Protein–RNA interactions for Protein: Q147U7

SMCO1, Single-pass membrane and coiled-coil domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 214 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMCO1Q147U7 AC034105.4-201ENST00000568304 277 ntBASIC2.1□□□□□ -2.07
SMCO1Q147U7 RPL23AP84-201ENST00000571193 464 ntBASIC2.1□□□□□ -2.07
SMCO1Q147U7 AC104365.3-201ENST00000587011 625 ntTSL 5 BASIC2.1□□□□□ -2.07
SMCO1Q147U7 PRKCQ-AS1-213ENST00000613985 883 ntTSL 5 BASIC2.1□□□□□ -2.07
SMCO1Q147U7 C17orf112-201ENST00000623702 835 ntTSL 2 BASIC2.1□□□□□ -2.07
SMCO1Q147U7 ANKRD36BP1-201ENST00000358576 1779 ntBASIC2.1□□□□□ -2.07
SMCO1Q147U7 RNF128-202ENST00000324342 2654 ntTSL 1 (best) BASIC2.1□□□□□ -2.07
SMCO1Q147U7 PTPRQ-208ENST00000614701 8289 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.1□□□□□ -2.07
SMCO1Q147U7 MTND4P35-201ENST00000604257 1375 ntBASIC2.1□□□□□ -2.07
SMCO1Q147U7 OR2L2-202ENST00000641771 4300 ntAPPRIS P1 BASIC2.09□□□□□ -2.07
SMCO1Q147U7 ZNF658B-202ENST00000615961 3375 ntBASIC2.09□□□□□ -2.07
SMCO1Q147U7 LGI1-201ENST00000371413 1247 ntTSL 1 (best) BASIC2.09□□□□□ -2.07
SMCO1Q147U7 LINC00587-201ENST00000374801 590 ntTSL 1 (best) BASIC2.09□□□□□ -2.07
SMCO1Q147U7 RNVU1-14-201ENST00000384770 164 ntBASIC2.09□□□□□ -2.07
SMCO1Q147U7 EEF1E1-BLOC1S5-201ENST00000397456 768 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC2.09□□□□□ -2.07
SMCO1Q147U7 AP003170.3-201ENST00000399123 158 ntTSL 5 BASIC2.09□□□□□ -2.07
SMCO1Q147U7 RNU6ATAC16P-201ENST00000408591 138 ntBASIC2.09□□□□□ -2.07
SMCO1Q147U7 CTNNA2-204ENST00000409266 432 ntTSL 3 BASIC2.09□□□□□ -2.07
SMCO1Q147U7 AC005062.1-204ENST00000415499 743 ntTSL 3 BASIC2.09□□□□□ -2.07
SMCO1Q147U7 AL049765.1-201ENST00000416237 573 ntTSL 5 BASIC2.09□□□□□ -2.07
SMCO1Q147U7 DSCR4-IT1-201ENST00000417138 424 ntTSL 5 BASIC2.09□□□□□ -2.07
SMCO1Q147U7 AC066595.1-201ENST00000426697 399 ntTSL 3 BASIC2.09□□□□□ -2.07
SMCO1Q147U7 WARS2P1-201ENST00000429678 537 ntBASIC2.09□□□□□ -2.07
SMCO1Q147U7 AL392003.1-201ENST00000434394 243 ntBASIC2.09□□□□□ -2.07
SMCO1Q147U7 AC020743.3-201ENST00000440351 360 ntTSL 3 BASIC2.09□□□□□ -2.07
SMCO1Q147U7 RPS29P26-201ENST00000477483 171 ntBASIC2.09□□□□□ -2.07
SMCO1Q147U7 PRR16-204ENST00000505123 1298 ntTSL 3 BASIC2.09□□□□□ -2.07
SMCO1Q147U7 NDUFB4P2-201ENST00000509515 391 ntBASIC2.09□□□□□ -2.07
SMCO1Q147U7 AC084116.3-201ENST00000519123 429 ntTSL 3 BASIC2.09□□□□□ -2.07
SMCO1Q147U7 AC025300.1-201ENST00000526616 384 ntTSL 3 BASIC2.09□□□□□ -2.07
SMCO1Q147U7 COX6CP5-201ENST00000527162 228 ntBASIC2.09□□□□□ -2.07
SMCO1Q147U7 GLYCAM1-201ENST00000546596 285 ntBASIC2.09□□□□□ -2.07
SMCO1Q147U7 PSMA4-204ENST00000558094 651 ntTSL 3 BASIC2.09□□□□□ -2.07
SMCO1Q147U7 MIR3609-201ENST00000582661 80 ntBASIC2.09□□□□□ -2.07
SMCO1Q147U7 MIR3158-1-201ENST00000583596 81 ntBASIC2.09□□□□□ -2.07
SMCO1Q147U7 YPEL5P2-201ENST00000605553 359 ntBASIC2.09□□□□□ -2.07
SMCO1Q147U7 AC025588.4-201ENST00000615802 908 ntBASIC2.09□□□□□ -2.07
SMCO1Q147U7 AL590410.1-201ENST00000617925 333 ntBASIC2.09□□□□□ -2.07
SMCO1Q147U7 CC2D2B-209ENST00000618242 980 ntTSL 5 BASIC2.09□□□□□ -2.07
SMCO1Q147U7 AL049780.3-201ENST00000624612 1583 ntBASIC2.09□□□□□ -2.08
SMCO1Q147U7 AL359851.1-201ENST00000569460 4997 ntBASIC2.08□□□□□ -2.08
SMCO1Q147U7 C6orf10-205ENST00000527965 2076 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC2.08□□□□□ -2.08
SMCO1Q147U7 TAB2-201ENST00000367456 4553 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.08□□□□□ -2.08
SMCO1Q147U7 OR4M1-202ENST00000641200 3493 ntAPPRIS P1 BASIC2.08□□□□□ -2.08
SMCO1Q147U7 RNU1-85P-201ENST00000364127 164 ntBASIC2.08□□□□□ -2.08
SMCO1Q147U7 SNORD114-30-201ENST00000364448 72 ntBASIC2.08□□□□□ -2.08
SMCO1Q147U7 MIR7-3-201ENST00000384898 110 ntBASIC2.08□□□□□ -2.08
SMCO1Q147U7 DHFRP5-201ENST00000406944 564 ntBASIC2.08□□□□□ -2.08
SMCO1Q147U7 AC006333.1-201ENST00000422401 410 ntTSL 3 BASIC2.08□□□□□ -2.08
SMCO1Q147U7 AL513175.1-201ENST00000431492 780 ntBASIC2.08□□□□□ -2.08
SMCO1Q147U7 AC087499.2-201ENST00000432861 149 ntBASIC2.08□□□□□ -2.08
SMCO1Q147U7 AC098826.1-201ENST00000433943 471 ntBASIC2.08□□□□□ -2.08
SMCO1Q147U7 DPPA3P1-201ENST00000448050 469 ntBASIC2.08□□□□□ -2.08
SMCO1Q147U7 AC008280.2-201ENST00000455473 307 ntBASIC2.08□□□□□ -2.08
SMCO1Q147U7 AL139260.1-202ENST00000456813 441 ntTSL 3 BASIC2.08□□□□□ -2.08
SMCO1Q147U7 AC121764.3-201ENST00000465946 384 ntTSL 2 BASIC2.08□□□□□ -2.08
SMCO1Q147U7 AC132825.2-201ENST00000483901 504 ntTSL 5 BASIC2.08□□□□□ -2.08
SMCO1Q147U7 AC104687.1-201ENST00000485829 412 ntBASIC2.08□□□□□ -2.08
SMCO1Q147U7 LNCSRLR-201ENST00000490375 709 ntTSL 3 BASIC2.08□□□□□ -2.08
SMCO1Q147U7 APOA2-210ENST00000491350 263 ntTSL 1 (best) BASIC2.08□□□□□ -2.08
SMCO1Q147U7 AC022493.1-201ENST00000492984 337 ntBASIC2.08□□□□□ -2.08
SMCO1Q147U7 AC090255.1-201ENST00000495779 349 ntBASIC2.08□□□□□ -2.08
SMCO1Q147U7 AL358832.1-201ENST00000497800 389 ntBASIC2.08□□□□□ -2.08
SMCO1Q147U7 LINC02270-201ENST00000505386 610 ntTSL 1 (best) BASIC2.08□□□□□ -2.08
SMCO1Q147U7 MLLT10P2-201ENST00000506434 249 ntBASIC2.08□□□□□ -2.08
SMCO1Q147U7 LINC02229-201ENST00000508486 661 ntTSL 3 BASIC2.08□□□□□ -2.08
SMCO1Q147U7 AC074250.1-201ENST00000511117 192 ntBASIC2.08□□□□□ -2.08
SMCO1Q147U7 AC010374.2-201ENST00000512933 535 ntBASIC2.08□□□□□ -2.08
SMCO1Q147U7 RNA5SP282-201ENST00000516355 108 ntBASIC2.08□□□□□ -2.08
SMCO1Q147U7 AC103794.1-201ENST00000531763 197 ntTSL 3 BASIC2.08□□□□□ -2.08
SMCO1Q147U7 PARPBP-212ENST00000543784 992 ntTSL 2 BASIC2.08□□□□□ -2.08
SMCO1Q147U7 MRPL42-204ENST00000548545 692 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC2.08□□□□□ -2.08
SMCO1Q147U7 AC079584.2-201ENST00000548756 515 ntTSL 3 BASIC2.08□□□□□ -2.08
SMCO1Q147U7 SERPINE4P-201ENST00000554978 281 ntBASIC2.08□□□□□ -2.08
SMCO1Q147U7 AC105020.2-201ENST00000564683 572 ntTSL 5 BASIC2.08□□□□□ -2.08
SMCO1Q147U7 AL020997.2-201ENST00000602607 184 ntBASIC2.08□□□□□ -2.08
SMCO1Q147U7 AC079089.3-201ENST00000603094 673 ntBASIC2.08□□□□□ -2.08
SMCO1Q147U7 NTAN1P1-201ENST00000603150 646 ntBASIC2.08□□□□□ -2.08
SMCO1Q147U7 DPRXP5-201ENST00000604662 539 ntBASIC2.08□□□□□ -2.08
SMCO1Q147U7 AP004372.1-201ENST00000604842 844 ntBASIC2.08□□□□□ -2.08
SMCO1Q147U7 AC159540.2-206ENST00000619371 355 ntTSL 3 BASIC2.08□□□□□ -2.08
SMCO1Q147U7 AC012314.7-201ENST00000619693 93 ntBASIC2.08□□□□□ -2.08
SMCO1Q147U7 PHTF2-202ENST00000275575 4541 ntTSL 1 (best) BASIC2.08□□□□□ -2.08
SMCO1Q147U7 RNF219-AS1-214ENST00000607862 6001 ntTSL 1 (best) BASIC2.08□□□□□ -2.08
SMCO1Q147U7 CEP57L1-203ENST00000368970 1680 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.08□□□□□ -2.08
SMCO1Q147U7 CR848007.1-201ENST00000442354 1699 ntBASIC2.08□□□□□ -2.08
SMCO1Q147U7 SNX10-209ENST00000619420 2361 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC2.08□□□□□ -2.08
SMCO1Q147U7 TXLNGY-201ENST00000253320 7299 ntTSL 2 BASIC2.08□□□□□ -2.08
SMCO1Q147U7 LEPR-202ENST00000349533 8227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.07□□□□□ -2.08
SMCO1Q147U7 Y_RNA.126-201ENST00000363382 111 ntBASIC2.07□□□□□ -2.08
SMCO1Q147U7 SNORA38-201ENST00000363946 132 ntBASIC2.07□□□□□ -2.08
SMCO1Q147U7 RNU1-112P-201ENST00000364401 164 ntBASIC2.07□□□□□ -2.08
SMCO1Q147U7 SNORA68.1-201ENST00000364537 132 ntBASIC2.07□□□□□ -2.08
SMCO1Q147U7 SNORA18.3-201ENST00000384122 132 ntBASIC2.07□□□□□ -2.08
SMCO1Q147U7 SNORA51.11-201ENST00000384442 131 ntBASIC2.07□□□□□ -2.08
SMCO1Q147U7 TRAJ59-201ENST00000390480 54 ntAPPRIS P1 BASIC2.07□□□□□ -2.08
SMCO1Q147U7 TAS2R19-201ENST00000390673 1002 ntAPPRIS P1 BASIC2.07□□□□□ -2.08
SMCO1Q147U7 MRLN-201ENST00000414264 422 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC2.07□□□□□ -2.08
SMCO1Q147U7 RPL35AP12-201ENST00000425362 338 ntBASIC2.07□□□□□ -2.08
SMCO1Q147U7 AL365496.1-201ENST00000426885 215 ntBASIC2.07□□□□□ -2.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 114.3 ms