Protein–RNA interactions for Protein: Q96Q15

SMG1, Serine/threonine-protein kinase SMG1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 3,661 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMG1Q96Q15 AC120053.1-201ENST00000607706 736 ntBASIC1.76□□□□□ -2.13
SMG1Q96Q15 CXADR-205ENST00000400169 1445 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC1.75□□□□□ -2.13
SMG1Q96Q15 RGPD1-204ENST00000559485 5247 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC1.75□□□□□ -2.13
SMG1Q96Q15 Z99714.1-201ENST00000450463 807 ntBASIC1.75□□□□□ -2.13
SMG1Q96Q15 AC079907.1-201ENST00000552707 374 ntTSL 3 BASIC1.75□□□□□ -2.13
SMG1Q96Q15 ORC3-201ENST00000257789 2501 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC1.75□□□□□ -2.13
SMG1Q96Q15 TTN-204ENST00000360870 18218 ntTSL 5 BASIC1.75□□□□□ -2.13
SMG1Q96Q15 NBPF20-201ENST00000369373 18760 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC1.75□□□□□ -2.13
SMG1Q96Q15 UGP2-203ENST00000445915 1955 ntTSL 2 BASIC1.75□□□□□ -2.13
SMG1Q96Q15 AJ009632.2-202ENST00000634644 1513 ntTSL 5 BASIC1.75□□□□□ -2.13
SMG1Q96Q15 RNA5SP502-201ENST00000362694 119 ntBASIC1.75□□□□□ -2.13
SMG1Q96Q15 AC112695.1-201ENST00000504213 592 ntTSL 2 BASIC1.75□□□□□ -2.13
SMG1Q96Q15 C3orf79-201ENST00000623038 580 ntTSL 1 (best) BASIC1.75□□□□□ -2.13
SMG1Q96Q15 AL353746.1-201ENST00000566293 6881 ntBASIC1.75□□□□□ -2.13
SMG1Q96Q15 Y_RNA.251-201ENST00000364551 99 ntBASIC1.75□□□□□ -2.13
SMG1Q96Q15 LINC00301-202ENST00000412599 772 ntTSL 1 (best) BASIC1.75□□□□□ -2.13
SMG1Q96Q15 AC234781.4-201ENST00000419384 244 ntBASIC1.75□□□□□ -2.13
SMG1Q96Q15 AC005005.2-201ENST00000420779 380 ntBASIC1.75□□□□□ -2.13
SMG1Q96Q15 AC121764.2-201ENST00000469806 587 ntTSL 2 BASIC1.75□□□□□ -2.13
SMG1Q96Q15 AC139718.1-201ENST00000508010 300 ntTSL 5 BASIC1.75□□□□□ -2.13
SMG1Q96Q15 RNU6ATAC9P-201ENST00000516210 116 ntBASIC1.75□□□□□ -2.13
SMG1Q96Q15 HMGN2P47-201ENST00000559378 272 ntBASIC1.75□□□□□ -2.13
SMG1Q96Q15 MIR6132-201ENST00000622083 109 ntBASIC1.75□□□□□ -2.13
SMG1Q96Q15 MUC15-201ENST00000281268 2968 ntTSL 5 BASIC1.74□□□□□ -2.13
SMG1Q96Q15 TAB2-205ENST00000538427 4240 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.74□□□□□ -2.13
SMG1Q96Q15 CC2D2B-210ENST00000636965 3247 ntTSL 5 BASIC1.74□□□□□ -2.13
SMG1Q96Q15 RNU6-53P-201ENST00000365367 106 ntBASIC1.74□□□□□ -2.13
SMG1Q96Q15 AIMP1P1-201ENST00000418670 937 ntBASIC1.74□□□□□ -2.13
SMG1Q96Q15 PIGFP3-201ENST00000441918 722 ntBASIC1.74□□□□□ -2.13
SMG1Q96Q15 GZMAP1-201ENST00000503054 631 ntBASIC1.74□□□□□ -2.13
SMG1Q96Q15 AC004486.1-201ENST00000546846 233 ntBASIC1.74□□□□□ -2.13
SMG1Q96Q15 AC025281.1-201ENST00000567026 265 ntBASIC1.74□□□□□ -2.13
SMG1Q96Q15 CCDC82-202ENST00000423339 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC1.74□□□□□ -2.13
SMG1Q96Q15 DST-202ENST00000312431 17756 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC1.74□□□□□ -2.13
SMG1Q96Q15 SULT1B1-201ENST00000310613 7115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.74□□□□□ -2.13
SMG1Q96Q15 SNX16-212ENST00000615066 1918 ntTSL 5 BASIC1.74□□□□□ -2.13
SMG1Q96Q15 CFH-202ENST00000367429 4127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.74□□□□□ -2.13
SMG1Q96Q15 AC119800.1-201ENST00000429871 423 ntTSL 2 BASIC1.74□□□□□ -2.13
SMG1Q96Q15 SMG7-AS1-202ENST00000432837 466 ntTSL 3 BASIC1.74□□□□□ -2.13
SMG1Q96Q15 AC020651.1-201ENST00000490324 360 ntTSL 3 BASIC1.74□□□□□ -2.13
SMG1Q96Q15 AC092138.2-201ENST00000563811 428 ntTSL 5 BASIC1.74□□□□□ -2.13
SMG1Q96Q15 AC007193.1-201ENST00000599645 448 ntTSL 5 BASIC1.74□□□□□ -2.13
SMG1Q96Q15 CCDC30-212ENST00000507855 2445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC1.74□□□□□ -2.13
SMG1Q96Q15 AB015752.1-201ENST00000521975 578 ntTSL 5 BASIC1.73□□□□□ -2.13
SMG1Q96Q15 AC025300.1-201ENST00000526616 384 ntTSL 3 BASIC1.73□□□□□ -2.13
SMG1Q96Q15 AC093025.1-201ENST00000547795 569 ntTSL 2 BASIC1.73□□□□□ -2.13
SMG1Q96Q15 AC007495.2-202ENST00000564102 535 ntTSL 4 BASIC1.73□□□□□ -2.13
SMG1Q96Q15 AC234775.3-201ENST00000564612 656 ntBASIC1.73□□□□□ -2.13
SMG1Q96Q15 MYL12BP1-201ENST00000569826 507 ntBASIC1.73□□□□□ -2.13
SMG1Q96Q15 LINC00158-201ENST00000332587 1476 ntTSL 1 (best) BASIC1.73□□□□□ -2.13
SMG1Q96Q15 FGF7-206ENST00000614567 3936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.73□□□□□ -2.13
SMG1Q96Q15 TBL1XR1-208ENST00000430069 7948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.73□□□□□ -2.13
SMG1Q96Q15 AC103988.1-201ENST00000566382 2177 ntBASIC1.73□□□□□ -2.13
SMG1Q96Q15 AC245100.2-201ENST00000454544 1679 ntBASIC1.73□□□□□ -2.13
SMG1Q96Q15 Y_RNA.458-201ENST00000384240 102 ntBASIC1.73□□□□□ -2.13
SMG1Q96Q15 AC093157.1-203ENST00000416329 713 ntTSL 5 BASIC1.73□□□□□ -2.13
SMG1Q96Q15 AL359634.1-201ENST00000429807 1179 ntTSL 5 BASIC1.73□□□□□ -2.13
SMG1Q96Q15 CDC42P1-201ENST00000456658 548 ntBASIC1.73□□□□□ -2.13
SMG1Q96Q15 RPL23AP55-201ENST00000498163 452 ntBASIC1.73□□□□□ -2.13
SMG1Q96Q15 AC020910.1-201ENST00000599404 413 ntTSL 5 BASIC1.73□□□□□ -2.13
SMG1Q96Q15 MTCO1P7-201ENST00000419523 1542 ntBASIC1.73□□□□□ -2.13
SMG1Q96Q15 AC006076.1-201ENST00000423233 345 ntTSL 3 BASIC1.73□□□□□ -2.13
SMG1Q96Q15 AC006390.1-201ENST00000508068 283 ntBASIC1.73□□□□□ -2.13
SMG1Q96Q15 MEF2C-AS1-208ENST00000512585 741 ntTSL 5 BASIC1.73□□□□□ -2.13
SMG1Q96Q15 DEUP1-203ENST00000527307 767 ntTSL 3 BASIC1.73□□□□□ -2.13
SMG1Q96Q15 AC087286.1-201ENST00000560712 568 ntTSL 3 BASIC1.73□□□□□ -2.13
SMG1Q96Q15 LAMTOR5-AS1-203ENST00000585330 463 ntTSL 2 BASIC1.73□□□□□ -2.13
SMG1Q96Q15 AC131902.3-201ENST00000611767 581 ntBASIC1.73□□□□□ -2.13
SMG1Q96Q15 AL353748.2-201ENST00000622148 471 ntBASIC1.73□□□□□ -2.13
SMG1Q96Q15 ZNF678-202ENST00000397097 8212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.73□□□□□ -2.13
SMG1Q96Q15 SYT14-204ENST00000472886 2966 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC1.73□□□□□ -2.13
SMG1Q96Q15 KTN1-205ENST00000395314 4618 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC1.73□□□□□ -2.13
SMG1Q96Q15 AC005336.3-201ENST00000623833 2679 ntBASIC1.72□□□□□ -2.13
SMG1Q96Q15 ANKRD30A-201ENST00000361713 4405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC1.72□□□□□ -2.13
SMG1Q96Q15 AC093911.1-201ENST00000419129 552 ntTSL 4 BASIC1.72□□□□□ -2.13
SMG1Q96Q15 RPL21P18-201ENST00000469899 480 ntBASIC1.72□□□□□ -2.13
SMG1Q96Q15 HESX1-202ENST00000473921 757 ntTSL 5 BASIC1.72□□□□□ -2.13
SMG1Q96Q15 AC097512.1-203ENST00000506425 957 ntTSL 3 BASIC1.72□□□□□ -2.13
SMG1Q96Q15 IGHV3-76-201ENST00000522465 295 ntBASIC1.72□□□□□ -2.13
SMG1Q96Q15 MIR151B-201ENST00000584249 96 ntBASIC1.72□□□□□ -2.13
SMG1Q96Q15 AC068790.3-201ENST00000602988 553 ntBASIC1.72□□□□□ -2.13
SMG1Q96Q15 HPVC1-201ENST00000629899 1198 ntBASIC1.72□□□□□ -2.13
SMG1Q96Q15 KIAA1109-203ENST00000388738 15574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.72□□□□□ -2.13
SMG1Q96Q15 PNPT1P2-201ENST00000456768 2050 ntBASIC1.72□□□□□ -2.13
SMG1Q96Q15 AC022336.2-201ENST00000568966 2538 ntBASIC1.72□□□□□ -2.13
SMG1Q96Q15 SI-201ENST00000264382 6011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.72□□□□□ -2.13
SMG1Q96Q15 NEB-203ENST00000397345 26202 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC1.72□□□□□ -2.13
SMG1Q96Q15 NEB-209ENST00000427231 26202 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC1.72□□□□□ -2.13
SMG1Q96Q15 ANKAR-201ENST00000313581 4391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.72□□□□□ -2.13
SMG1Q96Q15 RNU1-51P-201ENST00000365345 176 ntBASIC1.72□□□□□ -2.13
SMG1Q96Q15 DEFA7P-201ENST00000382676 285 ntBASIC1.72□□□□□ -2.13
SMG1Q96Q15 Y_RNA.393-201ENST00000383936 102 ntBASIC1.72□□□□□ -2.13
SMG1Q96Q15 MIR548J-201ENST00000408833 112 ntBASIC1.72□□□□□ -2.13
SMG1Q96Q15 AC093151.3-203ENST00000422305 514 ntTSL 3 BASIC1.72□□□□□ -2.13
SMG1Q96Q15 AFF2-IT1-201ENST00000435346 443 ntTSL 5 BASIC1.72□□□□□ -2.13
SMG1Q96Q15 ZDHHC20P3-201ENST00000531576 336 ntBASIC1.72□□□□□ -2.13
SMG1Q96Q15 DISC1FP1-204ENST00000563681 466 ntTSL 3 BASIC1.72□□□□□ -2.13
SMG1Q96Q15 PSMA6P4-201ENST00000603247 718 ntBASIC1.72□□□□□ -2.13
SMG1Q96Q15 TSGA10-205ENST00000410001 3036 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC1.72□□□□□ -2.13
SMG1Q96Q15 LPP-220ENST00000617246 18220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.72□□□□□ -2.13
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