Protein–RNA interactions for Protein: Q15699

ALX1, ALX homeobox protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 326 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ALX1Q15699 SNORA3.2-201ENST00000408221 125 ntBASIC2.68□□□□□ -1.98
ALX1Q15699 RNA5SP38-201ENST00000410750 119 ntBASIC2.68□□□□□ -1.98
ALX1Q15699 AC007064.1-201ENST00000412238 351 ntBASIC2.68□□□□□ -1.98
ALX1Q15699 AL139413.1-201ENST00000421309 217 ntBASIC2.68□□□□□ -1.98
ALX1Q15699 AP000477.2-201ENST00000447405 778 ntTSL 3 BASIC2.68□□□□□ -1.98
ALX1Q15699 HMGN1P5-201ENST00000448591 263 ntBASIC2.68□□□□□ -1.98
ALX1Q15699 ARNTL2-AS1-201ENST00000500498 804 ntTSL 1 (best) BASIC2.68□□□□□ -1.98
ALX1Q15699 IGKV2-36-201ENST00000519999 223 ntBASIC2.68□□□□□ -1.98
ALX1Q15699 AC021979.1-201ENST00000553822 336 ntTSL 3 BASIC2.68□□□□□ -1.98
ALX1Q15699 AC012409.1-202ENST00000558449 639 ntTSL 2 BASIC2.68□□□□□ -1.98
ALX1Q15699 MIR548Y-201ENST00000582739 110 ntBASIC2.68□□□□□ -1.98
ALX1Q15699 LINC00458-206ENST00000607494 849 ntTSL 3 BASIC2.68□□□□□ -1.98
ALX1Q15699 UBE2Q2P2-203ENST00000613592 761 ntBASIC2.68□□□□□ -1.98
ALX1Q15699 AC026523.1-201ENST00000617221 490 ntTSL 5 BASIC2.68□□□□□ -1.98
ALX1Q15699 AC009831.4-201ENST00000620744 325 ntBASIC2.68□□□□□ -1.98
ALX1Q15699 AC020923.1-201ENST00000624021 917 ntBASIC2.68□□□□□ -1.98
ALX1Q15699 AC103798.2-201ENST00000624292 632 ntBASIC2.68□□□□□ -1.98
ALX1Q15699 AC012594.1-272ENST00000625790 710 ntTSL 5 BASIC2.68□□□□□ -1.98
ALX1Q15699 ZNF37BP-203ENST00000452306 1352 ntBASIC2.68□□□□□ -1.98
ALX1Q15699 PABPC1P7-201ENST00000413177 1513 ntBASIC2.68□□□□□ -1.98
ALX1Q15699 ELF2P3-201ENST00000445099 1506 ntBASIC2.68□□□□□ -1.98
ALX1Q15699 RGS22-214ENST00000523287 4033 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC2.67□□□□□ -1.98
ALX1Q15699 OR6C76-201ENST00000328314 939 ntAPPRIS P1 BASIC2.67□□□□□ -1.98
ALX1Q15699 RNA5SP126-201ENST00000365092 109 ntBASIC2.67□□□□□ -1.98
ALX1Q15699 RNU6-629P-201ENST00000384061 103 ntBASIC2.67□□□□□ -1.98
ALX1Q15699 RNU1-138P-201ENST00000384093 164 ntBASIC2.67□□□□□ -1.98
ALX1Q15699 TRAV8-1-201ENST00000390430 473 ntAPPRIS P1 BASIC2.67□□□□□ -1.98
ALX1Q15699 AL356057.2-201ENST00000403318 432 ntBASIC2.67□□□□□ -1.98
ALX1Q15699 AC092638.1-201ENST00000411966 1275 ntBASIC2.67□□□□□ -1.98
ALX1Q15699 AC105402.1-201ENST00000413336 545 ntBASIC2.67□□□□□ -1.98
ALX1Q15699 AL035407.1-201ENST00000429211 571 ntBASIC2.67□□□□□ -1.98
ALX1Q15699 AL356320.1-201ENST00000429616 163 ntBASIC2.67□□□□□ -1.98
ALX1Q15699 AC023590.1-204ENST00000434023 431 ntTSL 5 BASIC2.67□□□□□ -1.98
ALX1Q15699 AL359878.2-201ENST00000435531 407 ntTSL 3 BASIC2.67□□□□□ -1.98
ALX1Q15699 AC105914.1-201ENST00000511798 226 ntBASIC2.67□□□□□ -1.98
ALX1Q15699 AC008413.1-201ENST00000511864 177 ntBASIC2.67□□□□□ -1.98
ALX1Q15699 AC034244.2-201ENST00000514668 858 ntBASIC2.67□□□□□ -1.98
ALX1Q15699 VTRNA2-2P-201ENST00000516091 103 ntBASIC2.67□□□□□ -1.98
ALX1Q15699 SNORA31.15-201ENST00000516771 132 ntBASIC2.67□□□□□ -1.98
ALX1Q15699 AC021736.1-201ENST00000521143 563 ntTSL 4 BASIC2.67□□□□□ -1.98
ALX1Q15699 MTCYBP20-201ENST00000524239 1129 ntBASIC2.67□□□□□ -1.98
ALX1Q15699 AP001363.1-201ENST00000544108 264 ntTSL 3 BASIC2.67□□□□□ -1.98
ALX1Q15699 AC091544.4-201ENST00000555268 342 ntBASIC2.67□□□□□ -1.98
ALX1Q15699 AC107958.2-201ENST00000555396 592 ntTSL 3 BASIC2.67□□□□□ -1.98
ALX1Q15699 AC026464.5-201ENST00000562497 722 ntBASIC2.67□□□□□ -1.98
ALX1Q15699 AC007610.2-201ENST00000566770 666 ntTSL 3 BASIC2.67□□□□□ -1.98
ALX1Q15699 MIR4435-1-201ENST00000582552 80 ntBASIC2.67□□□□□ -1.98
ALX1Q15699 AC002115.1-201ENST00000589603 568 ntTSL 4 BASIC2.67□□□□□ -1.98
ALX1Q15699 AL049779.4-201ENST00000604500 156 ntBASIC2.67□□□□□ -1.98
ALX1Q15699 AC064859.1-201ENST00000624741 174 ntBASIC2.67□□□□□ -1.98
ALX1Q15699 AL160394.1-201ENST00000624765 724 ntBASIC2.67□□□□□ -1.98
ALX1Q15699 RAPGEF6-210ENST00000512052 3535 ntTSL 2 BASIC2.67□□□□□ -1.98
ALX1Q15699 AL050331.3-201ENST00000448740 2081 ntTSL 2 BASIC2.67□□□□□ -1.98
ALX1Q15699 LCORL-202ENST00000382224 4984 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.67□□□□□ -1.98
ALX1Q15699 AGL-204ENST00000370161 6923 ntTSL 5 BASIC2.66□□□□□ -1.98
ALX1Q15699 CPXCR1-203ENST00000614120 1485 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC2.66□□□□□ -1.98
ALX1Q15699 STX7-202ENST00000367941 15791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.66□□□□□ -1.98
ALX1Q15699 C2orf73-208ENST00000615983 1376 ntTSL 1 (best) BASIC2.66□□□□□ -1.98
ALX1Q15699 SPINT4-201ENST00000279058 512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.66□□□□□ -1.98
ALX1Q15699 RNA5SP393-201ENST00000363423 117 ntBASIC2.66□□□□□ -1.98
ALX1Q15699 BX248415.1-201ENST00000367421 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.66□□□□□ -1.98
ALX1Q15699 RNU1-73P-201ENST00000383971 164 ntBASIC2.66□□□□□ -1.98
ALX1Q15699 MIR221-201ENST00000385135 110 ntBASIC2.66□□□□□ -1.98
ALX1Q15699 AL024474.1-201ENST00000404655 591 ntBASIC2.66□□□□□ -1.98
ALX1Q15699 LHFPL3-AS1-203ENST00000417290 950 ntTSL 1 (best) BASIC2.66□□□□□ -1.98
ALX1Q15699 Z98742.3-201ENST00000418637 326 ntBASIC2.66□□□□□ -1.98
ALX1Q15699 AL137014.1-201ENST00000420490 1226 ntBASIC2.66□□□□□ -1.98
ALX1Q15699 MAMDC2-AS1-203ENST00000420573 339 ntTSL 3 BASIC2.66□□□□□ -1.98
ALX1Q15699 RABEPKP1-201ENST00000440529 1026 ntBASIC2.66□□□□□ -1.98
ALX1Q15699 LINC00440-201ENST00000446579 734 ntTSL 5 BASIC2.66□□□□□ -1.98
ALX1Q15699 AL360091.1-201ENST00000447949 496 ntTSL 5 BASIC2.66□□□□□ -1.98
ALX1Q15699 AL445488.1-201ENST00000457272 706 ntTSL 5 BASIC2.66□□□□□ -1.98
ALX1Q15699 AC010486.1-201ENST00000511793 424 ntBASIC2.66□□□□□ -1.98
ALX1Q15699 RNA5SP200-201ENST00000516360 103 ntBASIC2.66□□□□□ -1.98
ALX1Q15699 RNU6-1308P-201ENST00000516817 103 ntBASIC2.66□□□□□ -1.98
ALX1Q15699 AP000889.2-201ENST00000532684 490 ntBASIC2.66□□□□□ -1.98
ALX1Q15699 LINC01467-201ENST00000554211 1187 ntTSL 1 (best) BASIC2.66□□□□□ -1.98
ALX1Q15699 AL133370.1-201ENST00000554679 537 ntTSL 3 BASIC2.66□□□□□ -1.98
ALX1Q15699 PWRN1-209ENST00000568019 359 ntTSL 3 BASIC2.66□□□□□ -1.98
ALX1Q15699 SMG1P7-203ENST00000573141 619 ntTSL 2 BASIC2.66□□□□□ -1.98
ALX1Q15699 COX6CP3-201ENST00000580869 223 ntBASIC2.66□□□□□ -1.98
ALX1Q15699 MIR5194-201ENST00000582634 120 ntBASIC2.66□□□□□ -1.98
ALX1Q15699 AC016493.1-201ENST00000586106 688 ntTSL 1 (best) BASIC2.66□□□□□ -1.98
ALX1Q15699 AC012254.1-201ENST00000592747 200 ntTSL 3 BASIC2.66□□□□□ -1.98
ALX1Q15699 NUTF2P8-201ENST00000604593 363 ntBASIC2.66□□□□□ -1.98
ALX1Q15699 SERPINI2-206ENST00000471111 1331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.66□□□□□ -1.98
ALX1Q15699 ZNF658B-202ENST00000615961 3375 ntBASIC2.65□□□□□ -1.98
ALX1Q15699 TFPI-202ENST00000339091 1088 ntTSL 1 (best) BASIC2.65□□□□□ -1.99
ALX1Q15699 AL606495.1-201ENST00000422100 813 ntBASIC2.65□□□□□ -1.99
ALX1Q15699 AC091133.1-201ENST00000435491 483 ntTSL 3 BASIC2.65□□□□□ -1.99
ALX1Q15699 AP000936.1-201ENST00000442124 483 ntTSL 5 BASIC2.65□□□□□ -1.99
ALX1Q15699 HMGB1P26-201ENST00000452520 628 ntBASIC2.65□□□□□ -1.99
ALX1Q15699 SATB1-AS1-204ENST00000453361 726 ntTSL 3 BASIC2.65□□□□□ -1.99
ALX1Q15699 AC027673.1-201ENST00000456245 405 ntBASIC2.65□□□□□ -1.99
ALX1Q15699 TRBV26-201ENST00000456572 344 ntBASIC2.65□□□□□ -1.99
ALX1Q15699 AC004917.1-201ENST00000490856 575 ntTSL 4 BASIC2.65□□□□□ -1.99
ALX1Q15699 PGRMC2-203ENST00000503588 818 ntTSL 4 BASIC2.65□□□□□ -1.99
ALX1Q15699 LINC00824-201ENST00000517583 805 ntTSL 5 BASIC2.65□□□□□ -1.99
ALX1Q15699 CIR1P1-201ENST00000524055 1133 ntBASIC2.65□□□□□ -1.99
ALX1Q15699 AC087241.2-201ENST00000535801 324 ntBASIC2.65□□□□□ -1.99
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 143.8 ms