Protein–RNA interactions for Protein: Q16518

RPE65, Retinoid isomerohydrolase, humanhuman

Predictions only

Length 533 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPE65Q16518 ZNF519P3-201ENST00000557158 1032 ntBASIC3.86□□□□□ -1.79
RPE65Q16518 LINC02562-201ENST00000561705 785 ntTSL 2 BASIC3.86□□□□□ -1.79
RPE65Q16518 AC034268.2-201ENST00000571784 482 ntBASIC3.86□□□□□ -1.79
RPE65Q16518 AC005899.4-201ENST00000581915 514 ntTSL 4 BASIC3.86□□□□□ -1.79
RPE65Q16518 AC005255.1-201ENST00000593748 216 ntBASIC3.86□□□□□ -1.79
RPE65Q16518 AC011451.2-201ENST00000604303 598 ntBASIC3.86□□□□□ -1.79
RPE65Q16518 AL365503.1-201ENST00000605247 905 ntBASIC3.86□□□□□ -1.79
RPE65Q16518 AL451086.1-201ENST00000605596 223 ntBASIC3.86□□□□□ -1.79
RPE65Q16518 OR10AB1P-201ENST00000609613 938 ntBASIC3.86□□□□□ -1.79
RPE65Q16518 AC131902.3-201ENST00000611767 581 ntBASIC3.86□□□□□ -1.79
RPE65Q16518 AC104010.1-201ENST00000616889 150 ntBASIC3.86□□□□□ -1.79
RPE65Q16518 RDM1-221ENST00000617591 432 ntTSL 1 (best) BASIC3.86□□□□□ -1.79
RPE65Q16518 AL603839.4-201ENST00000624658 1005 ntBASIC3.86□□□□□ -1.79
RPE65Q16518 CAPZA2-214ENST00000628758 525 ntTSL 5 BASIC3.86□□□□□ -1.79
RPE65Q16518 AC090337.1-201ENST00000579651 2074 ntBASIC3.86□□□□□ -1.79
RPE65Q16518 ADGRL2-208ENST00000370725 5293 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.86□□□□□ -1.79
RPE65Q16518 CRISP1-202ENST00000335847 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.85□□□□□ -1.79
RPE65Q16518 POU2F1-204ENST00000367866 13905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC3.85□□□□□ -1.79
RPE65Q16518 ASAH2-201ENST00000329428 2184 ntTSL 1 (best) BASIC3.85□□□□□ -1.79
RPE65Q16518 ETV1-202ENST00000399357 6096 ntTSL 2 BASIC3.85□□□□□ -1.79
RPE65Q16518 UBA6-201ENST00000322244 9564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.85□□□□□ -1.79
RPE65Q16518 FRG1BP-201ENST00000278882 761 ntBASIC3.85□□□□□ -1.79
RPE65Q16518 RNU6-1249P-201ENST00000363237 111 ntBASIC3.85□□□□□ -1.79
RPE65Q16518 LZIC-201ENST00000377213 945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.85□□□□□ -1.79
RPE65Q16518 KRTAP19-8-201ENST00000382822 318 ntAPPRIS P1 BASIC3.85□□□□□ -1.79
RPE65Q16518 SNX10-203ENST00000409367 746 ntTSL 5 BASIC3.85□□□□□ -1.79
RPE65Q16518 RNA5SP39-201ENST00000411245 120 ntBASIC3.85□□□□□ -1.79
RPE65Q16518 RPL7AP73-201ENST00000413490 353 ntBASIC3.85□□□□□ -1.79
RPE65Q16518 AC023669.2-201ENST00000436266 239 ntTSL 3 BASIC3.85□□□□□ -1.79
RPE65Q16518 AL451050.1-201ENST00000450126 415 ntBASIC3.85□□□□□ -1.79
RPE65Q16518 AC099794.1-201ENST00000450811 447 ntTSL 3 BASIC3.85□□□□□ -1.79
RPE65Q16518 HMGB1P25-201ENST00000468402 607 ntBASIC3.85□□□□□ -1.79
RPE65Q16518 PPIAP15-201ENST00000479662 484 ntBASIC3.85□□□□□ -1.79
RPE65Q16518 LARP1BP2-201ENST00000486594 519 ntBASIC3.85□□□□□ -1.79
RPE65Q16518 AC108062.1-201ENST00000505133 637 ntTSL 3 BASIC3.85□□□□□ -1.79
RPE65Q16518 AP002833.1-201ENST00000530572 566 ntTSL 3 BASIC3.85□□□□□ -1.79
RPE65Q16518 AC073655.2-202ENST00000547927 401 ntTSL 3 BASIC3.85□□□□□ -1.79
RPE65Q16518 AC090985.1-201ENST00000554440 480 ntTSL 2 BASIC3.85□□□□□ -1.79
RPE65Q16518 AC137800.2-201ENST00000574375 120 ntBASIC3.85□□□□□ -1.79
RPE65Q16518 AC093227.2-201ENST00000589357 285 ntBASIC3.85□□□□□ -1.79
RPE65Q16518 AC078795.2-201ENST00000602835 1252 ntBASIC3.85□□□□□ -1.79
RPE65Q16518 AL031176.1-201ENST00000604554 466 ntBASIC3.85□□□□□ -1.79
RPE65Q16518 AL109618.2-201ENST00000605527 211 ntBASIC3.85□□□□□ -1.79
RPE65Q16518 AC006566.1-201ENST00000608943 513 ntBASIC3.85□□□□□ -1.79
RPE65Q16518 OR6R2P-201ENST00000609216 300 ntBASIC3.85□□□□□ -1.79
RPE65Q16518 AC138749.5-201ENST00000611461 208 ntBASIC3.85□□□□□ -1.79
RPE65Q16518 AC116165.2-201ENST00000616705 206 ntBASIC3.85□□□□□ -1.79
RPE65Q16518 NRDE2-210ENST00000628832 132 ntTSL 5 BASIC3.85□□□□□ -1.79
RPE65Q16518 RPS4Y2-201ENST00000629237 792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.85□□□□□ -1.79
RPE65Q16518 AC084035.1-201ENST00000634543 607 ntBASIC3.85□□□□□ -1.79
RPE65Q16518 PTER-201ENST00000298942 3448 ntTSL 5 BASIC3.85□□□□□ -1.79
RPE65Q16518 CDH9-201ENST00000231021 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.85□□□□□ -1.79
RPE65Q16518 DENND2C-203ENST00000393277 4730 ntTSL 5 BASIC3.85□□□□□ -1.79
RPE65Q16518 ZNF962P-201ENST00000443465 3140 ntBASIC3.84□□□□□ -1.79
RPE65Q16518 FAP-214ENST00000627638 2569 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC3.84□□□□□ -1.79
RPE65Q16518 SUCNR1-201ENST00000362032 4181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.84□□□□□ -1.79
RPE65Q16518 TAB3-204ENST00000378932 3698 ntTSL 1 (best) BASIC3.84□□□□□ -1.79
RPE65Q16518 TRIQK-214ENST00000521988 3672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.84□□□□□ -1.79
RPE65Q16518 CRP-202ENST00000368110 667 ntTSL 3 BASIC3.84□□□□□ -1.79
RPE65Q16518 SNORD115.1-201ENST00000391109 76 ntBASIC3.84□□□□□ -1.79
RPE65Q16518 RPS20P2-201ENST00000402520 389 ntBASIC3.84□□□□□ -1.79
RPE65Q16518 AL445189.1-201ENST00000405722 338 ntBASIC3.84□□□□□ -1.79
RPE65Q16518 FCF1P10-201ENST00000407590 479 ntBASIC3.84□□□□□ -1.79
RPE65Q16518 AC092447.6-201ENST00000414578 210 ntBASIC3.84□□□□□ -1.79
RPE65Q16518 AC005009.1-201ENST00000423979 269 ntTSL 2 BASIC3.84□□□□□ -1.79
RPE65Q16518 AL451129.1-201ENST00000437471 285 ntTSL 3 BASIC3.84□□□□□ -1.79
RPE65Q16518 AL117336.1-201ENST00000439198 380 ntTSL 2 BASIC3.84□□□□□ -1.79
RPE65Q16518 AC007099.2-201ENST00000444852 336 ntTSL 5 BASIC3.84□□□□□ -1.79
RPE65Q16518 AL589684.1-201ENST00000445974 507 ntTSL 3 BASIC3.84□□□□□ -1.79
RPE65Q16518 RN7SL132P-201ENST00000478131 296 ntBASIC3.84□□□□□ -1.79
RPE65Q16518 ACTR3P3-201ENST00000480448 893 ntBASIC3.84□□□□□ -1.79
RPE65Q16518 RPL7P24-201ENST00000493052 752 ntBASIC3.84□□□□□ -1.79
RPE65Q16518 AP002075.1-201ENST00000505091 603 ntTSL 3 BASIC3.84□□□□□ -1.79
RPE65Q16518 AC008572.1-201ENST00000507269 442 ntTSL 5 BASIC3.84□□□□□ -1.79
RPE65Q16518 NPM1P41-201ENST00000512920 831 ntBASIC3.84□□□□□ -1.79
RPE65Q16518 LINC01969-201ENST00000514468 455 ntTSL 3 BASIC3.84□□□□□ -1.79
RPE65Q16518 LINC02492-204ENST00000515660 584 ntTSL 2 BASIC3.84□□□□□ -1.79
RPE65Q16518 RN7SKP298-201ENST00000515950 94 ntBASIC3.84□□□□□ -1.79
RPE65Q16518 RNU6-405P-201ENST00000516637 110 ntBASIC3.84□□□□□ -1.79
RPE65Q16518 MTCYBP20-201ENST00000524239 1129 ntBASIC3.84□□□□□ -1.79
RPE65Q16518 AP003392.2-201ENST00000527269 208 ntBASIC3.84□□□□□ -1.79
RPE65Q16518 AC103798.1-201ENST00000532562 376 ntTSL 2 BASIC3.84□□□□□ -1.79
RPE65Q16518 AP000777.1-201ENST00000541495 355 ntTSL 3 BASIC3.84□□□□□ -1.79
RPE65Q16518 AC079907.1-201ENST00000552707 374 ntTSL 3 BASIC3.84□□□□□ -1.79
RPE65Q16518 AL049779.1-201ENST00000553306 670 ntTSL 2 BASIC3.84□□□□□ -1.79
RPE65Q16518 AP005059.2-201ENST00000577527 578 ntTSL 3 BASIC3.84□□□□□ -1.79
RPE65Q16518 AC010649.1-203ENST00000592230 454 ntTSL 2 BASIC3.84□□□□□ -1.79
RPE65Q16518 AP001506.1-201ENST00000615444 211 ntBASIC3.84□□□□□ -1.79
RPE65Q16518 AC015540.1-201ENST00000615828 501 ntBASIC3.84□□□□□ -1.79
RPE65Q16518 AC012409.2-201ENST00000619812 751 ntTSL 5 BASIC3.84□□□□□ -1.79
RPE65Q16518 SEC23A-202ENST00000537403 4215 ntTSL 2 BASIC3.84□□□□□ -1.79
RPE65Q16518 AC024940.1-206ENST00000632817 4299 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC3.84□□□□□ -1.79
RPE65Q16518 NKTR-219ENST00000617821 7319 ntTSL 5 BASIC3.84□□□□□ -1.8
RPE65Q16518 CFHR4-204ENST00000608469 1601 ntTSL 1 (best) BASIC3.84□□□□□ -1.8
RPE65Q16518 MTTP-201ENST00000265517 4037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.84□□□□□ -1.8
RPE65Q16518 LINC00283-201ENST00000430111 1947 ntTSL 5 BASIC3.83□□□□□ -1.8
RPE65Q16518 FAM208A-202ENST00000431842 7119 ntTSL 1 (best) BASIC3.83□□□□□ -1.8
RPE65Q16518 AC244517.1-201ENST00000606030 2086 ntBASIC3.83□□□□□ -1.8
RPE65Q16518 DDX60L-201ENST00000260184 6754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.83□□□□□ -1.8
RPE65Q16518 NCOA1-202ENST00000348332 6895 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC3.83□□□□□ -1.8
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 95.6 ms