Protein–RNA interactions for Protein: Q16787

LAMA3, Laminin subunit alpha-3, humanhuman

Predictions only

Length 3,333 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LAMA3Q16787 LINC02399-201ENST00000547094 400 ntTSL 2 BASIC1.97□□□□□ -2.09
LAMA3Q16787 AC007495.2-202ENST00000564102 535 ntTSL 4 BASIC1.97□□□□□ -2.09
LAMA3Q16787 OR10AB1P-201ENST00000609613 938 ntBASIC1.97□□□□□ -2.09
LAMA3Q16787 AL589740.1-205ENST00000635561 565 ntTSL 5 BASIC1.97□□□□□ -2.09
LAMA3Q16787 OR5T1-201ENST00000641368 1118 ntAPPRIS P1 BASIC1.97□□□□□ -2.09
LAMA3Q16787 AL645939.4-201ENST00000604495 135 ntBASIC1.97□□□□□ -2.09
LAMA3Q16787 Metazoa_SRP.32-201ENST00000622685 286 ntBASIC1.97□□□□□ -2.09
LAMA3Q16787 ATP2B1-202ENST00000359142 6977 ntTSL 5 BASIC1.96□□□□□ -2.1
LAMA3Q16787 AFF2-IT1-201ENST00000435346 443 ntTSL 5 BASIC1.96□□□□□ -2.1
LAMA3Q16787 LINC01828-201ENST00000445514 531 ntTSL 4 BASIC1.96□□□□□ -2.1
LAMA3Q16787 AC006148.2-201ENST00000467017 650 ntTSL 2 BASIC1.96□□□□□ -2.1
LAMA3Q16787 POU5F1P7-201ENST00000508759 541 ntBASIC1.96□□□□□ -2.1
LAMA3Q16787 LNX1-AS1-202ENST00000510785 550 ntTSL 2 BASIC1.96□□□□□ -2.1
LAMA3Q16787 VWA8P1-201ENST00000510889 176 ntBASIC1.96□□□□□ -2.1
LAMA3Q16787 WDR61-205ENST00000558459 884 ntTSL 3 BASIC1.96□□□□□ -2.1
LAMA3Q16787 AC007001.1-201ENST00000590912 670 ntTSL 5 BASIC1.96□□□□□ -2.1
LAMA3Q16787 MIR7973-1-201ENST00000614683 76 ntBASIC1.96□□□□□ -2.1
LAMA3Q16787 SEPT7P7-201ENST00000420492 1301 ntBASIC1.96□□□□□ -2.1
LAMA3Q16787 ZNF678-202ENST00000397097 8212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.96□□□□□ -2.1
LAMA3Q16787 GLIPR1-201ENST00000266659 5877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.96□□□□□ -2.1
LAMA3Q16787 AP001148.1-201ENST00000624124 2359 ntBASIC1.96□□□□□ -2.1
LAMA3Q16787 RNU4-44P-201ENST00000363050 141 ntBASIC1.96□□□□□ -2.1
LAMA3Q16787 MIR598-201ENST00000384868 97 ntBASIC1.96□□□□□ -2.1
LAMA3Q16787 DENND6A-AS1-201ENST00000470427 364 ntTSL 2 BASIC1.96□□□□□ -2.1
LAMA3Q16787 AP000852.1-201ENST00000472460 573 ntBASIC1.96□□□□□ -2.1
LAMA3Q16787 AC021393.1-201ENST00000531077 433 ntTSL 3 BASIC1.96□□□□□ -2.1
LAMA3Q16787 AL355076.2-202ENST00000553754 574 ntTSL 4 BASIC1.96□□□□□ -2.1
LAMA3Q16787 AL442163.1-201ENST00000557251 515 ntTSL 5 BASIC1.96□□□□□ -2.1
LAMA3Q16787 AC103987.3-201ENST00000582071 292 ntBASIC1.96□□□□□ -2.1
LAMA3Q16787 OR51L1-203ENST00000641819 7300 ntAPPRIS P1 BASIC1.96□□□□□ -2.1
LAMA3Q16787 DSG2-AS1-202ENST00000583706 2024 ntTSL 5 BASIC1.96□□□□□ -2.1
LAMA3Q16787 RNU2-32P-201ENST00000411193 191 ntBASIC1.96□□□□□ -2.1
LAMA3Q16787 AC092185.1-201ENST00000491371 97 ntBASIC1.96□□□□□ -2.1
LAMA3Q16787 RPL23AP55-201ENST00000498163 452 ntBASIC1.96□□□□□ -2.1
LAMA3Q16787 ABCC9-206ENST00000621589 450 ntTSL 5 BASIC1.96□□□□□ -2.1
LAMA3Q16787 ARID2-206ENST00000457135 4356 ntTSL 1 (best) BASIC1.95□□□□□ -2.1
LAMA3Q16787 MAGI2-AS2-201ENST00000411616 476 ntTSL 2 BASIC1.95□□□□□ -2.1
LAMA3Q16787 MTCYBP31-201ENST00000438855 1122 ntBASIC1.95□□□□□ -2.1
LAMA3Q16787 AL356124.2-201ENST00000442449 391 ntTSL 5 BASIC1.95□□□□□ -2.1
LAMA3Q16787 AC245517.2-201ENST00000442890 346 ntBASIC1.95□□□□□ -2.1
LAMA3Q16787 SNORA25.15-201ENST00000516487 89 ntBASIC1.95□□□□□ -2.1
LAMA3Q16787 PARPBP-212ENST00000543784 992 ntTSL 2 BASIC1.95□□□□□ -2.1
LAMA3Q16787 AC078899.5-201ENST00000612475 178 ntBASIC1.95□□□□□ -2.1
LAMA3Q16787 ZNF720P1-201ENST00000562403 1939 ntBASIC1.95□□□□□ -2.1
LAMA3Q16787 AC010680.1-201ENST00000590024 3590 ntBASIC1.95□□□□□ -2.1
LAMA3Q16787 AL035604.1-201ENST00000416481 531 ntTSL 3 BASIC1.95□□□□□ -2.1
LAMA3Q16787 CALM1P2-201ENST00000452941 448 ntBASIC1.95□□□□□ -2.1
LAMA3Q16787 TTC39CP1-201ENST00000512513 755 ntBASIC1.95□□□□□ -2.1
LAMA3Q16787 AP005660.1-201ENST00000522972 293 ntBASIC1.95□□□□□ -2.1
LAMA3Q16787 FRYL-205ENST00000503238 11103 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.95□□□□□ -2.1
LAMA3Q16787 SYNE2-212ENST00000554584 20508 ntTSL 5 BASIC1.95□□□□□ -2.1
LAMA3Q16787 SNORA7.1-201ENST00000363750 139 ntBASIC1.94□□□□□ -2.1
LAMA3Q16787 DEFA7P-201ENST00000382676 285 ntBASIC1.94□□□□□ -2.1
LAMA3Q16787 MIR548J-201ENST00000408833 112 ntBASIC1.94□□□□□ -2.1
LAMA3Q16787 KRR1-202ENST00000438169 975 ntTSL 1 (best) BASIC1.94□□□□□ -2.1
LAMA3Q16787 AC020651.1-201ENST00000490324 360 ntTSL 3 BASIC1.94□□□□□ -2.1
LAMA3Q16787 AC067817.1-201ENST00000518535 356 ntTSL 2 BASIC1.94□□□□□ -2.1
LAMA3Q16787 AC110741.2-201ENST00000605278 268 ntBASIC1.94□□□□□ -2.1
LAMA3Q16787 AC105429.2-201ENST00000610567 517 ntBASIC1.94□□□□□ -2.1
LAMA3Q16787 LRRC6-212ENST00000618342 1754 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC1.94□□□□□ -2.1
LAMA3Q16787 AC002378.1-201ENST00000432360 298 ntTSL 3 BASIC1.94□□□□□ -2.1
LAMA3Q16787 PDCL2P2-201ENST00000533651 189 ntBASIC1.94□□□□□ -2.1
LAMA3Q16787 AL359233.1-201ENST00000554029 364 ntTSL 3 BASIC1.94□□□□□ -2.1
LAMA3Q16787 MIR151B-201ENST00000584249 96 ntBASIC1.94□□□□□ -2.1
LAMA3Q16787 AC013562.2-201ENST00000611632 603 ntBASIC1.94□□□□□ -2.1
LAMA3Q16787 SPANXN3-201ENST00000370503 590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.94□□□□□ -2.1
LAMA3Q16787 AL683807.1-202ENST00000432272 382 ntTSL 2 BASIC1.94□□□□□ -2.1
LAMA3Q16787 KATNBL1P3-201ENST00000443475 909 ntBASIC1.94□□□□□ -2.1
LAMA3Q16787 AL049552.1-201ENST00000444302 577 ntTSL 2 BASIC1.94□□□□□ -2.1
LAMA3Q16787 AC112695.1-201ENST00000504213 592 ntTSL 2 BASIC1.94□□□□□ -2.1
LAMA3Q16787 AC093767.1-201ENST00000504523 156 ntBASIC1.94□□□□□ -2.1
LAMA3Q16787 LINC02514-201ENST00000509058 498 ntTSL 3 BASIC1.94□□□□□ -2.1
LAMA3Q16787 AC016957.1-201ENST00000534895 309 ntBASIC1.94□□□□□ -2.1
LAMA3Q16787 AP000787.2-201ENST00000604432 568 ntBASIC1.94□□□□□ -2.1
LAMA3Q16787 CPXCR1-203ENST00000614120 1485 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC1.94□□□□□ -2.1
LAMA3Q16787 MTCO1P4-201ENST00000520516 1409 ntBASIC1.94□□□□□ -2.1
LAMA3Q16787 OR5V1-217ENST00000641768 2763 ntAPPRIS P1 BASIC1.93□□□□□ -2.1
LAMA3Q16787 ARPC3P1-201ENST00000437218 533 ntBASIC1.93□□□□□ -2.1
LAMA3Q16787 AL590652.1-201ENST00000453790 850 ntTSL 3 BASIC1.93□□□□□ -2.1
LAMA3Q16787 MIR6734-201ENST00000621166 68 ntBASIC1.93□□□□□ -2.1
LAMA3Q16787 AC025048.6-202ENST00000627667 438 ntBASIC1.93□□□□□ -2.1
LAMA3Q16787 AL133216.2-202ENST00000634512 349 ntBASIC1.93□□□□□ -2.1
LAMA3Q16787 AC084035.1-201ENST00000634543 607 ntBASIC1.93□□□□□ -2.1
LAMA3Q16787 MIR7153-201ENST00000637758 57 ntBASIC1.93□□□□□ -2.1
LAMA3Q16787 ASPM-202ENST00000367408 3747 ntTSL 1 (best) BASIC1.93□□□□□ -2.1
LAMA3Q16787 XPOTP1-201ENST00000443317 2398 ntBASIC1.93□□□□□ -2.1
LAMA3Q16787 NCSTNP1-201ENST00000406229 144 ntBASIC1.93□□□□□ -2.1
LAMA3Q16787 POLHP1-201ENST00000411806 470 ntBASIC1.93□□□□□ -2.1
LAMA3Q16787 MAGI1-AS1-201ENST00000472514 591 ntTSL 3 BASIC1.93□□□□□ -2.1
LAMA3Q16787 AC007513.1-201ENST00000548740 379 ntTSL 3 BASIC1.93□□□□□ -2.1
LAMA3Q16787 AC092138.2-201ENST00000563811 428 ntTSL 5 BASIC1.93□□□□□ -2.1
LAMA3Q16787 AC003973.1-201ENST00000600071 546 ntTSL 4 BASIC1.93□□□□□ -2.1
LAMA3Q16787 CNBD1-202ENST00000518476 1594 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC1.93□□□□□ -2.1
LAMA3Q16787 MTCO1P22-201ENST00000604619 1360 ntBASIC1.93□□□□□ -2.1
LAMA3Q16787 TTK-202ENST00000369798 3010 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC1.93□□□□□ -2.1
LAMA3Q16787 RNU2-20P-201ENST00000410425 191 ntBASIC1.92□□□□□ -2.1
LAMA3Q16787 RPL23AP39-201ENST00000415533 405 ntBASIC1.92□□□□□ -2.1
LAMA3Q16787 PAICSP7-201ENST00000419829 962 ntBASIC1.92□□□□□ -2.1
LAMA3Q16787 AC093151.3-203ENST00000422305 514 ntTSL 3 BASIC1.92□□□□□ -2.1
LAMA3Q16787 RPL39L-202ENST00000433055 749 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC1.92□□□□□ -2.1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 145.1 ms