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| SEMA3A | Q14563 | ZNF638-203 | ENST00000409544 | 6821 nt | APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC | 4.12 | □□□□□ -1.75 | | |
| SEMA3A | Q14563 | LINC02471-203 | ENST00000641941 | 4752 nt | BASIC | 4.12 | □□□□□ -1.75 | | |
| SEMA3A | Q14563 | ATP13A3-203 | ENST00000439040 | 7720 nt | APPRIS P1 TSL 5 BASIC | 4.12 | □□□□□ -1.75 | | |
| SEMA3A | Q14563 | RNF38-201 | ENST00000259605 | 5012 nt | TSL 1 (best) BASIC | 4.12 | □□□□□ -1.75 | | |
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| SEMA3A | Q14563 | MAPK10-253 | ENST00000641010 | 4072 nt | BASIC | 4.11 | □□□□□ -1.75 | | |
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| SEMA3A | Q14563 | AC116096.1-201 | ENST00000566804 | 2314 nt | BASIC | 4.11 | □□□□□ -1.75 | | |
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| SEMA3A | Q14563 | AC008243.1-202 | ENST00000506527 | 481 nt | TSL 5 BASIC | 4.11 | □□□□□ -1.75 | | |
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| SEMA3A | Q14563 | AC017037.1-201 | ENST00000508460 | 471 nt | BASIC | 4.11 | □□□□□ -1.75 | | |
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| SEMA3A | Q14563 | COX6CP8-201 | ENST00000522620 | 226 nt | BASIC | 4.11 | □□□□□ -1.75 | | |
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| SEMA3A | Q14563 | DAZAP2-209 | ENST00000549732 | 601 nt | TSL 2 BASIC | 4.11 | □□□□□ -1.75 | | |
| SEMA3A | Q14563 | AC091489.2-201 | ENST00000566263 | 604 nt | BASIC | 4.11 | □□□□□ -1.75 | | |
| SEMA3A | Q14563 | AL513324.1-201 | ENST00000575236 | 632 nt | TSL 5 BASIC | 4.11 | □□□□□ -1.75 | | |
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| SEMA3A | Q14563 | Metazoa_SRP.193-201 | ENST00000622007 | 277 nt | BASIC | 4.11 | □□□□□ -1.75 | | |
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| SEMA3A | Q14563 | ASAH2-201 | ENST00000329428 | 2184 nt | TSL 1 (best) BASIC | 4.11 | □□□□□ -1.75 | | |
| SEMA3A | Q14563 | CCDC102B-201 | ENST00000360242 | 2711 nt | APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC | 4.11 | □□□□□ -1.75 | | |
| SEMA3A | Q14563 | UTRN-204 | ENST00000367545 | 12339 nt | APPRIS P1 TSL 5 BASIC | 4.11 | □□□□□ -1.75 | | |
| SEMA3A | Q14563 | DSG2-AS1-202 | ENST00000583706 | 2024 nt | TSL 5 BASIC | 4.11 | □□□□□ -1.75 | | |
| SEMA3A | Q14563 | ZNF734P-201 | ENST00000419494 | 1534 nt | BASIC | 4.11 | □□□□□ -1.75 | | |
| SEMA3A | Q14563 | PHEX-201 | ENST00000379374 | 6172 nt | APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC | 4.1 | □□□□□ -1.75 | | |
| SEMA3A | Q14563 | AC116667.1-201 | ENST00000604855 | 2072 nt | BASIC | 4.1 | □□□□□ -1.75 | | |
| SEMA3A | Q14563 | AC097714.1-201 | ENST00000511272 | 1647 nt | BASIC | 4.1 | □□□□□ -1.75 | | |
| SEMA3A | Q14563 | ADGRG2-205 | ENST00000357991 | 4661 nt | APPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC | 4.1 | □□□□□ -1.75 | | |
| SEMA3A | Q14563 | ABCC9-201 | ENST00000261200 | 8293 nt | APPRIS P5 TSL 5 BASIC | 4.1 | □□□□□ -1.75 | | |
| SEMA3A | Q14563 | GPR171-201 | ENST00000309180 | 1786 nt | APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC | 4.1 | □□□□□ -1.75 | | |
| SEMA3A | Q14563 | SAGE1-203 | ENST00000537770 | 1824 nt | APPRIS ALT2 TSL 5 BASIC | 4.1 | □□□□□ -1.75 | | |
| SEMA3A | Q14563 | AC010186.3-201 | ENST00000537616 | 2508 nt | TSL 1 (best) BASIC | 4.1 | □□□□□ -1.75 | | |
| SEMA3A | Q14563 | Y_RNA.70-201 | ENST00000362886 | 110 nt | BASIC | 4.1 | □□□□□ -1.75 | | |
| SEMA3A | Q14563 | RNU6-797P-201 | ENST00000363101 | 109 nt | BASIC | 4.1 | □□□□□ -1.75 | | |
| SEMA3A | Q14563 | Y_RNA.256-201 | ENST00000364594 | 104 nt | BASIC | 4.1 | □□□□□ -1.75 | | |
| SEMA3A | Q14563 | SNORA51.2-201 | ENST00000364595 | 132 nt | BASIC | 4.1 | □□□□□ -1.75 | | |
| SEMA3A | Q14563 | MFAP5-202 | ENST00000396549 | 1195 nt | TSL 2 BASIC | 4.1 | □□□□□ -1.75 | | |
| SEMA3A | Q14563 | RPL31P1-201 | ENST00000398116 | 372 nt | BASIC | 4.1 | □□□□□ -1.75 | | |
| SEMA3A | Q14563 | MTCO1P17-201 | ENST00000411522 | 491 nt | BASIC | 4.1 | □□□□□ -1.75 | | |
| SEMA3A | Q14563 | AC091705.1-201 | ENST00000412197 | 209 nt | TSL 5 BASIC | 4.1 | □□□□□ -1.75 | | |
| SEMA3A | Q14563 | COX6CP17-201 | ENST00000421389 | 185 nt | BASIC | 4.1 | □□□□□ -1.75 | | |
| SEMA3A | Q14563 | TTTY20-201 | ENST00000434487 | 259 nt | TSL 1 (best) BASIC | 4.1 | □□□□□ -1.75 | | |
| SEMA3A | Q14563 | AC078993.1-203 | ENST00000435789 | 1037 nt | TSL 5 BASIC | 4.1 | □□□□□ -1.75 | | |
| SEMA3A | Q14563 | AC078845.1-202 | ENST00000435996 | 733 nt | TSL 3 BASIC | 4.1 | □□□□□ -1.75 | | |
| SEMA3A | Q14563 | AC091862.1-201 | ENST00000438016 | 1100 nt | BASIC | 4.1 | □□□□□ -1.75 | | |
| SEMA3A | Q14563 | AC002381.1-201 | ENST00000447049 | 280 nt | BASIC | 4.1 | □□□□□ -1.75 | | |
| SEMA3A | Q14563 | AC098484.1-201 | ENST00000447572 | 484 nt | TSL 3 BASIC | 4.1 | □□□□□ -1.75 | | |
| SEMA3A | Q14563 | PDSS1P2-201 | ENST00000449397 | 678 nt | BASIC | 4.1 | □□□□□ -1.75 | | |
| SEMA3A | Q14563 | AC005297.2-201 | ENST00000450430 | 606 nt | BASIC | 4.1 | □□□□□ -1.75 | | |
| SEMA3A | Q14563 | AL365356.5-201 | ENST00000478294 | 697 nt | TSL 2 BASIC | 4.1 | □□□□□ -1.75 | | |
| SEMA3A | Q14563 | AC105137.1-201 | ENST00000484355 | 562 nt | BASIC | 4.1 | □□□□□ -1.75 | | |
| SEMA3A | Q14563 | HMGB1P36-201 | ENST00000487709 | 576 nt | BASIC | 4.1 | □□□□□ -1.75 | | |
| SEMA3A | Q14563 | BTBD11-206 | ENST00000494235 | 811 nt | TSL 2 BASIC | 4.1 | □□□□□ -1.75 | | |