Protein–RNA interactions for Protein: Q13634

CDH18, Cadherin-18, humanhuman

Predictions only

Length 790 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDH18Q13634 AL133507.1-201ENST00000605269 557 ntBASIC3.48□□□□□ -1.85
CDH18Q13634 AC006270.3-201ENST00000605967 1036 ntBASIC3.48□□□□□ -1.85
CDH18Q13634 AC006329.2-201ENST00000611491 394 ntBASIC3.48□□□□□ -1.85
CDH18Q13634 AL713922.2-201ENST00000619384 716 ntBASIC3.48□□□□□ -1.85
CDH18Q13634 FP475955.2-201ENST00000623720 458 ntTSL 2 BASIC3.48□□□□□ -1.85
CDH18Q13634 AC127502.3-201ENST00000636170 1206 ntBASIC3.48□□□□□ -1.85
CDH18Q13634 ARHGAP12-201ENST00000311380 4625 ntTSL 1 (best) BASIC3.48□□□□□ -1.85
CDH18Q13634 R3HDM1-220ENST00000628915 4325 ntTSL 5 BASIC3.48□□□□□ -1.85
CDH18Q13634 C2orf73-202ENST00000398634 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.48□□□□□ -1.85
CDH18Q13634 DST-204ENST00000361203 22431 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.48□□□□□ -1.85
CDH18Q13634 AL390862.1-201ENST00000635467 1469 ntBASIC3.47□□□□□ -1.85
CDH18Q13634 LIG4-205ENST00000614526 3884 ntTSL 2 BASIC3.47□□□□□ -1.85
CDH18Q13634 RAD21-210ENST00000523986 2506 ntTSL 2 BASIC3.47□□□□□ -1.85
CDH18Q13634 AL513302.2-201ENST00000562313 1842 ntBASIC3.47□□□□□ -1.85
CDH18Q13634 AL391994.1-201ENST00000254724 282 ntBASIC3.47□□□□□ -1.85
CDH18Q13634 C12orf4-201ENST00000261250 3826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.47□□□□□ -1.85
CDH18Q13634 OR13C4-201ENST00000277216 957 ntAPPRIS P1 BASIC3.47□□□□□ -1.85
CDH18Q13634 C1orf100-202ENST00000366537 483 ntTSL 1 (best) BASIC3.47□□□□□ -1.85
CDH18Q13634 RNU6-1200P-201ENST00000384162 107 ntBASIC3.47□□□□□ -1.85
CDH18Q13634 RNU6-1122P-201ENST00000384449 107 ntBASIC3.47□□□□□ -1.85
CDH18Q13634 LINC02337-201ENST00000401043 374 ntTSL 3 BASIC3.47□□□□□ -1.85
CDH18Q13634 AL136116.1-201ENST00000403591 381 ntBASIC3.47□□□□□ -1.85
CDH18Q13634 AC009237.5-201ENST00000414271 501 ntBASIC3.47□□□□□ -1.85
CDH18Q13634 AC127526.1-201ENST00000417526 366 ntBASIC3.47□□□□□ -1.85
CDH18Q13634 EDNRB-AS1-201ENST00000422405 601 ntTSL 5 BASIC3.47□□□□□ -1.85
CDH18Q13634 AL160411.1-201ENST00000429853 400 ntTSL 2 BASIC3.47□□□□□ -1.85
CDH18Q13634 UBE2D3P1-201ENST00000436669 444 ntBASIC3.47□□□□□ -1.85
CDH18Q13634 RPL23AP74-201ENST00000437246 471 ntBASIC3.47□□□□□ -1.85
CDH18Q13634 AL354941.1-201ENST00000438600 464 ntBASIC3.47□□□□□ -1.85
CDH18Q13634 MTCYBP34-201ENST00000439552 670 ntBASIC3.47□□□□□ -1.85
CDH18Q13634 MTND5P2-201ENST00000442927 1142 ntBASIC3.47□□□□□ -1.85
CDH18Q13634 MTCYBP3-201ENST00000445588 1137 ntBASIC3.47□□□□□ -1.85
CDH18Q13634 AF127577.5-201ENST00000449746 446 ntTSL 3 BASIC3.47□□□□□ -1.85
CDH18Q13634 MAST4-AS1-201ENST00000451496 777 ntTSL 2 BASIC3.47□□□□□ -1.85
CDH18Q13634 AC097262.1-201ENST00000452559 548 ntBASIC3.47□□□□□ -1.85
CDH18Q13634 AL445669.2-201ENST00000454425 421 ntBASIC3.47□□□□□ -1.85
CDH18Q13634 PCDH9-AS4-201ENST00000456459 436 ntTSL 3 BASIC3.47□□□□□ -1.85
CDH18Q13634 AC026355.2-201ENST00000456755 723 ntTSL 2 BASIC3.47□□□□□ -1.85
CDH18Q13634 UBA6-AS1-204ENST00000502758 547 ntTSL 4 BASIC3.47□□□□□ -1.85
CDH18Q13634 SUB1-203ENST00000502897 562 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC3.47□□□□□ -1.85
CDH18Q13634 LINC02213-202ENST00000506021 774 ntTSL 2 BASIC3.47□□□□□ -1.85
CDH18Q13634 AC110751.1-201ENST00000511916 462 ntTSL 3 BASIC3.47□□□□□ -1.85
CDH18Q13634 SUB1-211ENST00000512913 684 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC3.47□□□□□ -1.85
CDH18Q13634 AC093689.1-201ENST00000514737 246 ntTSL 5 BASIC3.47□□□□□ -1.85
CDH18Q13634 UBE2NP1-201ENST00000545592 458 ntBASIC3.47□□□□□ -1.85
CDH18Q13634 ELOCP32-201ENST00000548625 324 ntBASIC3.47□□□□□ -1.85
CDH18Q13634 AL161757.2-201ENST00000553800 421 ntTSL 3 BASIC3.47□□□□□ -1.85
CDH18Q13634 LINC02126-202ENST00000563754 750 ntTSL 1 (best) BASIC3.47□□□□□ -1.85
CDH18Q13634 AC002400.1-201ENST00000569310 726 ntBASIC3.47□□□□□ -1.85
CDH18Q13634 AC233702.6-201ENST00000584594 396 ntTSL 3 BASIC3.47□□□□□ -1.85
CDH18Q13634 AP001029.2-202ENST00000588197 739 ntTSL 3 BASIC3.47□□□□□ -1.85
CDH18Q13634 AC015911.6-201ENST00000588445 457 ntTSL 3 BASIC3.47□□□□□ -1.85
CDH18Q13634 AL031985.2-201ENST00000600955 480 ntBASIC3.47□□□□□ -1.85
CDH18Q13634 DLEU1_1.1-201ENST00000618107 190 ntBASIC3.47□□□□□ -1.85
CDH18Q13634 AP000676.3-201ENST00000623299 569 ntBASIC3.47□□□□□ -1.85
CDH18Q13634 RMDN2-AS1-204ENST00000626669 448 ntTSL 5 BASIC3.47□□□□□ -1.85
CDH18Q13634 UBE2E2-207ENST00000628311 267 ntTSL 5 BASIC3.47□□□□□ -1.85
CDH18Q13634 TAF7L-201ENST00000324762 2107 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC3.47□□□□□ -1.85
CDH18Q13634 TLR10-206ENST00000508334 2616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.47□□□□□ -1.85
CDH18Q13634 PWAR6-201ENST00000552334 4618 ntBASIC3.47□□□□□ -1.85
CDH18Q13634 SYT14-204ENST00000472886 2966 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC3.47□□□□□ -1.85
CDH18Q13634 CYSLTR2-201ENST00000282018 4672 ntAPPRIS P1 BASIC3.47□□□□□ -1.85
CDH18Q13634 ARPP19-211ENST00000568196 1489 ntTSL 2 BASIC3.47□□□□□ -1.85
CDH18Q13634 Z83843.1-201ENST00000604070 3685 ntBASIC3.47□□□□□ -1.85
CDH18Q13634 ADGRG4-203ENST00000394143 9931 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC3.46□□□□□ -1.86
CDH18Q13634 DPP10-205ENST00000410059 6278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.46□□□□□ -1.86
CDH18Q13634 UBE2D2-201ENST00000253815 444 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC3.46□□□□□ -1.86
CDH18Q13634 OR6C76-201ENST00000328314 939 ntAPPRIS P1 BASIC3.46□□□□□ -1.86
CDH18Q13634 RNA5SP258-201ENST00000362750 119 ntBASIC3.46□□□□□ -1.86
CDH18Q13634 Y_RNA.169-201ENST00000363745 96 ntBASIC3.46□□□□□ -1.86
CDH18Q13634 SNORA4.1-201ENST00000364263 144 ntBASIC3.46□□□□□ -1.86
CDH18Q13634 SNORA7.2-201ENST00000364446 145 ntBASIC3.46□□□□□ -1.86
CDH18Q13634 RNA5SP189-201ENST00000364920 115 ntBASIC3.46□□□□□ -1.86
CDH18Q13634 RNU6-629P-201ENST00000384061 103 ntBASIC3.46□□□□□ -1.86
CDH18Q13634 AL590084.2-201ENST00000401481 382 ntBASIC3.46□□□□□ -1.86
CDH18Q13634 PIGPP2-201ENST00000411569 458 ntBASIC3.46□□□□□ -1.86
CDH18Q13634 AC098592.1-201ENST00000419352 333 ntBASIC3.46□□□□□ -1.86
CDH18Q13634 DIAPH3-AS2-201ENST00000428656 367 ntTSL 3 BASIC3.46□□□□□ -1.86
CDH18Q13634 AC005326.1-201ENST00000429197 123 ntBASIC3.46□□□□□ -1.86
CDH18Q13634 AL591503.2-201ENST00000442314 1005 ntBASIC3.46□□□□□ -1.86
CDH18Q13634 AL133217.1-201ENST00000450980 425 ntBASIC3.46□□□□□ -1.86
CDH18Q13634 AL589935.1-212ENST00000450998 525 ntTSL 2 BASIC3.46□□□□□ -1.86
CDH18Q13634 snoU109.4-201ENST00000458953 143 ntBASIC3.46□□□□□ -1.86
CDH18Q13634 AC026410.2-201ENST00000460281 156 ntBASIC3.46□□□□□ -1.86
CDH18Q13634 AC121764.3-201ENST00000465946 384 ntTSL 2 BASIC3.46□□□□□ -1.86
CDH18Q13634 RPS15AP17-201ENST00000470598 390 ntBASIC3.46□□□□□ -1.86
CDH18Q13634 RPL31P13-201ENST00000484151 370 ntBASIC3.46□□□□□ -1.86
CDH18Q13634 NCOR1P1-202ENST00000486162 291 ntBASIC3.46□□□□□ -1.86
CDH18Q13634 ARNTL2-AS1-201ENST00000500498 804 ntTSL 1 (best) BASIC3.46□□□□□ -1.86
CDH18Q13634 LINC02122-201ENST00000511395 577 ntTSL 4 BASIC3.46□□□□□ -1.86
CDH18Q13634 LINC02374-202ENST00000515222 578 ntTSL 4 BASIC3.46□□□□□ -1.86
CDH18Q13634 AC107934.2-201ENST00000518653 310 ntBASIC3.46□□□□□ -1.86
CDH18Q13634 AC024958.1-201ENST00000519364 902 ntTSL 5 BASIC3.46□□□□□ -1.86
CDH18Q13634 HSPA8P13-201ENST00000523715 472 ntBASIC3.46□□□□□ -1.86
CDH18Q13634 AP004242.1-201ENST00000533701 349 ntBASIC3.46□□□□□ -1.86
CDH18Q13634 SMILR-201ENST00000533992 553 ntTSL 4 BASIC3.46□□□□□ -1.86
CDH18Q13634 AC007834.2-201ENST00000536310 343 ntBASIC3.46□□□□□ -1.86
CDH18Q13634 EMP1-206ENST00000537612 505 ntTSL 3 BASIC3.46□□□□□ -1.86
CDH18Q13634 AC008015.1-201ENST00000555505 465 ntBASIC3.46□□□□□ -1.86
CDH18Q13634 MIR4738-201ENST00000579134 87 ntBASIC3.46□□□□□ -1.86
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