Protein–RNA interactions for Protein: Q14028

CNGB1, Cyclic nucleotide-gated cation channel beta-1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,251 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CNGB1Q14028 RGS21-201ENST00000417209 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.13□□□□□ -1.59
CNGB1Q14028 POSTN-203ENST00000379747 3373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.13□□□□□ -1.59
CNGB1Q14028 MS4A14-208ENST00000531783 2910 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.13□□□□□ -1.59
CNGB1Q14028 SAGE2P-201ENST00000420011 2126 ntBASIC5.12□□□□□ -1.59
CNGB1Q14028 CACNB4-260ENST00000637762 3800 ntTSL 5 BASIC5.12□□□□□ -1.59
CNGB1Q14028 MGA-201ENST00000219905 12042 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC5.12□□□□□ -1.59
CNGB1Q14028 AC024940.1-206ENST00000632817 4299 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC5.12□□□□□ -1.59
CNGB1Q14028 OR6Y1-202ENST00000641282 3702 ntAPPRIS P1 BASIC5.12□□□□□ -1.59
CNGB1Q14028 SETDB2-202ENST00000317257 5619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.12□□□□□ -1.59
CNGB1Q14028 OR6C75-201ENST00000343399 939 ntAPPRIS P1 BASIC5.12□□□□□ -1.59
CNGB1Q14028 PRRC2CP1-201ENST00000404428 159 ntBASIC5.12□□□□□ -1.59
CNGB1Q14028 AL109913.1-201ENST00000421173 514 ntBASIC5.12□□□□□ -1.59
CNGB1Q14028 Z93242.1-201ENST00000427102 353 ntBASIC5.12□□□□□ -1.59
CNGB1Q14028 AC093019.2-201ENST00000432294 384 ntTSL 3 BASIC5.12□□□□□ -1.59
CNGB1Q14028 AC010132.1-201ENST00000433315 561 ntTSL 4 BASIC5.12□□□□□ -1.59
CNGB1Q14028 BMS1P19-201ENST00000433925 393 ntBASIC5.12□□□□□ -1.59
CNGB1Q14028 NDUFB1P1-201ENST00000435191 180 ntBASIC5.12□□□□□ -1.59
CNGB1Q14028 AC078993.1-203ENST00000435789 1037 ntTSL 5 BASIC5.12□□□□□ -1.59
CNGB1Q14028 AL117336.1-201ENST00000439198 380 ntTSL 2 BASIC5.12□□□□□ -1.59
CNGB1Q14028 AL662791.1-201ENST00000441992 928 ntBASIC5.12□□□□□ -1.59
CNGB1Q14028 AL136972.1-201ENST00000443471 351 ntTSL 3 BASIC5.12□□□□□ -1.59
CNGB1Q14028 LINC01004-201ENST00000445184 686 ntTSL 5 BASIC5.12□□□□□ -1.59
CNGB1Q14028 AP000477.2-201ENST00000447405 778 ntTSL 3 BASIC5.12□□□□□ -1.59
CNGB1Q14028 PAXBP1P1-201ENST00000449315 447 ntBASIC5.12□□□□□ -1.59
CNGB1Q14028 AC092001.1-201ENST00000453012 261 ntBASIC5.12□□□□□ -1.59
CNGB1Q14028 ANP32BP2-201ENST00000454525 545 ntBASIC5.12□□□□□ -1.59
CNGB1Q14028 RPS27P23-201ENST00000487608 251 ntBASIC5.12□□□□□ -1.59
CNGB1Q14028 OR4G11P-201ENST00000492842 939 ntBASIC5.12□□□□□ -1.59
CNGB1Q14028 AC108866.1-202ENST00000511064 573 ntTSL 4 BASIC5.12□□□□□ -1.59
CNGB1Q14028 AC116347.2-201ENST00000514912 523 ntBASIC5.12□□□□□ -1.59
CNGB1Q14028 RN7SKP96-201ENST00000516948 297 ntBASIC5.12□□□□□ -1.59
CNGB1Q14028 NRG1-IT1-202ENST00000521463 742 ntTSL 1 (best) BASIC5.12□□□□□ -1.59
CNGB1Q14028 AC118942.1-202ENST00000529081 578 ntTSL 5 BASIC5.12□□□□□ -1.59
CNGB1Q14028 AC073530.1-201ENST00000535917 775 ntTSL 5 BASIC5.12□□□□□ -1.59
CNGB1Q14028 CYCSP30-201ENST00000546447 172 ntBASIC5.12□□□□□ -1.59
CNGB1Q14028 NTS-203ENST00000551529 801 ntTSL 3 BASIC5.12□□□□□ -1.59
CNGB1Q14028 AC009396.3-201ENST00000555680 354 ntTSL 5 BASIC5.12□□□□□ -1.59
CNGB1Q14028 GTF2IP8-201ENST00000560687 584 ntBASIC5.12□□□□□ -1.59
CNGB1Q14028 AC099489.2-201ENST00000574976 260 ntBASIC5.12□□□□□ -1.59
CNGB1Q14028 AC005154.1-222ENST00000579024 341 ntTSL 5 BASIC5.12□□□□□ -1.59
CNGB1Q14028 AC027514.2-201ENST00000591014 637 ntTSL 3 BASIC5.12□□□□□ -1.59
CNGB1Q14028 AC099654.14-201ENST00000638599 341 ntBASIC5.12□□□□□ -1.59
CNGB1Q14028 Z99496.1-201ENST00000469424 1477 ntBASIC5.12□□□□□ -1.59
CNGB1Q14028 ASPN-201ENST00000375543 2237 ntTSL 2 BASIC5.12□□□□□ -1.59
CNGB1Q14028 GABRG2-213ENST00000639046 3058 ntTSL 5 BASIC5.12□□□□□ -1.59
CNGB1Q14028 PHC3-215ENST00000495893 12666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.12□□□□□ -1.59
CNGB1Q14028 TBC1D31-210ENST00000521676 3256 ntTSL 5 BASIC5.12□□□□□ -1.59
CNGB1Q14028 NDST4-201ENST00000264363 3351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.12□□□□□ -1.59
CNGB1Q14028 SYNE2-202ENST00000344113 21777 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.11□□□□□ -1.59
CNGB1Q14028 DCUN1D1-201ENST00000292782 7954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.11□□□□□ -1.59
CNGB1Q14028 SLC2A2-201ENST00000314251 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.11□□□□□ -1.59
CNGB1Q14028 MIR554-201ENST00000384874 96 ntBASIC5.11□□□□□ -1.59
CNGB1Q14028 MIR16-1-201ENST00000385271 89 ntBASIC5.11□□□□□ -1.59
CNGB1Q14028 HSPE1P8-201ENST00000406997 288 ntBASIC5.11□□□□□ -1.59
CNGB1Q14028 MTATP6P27-201ENST00000416987 621 ntBASIC5.11□□□□□ -1.59
CNGB1Q14028 AL591419.1-201ENST00000427423 339 ntBASIC5.11□□□□□ -1.59
CNGB1Q14028 OFD1P12Y-201ENST00000427963 1207 ntBASIC5.11□□□□□ -1.59
CNGB1Q14028 RPL31P54-201ENST00000429803 370 ntBASIC5.11□□□□□ -1.59
CNGB1Q14028 AC026167.1-201ENST00000435651 299 ntTSL 3 BASIC5.11□□□□□ -1.59
CNGB1Q14028 AC098614.3-201ENST00000438957 440 ntBASIC5.11□□□□□ -1.59
CNGB1Q14028 CLEC4E-202ENST00000446457 701 ntTSL 3 BASIC5.11□□□□□ -1.59
CNGB1Q14028 AL500522.2-201ENST00000448562 343 ntBASIC5.11□□□□□ -1.59
CNGB1Q14028 AC013460.1-205ENST00000450695 518 ntTSL 4 BASIC5.11□□□□□ -1.59
CNGB1Q14028 ETV5-AS1-201ENST00000453370 560 ntTSL 4 BASIC5.11□□□□□ -1.59
CNGB1Q14028 SNORD108-201ENST00000459332 71 ntBASIC5.11□□□□□ -1.59
CNGB1Q14028 RPL31P58-201ENST00000469001 379 ntBASIC5.11□□□□□ -1.59
CNGB1Q14028 RPL9P6-201ENST00000492764 598 ntBASIC5.11□□□□□ -1.59
CNGB1Q14028 FCF1P3-201ENST00000496394 590 ntBASIC5.11□□□□□ -1.59
CNGB1Q14028 SAR1B-204ENST00000502539 708 ntTSL 5 BASIC5.11□□□□□ -1.59
CNGB1Q14028 NREP-AS1-202ENST00000507222 610 ntTSL 3 BASIC5.11□□□□□ -1.59
CNGB1Q14028 RNY4P37-201ENST00000516225 96 ntBASIC5.11□□□□□ -1.59
CNGB1Q14028 RNA5SP309-201ENST00000516670 106 ntBASIC5.11□□□□□ -1.59
CNGB1Q14028 AF279873.1-201ENST00000523393 313 ntBASIC5.11□□□□□ -1.59
CNGB1Q14028 OR5AK1P-201ENST00000524837 922 ntBASIC5.11□□□□□ -1.59
CNGB1Q14028 STX3-204ENST00000530221 534 ntTSL 5 BASIC5.11□□□□□ -1.59
CNGB1Q14028 AC084838.1-201ENST00000532973 312 ntTSL 3 BASIC5.11□□□□□ -1.59
CNGB1Q14028 AP000777.1-201ENST00000541495 355 ntTSL 3 BASIC5.11□□□□□ -1.59
CNGB1Q14028 AC107023.1-201ENST00000552757 356 ntTSL 5 BASIC5.11□□□□□ -1.59
CNGB1Q14028 ZNF519P2-201ENST00000557032 169 ntBASIC5.11□□□□□ -1.59
CNGB1Q14028 AC103987.2-201ENST00000583436 417 ntTSL 2 BASIC5.11□□□□□ -1.59
CNGB1Q14028 AC006130.2-201ENST00000586202 326 ntBASIC5.11□□□□□ -1.59
CNGB1Q14028 ZNF562-205ENST00000587392 583 ntTSL 2 BASIC5.11□□□□□ -1.59
CNGB1Q14028 AC020914.6-201ENST00000594327 272 ntBASIC5.11□□□□□ -1.59
CNGB1Q14028 AC006065.5-201ENST00000623427 349 ntBASIC5.11□□□□□ -1.59
CNGB1Q14028 AL158835.3-201ENST00000625908 565 ntTSL 5 BASIC5.11□□□□□ -1.59
CNGB1Q14028 TEX41-300ENST00000631048 69 ntTSL 5 BASIC5.11□□□□□ -1.59
CNGB1Q14028 CLIC2-202ENST00000369449 2655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.11□□□□□ -1.59
CNGB1Q14028 ESCO1-201ENST00000269214 4523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.11□□□□□ -1.59
CNGB1Q14028 AGTR1-205ENST00000461609 1545 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.11□□□□□ -1.59
CNGB1Q14028 RNF180-202ENST00000389100 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.11□□□□□ -1.59
CNGB1Q14028 SULT1B1-201ENST00000310613 7115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.11□□□□□ -1.59
CNGB1Q14028 ZNF92-204ENST00000450302 2957 ntTSL 1 (best) BASIC5.1□□□□□ -1.59
CNGB1Q14028 NUP35-201ENST00000295119 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.1□□□□□ -1.59
CNGB1Q14028 MT-CYB-201ENST00000361789 1141 ntAPPRIS P1 BASIC5.1□□□□□ -1.59
CNGB1Q14028 RNU6-433P-201ENST00000363216 104 ntBASIC5.1□□□□□ -1.59
CNGB1Q14028 FAM24A-201ENST00000368894 596 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.1□□□□□ -1.59
CNGB1Q14028 RNU6-761P-201ENST00000384148 107 ntBASIC5.1□□□□□ -1.59
CNGB1Q14028 AL024509.3-201ENST00000413898 745 ntTSL 1 (best) BASIC5.1□□□□□ -1.59
CNGB1Q14028 AC092832.1-201ENST00000422934 400 ntBASIC5.1□□□□□ -1.59
CNGB1Q14028 LINC00382-201ENST00000427918 890 ntTSL 1 (best) BASIC5.1□□□□□ -1.59
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 96.7 ms