Protein–RNA interactions for Protein: Q15431

SYCP1, Synaptonemal complex protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 976 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYCP1Q15431 RNU2-25P-201ENST00000411041 191 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
SYCP1Q15431 AL117337.1-201ENST00000412789 444 ntTSL 3 BASIC2.99□□□□□ -1.93
SYCP1Q15431 AC092447.6-201ENST00000414578 210 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
SYCP1Q15431 EEF1A1P41-201ENST00000414667 207 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
SYCP1Q15431 AC004946.1-201ENST00000421825 751 ntTSL 3 BASIC2.99□□□□□ -1.93
SYCP1Q15431 COTL1P1-201ENST00000422309 375 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
SYCP1Q15431 RPS4XP6-201ENST00000477670 797 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
SYCP1Q15431 AC117522.3-201ENST00000507974 584 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
SYCP1Q15431 AC010374.2-201ENST00000512933 535 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
SYCP1Q15431 AC097535.1-201ENST00000515263 332 ntTSL 3 BASIC2.99□□□□□ -1.93
SYCP1Q15431 PRELID3BP4-201ENST00000515476 571 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
SYCP1Q15431 RNU6-760P-201ENST00000516078 97 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
SYCP1Q15431 SNORA31.11-201ENST00000516528 139 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
SYCP1Q15431 RPPH1-2P-201ENST00000516688 293 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
SYCP1Q15431 AP002833.1-201ENST00000530572 566 ntTSL 3 BASIC2.99□□□□□ -1.93
SYCP1Q15431 AC104365.3-201ENST00000587011 625 ntTSL 5 BASIC2.99□□□□□ -1.93
SYCP1Q15431 AC008277.2-201ENST00000605196 797 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
SYCP1Q15431 SMIM2-AS1-204ENST00000619472 746 ntTSL 3 BASIC2.99□□□□□ -1.93
SYCP1Q15431 FO624990.1-201ENST00000636373 85 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
SYCP1Q15431 CEP57L1-216ENST00000521522 2259 ntTSL 5 BASIC2.99□□□□□ -1.93
SYCP1Q15431 ARHGAP11A-207ENST00000565905 3318 ntTSL 2 BASIC2.98□□□□□ -1.93
SYCP1Q15431 CSN3-201ENST00000304954 836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.98□□□□□ -1.93
SYCP1Q15431 OR5W2-201ENST00000344514 933 ntAPPRIS P1 BASIC2.98□□□□□ -1.93
SYCP1Q15431 RNU1-138P-201ENST00000384093 164 ntBASIC2.98□□□□□ -1.93
SYCP1Q15431 LINC00400-201ENST00000425609 547 ntTSL 3 BASIC2.98□□□□□ -1.93
SYCP1Q15431 LINC01884-201ENST00000433429 440 ntTSL 3 BASIC2.98□□□□□ -1.93
SYCP1Q15431 AC026167.1-201ENST00000435651 299 ntTSL 3 BASIC2.98□□□□□ -1.93
SYCP1Q15431 AL357052.1-201ENST00000443504 381 ntTSL 3 BASIC2.98□□□□□ -1.93
SYCP1Q15431 AL589963.1-201ENST00000449282 727 ntTSL 3 BASIC2.98□□□□□ -1.93
SYCP1Q15431 BIRC6-AS1-201ENST00000455572 697 ntTSL 3 BASIC2.98□□□□□ -1.93
SYCP1Q15431 LNCSRLR-201ENST00000490375 709 ntTSL 3 BASIC2.98□□□□□ -1.93
SYCP1Q15431 MLLT10P2-201ENST00000506434 249 ntBASIC2.98□□□□□ -1.93
SYCP1Q15431 OTUD4-208ENST00000509620 864 ntTSL 1 (best) BASIC2.98□□□□□ -1.93
SYCP1Q15431 RN7SKP40-201ENST00000517211 242 ntBASIC2.98□□□□□ -1.93
SYCP1Q15431 RGS4-209ENST00000531057 544 ntTSL 4 BASIC2.98□□□□□ -1.93
SYCP1Q15431 AC090912.2-203ENST00000581177 477 ntTSL 3 BASIC2.98□□□□□ -1.93
SYCP1Q15431 TTN-AS1-213ENST00000584485 838 ntTSL 3 BASIC2.98□□□□□ -1.93
SYCP1Q15431 AC130469.1-201ENST00000597256 388 ntTSL 5 BASIC2.98□□□□□ -1.93
SYCP1Q15431 HSPE1P7-201ENST00000604681 321 ntBASIC2.98□□□□□ -1.93
SYCP1Q15431 DLEU2_6.1-201ENST00000610536 112 ntBASIC2.98□□□□□ -1.93
SYCP1Q15431 AL137847.3-201ENST00000611521 109 ntBASIC2.98□□□□□ -1.93
SYCP1Q15431 CR589904.2-201ENST00000612533 440 ntBASIC2.98□□□□□ -1.93
SYCP1Q15431 C3orf79-201ENST00000623038 580 ntTSL 1 (best) BASIC2.98□□□□□ -1.93
SYCP1Q15431 AC103798.2-201ENST00000624292 632 ntBASIC2.98□□□□□ -1.93
SYCP1Q15431 AC006386.2-201ENST00000624491 75 ntBASIC2.98□□□□□ -1.93
SYCP1Q15431 AC012005.1-201ENST00000624575 75 ntBASIC2.98□□□□□ -1.93
SYCP1Q15431 AC110079.1-202ENST00000635213 138 ntBASIC2.98□□□□□ -1.93
SYCP1Q15431 AC092442.1-201ENST00000636216 138 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.98□□□□□ -1.93
SYCP1Q15431 LUZP4-201ENST00000371920 1701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC2.98□□□□□ -1.93
SYCP1Q15431 SLC6A15-202ENST00000309283 3108 ntTSL 5 BASIC2.98□□□□□ -1.93
SYCP1Q15431 SAMSN1-202ENST00000400564 1382 ntTSL 1 (best) BASIC2.98□□□□□ -1.93
SYCP1Q15431 LMNTD1-204ENST00000458174 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC2.98□□□□□ -1.93
SYCP1Q15431 CDC27-207ENST00000531206 3177 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC2.98□□□□□ -1.93
SYCP1Q15431 AC244517.1-201ENST00000606030 2086 ntBASIC2.97□□□□□ -1.93
SYCP1Q15431 AC109315.1-201ENST00000584143 1347 ntBASIC2.97□□□□□ -1.93
SYCP1Q15431 AASDH-207ENST00000513376 3241 ntTSL 1 (best) BASIC2.97□□□□□ -1.93
SYCP1Q15431 OXR1-215ENST00000531443 3599 ntTSL 5 BASIC2.97□□□□□ -1.93
SYCP1Q15431 APOH-201ENST00000205948 1176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.97□□□□□ -1.93
SYCP1Q15431 RNU6-1074P-201ENST00000383995 104 ntBASIC2.97□□□□□ -1.93
SYCP1Q15431 SNORA18.3-201ENST00000384122 132 ntBASIC2.97□□□□□ -1.93
SYCP1Q15431 Y_RNA.510-201ENST00000384511 114 ntBASIC2.97□□□□□ -1.93
SYCP1Q15431 MIR627-201ENST00000384979 97 ntBASIC2.97□□□□□ -1.93
SYCP1Q15431 FBXO11-201ENST00000402508 3844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.97□□□□□ -1.93
SYCP1Q15431 MOB4-205ENST00000409916 829 ntTSL 3 BASIC2.97□□□□□ -1.93
SYCP1Q15431 AC013286.1-201ENST00000412137 381 ntTSL 5 BASIC2.97□□□□□ -1.93
SYCP1Q15431 AC006076.1-201ENST00000423233 345 ntTSL 3 BASIC2.97□□□□□ -1.93
SYCP1Q15431 AL139132.1-201ENST00000431587 344 ntBASIC2.97□□□□□ -1.93
SYCP1Q15431 AC112220.1-201ENST00000434628 355 ntBASIC2.97□□□□□ -1.93
SYCP1Q15431 AC093579.1-201ENST00000439455 352 ntTSL 2 BASIC2.97□□□□□ -1.93
SYCP1Q15431 AC024597.1-201ENST00000442753 706 ntTSL 5 BASIC2.97□□□□□ -1.93
SYCP1Q15431 C1orf143-201ENST00000443836 762 ntTSL 2 BASIC2.97□□□□□ -1.93
SYCP1Q15431 AC068135.1-201ENST00000446164 246 ntBASIC2.97□□□□□ -1.93
SYCP1Q15431 AC093422.2-201ENST00000452599 686 ntTSL 2 BASIC2.97□□□□□ -1.93
SYCP1Q15431 SRIP1-201ENST00000489235 288 ntBASIC2.97□□□□□ -1.93
SYCP1Q15431 LINC02213-202ENST00000506021 774 ntTSL 2 BASIC2.97□□□□□ -1.93
SYCP1Q15431 RNU6-202P-201ENST00000515998 96 ntBASIC2.97□□□□□ -1.93
SYCP1Q15431 AC104233.2-201ENST00000518922 414 ntTSL 3 BASIC2.97□□□□□ -1.93
SYCP1Q15431 SPINK7-205ENST00000523535 299 ntTSL 2 BASIC2.97□□□□□ -1.93
SYCP1Q15431 AC126177.3-201ENST00000551839 688 ntBASIC2.97□□□□□ -1.93
SYCP1Q15431 AC090506.1-201ENST00000583089 572 ntTSL 4 BASIC2.97□□□□□ -1.93
SYCP1Q15431 AL451007.1-201ENST00000595491 289 ntBASIC2.97□□□□□ -1.93
SYCP1Q15431 AC079610.2-201ENST00000604818 690 ntBASIC2.97□□□□□ -1.93
SYCP1Q15431 AC090116.1-201ENST00000615679 446 ntBASIC2.97□□□□□ -1.93
SYCP1Q15431 AL356118.1-201ENST00000635272 1078 ntBASIC2.97□□□□□ -1.93
SYCP1Q15431 MTND2P41-201ENST00000637599 773 ntBASIC2.97□□□□□ -1.93
SYCP1Q15431 BIRC3-206ENST00000532808 4238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.97□□□□□ -1.93
SYCP1Q15431 DDIAS-201ENST00000329143 3367 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC2.97□□□□□ -1.93
SYCP1Q15431 NAALADL2-203ENST00000454872 9865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.97□□□□□ -1.93
SYCP1Q15431 AC046144.1-201ENST00000478559 1853 ntBASIC2.96□□□□□ -1.93
SYCP1Q15431 DNAH7-201ENST00000312428 12394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.96□□□□□ -1.94
SYCP1Q15431 KCNE2-201ENST00000290310 1051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.96□□□□□ -1.94
SYCP1Q15431 RNU6-7-201ENST00000364784 107 ntBASIC2.96□□□□□ -1.94
SYCP1Q15431 RNU6-8-201ENST00000365467 107 ntBASIC2.96□□□□□ -1.94
SYCP1Q15431 TRAJ26-201ENST00000390511 60 ntAPPRIS P1 BASIC2.96□□□□□ -1.94
SYCP1Q15431 RNU6-712P-201ENST00000410558 100 ntBASIC2.96□□□□□ -1.94
SYCP1Q15431 VN1R51P-201ENST00000411675 945 ntBASIC2.96□□□□□ -1.94
SYCP1Q15431 FNDC3CP-201ENST00000420795 1155 ntBASIC2.96□□□□□ -1.94
SYCP1Q15431 TMEM167AP1-201ENST00000423409 219 ntBASIC2.96□□□□□ -1.94
SYCP1Q15431 AL109947.1-201ENST00000423747 382 ntTSL 2 BASIC2.96□□□□□ -1.94
SYCP1Q15431 RAB6C-AS1-202ENST00000433431 123 ntBASIC2.96□□□□□ -1.94
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 89 ms