Protein–RNA interactions for Protein: Q16849

PTPRN, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase-like N, humanhuman

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Length 979 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRNQ16849 LINC01844-201ENST00000432677 2237 ntTSL 1 (best) BASIC5.98□□□□□ -1.45
PTPRNQ16849 SPAM1-205ENST00000439500 2220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.98□□□□□ -1.45
PTPRNQ16849 CRB1-211ENST00000638467 4348 ntTSL 1 (best) BASIC5.98□□□□□ -1.45
PTPRNQ16849 PDE4D-202ENST00000317118 2599 ntTSL 1 (best) BASIC5.98□□□□□ -1.45
PTPRNQ16849 ANKRD49-208ENST00000544253 3002 ntTSL 1 (best) BASIC5.98□□□□□ -1.45
PTPRNQ16849 TLR6-201ENST00000381950 2938 ntAPPRIS P1 BASIC5.98□□□□□ -1.45
PTPRNQ16849 NFE2L2-206ENST00000446151 2399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.98□□□□□ -1.45
PTPRNQ16849 PUS10-203ENST00000407787 1820 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.98□□□□□ -1.45
PTPRNQ16849 SLC4A10-204ENST00000421911 3398 ntTSL 5 BASIC5.98□□□□□ -1.45
PTPRNQ16849 SNORD81.1-201ENST00000363064 77 ntBASIC5.98□□□□□ -1.45
PTPRNQ16849 RNU6-817P-201ENST00000391083 104 ntBASIC5.98□□□□□ -1.45
PTPRNQ16849 HSPE1P8-201ENST00000406997 288 ntBASIC5.98□□□□□ -1.45
PTPRNQ16849 RNU6-1140P-201ENST00000410517 106 ntBASIC5.98□□□□□ -1.45
PTPRNQ16849 RAD23B-202ENST00000416373 3835 ntTSL 1 (best) BASIC5.98□□□□□ -1.45
PTPRNQ16849 AL391807.1-202ENST00000419979 534 ntTSL 2 BASIC5.98□□□□□ -1.45
PTPRNQ16849 AL159987.2-201ENST00000432754 307 ntBASIC5.98□□□□□ -1.45
PTPRNQ16849 LINC02528-202ENST00000434437 535 ntTSL 2 BASIC5.98□□□□□ -1.45
PTPRNQ16849 SIRPG-AS1-201ENST00000437384 410 ntTSL 3 BASIC5.98□□□□□ -1.45
PTPRNQ16849 AC239809.1-201ENST00000450470 217 ntBASIC5.98□□□□□ -1.45
PTPRNQ16849 RNU7-120P-201ENST00000459334 63 ntBASIC5.98□□□□□ -1.45
PTPRNQ16849 RPS17P15-201ENST00000475609 349 ntBASIC5.98□□□□□ -1.45
PTPRNQ16849 AC006539.1-201ENST00000481419 501 ntBASIC5.98□□□□□ -1.45
PTPRNQ16849 AC138965.1-202ENST00000502354 547 ntTSL 5 BASIC5.98□□□□□ -1.45
PTPRNQ16849 AC140125.3-201ENST00000505248 547 ntTSL 4 BASIC5.98□□□□□ -1.45
PTPRNQ16849 OR51K1P-201ENST00000510214 950 ntBASIC5.98□□□□□ -1.45
PTPRNQ16849 AC067942.3-201ENST00000512025 362 ntBASIC5.98□□□□□ -1.45
PTPRNQ16849 AC007016.1-201ENST00000512110 244 ntBASIC5.98□□□□□ -1.45
PTPRNQ16849 AC096577.1-202ENST00000515649 448 ntTSL 3 BASIC5.98□□□□□ -1.45
PTPRNQ16849 RNA5SP362-201ENST00000516048 118 ntBASIC5.98□□□□□ -1.45
PTPRNQ16849 IGKV2D-36-201ENST00000518643 226 ntBASIC5.98□□□□□ -1.45
PTPRNQ16849 AC087441.2-201ENST00000529141 262 ntBASIC5.98□□□□□ -1.45
PTPRNQ16849 HIGD1AP5-201ENST00000529959 259 ntBASIC5.98□□□□□ -1.45
PTPRNQ16849 MYL6-213ENST00000549017 502 ntTSL 3 BASIC5.98□□□□□ -1.45
PTPRNQ16849 HNRNPCP4-201ENST00000571636 900 ntBASIC5.98□□□□□ -1.45
PTPRNQ16849 AC010547.6-201ENST00000571789 193 ntBASIC5.98□□□□□ -1.45
PTPRNQ16849 RN7SL652P-201ENST00000577769 300 ntBASIC5.98□□□□□ -1.45
PTPRNQ16849 GAPLINC-202ENST00000579007 643 ntTSL 3 BASIC5.98□□□□□ -1.45
PTPRNQ16849 SDR42E1P1-201ENST00000611327 477 ntBASIC5.98□□□□□ -1.45
PTPRNQ16849 AL139099.4-201ENST00000614802 114 ntBASIC5.98□□□□□ -1.45
PTPRNQ16849 SMAD5-AS1_4.1-201ENST00000615561 167 ntBASIC5.98□□□□□ -1.45
PTPRNQ16849 MIR6130-201ENST00000619419 109 ntBASIC5.98□□□□□ -1.45
PTPRNQ16849 OR2H1-201ENST00000377132 2253 ntAPPRIS P1 BASIC5.98□□□□□ -1.45
PTPRNQ16849 ADGRL3-218ENST00000514996 4731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.98□□□□□ -1.45
PTPRNQ16849 ADGRL3-210ENST00000508946 4758 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.98□□□□□ -1.45
PTPRNQ16849 THEMIS-206ENST00000630369 2786 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.98□□□□□ -1.45
PTPRNQ16849 FANCD2-203ENST00000419585 5185 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.98□□□□□ -1.45
PTPRNQ16849 PREPL-216ENST00000541738 6049 ntTSL 2 BASIC5.98□□□□□ -1.45
PTPRNQ16849 VPS13B-203ENST00000358544 14094 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC5.98□□□□□ -1.45
PTPRNQ16849 AL606537.1-201ENST00000607258 2011 ntBASIC5.98□□□□□ -1.45
PTPRNQ16849 MSANTD2-204ENST00000526629 3086 ntTSL 1 (best) BASIC5.97□□□□□ -1.45
PTPRNQ16849 EDA2R-203ENST00000396050 3429 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.97□□□□□ -1.45
PTPRNQ16849 SYTL2-204ENST00000389958 1943 ntTSL 2 BASIC5.97□□□□□ -1.45
PTPRNQ16849 RASGRP1-203ENST00000450598 2296 ntTSL 1 (best) BASIC5.97□□□□□ -1.45
PTPRNQ16849 AP000560.1-201ENST00000624150 1937 ntBASIC5.97□□□□□ -1.45
PTPRNQ16849 OR10A6-203ENST00000641238 6052 ntAPPRIS P1 BASIC5.97□□□□□ -1.45
PTPRNQ16849 PYHIN1-203ENST00000368140 2083 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC5.97□□□□□ -1.45
PTPRNQ16849 PPP2R5A-205ENST00000537030 1719 ntTSL 2 BASIC5.97□□□□□ -1.45
PTPRNQ16849 ANO4-201ENST00000392977 3509 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.97□□□□□ -1.45
PTPRNQ16849 BCL2L14-213ENST00000589718 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.97□□□□□ -1.45
PTPRNQ16849 OR5J2-201ENST00000312298 939 ntAPPRIS P1 BASIC5.97□□□□□ -1.45
PTPRNQ16849 MT-TC-201ENST00000387405 66 ntBASIC5.97□□□□□ -1.45
PTPRNQ16849 TRAV26-2-201ENST00000390460 327 ntAPPRIS P1 BASIC5.97□□□□□ -1.45
PTPRNQ16849 AC092447.6-201ENST00000414578 210 ntBASIC5.97□□□□□ -1.45
PTPRNQ16849 AL391219.1-201ENST00000422570 483 ntBASIC5.97□□□□□ -1.45
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PTPRNQ16849 AL445305.1-201ENST00000432577 575 ntBASIC5.97□□□□□ -1.45
PTPRNQ16849 LINC01698-201ENST00000443636 727 ntTSL 3 BASIC5.97□□□□□ -1.45
PTPRNQ16849 AL353804.1-201ENST00000444482 451 ntTSL 5 BASIC5.97□□□□□ -1.45
PTPRNQ16849 AL589765.1-201ENST00000457548 386 ntTSL 2 BASIC5.97□□□□□ -1.45
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PTPRNQ16849 APOA2-210ENST00000491350 263 ntTSL 1 (best) BASIC5.97□□□□□ -1.45
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PTPRNQ16849 AC083973.1-205ENST00000518994 601 ntTSL 2 BASIC5.97□□□□□ -1.45
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PTPRNQ16849 RNF138P2-201ENST00000603490 592 ntBASIC5.97□□□□□ -1.45
PTPRNQ16849 AC243829.4-202ENST00000610845 410 ntTSL 5 BASIC5.97□□□□□ -1.45
PTPRNQ16849 AC239809.3-208ENST00000611452 531 ntTSL 5 BASIC5.97□□□□□ -1.45
PTPRNQ16849 RN7SL544P-201ENST00000617232 284 ntBASIC5.97□□□□□ -1.45
PTPRNQ16849 RN7SL763P-201ENST00000620922 284 ntBASIC5.97□□□□□ -1.45
PTPRNQ16849 AJ009632.2-204ENST00000635621 1401 ntTSL 5 BASIC5.97□□□□□ -1.45
PTPRNQ16849 CHST9-203ENST00000618847 11388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.97□□□□□ -1.45
PTPRNQ16849 ZFX-202ENST00000338565 2906 ntTSL 5 BASIC5.97□□□□□ -1.45
PTPRNQ16849 EXO1-201ENST00000348581 3192 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.97□□□□□ -1.45
PTPRNQ16849 ZNF266-207ENST00000592904 4401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.97□□□□□ -1.45
PTPRNQ16849 IL1RL1-201ENST00000233954 2058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.97□□□□□ -1.45
PTPRNQ16849 AC010329.2-201ENST00000595195 2737 ntBASIC5.97□□□□□ -1.45
PTPRNQ16849 TOR1AIP2-206ENST00000609928 4364 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.97□□□□□ -1.45
PTPRNQ16849 AC020656.2-201ENST00000613291 5309 ntBASIC5.96□□□□□ -1.45
PTPRNQ16849 AP001148.1-201ENST00000624124 2359 ntBASIC5.96□□□□□ -1.45
PTPRNQ16849 AC109446.4-201ENST00000623235 2755 ntBASIC5.96□□□□□ -1.45
PTPRNQ16849 LZTFL1-215ENST00000536047 4342 ntTSL 2 BASIC5.96□□□□□ -1.45
PTPRNQ16849 ARHGEF12-213ENST00000532993 8753 ntTSL 1 (best) BASIC5.96□□□□□ -1.45
PTPRNQ16849 AC091534.1-201ENST00000548779 1751 ntTSL 2 BASIC5.96□□□□□ -1.46
PTPRNQ16849 ARIH1-201ENST00000379887 21681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.96□□□□□ -1.46
PTPRNQ16849 PARP8-212ENST00000505697 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.96□□□□□ -1.46
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