5.58□□□□□ -1.52
USP35Q9P2H5 MAP3K21-201ENST00000366622 4005 ntTSL 1 (best) BASIC5.58□□□□□ -1.52
USP35Q9P2H5 LRRC63-203ENST00000595396 2327 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC5.58□□□□□ -1.52
USP35Q9P2H5 EFHC1-205ENST00000538167 5308 ntTSL 5 BASIC5.57□□□□□ -1.52
USP35Q9P2H5 FGF7P2-201ENST00000332473 296 ntBASIC5.57□□□□□ -1.52
USP35Q9P2H5 Y_RNA.46-201ENST00000362695 102 ntBASIC5.57□□□□□ -1.52
USP35Q9P2H5 S100A10-201ENST00000368809 616 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.57□□□□□ -1.52
USP35Q9P2H5 RNY3P10-201ENST00000384764 102 ntBASIC5.57□□□□□ -1.52
USP35Q9P2H5 RPL7P25-201ENST00000404151 721 ntBASIC5.57□□□□□ -1.52
USP35Q9P2H5 AC233728.2-201ENST00000425348 757 ntBASIC5.57□□□□□ -1.52
USP35Q9P2H5 VDAC1P3-201ENST00000434069 851 ntBASIC5.57□□□□□ -1.52
USP35Q9P2H5 AC004866.2-201ENST00000438285 481 ntBASIC5.57□□□□□ -1.52
USP35Q9P2H5 AC099342.1-201ENST00000446399 1124 ntTSL 3 BASIC5.57□□□□□ -1.52
USP35Q9P2H5 AL163192.1-201ENST00000448858 708 ntTSL 5 BASIC5.57□□□□□ -1.52
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