Protein–RNA interactions for Protein: Q9NQ69

LHX9, LIM/homeobox protein Lhx9, humanhuman

Predictions only

Length 397 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LHX9Q9NQ69 AP004217.1-201ENST00000480579 346 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
LHX9Q9NQ69 DYNLL1P6-201ENST00000503440 264 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
LHX9Q9NQ69 AC002460.1-201ENST00000504394 370 ntTSL 3 BASIC2.77□□□□□ -1.97
LHX9Q9NQ69 AC113420.1-201ENST00000507903 571 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
LHX9Q9NQ69 AC093755.1-201ENST00000512950 1023 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
LHX9Q9NQ69 COX6CP8-201ENST00000522620 226 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
LHX9Q9NQ69 PKIA-AS1-203ENST00000522807 692 ntTSL 3 BASIC2.77□□□□□ -1.97
LHX9Q9NQ69 AP001207.1-201ENST00000524051 481 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
LHX9Q9NQ69 AC087276.1-201ENST00000529659 480 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
LHX9Q9NQ69 ATF7IP2-206ENST00000543967 998 ntTSL 2 BASIC2.77□□□□□ -1.97
LHX9Q9NQ69 AF099810.1-201ENST00000554219 525 ntTSL 3 BASIC2.77□□□□□ -1.97
LHX9Q9NQ69 ITFG1-AS1-202ENST00000565694 494 ntTSL 2 BASIC2.77□□□□□ -1.97
LHX9Q9NQ69 AC116003.2-201ENST00000579278 748 ntTSL 2 BASIC2.77□□□□□ -1.97
LHX9Q9NQ69 AC009237.15-201ENST00000610252 501 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
LHX9Q9NQ69 AP003485.2-201ENST00000623636 610 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
LHX9Q9NQ69 SMIM18-202ENST00000626298 114 ntTSL 5 BASIC2.77□□□□□ -1.97
LHX9Q9NQ69 ZNF663P-202ENST00000641770 1131 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
LHX9Q9NQ69 MAPK6PS3-201ENST00000403865 2162 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
LHX9Q9NQ69 RXFP1-201ENST00000307765 3842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.77□□□□□ -1.97
LHX9Q9NQ69 ARHGAP5-202ENST00000345122 9604 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC2.77□□□□□ -1.97
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LHX9Q9NQ69 AF165147.1-201ENST00000433310 6103 ntTSL 2 BASIC2.76□□□□□ -1.97
LHX9Q9NQ69 SERPINA7-201ENST00000327674 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.76□□□□□ -1.97
LHX9Q9NQ69 AC096644.4-201ENST00000563417 2912 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
LHX9Q9NQ69 YWHAZ-219ENST00000522542 1394 ntTSL 2 BASIC2.76□□□□□ -1.97
LHX9Q9NQ69 SUCLA2P2-201ENST00000417269 1309 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
LHX9Q9NQ69 RNU6-582P-201ENST00000362989 107 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
LHX9Q9NQ69 SNORA9.2-201ENST00000365361 133 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
LHX9Q9NQ69 U8.9-201ENST00000365667 134 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
LHX9Q9NQ69 SNORA26.7-201ENST00000391288 122 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
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LHX9Q9NQ69 RN7SKP58-201ENST00000411010 305 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
LHX9Q9NQ69 AC093157.1-203ENST00000416329 713 ntTSL 5 BASIC2.76□□□□□ -1.97
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LHX9Q9NQ69 AL591721.1-201ENST00000439849 751 ntTSL 3 BASIC2.76□□□□□ -1.97
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LHX9Q9NQ69 NUTM2A-AS1-209ENST00000447424 571 ntTSL 3 BASIC2.76□□□□□ -1.97
LHX9Q9NQ69 Z99714.1-201ENST00000450463 807 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
LHX9Q9NQ69 BX276092.4-201ENST00000452056 248 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
LHX9Q9NQ69 AL391704.1-202ENST00000453889 874 ntTSL 3 BASIC2.76□□□□□ -1.97
LHX9Q9NQ69 AC073359.2-201ENST00000478814 351 ntTSL 3 BASIC2.76□□□□□ -1.97
LHX9Q9NQ69 LINC02053-202ENST00000488262 940 ntTSL 1 (best) BASIC2.76□□□□□ -1.97
LHX9Q9NQ69 ATP6V1G3-204ENST00000489986 449 ntTSL 1 (best) BASIC2.76□□□□□ -1.97
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LHX9Q9NQ69 UGT2A2-201ENST00000604021 1544 ntTSL 1 (best) BASIC2.76□□□□□ -1.97
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LHX9Q9NQ69 ZRANB2-201ENST00000254821 2821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.75□□□□□ -1.97
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LHX9Q9NQ69 TSHB-201ENST00000256592 537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.75□□□□□ -1.97
LHX9Q9NQ69 OR52E6-201ENST00000329322 970 ntAPPRIS P1 BASIC2.75□□□□□ -1.97
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LHX9Q9NQ69 Y_RNA.472-201ENST00000384322 102 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
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LHX9Q9NQ69 BTBD10P2-201ENST00000404779 676 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
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LHX9Q9NQ69 RNA5SP344-201ENST00000411081 104 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
LHX9Q9NQ69 AC073264.1-201ENST00000411508 416 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
LHX9Q9NQ69 AL136133.1-201ENST00000413694 376 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
LHX9Q9NQ69 RPL31P2-201ENST00000413849 377 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
LHX9Q9NQ69 RPL31P45-201ENST00000419532 356 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
LHX9Q9NQ69 AP001599.1-201ENST00000426771 361 ntTSL 3 BASIC2.75□□□□□ -1.97
LHX9Q9NQ69 AL122034.1-201ENST00000427609 497 ntTSL 2 BASIC2.75□□□□□ -1.97
LHX9Q9NQ69 OR51AB1P-201ENST00000429046 620 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
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LHX9Q9NQ69 NDUFA5P7-201ENST00000452914 242 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
LHX9Q9NQ69 AC087879.1-201ENST00000474343 374 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
LHX9Q9NQ69 RPS26P21-201ENST00000475397 348 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
LHX9Q9NQ69 GAPDHP39-201ENST00000481866 979 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
LHX9Q9NQ69 UBE2V1P12-201ENST00000503954 474 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
LHX9Q9NQ69 AC093752.2-201ENST00000506942 573 ntTSL 5 BASIC2.75□□□□□ -1.97
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