Protein–RNA interactions for Protein: Q6R2W3

ZBED9, SCAN domain-containing protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 1,325 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZBED9Q6R2W3 SNORA36C-201ENST00000384289 132 ntBASIC2.92□□□□□ -1.94
ZBED9Q6R2W3 BPIFC-202ENST00000397450 458 ntTSL 1 (best) BASIC2.92□□□□□ -1.94
ZBED9Q6R2W3 LINC02532-205ENST00000430094 628 ntTSL 5 BASIC2.92□□□□□ -1.94
ZBED9Q6R2W3 TCF7L1-IT1-201ENST00000433581 458 ntTSL 3 BASIC2.92□□□□□ -1.94
ZBED9Q6R2W3 RPL21P112-201ENST00000434403 463 ntBASIC2.92□□□□□ -1.94
ZBED9Q6R2W3 OR51B8P-201ENST00000449892 769 ntBASIC2.92□□□□□ -1.94
ZBED9Q6R2W3 HMGB1P26-201ENST00000452520 628 ntBASIC2.92□□□□□ -1.94
ZBED9Q6R2W3 AP002345.1-201ENST00000456493 928 ntBASIC2.92□□□□□ -1.94
ZBED9Q6R2W3 SATB1-216ENST00000491519 1000 ntTSL 2 BASIC2.92□□□□□ -1.94
ZBED9Q6R2W3 FABP5P6-201ENST00000510588 409 ntBASIC2.92□□□□□ -1.94
ZBED9Q6R2W3 AC114284.1-201ENST00000511422 1114 ntTSL 2 BASIC2.92□□□□□ -1.94
ZBED9Q6R2W3 AC117525.1-201ENST00000515228 503 ntBASIC2.92□□□□□ -1.94
ZBED9Q6R2W3 AC083973.1-205ENST00000518994 601 ntTSL 2 BASIC2.92□□□□□ -1.94
ZBED9Q6R2W3 AC027807.1-201ENST00000559921 996 ntBASIC2.92□□□□□ -1.94
ZBED9Q6R2W3 AC018904.1-201ENST00000560594 542 ntTSL 3 BASIC2.92□□□□□ -1.94
ZBED9Q6R2W3 ACTR3BP3-201ENST00000565577 979 ntBASIC2.92□□□□□ -1.94
ZBED9Q6R2W3 AC007610.2-201ENST00000566770 666 ntTSL 3 BASIC2.92□□□□□ -1.94
ZBED9Q6R2W3 AP001029.3-201ENST00000588063 596 ntBASIC2.92□□□□□ -1.94
ZBED9Q6R2W3 DUXAP4-201ENST00000603046 613 ntBASIC2.92□□□□□ -1.94
ZBED9Q6R2W3 BX322635.1-201ENST00000605804 496 ntBASIC2.92□□□□□ -1.94
ZBED9Q6R2W3 MIR6864-201ENST00000617935 70 ntBASIC2.92□□□□□ -1.94
ZBED9Q6R2W3 AC025034.2-201ENST00000623264 286 ntBASIC2.92□□□□□ -1.94
ZBED9Q6R2W3 AC007405.1-203ENST00000623667 932 ntTSL 5 BASIC2.92□□□□□ -1.94
ZBED9Q6R2W3 AP000553.5-201ENST00000641933 54 ntBASIC2.92□□□□□ -1.94
ZBED9Q6R2W3 AC046144.1-201ENST00000478559 1853 ntBASIC2.91□□□□□ -1.94
ZBED9Q6R2W3 MYOT-202ENST00000421631 1474 ntTSL 2 BASIC2.91□□□□□ -1.94
ZBED9Q6R2W3 TLK1-206ENST00000434911 2156 ntTSL 2 BASIC2.91□□□□□ -1.94
ZBED9Q6R2W3 WDFY3-AS2-202ENST00000451762 5814 ntTSL 3 BASIC2.91□□□□□ -1.94
ZBED9Q6R2W3 DEFB112-201ENST00000322246 342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.91□□□□□ -1.94
ZBED9Q6R2W3 AC083799.1-201ENST00000366451 910 ntBASIC2.91□□□□□ -1.94
ZBED9Q6R2W3 RNU2-21P-201ENST00000410368 188 ntBASIC2.91□□□□□ -1.94
ZBED9Q6R2W3 ZNF92P1Y-201ENST00000415010 1191 ntBASIC2.91□□□□□ -1.94
ZBED9Q6R2W3 EI24P1-201ENST00000416584 867 ntBASIC2.91□□□□□ -1.94
ZBED9Q6R2W3 MYL8P-204ENST00000431574 518 ntBASIC2.91□□□□□ -1.94
ZBED9Q6R2W3 AC005160.1-201ENST00000432405 381 ntTSL 3 BASIC2.91□□□□□ -1.94
ZBED9Q6R2W3 RPS15AP7-201ENST00000439294 405 ntBASIC2.91□□□□□ -1.94
ZBED9Q6R2W3 ARL5AP3-201ENST00000439327 386 ntBASIC2.91□□□□□ -1.94
ZBED9Q6R2W3 Z99127.2-201ENST00000441426 334 ntBASIC2.91□□□□□ -1.94
ZBED9Q6R2W3 DNAJC19P8-201ENST00000452887 259 ntBASIC2.91□□□□□ -1.94
ZBED9Q6R2W3 AL606519.1-201ENST00000458146 580 ntTSL 2 BASIC2.91□□□□□ -1.94
ZBED9Q6R2W3 AC096992.1-201ENST00000459808 709 ntBASIC2.91□□□□□ -1.94
ZBED9Q6R2W3 HMGN2P13-201ENST00000476476 274 ntBASIC2.91□□□□□ -1.94
ZBED9Q6R2W3 AC099520.1-203ENST00000506976 464 ntTSL 3 BASIC2.91□□□□□ -1.94
ZBED9Q6R2W3 IGKV2-36-201ENST00000519999 223 ntBASIC2.91□□□□□ -1.94
ZBED9Q6R2W3 AC025434.1-201ENST00000520705 460 ntTSL 3 BASIC2.91□□□□□ -1.94
ZBED9Q6R2W3 MTND2P26-201ENST00000528255 1029 ntBASIC2.91□□□□□ -1.94
ZBED9Q6R2W3 AC091053.2-201ENST00000534169 537 ntTSL 4 BASIC2.91□□□□□ -1.94
ZBED9Q6R2W3 AP005205.1-201ENST00000563503 508 ntBASIC2.91□□□□□ -1.94
ZBED9Q6R2W3 MTATP6P25-201ENST00000574491 261 ntBASIC2.91□□□□□ -1.94
ZBED9Q6R2W3 AC002115.1-201ENST00000589603 568 ntTSL 4 BASIC2.91□□□□□ -1.94
ZBED9Q6R2W3 TEX41-222ENST00000597173 1134 ntTSL 1 (best) BASIC2.91□□□□□ -1.94
ZBED9Q6R2W3 SNRPGP15-201ENST00000600149 222 ntBASIC2.91□□□□□ -1.94
ZBED9Q6R2W3 AL596220.1-201ENST00000622121 542 ntTSL 4 BASIC2.91□□□□□ -1.94
ZBED9Q6R2W3 AC119674.1-220ENST00000641502 1048 ntBASIC2.91□□□□□ -1.94
ZBED9Q6R2W3 C6orf10-201ENST00000375007 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.9□□□□□ -1.94
ZBED9Q6R2W3 UHMK1-204ENST00000545294 8117 ntTSL 2 BASIC2.9□□□□□ -1.94
ZBED9Q6R2W3 OR11H4-202ENST00000641082 1585 ntAPPRIS P1 BASIC2.9□□□□□ -1.95
ZBED9Q6R2W3 SNORA7.2-201ENST00000364446 145 ntBASIC2.9□□□□□ -1.95
ZBED9Q6R2W3 RNA5SP37-201ENST00000365420 130 ntBASIC2.9□□□□□ -1.95
ZBED9Q6R2W3 MIR7-1-201ENST00000384871 110 ntBASIC2.9□□□□□ -1.95
ZBED9Q6R2W3 MIR221-201ENST00000385135 110 ntBASIC2.9□□□□□ -1.95
ZBED9Q6R2W3 SNORA48.3-201ENST00000391081 134 ntBASIC2.9□□□□□ -1.95
ZBED9Q6R2W3 RPS4XP7-201ENST00000406274 780 ntBASIC2.9□□□□□ -1.95
ZBED9Q6R2W3 RNA5SP338-201ENST00000410495 85 ntBASIC2.9□□□□□ -1.95
ZBED9Q6R2W3 AC105402.1-201ENST00000413336 545 ntBASIC2.9□□□□□ -1.95
ZBED9Q6R2W3 AC079799.1-201ENST00000430696 331 ntTSL 3 BASIC2.9□□□□□ -1.95
ZBED9Q6R2W3 AL591719.1-201ENST00000444669 744 ntBASIC2.9□□□□□ -1.95
ZBED9Q6R2W3 AL118520.1-201ENST00000450770 291 ntBASIC2.9□□□□□ -1.95
ZBED9Q6R2W3 SEM1P1-201ENST00000506694 209 ntBASIC2.9□□□□□ -1.95
ZBED9Q6R2W3 HMGB1P47-201ENST00000511281 589 ntBASIC2.9□□□□□ -1.95
ZBED9Q6R2W3 RNA5SP200-201ENST00000516360 103 ntBASIC2.9□□□□□ -1.95
ZBED9Q6R2W3 LINC01603-201ENST00000517343 1134 ntTSL 2 BASIC2.9□□□□□ -1.95
ZBED9Q6R2W3 IGLV3-17-201ENST00000519099 244 ntBASIC2.9□□□□□ -1.95
ZBED9Q6R2W3 AC023796.1-201ENST00000536131 670 ntTSL 3 BASIC2.9□□□□□ -1.95
ZBED9Q6R2W3 AC117377.1-201ENST00000547633 1038 ntTSL 1 (best) BASIC2.9□□□□□ -1.95
ZBED9Q6R2W3 AC067805.1-201ENST00000559344 470 ntBASIC2.9□□□□□ -1.95
ZBED9Q6R2W3 LAMTOR5-AS1-203ENST00000585330 463 ntTSL 2 BASIC2.9□□□□□ -1.95
ZBED9Q6R2W3 DNAJC19P3-201ENST00000594491 331 ntBASIC2.9□□□□□ -1.95
ZBED9Q6R2W3 OR4C16-201ENST00000623907 933 ntAPPRIS P1 BASIC2.9□□□□□ -1.95
ZBED9Q6R2W3 MIR4496-201ENST00000635896 61 ntBASIC2.9□□□□□ -1.95
ZBED9Q6R2W3 MTCO1P24-201ENST00000515438 1558 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
ZBED9Q6R2W3 SI-201ENST00000264382 6011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.89□□□□□ -1.95
ZBED9Q6R2W3 MAPK8-202ENST00000374174 739 ntTSL 3 BASIC2.89□□□□□ -1.95
ZBED9Q6R2W3 PPP3R1-202ENST00000409377 684 ntTSL 3 BASIC2.89□□□□□ -1.95
ZBED9Q6R2W3 ARHGAP15-202ENST00000409869 2968 ntTSL 5 BASIC2.89□□□□□ -1.95
ZBED9Q6R2W3 AC107081.1-201ENST00000414975 361 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
ZBED9Q6R2W3 AC234782.4-201ENST00000417646 1048 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
ZBED9Q6R2W3 RPS15AP40-201ENST00000419621 391 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
ZBED9Q6R2W3 AL357832.1-201ENST00000427460 420 ntTSL 3 BASIC2.89□□□□□ -1.95
ZBED9Q6R2W3 AC010157.1-201ENST00000440589 527 ntTSL 4 BASIC2.89□□□□□ -1.95
ZBED9Q6R2W3 AP000477.2-201ENST00000447405 778 ntTSL 3 BASIC2.89□□□□□ -1.95
ZBED9Q6R2W3 MTND3P4-201ENST00000453537 303 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
ZBED9Q6R2W3 RNU6-717P-201ENST00000459076 104 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
ZBED9Q6R2W3 RPL21P104-201ENST00000464143 478 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
ZBED9Q6R2W3 PGRMC2-203ENST00000503588 818 ntTSL 4 BASIC2.89□□□□□ -1.95
ZBED9Q6R2W3 AC017037.2-201ENST00000513850 890 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
ZBED9Q6R2W3 AC010226.1-203ENST00000515570 765 ntTSL 2 BASIC2.89□□□□□ -1.95
ZBED9Q6R2W3 RNU6-491P-201ENST00000516099 110 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
ZBED9Q6R2W3 AP000790.1-201ENST00000528891 737 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
ZBED9Q6R2W3 AC090092.1-201ENST00000530576 510 ntTSL 2 BASIC2.89□□□□□ -1.95
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 151.1 ms