Protein–RNA interactions for Protein: Q92696

RABGGTA, Geranylgeranyl transferase type-2 subunit alpha, humanhuman

Predictions only

Length 567 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RABGGTAQ92696 PAIP2-205ENST00000510080 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.8□□□□□ -1.64
RABGGTAQ92696 RN7SKP21-201ENST00000516503 220 ntBASIC4.8□□□□□ -1.64
RABGGTAQ92696 LINC02384-208ENST00000546086 565 ntTSL 3 BASIC4.8□□□□□ -1.64
RABGGTAQ92696 AC008083.1-201ENST00000547748 663 ntTSL 2 BASIC4.8□□□□□ -1.64
RABGGTAQ92696 CBX3P5-201ENST00000552017 521 ntBASIC4.8□□□□□ -1.64
RABGGTAQ92696 AL109766.1-201ENST00000555080 552 ntBASIC4.8□□□□□ -1.64
RABGGTAQ92696 AL138976.2-201ENST00000563989 694 ntBASIC4.8□□□□□ -1.64
RABGGTAQ92696 AC034268.2-201ENST00000571784 482 ntBASIC4.8□□□□□ -1.64
RABGGTAQ92696 AC044792.1-201ENST00000593294 196 ntBASIC4.8□□□□□ -1.64
RABGGTAQ92696 ZNF28-207ENST00000594602 684 ntTSL 5 BASIC4.8□□□□□ -1.64
RABGGTAQ92696 NRBF2P5-201ENST00000603087 788 ntBASIC4.8□□□□□ -1.64
RABGGTAQ92696 AC010680.3-201ENST00000604215 520 ntBASIC4.8□□□□□ -1.64
RABGGTAQ92696 MIR98-201ENST00000606724 119 ntBASIC4.8□□□□□ -1.64
RABGGTAQ92696 RNU6-87P-201ENST00000607561 108 ntBASIC4.8□□□□□ -1.64
RABGGTAQ92696 AL445567.2-201ENST00000618935 498 ntBASIC4.8□□□□□ -1.64
RABGGTAQ92696 AC233309.1-201ENST00000619522 751 ntBASIC4.8□□□□□ -1.64
RABGGTAQ92696 ZNF345-216ENST00000640438 963 ntTSL 5 BASIC4.8□□□□□ -1.64
RABGGTAQ92696 RIMS1-204ENST00000401910 3542 ntTSL 2 BASIC4.8□□□□□ -1.64
RABGGTAQ92696 OR9H1P-201ENST00000446393 4888 ntAPPRIS P1 BASIC4.8□□□□□ -1.64
RABGGTAQ92696 SOS1-202ENST00000402219 8314 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC4.8□□□□□ -1.64
RABGGTAQ92696 SENP7-202ENST00000348610 3272 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.8□□□□□ -1.64
RABGGTAQ92696 ADAM5-201ENST00000359790 1663 ntTSL 1 (best) BASIC4.8□□□□□ -1.64
RABGGTAQ92696 NRK-204ENST00000540278 1687 ntTSL 2 BASIC4.8□□□□□ -1.64
RABGGTAQ92696 SCAI-201ENST00000336505 12079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.79□□□□□ -1.64
RABGGTAQ92696 CARF-208ENST00000428585 2513 ntTSL 2 BASIC4.79□□□□□ -1.64
RABGGTAQ92696 TMEM106B-201ENST00000396667 12539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.79□□□□□ -1.64
RABGGTAQ92696 IL18R1-202ENST00000334376 537 ntTSL 1 (best) BASIC4.79□□□□□ -1.64
RABGGTAQ92696 SNORD56.2-201ENST00000363242 71 ntBASIC4.79□□□□□ -1.64
RABGGTAQ92696 RNU1-132P-201ENST00000364300 164 ntBASIC4.79□□□□□ -1.64
RABGGTAQ92696 Y_RNA.263-201ENST00000364659 114 ntBASIC4.79□□□□□ -1.64
RABGGTAQ92696 Y_RNA.356-201ENST00000365475 113 ntBASIC4.79□□□□□ -1.64
RABGGTAQ92696 RNU6-116P-201ENST00000384042 109 ntBASIC4.79□□□□□ -1.64
RABGGTAQ92696 RNU6-921P-201ENST00000384361 107 ntBASIC4.79□□□□□ -1.64
RABGGTAQ92696 EIF5P1-201ENST00000400019 1231 ntBASIC4.79□□□□□ -1.64
RABGGTAQ92696 RNU6-603P-201ENST00000411403 107 ntBASIC4.79□□□□□ -1.64
RABGGTAQ92696 AC127391.1-201ENST00000411737 98 ntBASIC4.79□□□□□ -1.64
RABGGTAQ92696 TTTY17A-201ENST00000416110 166 ntTSL 1 (best) BASIC4.79□□□□□ -1.64
RABGGTAQ92696 AL672277.1-201ENST00000420865 588 ntTSL 2 BASIC4.79□□□□□ -1.64
RABGGTAQ92696 TTTY17C-201ENST00000421387 166 ntTSL 1 (best) BASIC4.79□□□□□ -1.64
RABGGTAQ92696 LINC01074-201ENST00000422527 555 ntTSL 3 BASIC4.79□□□□□ -1.64
RABGGTAQ92696 AL589986.2-201ENST00000429352 397 ntTSL 2 BASIC4.79□□□□□ -1.64
RABGGTAQ92696 AC104850.1-201ENST00000435940 476 ntBASIC4.79□□□□□ -1.64
RABGGTAQ92696 AC004485.1-201ENST00000439839 527 ntTSL 5 BASIC4.79□□□□□ -1.64
RABGGTAQ92696 TTTY17B-201ENST00000441906 166 ntTSL 1 (best) BASIC4.79□□□□□ -1.64
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RABGGTAQ92696 AC004888.1-201ENST00000450480 547 ntTSL 2 BASIC4.79□□□□□ -1.64
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RABGGTAQ92696 AC053481.1-201ENST00000467217 306 ntBASIC4.79□□□□□ -1.64
RABGGTAQ92696 CREM-226ENST00000469949 721 ntTSL 3 BASIC4.79□□□□□ -1.64
RABGGTAQ92696 RC3H2-207ENST00000471874 749 ntTSL 1 (best) BASIC4.79□□□□□ -1.64
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RABGGTAQ92696 F8-202ENST00000360256 9059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.79□□□□□ -1.64
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RABGGTAQ92696 N4BP2L2-201ENST00000267068 9427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.79□□□□□ -1.64
RABGGTAQ92696 PHF20L1-210ENST00000395390 5900 ntTSL 5 BASIC4.79□□□□□ -1.64
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RABGGTAQ92696 POLR2B-203ENST00000431623 3666 ntTSL 2 BASIC4.78□□□□□ -1.64
RABGGTAQ92696 NEDD4-201ENST00000338963 7019 ntTSL 1 (best) BASIC4.78□□□□□ -1.64
RABGGTAQ92696 LPAR6-209ENST00000620633 2175 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.78□□□□□ -1.64
RABGGTAQ92696 MAPK10-206ENST00000395161 4186 ntTSL 5 BASIC4.78□□□□□ -1.64
RABGGTAQ92696 FAM169A-201ENST00000389156 5990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.78□□□□□ -1.64
RABGGTAQ92696 FAT3-204ENST00000525166 18699 ntTSL 5 BASIC4.78□□□□□ -1.64
RABGGTAQ92696 RIMS1-212ENST00000517827 3065 ntTSL 2 BASIC4.78□□□□□ -1.64
RABGGTAQ92696 KATNA1-202ENST00000335647 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.78□□□□□ -1.64
RABGGTAQ92696 DEFB114-201ENST00000322066 253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.78□□□□□ -1.64
RABGGTAQ92696 RPL23AP57-201ENST00000332361 466 ntBASIC4.78□□□□□ -1.64
RABGGTAQ92696 DEFB125-201ENST00000382410 587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.78□□□□□ -1.64
RABGGTAQ92696 RPL31P1-201ENST00000398116 372 ntBASIC4.78□□□□□ -1.64
RABGGTAQ92696 AL603766.1-201ENST00000407763 664 ntBASIC4.78□□□□□ -1.64
RABGGTAQ92696 RPS20P14-201ENST00000412545 360 ntBASIC4.78□□□□□ -1.64
RABGGTAQ92696 RPL23AP26-201ENST00000412728 464 ntBASIC4.78□□□□□ -1.64
RABGGTAQ92696 RPS23P10-201ENST00000416185 486 ntBASIC4.78□□□□□ -1.64
RABGGTAQ92696 AL353193.1-201ENST00000421444 268 ntBASIC4.78□□□□□ -1.64
RABGGTAQ92696 AC105399.1-201ENST00000422418 418 ntTSL 2 BASIC4.78□□□□□ -1.64
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